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胃癌相关基因COL1A2、FN1、COL6A3预后分析 被引量:6
1
作者 姚远 李胜昔 《解剖科学进展》 2019年第5期525-527,531,共4页
目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采... 目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采用GEO在线分析工具GEO2R分析数据,选取TOP250,输出差异表达基因,并通过在线生物信息学绘制韦恩图,获得共有差异基因;通过KM plotter数据库的应用分析COL1A2、FN1、 COL6A3与预后的关系。结果通过分析GSE2685、GSE19826、GSE79973芯片数据,共获得6个共表达基因,利用差异倍数作图,选取差异倍数在2倍以上的基因COL1A2、FN1、COL6A3进行分析,KM plotter数据库的分析显示COL1A2、FN1、COL6A3与胃癌的总生存期成负相关。结论 COL1A2、FN1、COL6A3在胃癌组织中表达高于癌旁组织,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。 展开更多
关键词 胃癌 预后 KM plotter数据库 COL1A2 FN1 COL6A3
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基于Oncomine数据库分析COL5A2基因在胰腺癌中的表达及其临床意义 被引量:4
2
作者 李萍 刘怡茜 《生物技术通讯》 CAS 2020年第4期461-466,共6页
目的:探讨COL5A2基因在胰腺癌中的表达及临床意义。方法:收集Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库中关于COL5A2的信息,对目前数据库中的资料进行二次分析,并对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析,利用Kaplan-Meier Plotte... 目的:探讨COL5A2基因在胰腺癌中的表达及临床意义。方法:收集Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库中关于COL5A2的信息,对目前数据库中的资料进行二次分析,并对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析COL5A2与胰腺癌患者预后的关系。结果:Oncomine数据库中共收集了417项不同类型的研究,其中COL5A2高表达有75项研究,低表达有3项研究。共有7项研究涉及COL5A2在胰腺癌组织与正常组织中的表达,包括178例样本,与正常组织相比,COL5A2在胰腺癌组织中高表达(P<0.05)。NCBI/GEO Profiles数据库分析同样发现COL5A2在胰腺癌组织中高表达(P<0.05),与达沙替尼(dasatinib)敏感细胞株相比,达沙替尼耐药细胞株中COL5A2表达升高,进一步分析发现TGF-β处理48 h后COL5A2表达升高。Kaplan-Mei⁃er Plotter数据库分析表明COL5A2高、低表达组胰腺癌患者的总体生存率(OS)无统计学差异(HR=1.45,95%CI:0.96~2.18,P=0.077),但高表达组胰腺癌患者的无复发生存率(RFS)明显差于低表达组(HR=4.13,95%CI:1.46~11.72,P=0.0045)。结论:基于Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库分析发现COL5A2在胰腺癌组织高表达,且与胰腺癌患者的无复发生存及达沙替尼耐药性密切相关,有望成为胰腺癌诊断和治疗的重要靶标。 展开更多
关键词 胰腺癌 COL5A2 Oncomine数据库 NCBI/GEO Profiles数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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卵巢癌组织中lncRNA NORAD的表达水平及其与临床病理特征和预后的相关性 被引量:1
3
作者 隋磊 纪晓宇 +3 位作者 朱晓瑛 杜秀珍 尤师静 姚勤 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第1期152-155,共4页
