油茶2个甘油-3-磷酸酰基转移酶基因的克隆与组织表达特异性分析 被引量：12

1

作者 魏琦琦 赵广 +4 位作者 何潇 龙洪旭 李泽 谭晓风 张琳 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期1099-1109,共11页

甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphate acyltransferase,GPAT)是三酰甘油生物合成Kennedy途径中的关键酶,在植物的油脂合成与抗逆等方面起着重要作用。本研究在转录组数据基础上,通过RACE技术,从我国重要木本食用油料树种油茶中... 甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphate acyltransferase,GPAT)是三酰甘油生物合成Kennedy途径中的关键酶,在植物的油脂合成与抗逆等方面起着重要作用。本研究在转录组数据基础上,通过RACE技术,从我国重要木本食用油料树种油茶中克隆了2个GPAT基因CoATS1和CoGPAT6的全长cDNA序列,编码序列长度分别为1 353和1 488 bp,分别编码450和495个氨基酸。蛋白结构预测发现2个蛋白C-端都含有1个酰基转移酶结构域,CoGPAT6的N-端还具有1个类卤酸脱卤酶结构域。多序列比对和系统进化分析结果表明,CoATS1与茶树的CsGPAT聚为一类,CoGPAT6与芝麻的SiGPAT6聚为一类。实时荧光定量PCR分析表明,CoATS1和CoGPAT6基因在检测的各样本中均有表达,其中CoATS1在叶片中的表达量显著高于其他组织,在种子的发育过程中,表达呈递减变化;CoGPAT6在花瓣中表达量最高,在种子中呈"降低-升高-降低"的表达特征。本研究为阐明GPAT类基因在油茶种子油脂合成途径中的功能奠定了基础。 展开更多

关键词 油茶 甘油-3-磷酸酰基转移酶 蛋白结构 系统进化树 表达分析

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枣蔗糖合成酶基因SS6的克隆及表达分析 被引量：7

2

作者 冯延芝 魏琦琦 +3 位作者 何潇 张伟健 赵广 张琳 《经济林研究》 北大核心 2017年第4期36-42,共7页

蔗糖合成酶是蔗糖代谢的关键酶之一,它在调控果实品质和产量方面均有重大意义。为了探究ZjSS6基因在枣蔗糖合成代谢途径中的功能,文中基于枣的转录组测序数据,以中秋酥脆枣为试验材料,利用RACE技术克隆了枣SS6基因的全长cDNA序列,编码... 蔗糖合成酶是蔗糖代谢的关键酶之一,它在调控果实品质和产量方面均有重大意义。为了探究ZjSS6基因在枣蔗糖合成代谢途径中的功能,文中基于枣的转录组测序数据,以中秋酥脆枣为试验材料,利用RACE技术克隆了枣SS6基因的全长cDNA序列,编码区长度为2 553 bp,编码850个氨基酸;该蛋白质的分子量为96.67 kDa,理论等电点为7.57。蛋白结构预测发现,该基因编码的蛋白含有蔗糖合成酶和糖基转移酶两个结构域。多序列比对和系统进化分析结果均表明,枣SS6与桑SS6的亲缘关系最近,其次是梅。实时荧光定量PCR表达分析结果显示,ZjSS6基因在枣各组织器官(果实、枣花、枣吊、叶片和根)中均有表达,其在幼果期枣果中的表达量最高,其次是绿果期枣果和枣吊,而在果实发育过程中其表达量呈整体下降趋势。 展开更多

关键词 枣 蔗糖合成酶 基因克隆 表达分析

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电感耦合等离子体质谱法与离子色谱法测定卷烟纸中镁含量的比较

3

作者 魏琦琦 《中华纸业》 CAS 2024年第5期57-60,共4页

采用电感耦合等离子体质谱法与离子色谱法分别检测卷烟纸中镁含量,对两种方法进行比较。结果表明:两种方法都可以准确地测出卷烟纸中镁含量,但离子色谱法的前处理方法更加简单安全,结果的稳定性、准确性与精密度更高,因而在检测中更具... 采用电感耦合等离子体质谱法与离子色谱法分别检测卷烟纸中镁含量,对两种方法进行比较。结果表明:两种方法都可以准确地测出卷烟纸中镁含量,但离子色谱法的前处理方法更加简单安全,结果的稳定性、准确性与精密度更高,因而在检测中更具优势。 展开更多

