摘要
时空组学技术通过在连续的空间和时间维度内检测器官、组织和细胞内的遗传分子特征,可以在多个组学水平解析生命现象的调控机制。多组学包括基因组、表观组、转录组和蛋白组等。本文介绍了时空组学技术的技术分类、原理和特点,简述了时空组学数据的分析策略和方案,回顾了时空组学技术在发育生物学、癌症生物学、神经科学和植物学领域的研究进展,并展望了时空组学未来的发展发向。
Spatiotemporal omics technology facilitates the examination of genetic and molecular characteristics within organs,tissues,and cells across both spatial and temporal dimensions,thereby enabling the elucidation of regulatory mechanisms at multiple omics levels,including the genome,epigenome,transcriptome,and proteome.This work provides an overview of the technical classifications,underlying principles,and distinctive features of spatiotemporal omics technology.Additionally,it delineates the bioinformatics strategies and methodologies for processing spatiotemporal omics data.The work also encompasses recent advancements in the application of spatiotemporal omics technology within the field of developmental biology,cancer biology,neuroscience and botany,and provides an outlook on the future development of spatiotemporal omics.
作者
冯静
夏骏
张哲玮
刘龙奇
姜宇佳
FENG Jing;XIA Jun;ZHANG Zhewei;LIU Longqi;JIANG Yujia(BGI Research,Hangzhou 310030,China)
出处
《生命的化学》
CAS
2024年第10期1791-1805,共15页
Chemistry of Life
基金
国家重点研发计划-前沿生物技术(2022YFC3400405)
科技创新2030-“脑科学与类脑研究”重大项目(2021ZD0200100)
深圳市优秀科技创新人才培养项目(RCYX20200714114644191)。
关键词
时空组学
空间转录组学
发育生物学
癌症生物学
神经科学
植物学
spatiotemporal omics
spatial transcriptomics
developmental biology
cancer biology
neuroscience
botany