目的:探讨卵巢癌组织中DNA损伤激活的非编码RNA(non-coding RNA activated by DNA damage,NORAD)的表达水平及其与临床病理特征和预后的相关性。方法:选取2019年至2020年于青岛大学附属医院诊治的50例卵巢癌患者和50例正常卵巢患者的组... 目的:探讨卵巢癌组织中DNA损伤激活的非编码RNA(non-coding RNA activated by DNA damage,NORAD)的表达水平及其与临床病理特征和预后的相关性。方法:选取2019年至2020年于青岛大学附属医院诊治的50例卵巢癌患者和50例正常卵巢患者的组织标本。通过实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)方法检测以上患者组织中NORAD的相对表达水平,并分析NORAD的表达水平与临床病理特征和预后的关系。使用Kaplan-Meier plotter在线数据库评估NORAD的表达与卵巢癌预后的相关性。结果:NORAD在卵巢癌组织中呈高表达,其表达与FIGO分期、组织类型、腹水以及淋巴结转移相关(P<0.05)。NORAD高表达的卵巢癌患者5年无进展生存期(progression-free survival,PFS)显著低于低表达组。NORAD在卵巢癌组织中的表达水平在FIGO分期、病理分级、TP53状态以及化疗方面对患者的预后具有评估价值。结论:卵巢癌组织中NORAD表达水平明显升高,且其水平与卵巢癌临床病理特征及预后相关。 展开更多
关键词 卵巢癌 NORAD 预后 Kaplan-Meier plotter数据库
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基于Kaplan-Meier plotter数据库分析CD_(44)基因表达状态对卵巢癌生存结局的影响 被引量:3
4
作者 郑建清 黄碧芬 《吉林医学》 CAS 2022年第1期5-7,共3页
目的:探讨不同CD_(44)基因表达状态与卵巢癌生存结局的关系。方法:通过Kaplan-Meier plotter数据库检索CD_(44)基因的表达结果与生存数据,分析CD_(44)基因在卵巢癌组织和正常卵巢组织中的表达差异,同时分析不同CD_(44)基因表达分组的总... 目的:探讨不同CD_(44)基因表达状态与卵巢癌生存结局的关系。方法:通过Kaplan-Meier plotter数据库检索CD_(44)基因的表达结果与生存数据,分析CD_(44)基因在卵巢癌组织和正常卵巢组织中的表达差异,同时分析不同CD_(44)基因表达分组的总生存差别。结果:Kaplan-Meier plotter数据库包含了1653个样本,其中5个样本为正常卵巢组织,1648个样本是卵巢癌组织。正常卵巢组织CD_(44)基因表达量为174(91-276),而卵巢癌组织为231(4-4204),但差异无统计学意义(P=0.262)。数据库共记录了655例卵巢癌患者的总生存数据,以表达量172为阈值,低表达组卵巢癌中位总生存时间为35.0个月,而高表达组为47.8个月;差异具有显著统计学意义[风险比HR=0.76,95%CI(0.61-0.93),P=0.0089]。结论:卵巢癌组织中CD_(44)基因的表达与正常卵巢组织相当,但卵巢癌CD_(44)基因高表达提示预后良好,可以提高患者总生存率。 展开更多
关键词 卵巢癌 Kaplan-Meier plotter数据库 CD_(44)基因 基因表达 预后因素
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MMPs基因家族在肺腺癌中的表达及临床意义 被引量:2
5
作者 李珂 王娴 王小琦 《现代医药卫生》 2020年第16期2512-2517,共6页
目的研究基质金属蛋白酶(MMPs)基因家族在肺腺癌中的表达及临床意义。方法检索Oncomine,GEPIA及cBioPortal数据库中有关肺腺癌MMPs(MMP-1/9/11/12/14)的数据集,对数据集进行挖掘并结合文献资料进行荟萃分析。结果Oncomine数据库收集9项... 目的研究基质金属蛋白酶(MMPs)基因家族在肺腺癌中的表达及临床意义。方法检索Oncomine,GEPIA及cBioPortal数据库中有关肺腺癌MMPs(MMP-1/9/11/12/14)的数据集,对数据集进行挖掘并结合文献资料进行荟萃分析。结果Oncomine数据库收集9项研究,943例样本;GEPIA数据库收集830例样本。综合分析发现,肺腺癌组织中MMPs的表达显著高于正常肺组织,差异有统计学意义(P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter生存分析表明,MMPs高表达的肺腺癌患者总体病死率高,预后较差,差异有统计学意义(P<0.05)。cBioPortal数据库显示,MMPs在肺腺癌中的突变发生率达39%,且互为正相关。结论MMPs在肺腺癌组织中呈高表达,并与肺腺癌的预后密切相关,有望成为肺腺癌治疗的重要靶点。 展开更多
关键词 肺腺癌 MMPs基因 Oncomine数据库 GEPIA数据库 cBioPortal数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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基于Oncomine数据库研究钙黏附蛋白11基因在胃癌中的表达及意义 被引量:2
6
作者 余超 李晟 +2 位作者 曾永庆 程元光 何磊 《安徽医药》 CAS 2022年第2期356-359,共4页
