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几个地方鸡种MHCB-G座位克隆与生物信息学分析 被引量:1

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摘要 本研究利用PCR和克隆测序方法,克隆新狼山鸡和仙居鸡MHC B-G基因全序列,分析序列的多态性并预测其蛋白质的结构与功能,为更好地保护地方鸡种提供基础资料。结果表明:分别获得新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G基因6 183 bp和6 415 bp全序列,与红色原鸡同源性达98%,3鸡种存在148个变异位点,为3个单倍型,单倍型多样度为0.07407,仙居鸡在4413-4661位置缺失249 bp;利用生物信息学预测新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G蛋白,该蛋白具有丰富的B细胞抗原位点;新狼山鸡和仙居鸡有明显的跨膜螺旋结构,分别含有138个和98个磷酸化位点;MHC B-G基因具有丰富的遗传多样性,该MHC B-G蛋白可能是抗原位点的富集区,对其进化、抗原递呈作用以及疾病和生产性能的相关性发生重要影响。
出处 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2012年第15期8-11,共4页 Chinese Journal of Animal Science
基金 江苏省自然科学基金(BK2010298) 国家863子课题(2011AA100305) 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-41) 江苏省农业科技支撑项目(BE2010374)
  • 相关文献

参考文献9

二级参考文献48

  • 1殷志祥.蛋白质结构预测方法的研究进展[J].计算机工程与应用,2004,40(20):54-57. 被引量:20
  • 2徐日福,李奎,陈国宏,强巴央宗,莫德林,李长春,樊斌,刘榜.鸡MHC B-LBⅡ新等位基因检测及多态性研究[J].畜牧兽医学报,2005,36(12):1247-1255. 被引量:8
  • 3BENSON D A,KARSCH-MIZRACHI I,LIPMAND J,et al.GenBank:Update[J].Nucl.Acids Res.,2004,32:23-26 被引量:1
  • 4KULIKOVAT,ALDEBERTP,ALTHORPE N,et al.The EMBL Nucleotide Sequence Database[J].Nucl.Acids Res.,2004,32:27-30 被引量:1
  • 5MIYAZAKI S,SUGAWARAH,IKEO K,et al.DDBJ in the Stream of Various Biological Data[J].Nucl.Acids Res.,2004,32:31-34 被引量:1
  • 6BOECKMANN B,BAIROCHA,APWEILER R,et al.The SWISS-PROTProtein Knowledgebase and Its SupplementTrEMBL in 2003[J].Nucl.Acids Res.,2003,31(1):365-370 被引量:1
  • 7WU C H,HUANGH Z,ARMINSKI L,et al.The Protein Information Resource:An Integrated Public Resource of Functional Annota-tion of Proteins[J].Nucl.Acids Res.,2002,30(1):35-37 被引量:1
  • 8MULDER NJ,APWEILER R,ATTWOODTK,et al.The InterPro Database,Brings Increased Coverage and NewFeatures[J].Nucl.Acids Res.,2003,31(1):315-318 被引量:1
  • 9WESTBROOK J,FENG Z K,CHENL,et al.The Protein Data Bank and Structural Genomics[J].Nucl.Acids Res.,2003,31(1):489-491 被引量:1
  • 10HAMOSHA,SCOTTA F,AMBERGER J,et al.Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM),a Knowledgebase of Human Genes and Genetic Disorders[J].Nucl.Acids Res.,2003,30(1):52-55 被引量:1

共引文献36

同被引文献3

引证文献1

二级引证文献3

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