应用RSAP、SRAP和SSR分析苎麻种质亲缘关系 被引量：19

1

作者 邹自征 陈建华 +5 位作者 栾明宝 郭劲霞 王超 王晓飞 许英 孙志民 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期840-847,共8页

分别采用RSAP、SRAP和SSR3种分子标记和田间性状对16份苎麻种质进行亲缘关系聚类,结果表明,每对引物扩增出的多态性位点,SRAP标记最多,RSAP次之,SSR较少;根据SRAP标记和RSAP标记分类的结果都与RSAP+SRAP+SSR联合分类的结果基本一致,相... 分别采用RSAP、SRAP和SSR3种分子标记和田间性状对16份苎麻种质进行亲缘关系聚类,结果表明,每对引物扩增出的多态性位点,SRAP标记最多,RSAP次之,SSR较少;根据SRAP标记和RSAP标记分类的结果都与RSAP+SRAP+SSR联合分类的结果基本一致,相关达到了极显著水平,而与SSR标记分类结果差异较大;分子标记聚类结果与田间性状的聚类结果接近程度,依次为SRAP+RSAP+SSR>SRAP>RSAP>>SSR。在检测苎麻种质亲缘关系中,SRAP标记效果最优,RSAP标记稍逊,SSR标记最差。RSAP标记能较好地显示苎麻种属间的多态性和亲缘关系。以RSAP、SRAP、SSR标记联合分析,能更好地揭示种质之间的亲缘关系。 展开更多

关键词 苎麻 RSAP SRAP SSR 亲缘关系

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苎麻核心种质构建方法 被引量：15

2

作者 栾明宝 陈建华 +2 位作者 许英 王晓飞 孙志民 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期2099-2106,共8页

选用国家长沙苎麻圃的790份种质资源,在已有的25个性状数据的基础上,采用不同取样方法、不同系统聚类方法、不同遗传距离方法构建苎麻核心种质,用质量性状的多样性指数均值、表型保留比率均值和数量性状均值差异百分率、方差差异百分率... 选用国家长沙苎麻圃的790份种质资源,在已有的25个性状数据的基础上,采用不同取样方法、不同系统聚类方法、不同遗传距离方法构建苎麻核心种质,用质量性状的多样性指数均值、表型保留比率均值和数量性状均值差异百分率、方差差异百分率、极差符合率和变异系数变化率等6个指标评价不同方法组合(取样方法、聚类方法、遗传距离)构建核心种质的优劣。选出合适的构建方法,构建苎麻核心种质。结果表明,不同的取样方法对质量性状和数量性状的遗传多样性影响不同,就质量性状的最大遗传多样性而言,选择优先取样+多次聚类随机取样方法比较适宜,而对数量性状的最大遗传多样性而言,选择优先取样+多次聚类变异度取样方法则较适宜。用优先取样+多次聚类随机取样方法取样时,采用最短距离法和重心法构建的核心种质最好,用优先取样+多次聚类变异度取样时,采用离差平方和法则是构建苎麻核心种质的最佳聚类方法。苎麻核心种质构建与质量性状的不同遗传距离无关,但数量性状以欧氏距离最佳。 展开更多

关键词 苎麻 核心种质 取样方法 聚类方法 遗传距离

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棉花第14染色体分子标记连锁群的构建及其应用 被引量：3

3

作者 栾明宝 郭香墨 +2 位作者 张永山 姚金波 陈保锋 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2009年第3期196-200,共5页

利用置换系CSB14Sh与TM-1杂交产生F2分离群体,以SSR标记构建连锁图对置换系进行分子鉴定。利用从覆盖全基因组的3800对引物筛选出的15对多态性引物对群体进行扩增,产生23个分子标记位点。其中,21个分子标记进入了同1个连锁群。通过与前... 利用置换系CSB14Sh与TM-1杂交产生F2分离群体,以SSR标记构建连锁图对置换系进行分子鉴定。利用从覆盖全基因组的3800对引物筛选出的15对多态性引物对群体进行扩增,产生23个分子标记位点。其中,21个分子标记进入了同1个连锁群。通过与前人的分子图谱比较,把该连锁群定位在第14染色体上。表明TM-1与CSB14Sh在第14条染色体上有差异,而在其它染色体上没有差异。再结合染色体置换系构建的过程,可以认为CSB14Sh确实为第14条染色体短臂的置换系。 展开更多