目的研究钙黏附蛋白11(Cadherin11,CDH11)基因在胃癌中的表达并探讨其表达差异与预后的关系。方法通过Oncomine数据库探索CDH11在胃癌中的表达变化;应用在线数据库及分析工具“the Kaplan Meier plotter”(KM plotter)数据库探索CDH11... 目的研究钙黏附蛋白11(Cadherin11,CDH11)基因在胃癌中的表达并探讨其表达差异与预后的关系。方法通过Oncomine数据库探索CDH11在胃癌中的表达变化;应用在线数据库及分析工具“the Kaplan Meier plotter”(KM plotter)数据库探索CDH11在胃癌的预后评判价值。结果Oncomine数据库中共有445个涉及不同种类类型肿瘤的研究结果。其中有66项研究结果关于CDH11表达差异有统计学意义(P<0.05),59项研究结果显示CDH11的表达增高,7项研究结果显示CDH11的表达降低。共有85项研究,8个数据子集涉及CDH11在胃癌和正常组织中的表达,共478个样本,均显示CDH11在胃癌中的表达较正常组织明显增高。另外,KM plotter数据库的分析显示CDH11水平与胃癌病人的总生存时间呈负相关。结论与正常组织比较,CDH11的表达水平在胃癌组织中明显增高,且与胃癌病人生存预后相关,CDH11有望成为胃癌靶向治疗药物的重要靶点。 展开更多
关键词 钙黏着糖蛋白类 胃肿瘤 Oncomine数据库 钙黏附蛋白11 Kaplan-Meier plotter数据库
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基于Oncomine数据库分析Pygopus2基因在乳腺癌组织中的表达及其临床意义 被引量:3
7
作者 李开国 王茹月 +1 位作者 杨晓慧 曲颂 《中国癌症防治杂志》 CAS 2018年第6期449-453,共5页
目的探讨Pygopus2(PYGO2)基因在乳腺癌组织中的表达及临床意义。方法收集Oncomine数据库中关于PYGO2的信息,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析PYGO2与乳腺癌患者预后的关系。结果 Oncomine数据库中共收集了45项研究(包括3 730个样本)... 目的探讨Pygopus2(PYGO2)基因在乳腺癌组织中的表达及临床意义。方法收集Oncomine数据库中关于PYGO2的信息,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析PYGO2与乳腺癌患者预后的关系。结果 Oncomine数据库中共收集了45项研究(包括3 730个样本)涉及PYGO2在乳腺癌组织和正常组织中表达的比较。与正常组织相比,PYGO2在乳腺癌组织中高表达(P<0.05)。PYGO2高表达组乳腺癌患者的总体生存率(HR=0.69,95%CI:0.51~0.95,P=0.021)、无复发生存率(HR=0.60,95%CI:0.51~0.70,P<0.001)以及无远处转移生存率(HR=0.61,95%CI:0.43~0.87,P=0.005)均优于低表达组。结论 PYGO2在乳腺癌组织中高表达,且与乳腺癌患者不良预后有关,可能是评估乳腺癌患者预后的潜在生物标志物。 展开更多
关键词 乳腺癌 Pygopus2 Oncomine数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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ELF5在乳腺癌的表达及意义 被引量:3
8
作者 齐佳瑞 肖琼 +1 位作者 杨坤 张红艳 《解剖科学进展》 2019年第2期190-192,共3页
目的研究E74-like factor 5 (ELF5)在乳腺癌的表达,探讨ELF5的表达与不同分型乳腺癌预后的关系。方法利用Oncomine数据库挖掘ELF5在乳腺癌组织中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析ELF5表达水平与雌激素受体阳性/阴性表达乳腺癌生存... 目的研究E74-like factor 5 (ELF5)在乳腺癌的表达,探讨ELF5的表达与不同分型乳腺癌预后的关系。方法利用Oncomine数据库挖掘ELF5在乳腺癌组织中的表达;利用Kaplan-Meier Plotter分析ELF5表达水平与雌激素受体阳性/阴性表达乳腺癌生存的关系。结果 Oncomine数据库分析ELF5在乳腺癌中表达降低(P=8.29e^(-10));KM plotter数据库分析结果显示ELF5表达量与雌激素受体阳性表达的乳腺癌无复发生存(RFS)呈正相关,即高表达ELF5的患者无复发生存较高(P=0.008)。结论 ELF5在乳腺癌组织中表达低于癌旁正常组织,其表达水平越高预后越好。 展开更多
关键词 乳腺癌 ELF5 Oncomine数据库 KM plotter数据库 预后