关键词 卷烟纸 电感耦合等离子体质谱仪 离子色谱 镁

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补阳还五汤对关节镜下小切口肩袖损伤修补缝合术后的短期影响

4

作者 魏琦琦 肖毅 《光明中医》 2024年第4期689-691,共3页

目的观察补阳还五汤应用于关节镜下小切口肩袖损伤术后的短期临床疗效。方法将山东中医药大学附属医院微创骨科于2021年1月—2023年1月收治的60例患者随机分成2组,对照组(30例)进行正常康复训练,观察组(30例)加用补阳还五汤,持续4周。比... 目的观察补阳还五汤应用于关节镜下小切口肩袖损伤术后的短期临床疗效。方法将山东中医药大学附属医院微创骨科于2021年1月—2023年1月收治的60例患者随机分成2组,对照组(30例)进行正常康复训练,观察组(30例)加用补阳还五汤,持续4周。比较2组患者肩关节功能独立性(FIM)、肩关节功能评分(Constant-Murley)等指标以及不良反应发生率。结果治疗4周后,2组FIM和Constant-Murley的评分较治疗前明显提高,且观察组高于对照组(P<0.05);2组均无明显不良反应。结论补阳还五汤加减应用于关节镜辅助下肩袖损伤缝合修补术后,能够帮助患者尽早恢复功能锻炼,促进肩关节健骨愈合,有效地促进患者早期恢复。 展开更多

关键词 筋伤 肩袖损伤 补阳还五汤 关节镜 中医康复

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LEAFY同源基因系统进化及研究进展 被引量：5

5

作者 冯延芝 李芳东 +5 位作者 王璐 魏琦琦 何潇 赵广 张悦 傅建敏 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期25-32,共8页

LEAFY(简称LFY)同源基因是一个调控植物花分生组织和花器官形成的特征基因,它是启动开花的枢纽,而且还可防止花分生组织的逆转。本文分别利用软件Vector NTI software(I nvitrog en)和MEGA5.1对36种植物LFY基因编码的氨基酸序列特征、... LEAFY(简称LFY)同源基因是一个调控植物花分生组织和花器官形成的特征基因,它是启动开花的枢纽,而且还可防止花分生组织的逆转。本文分别利用软件Vector NTI software(I nvitrog en)和MEGA5.1对36种植物LFY基因编码的氨基酸序列特征、系统进化等进行分析,结果表明,其蛋白质平均含有397个氨基酸,分子量为44.35 kDa,等电点为7.32;多序列比对显示它们有37个完全保守的氨基酸残基,另外还存在丙氨酸、赖氨酸、组氨酸等氨基酸富集区;系统进化显示裸子植物与单子叶植物聚为一类,后与双子叶植物聚在同一进化树中。上述研究不仅对植物成花机理的研究具有重要的参考价值,而且为植物花发育以及早花早果奠定了理论基础。 展开更多

关键词 LFY同源基因 系统进化 表达 功能

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枣AGL6基因的克隆及表达分析 被引量：4

6

作者 牟村 魏琦琦 +3 位作者 何潇 邹锋 张伟健 张琳 《经济林研究》 北大核心 2017年第4期29-35,48,共8页

AGL6基因在植物花器官的发育和花分生组织的形成中起着重要作用。为给探究AGL6基因在枣花发育过程中的功能奠定基础,作者基于其前期研究得到的枣转录组数据,采用RACE技术,从中秋酥脆枣中克隆得到了ZjAGL6基因的全长cDNA序列,并用实时荧... AGL6基因在植物花器官的发育和花分生组织的形成中起着重要作用。为给探究AGL6基因在枣花发育过程中的功能奠定基础,作者基于其前期研究得到的枣转录组数据,采用RACE技术,从中秋酥脆枣中克隆得到了ZjAGL6基因的全长cDNA序列,并用实时荧光定量PCR技术分析了ZjAGL6基因的表达情况。序列分析结果表明,ZjAGL6基因编码区的序列长度为750 bp,共编码250个氨基酸;ZjAGL6具有保守的MADS-box和K-box两个结构域,该基因属于MADS-box基因家族中的TypeⅡ基因。系统进化分析发现,枣ZjAGL6与苹果MdAGL6的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析结果表明,ZjAGL6基因在枣花和枣果中均有表达,但在枣吊、枣嫩叶和枣根中几乎不表达;在枣花发育过程中大量表达,其在大蕾期的表达量最高。 展开更多