关键词 陆地棉 染色体置换系 分子标记 SSR

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苎麻种质资源核心种质构建 被引量：3

4

作者 陈建华 栾明宝 +4 位作者 许英 王晓飞 孙志民 邹自征 熊和平 《中国麻业科学》 2011年第2期59-64,共6页

选用国家长沙苎麻圃的790份种质资源,在已有的25个性状数据的基础上,采取优先取样+多次聚类变异度取样方法,利用离差平方和法的聚类方法,无序质量性状采用simplematching,有序质量性状和数量性状采用欧氏距离,在20%的抽样水平下,构建了... 选用国家长沙苎麻圃的790份种质资源,在已有的25个性状数据的基础上,采取优先取样+多次聚类变异度取样方法,利用离差平方和法的聚类方法,无序质量性状采用simplematching,有序质量性状和数量性状采用欧氏距离,在20%的抽样水平下,构建了158份苎麻核心种质。构建的核心种质的质量性状多样性指数均值、数量性状方差差异百分率、变异系数变化率均高于原种质,极差符合率100%;质量性状的性状频率分布与原种质有差异的性状为12.5%;原种质的各数量性状间的相关性共适应基因系统基本上在核心种质中得到保留。构建的核心种质可以很好的代表原种质的遗传多样性。 展开更多

关键词 苎麻 核心种质 抽样方法 聚类方法 遗传距离

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苎麻纤维发育相关基因FB27表达与纤维细度相关研究 被引量：3

5

作者 栾明宝 秦占军 +3 位作者 陈建华 王晓飞 许英 孙志民 《中国麻业科学》 2009年第6期339-343,共5页

利用半定量RT-PCR技术研究了纤维蛋白FB27基因在不同组织、不同基因型和不同时期的茎皮中的表达情况。结果表明,苎麻FB27基因的表达不具有组织特异性,但在苎麻纤维组织高度发达、纤维组成成分最多的茎部表达量最高,尤其是茎皮;在高纤维... 利用半定量RT-PCR技术研究了纤维蛋白FB27基因在不同组织、不同基因型和不同时期的茎皮中的表达情况。结果表明,苎麻FB27基因的表达不具有组织特异性,但在苎麻纤维组织高度发达、纤维组成成分最多的茎部表达量最高,尤其是茎皮;在高纤维细度种质中相对表达量较高,在低纤维细度种质中相对表达量较低;在不同的生长季FB27基因的相对表达量为:头麻>三麻>二麻。在同季麻不同生长发育时期,伸长增粗期FB27基因的相对表达量较高,苗期和工艺成熟期较低。苎麻纤维发育相关基因FB27的表达程度与纤维细度表现出正相关。 展开更多

关键词 苎麻 纤维细度 RT-PCR 纤维发育相关基因

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BE-91菌株木聚糖酶活力测定条件的优化 被引量：3

6

作者 张居作 徐君飞 +7 位作者 陈汉忠 刘正初 戴良英 段盛文 冯湘沅 郑科 成莉凤 郑霞 《湖北农业科学》 北大核心 2010年第4期950-953,共4页

采用单因素试验法和正交试验法对BE-91菌株木聚糖酶活力测定条件进行系统研究,获得优化的木聚糖酶活力测定条件为:按1/9的比值添加稀释100倍的木聚糖酶与预热至62℃的浓度为0.8%的木聚糖底物(用pH值5.4～5.6的0.1mol/L柠檬酸-柠檬酸钠... 采用单因素试验法和正交试验法对BE-91菌株木聚糖酶活力测定条件进行系统研究,获得优化的木聚糖酶活力测定条件为:按1/9的比值添加稀释100倍的木聚糖酶与预热至62℃的浓度为0.8%的木聚糖底物(用pH值5.4～5.6的0.1mol/L柠檬酸-柠檬酸钠缓冲溶液配制),62℃水浴准确反应3min,加入2.0mLDNS溶液,沸水浴显色10min,测定波长为540nm。在此优化条件下,测得BE-91菌株木聚糖酶活力达350.24U/mL。 展开更多