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基于Oncomine数据库探究COL1A1基因在胰腺癌中的表达及意义 被引量:1
9
作者 李萍 《生物技术》 CAS 2022年第6期715-720,736,共7页
[目的]探究COL1A1基因在胰腺癌中的表达及临床意义。[方法]收集Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库中关于COL1A1的信息,对目前数据库中资料再次进行分析,并对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析,使用Kaplan-Meier Plotte... [目的]探究COL1A1基因在胰腺癌中的表达及临床意义。[方法]收集Oncomine和NCBI/GEO Profiles数据库中关于COL1A1的信息,对目前数据库中资料再次进行分析,并对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析,使用Kaplan-Meier Plotter在线数据库分析该基因是否与胰腺癌患者的预后相关。[结果]Oncomine数据库中共收集了400项不同类型的研究。其中COL1A1高表达有86项研究,低表达有6项研究。共有8项研究涉及COL1A1在胰腺癌组织与正常组织中的表达,包括209例样本,与正常组织相比,COL1A1在胰腺癌组织中高表达(P<0.05)。NCBI/GEO Profiles数据库分析发现TGF-β处理48 h后COL1A1表达升高。Kaplan-Meier Plotter数据库分析表明COL1A1高、低表达组胰腺癌患者的总体生存率(OS)无统计学差异(HR=1.4,95%CI:0.92~2.12,P=0.11),但高表达组胰腺癌患者的无复发生存(RFS)明显差于低表达组(HR=5.05,95%CI:1.48~17.24,P=0.0044)。[结论]COL1A1基因在胰腺癌组织中的表达明显高于正常组织,低表达患者的RFS延长。可见靶向COL1A1的药物有望改善胰腺癌患者的预后。 展开更多
关键词 胰腺癌 COL1A1 Oncomine数据库 NCBI/GEO Profiles数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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GPX3在胃癌中的表达及临床意义 被引量:2
10
作者 张海平 李蜀豫 《世界华人消化杂志》 CAS 2019年第24期1483-1489,共7页
背景谷胱甘肽过氧化物酶3(glutathione peroxidase 3,GPX3)在胃癌(gastric cancer,GC)中低表达,但其表达与GC患者预后联系尚不明确.目的分析GPX3基因在GC中的表达模式及预后价值.方法首选,利用Oncomine数据库分析GPX3基因在GC及正常胃... 背景谷胱甘肽过氧化物酶3(glutathione peroxidase 3,GPX3)在胃癌(gastric cancer,GC)中低表达,但其表达与GC患者预后联系尚不明确.目的分析GPX3基因在GC中的表达模式及预后价值.方法首选,利用Oncomine数据库分析GPX3基因在GC及正常胃黏膜组织中的表达情况;利用KM Plotter数据库分析GPX3的表达对GC患者的预后进行分析.其次,运用TCGA数据集对GPX3的表达模式和预后价值进行验证.最后,通过免疫组织化学法检测含有90例胃腺癌及其癌旁组织的组织芯片对上述结果进一步验证.结果利用Oncomine数据库分析,发现GPX3基因在GC组中表达显著低于正常胃黏膜组织(P<0.05).利用KM Plotter数据库分析,发现GC组织中GPX3低表达与患者总体生存率显著相关(P<0.05).利用TCGA数据集对GPX3的表达模式和预后价值进行验证,提示GPX3低表达与患者GC患者总体生存率显著相关(P<0.05).通过对90例GC及其癌旁组织的组织芯片研究分析发现,GPX3在癌组织中显著低表达(P=0.037),GPX3低表达与患者的年龄、性别、肿瘤临床分期无关,但与GC患者总体生存率显著相关(HR=0.48,95%CI:0.28-0.85,P=0.019).结论GPX3在GC中呈低表达,且与预后显著相关. 展开更多
关键词 胃癌 GPX3 Oncomine数据库 KM plotter数据库 TCGA数据库 组织芯片 预后
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基于Oncomine数据库探讨TMC5基因在胰腺癌中的表达及预后分析 被引量:2
11
作者 李萍 《生物技术》 CAS 2021年第1期65-70,9,共7页
