摘要
传统的微生物研究方法主要利用微生物培养技术,但自然界中只有不到1%的微生物可以通过传统培养方法获得[1],极大的限制了微生物相关研究。宏基因组学最早由Handelsman等提出,自环境样品中提取出含有的总微生物DNA构建微生物宏基因组文库[2]。宏基因组学方法共包括全宏基因组技术及16SrRNA片段扩增技术,通过高通量测序,打破了传统以培养为主的微生物研究方式,又比变性梯度凝胶电泳和末端片段长度多态性等早期用于微生物研究的分子生物学技术效率更高,花费更少。利用宏基因组学方法可以准确获得样品微生物物种组成及丰度等信息[3],进人数据库预测微生物功能,还能分析微生物代谢网络等多方面的信息[4],为微生物的研究提供了便利的工具。
作者
陈泓宇
闫海亚
赵胤丞
肖蘅
陈善元
CHEN Hongyu;YAN Haiya;ZHAO Yincheng;XIAO Heng;CHEN Shanyuan(School of Life Sciences,Yunnan University,Kunming 650091,China)
出处
《水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期699-706,共8页
Fisheries Science
基金
国家自然科学基金资助项目(31560111)
云南大学引进人才科研启动资金资助项目(XT412002)
关键词
宏基因组学
肠道微生物
鱼类
宿主免疫
食性
metagenomics
intestinal microorganism
fish
host immunity
feeding habit
