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绵羊KAP1.1基因克隆与单核苷酸多态性分析 被引量:11
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作者 冯静 杨华 +4 位作者 宋天增 杨剑波 石国庆 徐从祥 黄锡霞 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第5期1720-1724,共5页
本研究以768只中国美利奴羊(新疆军垦型)为实验材料,采用测序和PCR技术分析KAP1.1(B2A)基因单核苷酸多态性。测序表明中国美利奴羊(新疆军垦型)KAP1.1基因存在30 bp的插入/缺失,12%PAGE电泳证实KAP1.1基因存在6种基因型:(341 bp)AA型、(... 本研究以768只中国美利奴羊(新疆军垦型)为实验材料,采用测序和PCR技术分析KAP1.1(B2A)基因单核苷酸多态性。测序表明中国美利奴羊(新疆军垦型)KAP1.1基因存在30 bp的插入/缺失,12%PAGE电泳证实KAP1.1基因存在6种基因型:(341 bp)AA型、(311 bp)BB型、(281 bp)CC型、(341 bp/311 bp)AB型、(341 bp/281 bp)AC型和(311 bp/281 bp)BC型,基因型频率依次为0.0208、0.5534、0.0260、0.1589、0.0456和0.1953。检测到A、B和C3个等位基因,基因频率依次为0.1230、0.7305和0.1465。研究结果将为开展优质细毛羊毛性状功能基因的研究提供基础。 展开更多
关键词 中国美利奴羊(新疆军垦型) kap1.1 SNP 基因克隆
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宁夏滩羊KAP1.1基因多态性及其与二毛裘皮重要性状关系的研究 被引量:6
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作者 贾桦 杨丽娟 +4 位作者 李爱华 张蕊 陈志强 何立荣 赵万余 《牡丹江医学院学报》 2013年第6期1-5,共5页
目的:研究宁夏滩羊KAP1.1基因的遗传多态性及其多态位点与滩羊二毛毛股弯曲数、纤维直径及毛股自然长度的关系,寻找可用于辅助选择的分子标记,为下一步分子育种提供理论依据。方法:采用PCR-SSCP技术研究了261只滩羔羊KAP1.1基因的多态性... 目的:研究宁夏滩羊KAP1.1基因的遗传多态性及其多态位点与滩羊二毛毛股弯曲数、纤维直径及毛股自然长度的关系,寻找可用于辅助选择的分子标记,为下一步分子育种提供理论依据。方法:采用PCR-SSCP技术研究了261只滩羔羊KAP1.1基因的多态性,利用DPS7.05软件分析了2个多态位点不同基因型裘皮性状的最小二乘均值(LSM),并进行了多重比较。结果:发现KAP1.1基因有两个突变位点S1和S2,其中S1位点有3个基因型,S2位点有5个基因型。在二毛裘皮毛股弯曲数性状上,S1-AA的LSM高于S1-AB、S1-BB,但三种基因型间无显著差异(P>0.05),S2-AB的LSM高于S2-AA、S2-BB、S2-AC、S2-DD,但五种基因型间无显著差异(P>0.05);在毛股自然长度性状上,S1-AB的LSM显著高于S1-BB(P<0.05),S2-AC基因型的LSM极显著高于S2-BB(P<0.01);在毛纤维细度性状上,S1-AA的LSM低于S1-AB、S1-BB,但三种基因型间无显著差异(P>0.05)。结论:本研究发现了宁夏滩羊KAP1.1基因的两个多肽位点S1和S2,其中S1位点有3个基因型,而S2位点有5个基因型,处于高度多态(PIC=0.7078)和高度杂合(h=0.7078),该位点上遗传多样性很丰富,在品系培育上选择潜力很大;S1位点的AB基因型和S2位点的AC基因型都与滩羊二毛皮的毛股自然长度有明显关系,可作为分子标记用于二毛裘皮较长毛股自然长度滩羊品系定向选育。 展开更多
关键词 滩羊 kap1 1 PCR—SSCP 裘皮性状
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绵羊KAP1.1基因编码蛋白生物信息学分析 被引量:4
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作者 翟刚 杜天宁 +5 位作者 张天浩 李振林 葛丛丛 郑庆丰 郭瑞芬 巩元芳 《河北科技师范学院学报》 CAS 2019年第4期36-41,共6页
为了探究KAP1.1基因(keratin-associated protein 1-1)潜在的生物学功能,利用分子生物学软件对绵羊KAP1.1基因编码蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,该基因共编码182个氨基酸,为一可溶性不稳定蛋白。分子量为18788.45 u,等电点为6.0... 为了探究KAP1.1基因(keratin-associated protein 1-1)潜在的生物学功能,利用分子生物学软件对绵羊KAP1.1基因编码蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,该基因共编码182个氨基酸,为一可溶性不稳定蛋白。分子量为18788.45 u,等电点为6.03。另预测得知该蛋白含有6个磷酸化位点,无糖基化位点,不含有跨膜区和信号肽,推测其不是一个分泌型蛋白。亚细胞定位绵羊KAP1.1蛋白主要在线粒体和细胞核中发挥生物学功能,二级、三级结构显示,无规则卷曲是构成该蛋白的主要结构元件。物种间同源性分析显示,绵羊KAP1.1蛋白氨基酸组成与牛的相似度最高(85.9%)。 展开更多