[目的]揭示TMC5基因在胰腺癌中的表达及预后相关性。[方法]收集Oncomine和CCLE数据库中TMC5相关资料,对其表达情况进行二次分析,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析预后。[结果]Oncomine数据库有关TMC5在不同类型肿瘤中的研究共362项(... [目的]揭示TMC5基因在胰腺癌中的表达及预后相关性。[方法]收集Oncomine和CCLE数据库中TMC5相关资料,对其表达情况进行二次分析,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析预后。[结果]Oncomine数据库有关TMC5在不同类型肿瘤中的研究共362项(高表达16项、低表达8项)。胰腺癌相关研究7项,共计187例样本。TMC5在胰腺癌组织中的表达明显高于正常组织(P <0.05)。分析CCLE数据库发现,与多种癌细胞系相比,胰腺癌细胞系中TMC5高表达,其mRNA表达水平排名第一。Kaplan-Meier Plotter数据库阐明胰腺癌患者的总生存与TMC5表达水平无关(HR=1.56,95%CI:0.93~2.61,P=0.09),但低表达组患者的无复发生存(RFS)明显优于高表达组(HR=5.37,95%CI:1.26~22.99,P=0.011)。[结论]通过Oncomine和CCLE数据库我们发现胰腺癌中TMC5表达水平升高,高表达患者RFS缩短,因此,检测TMC5表达及靶向该基因的药物有望成为胰腺癌诊疗的重要手段之一。 展开更多
关键词 胰腺癌 TMC5 Oncomine数据库 CCLE数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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Rho GTP酶结合蛋白2基因表达与卵巢癌的预后关系及机制分析 被引量:3
12
作者 黄丹 周航 郑建清 《中外医学研究》 2019年第19期152-153,共2页
目的:探讨卵巢癌组织Rho GTP酶结合蛋白2(RHPN2)表达变化与卵巢癌预后的关系。方法:用Kaplan-Meier plotter数据库分析卵巢癌组织和正常组织中RHPN2基因表达的差异,并分析不同RHPN2基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索RHPN2基因表达... 目的:探讨卵巢癌组织Rho GTP酶结合蛋白2(RHPN2)表达变化与卵巢癌预后的关系。方法:用Kaplan-Meier plotter数据库分析卵巢癌组织和正常组织中RHPN2基因表达的差异,并分析不同RHPN2基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索RHPN2基因表达的预后价值。结果:Kaplan-Meier plotter数据库包含了1 653个病例样本。数据分析结果显示正常卵巢组织中RHPN2基因低表达,卵巢癌组织中RHPN2基因高表达。根据预设的截断值,308例为高表达组,347例患者为低表达。RHPN2基因低表达组卵巢癌中位总生存时间为52.03个月,高表达组为35.53个月,差异有统计学意义[风险比(HR)=1.47,95%CI(1.2,1.8),P=0.001]。结论:RHPN2基因高表达是降低卵巢癌总生存的不良预后因素。 展开更多
关键词 卵巢癌 RHPN2 KAPLAN Meier plotter数据库 生存分析 预后因素
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ATAD2在卵巢癌中表达及意义的现状分析 被引量:2
13
作者 韩迎燕 王志 +3 位作者 孙书娟 吴娟子 吴鹏 刘佳 《中国妇幼保健》 CAS 2017年第19期4887-4889,共3页
目的研究ATAD2在卵巢癌中的表达及预后评判价值。方法首先,通过Oncomine数据库探索ATAD2在卵巢癌中的表达变化;其次,应用在线数据库及分析工具"the KaplanM eier plotter"(KM plotter)数据库探索ATAD2在卵巢癌中的预后评判价... 目的研究ATAD2在卵巢癌中的表达及预后评判价值。方法首先,通过Oncomine数据库探索ATAD2在卵巢癌中的表达变化;其次,应用在线数据库及分析工具"the KaplanM eier plotter"(KM plotter)数据库探索ATAD2在卵巢癌中的预后评判价值。结果 Oncomine数据库中共有391个涉及不同种类类型肿瘤的研究结果。其中有75个研究结果关于ATAD2表达差异有统计学意义(P<0.05),70个研究结果显示ATAD2的表达增高,5个研究结果显示ATAD2的表达降低。共有两个研究涉及ATAD2在卵巢癌和正常组织中的表达,共647个样本,显示ATAD2在卵巢癌中的表达较正常组织明显增高。另外,KM plotter数据库的分析显示ATAD2mRNA水平与卵巢癌患者的总生存期以及无进展生存期成负相关。结论 ATAD2 mRNA水平在卵巢癌组织中明显增高,并且是卵巢癌的危险因素,其水平越高预后越差。 展开更多
关键词 卵巢癌 预后 Oncomine数据库 KM plotter数据库 ATAD2
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卵巢上皮性癌组织中长链非编码RNA PURPL的表达及其意义 被引量:2
