为了对梨PbrGH3基因家族的功能进行深入研究,本研究利用生物信息学方法对梨PbrGH3基因家族进行鉴定和分析。结果表明:基于梨全基因组数据共鉴定出10个PbrGH3家族成员,编码氨基酸长度在596~614 aa之间,分子量在67.34~69.71 k D之间,等电...为了对梨PbrGH3基因家族的功能进行深入研究,本研究利用生物信息学方法对梨PbrGH3基因家族进行鉴定和分析。结果表明:基于梨全基因组数据共鉴定出10个PbrGH3家族成员,编码氨基酸长度在596~614 aa之间,分子量在67.34~69.71 k D之间,等电点在5.23~7.14之间,酸性蛋白较多,所有成员均为不稳定的亲水性蛋白且均在细胞质中起主要作用。二级结构分析发现无规则卷曲所占比例最高。系统进化树分析后将10个PbrGH3成员分成了3大类,分析保守基序和基因结构后发现,全部成员均包括所预测的10个motif且均包含3~4个CDS,同一分类下的成员基因结构一致,PbrGH3基因保守度较高。启动子分析结果表明,PbrGH3基因更多地参与到与激素和光反应相关的植物活动中。通过对‘砀山酥梨’果实不同发育期的表达分析发现PbrGH3-5在果实发育过程中起到了重要作用。本研究初步分析梨PbrGH3基因家族成员的特征和功能,为后期深入研究提供了参考依据。展开更多
文摘为了对梨PbrGH3基因家族的功能进行深入研究,本研究利用生物信息学方法对梨PbrGH3基因家族进行鉴定和分析。结果表明:基于梨全基因组数据共鉴定出10个PbrGH3家族成员,编码氨基酸长度在596~614 aa之间,分子量在67.34~69.71 k D之间,等电点在5.23~7.14之间,酸性蛋白较多,所有成员均为不稳定的亲水性蛋白且均在细胞质中起主要作用。二级结构分析发现无规则卷曲所占比例最高。系统进化树分析后将10个PbrGH3成员分成了3大类,分析保守基序和基因结构后发现,全部成员均包括所预测的10个motif且均包含3~4个CDS,同一分类下的成员基因结构一致,PbrGH3基因保守度较高。启动子分析结果表明,PbrGH3基因更多地参与到与激素和光反应相关的植物活动中。通过对‘砀山酥梨’果实不同发育期的表达分析发现PbrGH3-5在果实发育过程中起到了重要作用。本研究初步分析梨PbrGH3基因家族成员的特征和功能,为后期深入研究提供了参考依据。