关键词 kap1.1基因 编码蛋白 生物信息学分析
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天祝白牦牛KAP1.1基因的克隆及生物信息学分析 被引量:2
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作者 张良斌 潘和平 《广东农业科学》 CAS 2015年第2期131-136,共6页
以牦牛的角蛋白关联蛋白1.1(KAP1.1)基因为研究对象,根据GenBank收录的黄牛KAP1.1基因的mRNA序列(登录号:NM_001105369.1)设计特异性引物,通过反转录PCR、PCR以及克隆方法首次获得牦牛的KAP1.1完整CDS区,将所得序列提交到NCBI,登录号为K... 以牦牛的角蛋白关联蛋白1.1(KAP1.1)基因为研究对象,根据GenBank收录的黄牛KAP1.1基因的mRNA序列(登录号:NM_001105369.1)设计特异性引物,通过反转录PCR、PCR以及克隆方法首次获得牦牛的KAP1.1完整CDS区,将所得序列提交到NCBI,登录号为KJ095199,并对其进行生物信息学分析。结果表明,牦牛KAP1.1基因的CDS区全长为501bp,共编码166个氨基酸;编码的蛋白质属于亲水性蛋白质。二级结构含有α螺旋区、延伸链、β转角和无规卷曲4种。氨基酸序列与黄牛的同源性最高,具有High sulphur keratin-associated protein家族蛋白的完整结构域。 展开更多
关键词 牦牛 kap1.1基因 绒毛 CDS区
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天祝白牦牛KAP1.1基因亚型B2A克隆及鉴定 被引量:2
5
作者 张良斌 梁春年 +5 位作者 裴杰 褚敏 吴晓云 张建一 潘和平 阎萍 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2015年第1期109-117,共9页
通过对天祝白牦牛高硫角蛋白基因启动子B2A克隆得到其序列,将序列提交到NCBI,登录号:KJ910005,并对其进行生物信息学分析,通过亚细胞定位,磷酸化分析,二级、三级结构和保守结构域预测结果比较,MEGA 5.10软件进行NJ法进化树构建和Meg Al... 通过对天祝白牦牛高硫角蛋白基因启动子B2A克隆得到其序列,将序列提交到NCBI,登录号:KJ910005,并对其进行生物信息学分析,通过亚细胞定位,磷酸化分析,二级、三级结构和保守结构域预测结果比较,MEGA 5.10软件进行NJ法进化树构建和Meg Align进行蛋白质相似分析来分析B2A基因与KAP1.1(Keratin associated protein1.1)基因的差异性。B2A基因的CDS区全长为471 bp,共编码156个氨基酸,二级结构含有延伸链、β转角和无规卷曲3种。B2A蛋白和KAP1.1蛋白的亚细胞定位,磷酸化分析,保守结构域,二级结构、三级结构和同源性差异较大。但是从功能预测结果显示2个蛋白功能完全一致,并且使用Clustal X进行氨基酸序列比对分析显示B2A蛋白从第33位开始相对于KA1.1蛋白有10个氨基酸的缺失以外,其余序列之间的保守性相当高。因此,可以证明B2A基因是KAP1.1基因的基因亚型。 展开更多
关键词 牦牛 B2A基因 kap1.1蛋白 基因亚型
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山区型和田羊毛囊KAP1.1基因表达载体构建及生物信息学分析 被引量:1
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作者 余路菲 赵军 李树伟 《塔里木大学学报》 2020年第3期21-28,共8页
为了分析山区型和田羊毛囊角蛋白关联蛋白(Keratin associated protein,KAP1.1)基因对绵羊羊毛产量与品质的影响。以山区型和田羊皮肤毛囊为试验材料,提取总RNA,反转录获得cDNA,PCR扩增毛囊KAP 1.1基因,插入pMD18-T载体,构建pMD18-T-KAP... 为了分析山区型和田羊毛囊角蛋白关联蛋白(Keratin associated protein,KAP1.1)基因对绵羊羊毛产量与品质的影响。以山区型和田羊皮肤毛囊为试验材料,提取总RNA,反转录获得cDNA,PCR扩增毛囊KAP 1.1基因,插入pMD18-T载体,构建pMD18-T-KAP 1.1克隆质粒,双酶切鉴定后构建pEGFP-N l-KAP 1.1真核表达重组质粒,做PCR、双酶切鉴定后送公司测序,并进行生物信息学分析。结果表明:成功构建了pEGFP-N l-KAP 1.1真核表达重组质粒,获得了山区型和田羊毛囊KAP 1.1基因编码序列,片段全长为519 bp,编码172个氨基酸。与GenBank中美利奴绵羊序列比对,碱基序列同源性达98.85%,氨基酸序列同源性达97.09%。说明试验成功构建了毛囊KAP 1.1真核表达载体,并获知了山区型和田羊KAP 1.1基因与蛋白序列。 展开更多