14
作者 何婷婷 张瑞涛 +4 位作者 史惠蓉 曹媛 冯巍 王文文 张微微 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2021年第19期979-982,共4页
目的:检测长链非编码RNA PURPL(p53 upregulated regulator of p53 levels)在卵巢上皮性癌(epithelial ovarian cancer,EOC)组织中的表达情况,探讨其在卵巢癌发生发展中的作用。方法:选用开放医学数据库lncRNASNP2、GEPIA和Kaplan-Meier... 目的:检测长链非编码RNA PURPL(p53 upregulated regulator of p53 levels)在卵巢上皮性癌(epithelial ovarian cancer,EOC)组织中的表达情况,探讨其在卵巢癌发生发展中的作用。方法:选用开放医学数据库lncRNASNP2、GEPIA和Kaplan-Meier Plotter检索PURPL在EOC组织中的表达及其与预后的关系。收集2012年10月至2015年10月郑州大学第一附属医院105例患者的临床病理资料,其中包括正常卵巢组织20例、良性卵巢上皮性肿瘤组织20例、EOC组织65例,采用实时荧光定量PCR检测上述不同卵巢组织中的PURPL表达情况,分析EOC组织中PURPL表达与EOC临床病理指标的关系,Kaplan-Meier法分析PURPL表达对EOC患者生存的影响。结果:数据库检索显示,EOC组织中PURPL的表达显著高于正常卵巢组织,PURPL表达升高与EOC患者的总生存(overall survival,OS)率和无复发生存期(recurrence-free survival,RFS)缩短相关。实时荧光定量PCR检测显示,晚期EOC组织中的PURPL表达为0.530±0.004,显著高于正常卵巢组织的0.029±0.001、良性卵巢上皮性肿瘤组织的0.135±0.001和早期EOC组织的0.488±0.006的表达(P<0.0001)。临床分期越晚(χ2=10.785,P=0.001)、有淋巴结转移(χ2=4.481,P=0.034)的EOC组织中的PURPL高表达。PURPL表达水平相对较高的EOC患者的OS和RFS,明显短于PURPL表达水平相对较低的患者(P<0.05)。结论:PURPL高表达提示EOC患者预后不良,可作为EOC预后监测的潜在标记物。 展开更多
关键词 卵巢上皮性癌 医学数据库lncRNASNP2 GEPIA数据 Kaplan-Meier plotter数据库 PURPL预后
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基于Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库分析GPX2在非小细胞肺癌组织中的表达和临床意义 被引量:1
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作者 高华 张贝贝 +1 位作者 庞俊芳 王黎 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2021年第19期3390-3395,共6页
目的:探讨谷胱甘肽过氧化物酶2(glutathione peroxidase 2,GPX2)在非小细胞肺癌组织中的表达及预后意义。方法:基于Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库,收集关于GPX2表达的相关数据集,深入挖掘GPX2在非小细胞肺癌组织与正常组织中的... 目的:探讨谷胱甘肽过氧化物酶2(glutathione peroxidase 2,GPX2)在非小细胞肺癌组织中的表达及预后意义。方法:基于Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库,收集关于GPX2表达的相关数据集,深入挖掘GPX2在非小细胞肺癌组织与正常组织中的差异表达情况。采用Kaplan-Meier法进行预后分析,并绘制生存曲线。此外,通过单/多因素COX回归进一步评估GPX2在不同临床特征中的预后评估价值。结果:与正常组织相比,GPX2在非小细胞肺癌组织中高表达(P<0.001)。GPX2高表达非小细胞肺癌患者的总体生存率(HR=1.42,95%CI:1.25~1.61,P=5.6E-08)和肺腺癌患者的总体生存率(HR=1.35,95%CI:1.07~1.71,P=0.011)均差于低表达组。但GPX2表达水平对鳞癌患者预后无显著影响(HR=1.06,95%CI:0.84~1.35,P=0.61)。此外,本研究也发现GPX2的表达对同一临床特征(如男性、临床分期、吸烟/不吸烟、经化疗方式治疗)的患者的预后有预测评估价值。多因素分析结果显示临床分期和GPX2的表达是非小细胞肺癌患者预后的独立影响因素。结论:检测非小细胞肺癌组织中GPX2的表达有助于患者预后评估。 展开更多