关键词 枣 转录组 AGL6基因 基因克隆 基因表达

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基于RNA-Seq的杜仲转录组微卫星特征分析 被引量：2

7

作者 冯延芝 李芳东 +4 位作者 魏琦琦 莫文娟 王璐 黄地歌 傅建敏 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期68-79,共12页

对杜仲(Eucommia ulmoides)国审良种‘华仲6号’和‘华仲10号’花后70和160d的种仁共4个样本进行转录组测序,对测序数据进行组装和功能注释分类,并对转录组获得的单基因簇(unigene)进行微卫星特征分析。利用新一代高通量测序技术Illumin... 对杜仲(Eucommia ulmoides)国审良种‘华仲6号’和‘华仲10号’花后70和160d的种仁共4个样本进行转录组测序,对测序数据进行组装和功能注释分类,并对转录组获得的单基因簇(unigene)进行微卫星特征分析。利用新一代高通量测序技术Illumina HiSeq^(TM)2000对杜仲样品进行转录组测序,采用软件Trinity进行组装;利用BLAST软件将unigene序列分别与Nr、GO、COG和KEGG等数据库比对分析;利用MISA软件对转录组的96 469条unigenes进行SSR搜索。结果表明:转录组测序分析,共得到72 791 399个高质量的序列读取片段(Clean reads),包含了14 702 548 161个的碱基序列(bp)信息。对reads进行序列组装,共获得96 469个平均长度为690bp的unigene,序列信息量达到了66.56 Mb。同源性分析结果显示,有49 856个与其它物种同源的unigenes得到注释,占All-unigene的51.68%。将杜仲转录组中的unigene与GO数据库进行比对分析,根据其功能可将注释到的38 983条unigene分成3大类(细胞组分、分子功能和生物学过程)56个分支;根据COG功能可将注释的14 796条unigene基因划分成25个类别;KEGG数据库作为参照,可将注释到的11 260条unigene定位到117个代谢途径分支;SSR位点搜索结果显示,96 469条unigenes中共包含9 621个完整型SSR位点,占总SSR位点的84.14%。完整型SSR位点共包含55种重复基元,其中出现频率最高的重复基序类型为单核苷酸重复中的A/T(4 597个),其次是AG/CT(2 597个)、AT/AT(439个)。 展开更多

关键词 杜仲 转录组 转录组测序 单基因簇 SSR

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呼和浩特地区青少年儿童近视情况调查分析

8

作者 郭雅惠 陈才 +6 位作者 王广龙 魏琦琦 张欣然 石洪伟 吴洪林 赵浩宇 奥晓静 《中国中医药现代远程教育》 2020年第13期71-73,共3页

目的了解并分析呼和浩特青少年儿童近视情况,为国内青少年儿童近视情况提供参考数据。方法针对呼和浩特中小学生及其家长共发放280份网络问卷调查,回收有效调查问卷235份。结果 84%的青少年有近视眼,是由于经常看电视、看画本、看书写字... 目的了解并分析呼和浩特青少年儿童近视情况,为国内青少年儿童近视情况提供参考数据。方法针对呼和浩特中小学生及其家长共发放280份网络问卷调查,回收有效调查问卷235份。结果 84%的青少年有近视眼,是由于经常看电视、看画本、看书写字,长期近距离视物,导致眼睛睫状肌紧张,晶状体变形,引起近视。有80.11%的青少年用眼一次性超过1小时,更有29.11%的青少年一次性用眼超过2个小时以上。青少年儿童近视度数在150~250处于高峰期,此阶段是属于轻度近视,容易矫正,若在此时及时进行治疗,矫正周期较短,预后也相对较好。有近九成家长及青少年认为近视会影响他们正常的社交活动。有69.62%的家长及青少年认为眼保健操对近视有预防作用,并愿意接受中医推拿治疗近视。结论对患有近视的青少年儿童来说,穴位推拿治疗是青少年及其家长公认首选预防及治疗近视的方法。 展开更多

关键词 青少年 近视 调查问卷

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枣转录组序列的微卫星特征分析 被引量：16

9

作者 魏琦琦 林青 +3 位作者 贾宝光 吴炼 李承想 张琳 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期93-97,139,共5页