关键词 正交试验法 木聚糖酶活力 优化 测定条件

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甘露聚糖酶基因3′端缺失研究 被引量：1

7

作者 王溪森 刘正初 +4 位作者 李斌 冯湘沅 段盛文 郑科 成莉凤 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第8期3496-3497,3579,共3页

[目的]初步研究甘露聚糖酶基因3′端对甘露聚糖酶功能的重要性。[方法]以甘露聚糖酶的二级结构为基础,用PCR扩增的方法获得3′端特异性缺失的甘露聚糖酶DNA片段,连接到载体上,表达并鉴定酶的活性。[结果]删除甘露聚糖酶基因3′端246 bp... [目的]初步研究甘露聚糖酶基因3′端对甘露聚糖酶功能的重要性。[方法]以甘露聚糖酶的二级结构为基础,用PCR扩增的方法获得3′端特异性缺失的甘露聚糖酶DNA片段,连接到载体上,表达并鉴定酶的活性。[结果]删除甘露聚糖酶基因3′端246 bp后甘露聚糖酶依然具有酶活性。[结论]甘露聚糖酶基因3′端的部分序列不是酶具有功能所必需的。 展开更多

关键词 甘露聚糖酶 序列 删除

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草本纤维提取专用复合酶工程菌株的构建

8

作者 王溪森 刘正初 +4 位作者 李斌 冯湘沅 段盛文 郑科 成莉凤 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第9期3928-3930,3935,共4页

[目的]研究如何构建草本纤维提取工程菌株。[方法]用PCR扩增的方法获得甘露聚糖酶、果胶酶和木聚糖酶DNA片段,连到载体上,获得单质酶表达载体,依次将单质酶载体转入大肠杆菌JM109中,使其共存于同一宿主细胞。[结果]获得了一个果胶酶新基... [目的]研究如何构建草本纤维提取工程菌株。[方法]用PCR扩增的方法获得甘露聚糖酶、果胶酶和木聚糖酶DNA片段,连到载体上,获得单质酶表达载体,依次将单质酶载体转入大肠杆菌JM109中,使其共存于同一宿主细胞。[结果]获得了一个果胶酶新基因(EU597234);得到了能同时产甘露聚糖酶、果胶酶、木聚糖酶3种酶的复合酶工程菌株。[结论]草本纤维生物提取是一个复杂的生物反应过程,构建草本纤维提取菌株既要考虑菌株所产的酶又要考虑菌株本身的生物学特性。 展开更多

关键词 草本纤维 生物提取 菌株 果胶酶

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甘露聚糖酶3′序列缺失与酶功能间的关系初探

9

作者 王溪森 刘正初 +4 位作者 李斌 冯湘沅 段盛文 郑科 成莉凤 《湖北农业科学》 北大核心 2009年第3期524-526,共3页

初步研究了3′端对甘露聚糖酶的功能重要性,即以甘露聚糖酶的二级结构为基础,用PCR扩增的方法获得3′端特异性缺失的甘露聚糖酶DNA片段,连接到载体上,表达并鉴定酶的活性。结果表明,删除390bp依然具有酶活性,3′端的部分序列不是酶具有... 初步研究了3′端对甘露聚糖酶的功能重要性,即以甘露聚糖酶的二级结构为基础,用PCR扩增的方法获得3′端特异性缺失的甘露聚糖酶DNA片段,连接到载体上,表达并鉴定酶的活性。结果表明,删除390bp依然具有酶活性,3′端的部分序列不是酶具有功能所必需的。 展开更多

关键词 甘露聚糖酶 序列 删除

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欧文氏菌T85-166果胶酶基因克隆与序列分析 被引量：8