关键词 NSCLC GPX2 Oncomine数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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基于Oncomine数据库分析SNRPB基因在乳腺癌中的表达及临床意义 被引量:1
16
作者 姚森邦 王妤琪 +5 位作者 刘念礼 秦庆伟 温馨 张兴颖 陈澳星 章龙珍 《现代肿瘤医学》 CAS 2020年第6期958-962,共5页
目的:研究小核糖体核蛋白B(small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1,SNRPB)在乳腺癌中的表达及临床意义。方法:运用Oncomine数据库搜索乳腺癌与SNRPB基因相关的数据,通过Kaplan-Meier Plotter数据库分析SNRPB基因与乳... 目的:研究小核糖体核蛋白B(small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1,SNRPB)在乳腺癌中的表达及临床意义。方法:运用Oncomine数据库搜索乳腺癌与SNRPB基因相关的数据,通过Kaplan-Meier Plotter数据库分析SNRPB基因与乳腺癌患者预后的关系。结果:Oncomine数据库中SNRPB基因癌组织/正常组织表达量分析结果共有414个,在癌组织中显著高表达109个,低表达3个。其中13个分析结果显示SNRPB在乳腺癌组织(包括6个侵袭性乳腺癌分析结果)中显著高表达,低表达的分析结果为1个。运用Kaplan-Meier Plotter数据库分析结果显示,高表达SNRPB的乳腺癌患者其总体生存率(OS)、无复发生存率(PFS)、无远处转移生存率(DMFS)显著低于低表达SNRPB的乳腺癌患者(P<0.05)。结论:SNRPB基因在乳腺癌中高表达,可以作为有效的生物标志物预测乳腺癌患者转移的发生及判断预后,可为乳腺癌的靶向治疗提供依据。 展开更多
关键词 乳腺癌 SNRPB Oncomine数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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联合生物信息学分析S1PR1在肺癌组织中的表达及临床意义 被引量:1
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作者 徐鑫鑫 蔡花 +1 位作者 彭静静 褚福营 《标记免疫分析与临床》 CAS 2020年第6期1006-1010,共5页
目的探讨肺癌组织中1-磷酸神经鞘氨醇受体1 (S1PR1)的表达及临床意义。方法收集南通市肿瘤医院52例肺癌患者组织标本,采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)法检测肺癌组织及癌旁组织中S1PR1的表达水平,通过Oncomine数据库对S1PR1表达结果进行佐... 目的探讨肺癌组织中1-磷酸神经鞘氨醇受体1 (S1PR1)的表达及临床意义。方法收集南通市肿瘤医院52例肺癌患者组织标本,采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)法检测肺癌组织及癌旁组织中S1PR1的表达水平,通过Oncomine数据库对S1PR1表达结果进行佐证,并分析其与临床病理参数之间的关系;利用ROC曲线,评价其表达水平对肺癌的诊断价值;Kaplan-Meier Plotter数据库分析其与肺癌预后的关系。结果肺癌组织中S1PR1的表达水平明显低于癌旁组织(P<0.01),Oncomine数据库共检索出9项符合筛选条件的研究,S1PR1在所有研究中都呈低表达(P<0.01)。S1PR1的表达与肿瘤大小和淋巴结转移有关(P<0.05),而与性别、年龄、吸烟情况、病理类型及TNM分期无明显相关性(P>0.05)。根据S1PR1表达水平绘制ROC曲线,曲线下面积(AUC)为0.711(95%CI:0.610~0.813),临界值取1.127时,S1PR1诊断肺癌的灵敏度和特异性均为71.2%。Kaplan-Meier生存分析发现低表达S1PR1的患者5年总生存期显著低于高表达患者(P<0.01)。结论肺癌组织中S1PR1表达水平下调,且低表达S1PR1的患者预后较差,S1PR1有望成为肺癌诊断和预后的分子标志物。 展开更多
关键词 S1PR1 肺癌 Oncomine数据库 Kaplan-Meier plotter数据库
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HOXB7基因在胃癌中的表达及预后价值 被引量:1
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作者 方红艳 王群 +1 位作者 张江洲 黄慧, 《世界华人消化杂志》 CAS 2019年第11期671-675,共5页