运用Illumina测序平台的RNA-seq技术对中秋酥脆枣的花、果实和枣吊进行了转录组测序,并对测序获得的Unigene进行微卫星特征分析。经序列组装和拼接,共获得34 587个Unigene,运用Misa软件分析发现12 624个微卫星。在所得转录组序列的单碱... 运用Illumina测序平台的RNA-seq技术对中秋酥脆枣的花、果实和枣吊进行了转录组测序,并对测序获得的Unigene进行微卫星特征分析。经序列组装和拼接,共获得34 587个Unigene,运用Misa软件分析发现12 624个微卫星。在所得转录组序列的单碱基至五碱基微卫星中,以单碱基微卫星最多(6 314个,50.02%),并以A/T(6 217个,98.46%)为主要重复单元;二碱基微卫星(3 335个,26.42%)次之,其中以AG/CT(2532个,75.92%)类型最多;再次是三碱基微卫星(2 871个,22.74%);最后是四碱基和五碱基微卫星,二者仅占所有微卫星信息的0.82%。单碱基微卫星所占比例最多,为枣最优势微卫星,而且其重复单元次数的变化明显高于其他重复类型,表明单碱基在整个枣转录组中变异最为活跃。 展开更多

关键词 枣 转录组测序 RNA 测序 微卫星特征

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适于转录组测序的枣不同器官总RNA提取方法筛选 被引量：12

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作者 魏琦琦 冯延芝 +2 位作者 林青 贾宝光 张琳 《经济林研究》 北大核心 2015年第2期63-67,共5页

为获得适用于转录组测序的枣花、结果枝和果实的总RNA提取方法,以中秋酥脆枣为材料,比较分析了Ambiogen和Autolab 2种总RNA提取试剂盒和基于Autolab试剂盒改良的CTAB法的总RNA的提取效果。结果表明:3种方法提取RNA的OD260/OD280差别不大... 为获得适用于转录组测序的枣花、结果枝和果实的总RNA提取方法,以中秋酥脆枣为材料,比较分析了Ambiogen和Autolab 2种总RNA提取试剂盒和基于Autolab试剂盒改良的CTAB法的总RNA的提取效果。结果表明:3种方法提取RNA的OD260/OD280差别不大,但用2种试剂盒提取的RNA有降解,其中Ambiogen试剂盒提取的花、结果枝和果实3个器官的RNA质量浓度分别为126、284和222 ng/μL;Autolab试剂盒提取的RNA质量浓度分别为307、402和266 ng/μL;基于Autolab试剂盒改良的CTAB法提取的RNA质量浓度分别为401、417和296 ng/μL。与2种试剂盒相比,基于Autolab试剂盒改良的CTAB法提取出来的RNA完整性好、纯度和浓度高,能够满足转录组测序的要求。 展开更多

关键词 中秋酥脆枣 转录组测序 RNA提取 RNA完整性

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枣抑制消减cDNA文库构建与分析 被引量：2

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作者 魏琦琦 段经华 +2 位作者 冯延芝 李芳东 张琳 《经济林研究》 北大核心 2016年第4期20-24,共5页

枣树具有独特的开花结果特性，为获得枣花发育基因，以金丝4号枣不同发育时期的花蕾和同时期的叶片cDNA互为试验方和驱动方，利用抑制消减杂交技术分别构建了枣花和枣叶抑制消减杂交cDNA文库（SSH文库）。枣花和枣叶SSH文库重组率分别... 枣树具有独特的开花结果特性，为获得枣花发育基因，以金丝4号枣不同发育时期的花蕾和同时期的叶片cDNA互为试验方和驱动方，利用抑制消减杂交技术分别构建了枣花和枣叶抑制消减杂交cDNA文库（SSH文库）。枣花和枣叶SSH文库重组率分别是92．05％和90．26％，插入片段长度均介于200～2000bp之间，主要集中于1000bp左右。分别从枣花和枣叶SSH文库中随机挑选1000个阳性克隆进行DNA测序、组装拼接，结果显示枣花SSH文库中获得96条unigene，其中contigs43个，singletons53个，96条unigene预测得到73个ORF，经过同源比对分析获得有注释的序列20条，按功能分为7类；枣叶SSH文库中获得86条unigene，其中contigs45个，singletons41个，86条unigene预测得到70个ORF，经过同源比对分析获得有23条注释的序列，按功能分为6类。 展开更多

关键词 枣 抑制消减杂交 CDNA文库 生物信息学分析 功能注释

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