关键词 绵羊 山区型和田羊 毛囊 角蛋白关联蛋白 kap 1.1基因
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内蒙古绒山羊角蛋白辅助蛋白1.1基因真核表达载体构建及基因转染 被引量:1
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作者 包阿东 苏志芳 +1 位作者 梅步俊 汪长寿 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第3期39-43,共5页
试验通过提取绒山羊皮肤总RNA,克隆角蛋白辅助蛋白1.1(keratin-associated protein 1.1,KAP1.1)基因,构建重组真核表达载体pEGFP-N3-KAP1.1,利用脂质体介导法将重组质粒转入内蒙古绒山羊体外培养的成纤维细胞中,研究该基因在真核细胞中... 试验通过提取绒山羊皮肤总RNA,克隆角蛋白辅助蛋白1.1(keratin-associated protein 1.1,KAP1.1)基因,构建重组真核表达载体pEGFP-N3-KAP1.1,利用脂质体介导法将重组质粒转入内蒙古绒山羊体外培养的成纤维细胞中,研究该基因在真核细胞中的时空表达、亚细胞定位及表达规律。结果显示,2.0μg重组质粒和6.0μL脂质体的比例为适合本试验的最优化方案,KAP1.1基因能在内蒙古绒山羊成纤维细胞中成功表达,并在转染后48h转染率达到峰值,该基因在真核体外培养细胞中细胞核、细胞质和细胞膜上均有表达,但以细胞核表达量最强。 展开更多
关键词 内蒙古绒山羊 角蛋白辅助蛋白1 1基因 载体构建
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绵羊KAP1.1基因多态性与毛纤维直径的相关性分析 被引量:1
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作者 冯静 宋天增 +5 位作者 杨华 徐从祥 杨剑波 韩猛立 杨永林 石国庆 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2012年第1期45-50,共6页
以768只中国美利奴羊(新疆军垦型)为材料,采用测序和PCR技术分析KAP1.1(B2A)基因单核苷酸多态性及其与羊毛纤维直径的相关性。结果表明:中国美利奴羊(新疆军垦型)KAP1.1基因存在30个碱基的插入/缺失和6种基因型,分别为(341 bp)AA基因型... 以768只中国美利奴羊(新疆军垦型)为材料,采用测序和PCR技术分析KAP1.1(B2A)基因单核苷酸多态性及其与羊毛纤维直径的相关性。结果表明:中国美利奴羊(新疆军垦型)KAP1.1基因存在30个碱基的插入/缺失和6种基因型,分别为(341 bp)AA基因型、(311 bp)BB基因型、(281 bp)CC基因型、(341 bp/311 bp)AB基因型、(341 bp/281 bp)AC基因型和(311 bp/281 bp)BC基因型。AA、BC、AC、AB和CC基因型间的毛卷曲度、细度离散、毛长、污毛重、净毛率和密度差异不显著(P>0.05),而BB基因型羊只的平均纤维直径显著小于AA、BC、AC、AB和CC基因型羊只的平均纤维直径(P<0.05)。以上结果表明,KAP1.1基因可作为绵羊毛纤维直径的主要候选基因之一,BB基因型可作为分子标记用于预测绵羊毛纤维直径。 展开更多
关键词 中国美利奴羊(新疆军垦型) kap1.1基因 SNP 纤维直径
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和田羊毛囊KAP1.1基因的克隆及生物信息学分析 被引量:1
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作者 刘鑫 李树伟 姜仁军 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第5期41-43,共3页
为了分析和田羊毛囊角蛋白关联蛋白(KAP)1.1基因,试验以南疆地方品种羊(和田羊)为样本,从和田羊毛囊中提取总RNA,设计1对引物,通过PCR反应扩增出长度为535 bp的基因片段,连接到pMD18-T载体上。结果表明:克隆得到和田羊毛囊KAP1.1基因成... 为了分析和田羊毛囊角蛋白关联蛋白(KAP)1.1基因,试验以南疆地方品种羊(和田羊)为样本,从和田羊毛囊中提取总RNA,设计1对引物,通过PCR反应扩增出长度为535 bp的基因片段,连接到pMD18-T载体上。结果表明:克隆得到和田羊毛囊KAP1.1基因成熟蛋白编码序列,序列长度与GenBank上发表的序列长度相同,经生物信息学软件分析,有2处碱基发生突变,同源性为99%,说明试验成功克隆了KAP1.1基因。 展开更多
关键词 和田羊毛囊 角蛋白关联蛋白(kap)1 1基因 克隆 生物信息学分析
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