背景胃癌(gastric cancer, GC)是严重危害人体健康的恶性肿瘤,其发病率和死亡率分别占世界恶性肿瘤的第5位和第3位,因此,寻找GC治疗的新靶点和预后的新标志对改善患者预后至关重要.目前, HOXB7在GC中的表达及预后价值鲜有报道.目的分析H... 背景胃癌(gastric cancer, GC)是严重危害人体健康的恶性肿瘤,其发病率和死亡率分别占世界恶性肿瘤的第5位和第3位,因此,寻找GC治疗的新靶点和预后的新标志对改善患者预后至关重要.目前, HOXB7在GC中的表达及预后价值鲜有报道.目的分析HOXB7基因在GC中的表达模式及预后价值.方法利用Oncomine数据库分析HOXB7基因在GC及正常胃黏膜组织中的表达.利用KM Plotter数据库分析HOXB7表达与预后的关系.结果对Oncomine数据库中关于GC和正常胃黏膜组织HOXB7基因芯片数据集进行分析发现GC组织中HOXB7基因的表达显著高于正常胃黏膜组织,差异有统计学意义(P<0.05).进一步分析发现HOXB7基因在肠型GC和弥漫型GC中的表达均显著高于正常胃黏膜组织. KM Plotter数据库分析显示, GC组织中HOXB7高表达与患者总体生存率显著相关(P<0.05).且HOXB7高表达与不同亚型GC患者(Lauren亚型)总体生存率仍显著相关(P<0.05).结论 HOXB7的表达变化可能是正常胃黏膜上皮转变为GC的重要分子生物学事件,HOXB7或可作为GC预后的标志物. 展开更多
关键词 胃癌 HOXB7 Oncomine数据库 KM plotter数据库 肿瘤标志物
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CCNE1基因表达状态在卵巢癌中的预后价值 被引量:1
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作者 黄春珍 郑建清 黄碧芬 《中外医学研究》 2019年第6期1-2,共2页
目的:探讨CCNE1基因表达状态对卵巢癌总生存结果的影响及预后价值。方法:利用The Kaplan Meier plotter数据库中的卵巢癌患者生存资料及CCNE1基因表达资料,分析不同CCNE1基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索CCNE1基因表达的预后价值... 目的:探讨CCNE1基因表达状态对卵巢癌总生存结果的影响及预后价值。方法:利用The Kaplan Meier plotter数据库中的卵巢癌患者生存资料及CCNE1基因表达资料,分析不同CCNE1基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索CCNE1基因表达的预后价值。结果:共检出1 656例卵巢癌患者用于最终的生存分析,根据CCNE1基因表达状态,分为低表达组(1 171例)和高表达组(485例),低表达组卵巢癌中位总生存时间为48.0个月,高表达组为37.4个月,差异有统计学意义(P=0.001),风险比HR=1.26,95%CI(1.10,1.44)。结论:CCNE1基因高表达降低卵巢癌总生存,是不良预后因子。 展开更多
关键词 CCNE1 生存分析 预后因素 The KAPLAN Meier plotter数据库
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肿瘤转移抑制基因KAI1与卵巢癌的预后关系及机制的大数据分析 被引量:1
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作者 黄丹 郑建清 《吉林医学》 CAS 2019年第8期1677-1679,共3页
目的:探讨卵巢癌组织肿瘤转移抑制基因Kang Ai1(KAI1)表达变化与卵巢癌预后的关系。方法:用Kaplan Meier plotter数据库分析卵巢癌组织和正常组织中KAI1基因表达的差异,并分析不同KAI1基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索KAI1基因表... 目的:探讨卵巢癌组织肿瘤转移抑制基因Kang Ai1(KAI1)表达变化与卵巢癌预后的关系。方法:用Kaplan Meier plotter数据库分析卵巢癌组织和正常组织中KAI1基因表达的差异,并分析不同KAI1基因表达状态下卵巢癌的总生存差异,探索KAI1基因表达的预后价值。结果:Kaplan Meier plotter数据库包含了1 653个病例样本。数据分析结果显示正常卵巢组织中KAI1基因低表达,卵巢癌组织中KAI1基因高表达。根据预设的截断值,824例为高表达组,832例患者为低表达。低表达组卵巢癌中位总生存时间为44.03个月,高表达组为46.52个月,差异具有统计学意义[风险比HR=0.83,95%CI(0.73~0.95),P=0.005 1]。结论:卵巢癌组织KAI1基因高表达提示预后良好,总生存可获得改善。 展开更多
关键词 卵巢癌 KAI1 The KAPLAN Meier plotter数据库 生存分析 预后因素
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