10

作者 李琦 戴小阳 +3 位作者 刘正初 谢达平 王文芳 宋娟 《湖南农业科学》 2009年第7期8-10,共3页

根据果胶酶Pel基因在欧文氏菌基因组上的分布特点,通过合理设计引物,从欧文氏菌株T85-166克隆出3个果胶酶Pel基因(Pel-1、Pel-2和Pel-3),它们分别编码372、373和374个氨基酸。序列分析表明,Pel-1前105及后100个氨基酸序列与Pel-2完全相... 根据果胶酶Pel基因在欧文氏菌基因组上的分布特点,通过合理设计引物,从欧文氏菌株T85-166克隆出3个果胶酶Pel基因(Pel-1、Pel-2和Pel-3),它们分别编码372、373和374个氨基酸。序列分析表明,Pel-1前105及后100个氨基酸序列与Pel-2完全相同,但与Pel-3有较大差异,而中间170个左右的氨基酸序列与Pel-3则高度相似。初步构建了3个Pel基因的工程菌。 展开更多

关键词 果胶酶 果胶酸裂解酶 欧文氏菌 克隆 PCR

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木聚糖酶高产菌株BE-91发酵工艺的优化 被引量：6

11

作者 徐君飞 刘正初 +7 位作者 张居作 戴良英 陈汉忠 段盛文 冯湘沅 郑科 成莉凤 郑霞 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2009年第B12期247-251,共5页

采用因素轮换试验设计和均匀试验设计对现有枯草芽孢杆菌BE-91菌株的发酵工艺进行系统研究,获得木聚糖酶高产的优化发酵工艺为:国产胰蛋白胨1.5%,国产酵母膏0.05%,牛肉膏0.3%,KH2PO40.2%,MgSO40.03%,NaCl 0.5%,吐温80 0.4%,起始pH9.2,... 采用因素轮换试验设计和均匀试验设计对现有枯草芽孢杆菌BE-91菌株的发酵工艺进行系统研究,获得木聚糖酶高产的优化发酵工艺为:国产胰蛋白胨1.5%,国产酵母膏0.05%,牛肉膏0.3%,KH2PO40.2%,MgSO40.03%,NaCl 0.5%,吐温80 0.4%,起始pH9.2,摇瓶装液量150 mL/500 mL,接种量3.5%,转速180 r/min,发酵温度37℃。在优化发酵工艺条件下培养BE-91菌株8 h,发酵液木聚糖酶活力达到423.24 U/mL,是优化前酶活力的1.5倍。BE-91菌株在国内已报道菌株中具有发酵周期短、耐热酸性木聚糖酶活力高的特点。 展开更多

关键词 均匀试验设计 木聚糖酶 酶活力 发酵工艺

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枯草芽孢杆菌BE-91菌株木聚糖酶对小鼠的免疫原性试验 被引量：1

12

作者 张居作 徐君飞 +3 位作者 陈汉忠 刘正初 戴良英 黄维义 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期180-184,共5页

利用纯化的木聚糖酶免疫SPF小白鼠,收集血清样品,以建立的ELISA方法检测血清样品中的IgG水平、IFN-γ和IL-4含量,利用SPSS软件对结果进行分析。发现试验组IgG水平与阴性组、空白组有极显著差异(P<0.01),空白组与阴性组无显著差异(P&g... 利用纯化的木聚糖酶免疫SPF小白鼠,收集血清样品,以建立的ELISA方法检测血清样品中的IgG水平、IFN-γ和IL-4含量,利用SPSS软件对结果进行分析。发现试验组IgG水平与阴性组、空白组有极显著差异(P<0.01),空白组与阴性组无显著差异(P>0.05);试验组IFN-γ含量与阴性组、空白组和阳性组有极显著差异,阳性组与阴性组、空白组有极显著差异,空白组与阴性组无显著差异;试验组IL-4含量与阳性组无显著差异,与阴性组、空白组有极显著差异,空白组与阴性组无显著差异。结果证明,BE-91菌株分泌的木聚糖酶具有良好的免疫原性和反应原性,能刺激机体启动细胞免疫和体液免疫。 展开更多

关键词 木聚糖酶 酶联免疫吸附试验 免疫原性

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