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1981~2005年中国H1N1甲型流感病毒血凝素基因的HA1演变特征 被引量:13
1
作者 张家淮 徐红 +4 位作者 张烨 赵翔 郭俊峰 蓝雨 舒跃龙 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期350-355,共6页
为了解1981~2005年我国H1N1甲型流感病毒血凝素基因的HA1演变特征,选取H1N1甲型流感病毒370株,提取病毒RNA,经逆转录和聚合酶链反应扩增HA1并测序,测定的序列用生物信息软件分析,与GenBank中相关序列比较,并对推导的编码氨基酸... 为了解1981~2005年我国H1N1甲型流感病毒血凝素基因的HA1演变特征,选取H1N1甲型流感病毒370株,提取病毒RNA,经逆转录和聚合酶链反应扩增HA1并测序,测定的序列用生物信息软件分析,与GenBank中相关序列比较,并对推导的编码氨基酸序列进行基因特性分析。结果表明:HA1氨基酸的变异表现为抗原决定簇4个区均有变异,Sb区和Ca区变化较大;HA1受体结合位点(RBS)的前壁130环的第134位赖氨酸从1991年起在部分毒株HA1序列上开始缺失,以后缺失株逐步增多,自2000年起测定的所有毒株上该氨基酸全部缺失,同时这些缺失株的第137位氨基酸也全部由苏氨酸替换为丝氨酸;糖基化位点从增多到减少,最后稳定在7个;1981~2004年我国H1N1甲型流感病毒血凝素HA1编码的氨基酸在种系发育树上同年代基本呈现集中分布,与时间和地域无关,2005年毒株分成两个分支在时间上有明显差异。 展开更多
关键词 h1n1甲型流感病毒 hA1 种系发生树
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上海市浦东新区2008—2010年流感监测点疫情分析 被引量:9
2
作者 马平 张爱华 +3 位作者 王闻卿 刘青 章红红 潘丽峰 《上海预防医学》 CAS 2011年第6期262-264,共3页
[目的]了解上海市浦东新区流感流行趋势及病原学特征。[方法]监测点医院每周填写流感样病例(ILI)报表并上报网络,监测点医院每周采集ILI鼻咽试子5~20份送浦东新区疾病预防控制中心进行流感病原检测。[结果]流行病学监测及病原学监测显... [目的]了解上海市浦东新区流感流行趋势及病原学特征。[方法]监测点医院每周填写流感样病例(ILI)报表并上报网络,监测点医院每周采集ILI鼻咽试子5~20份送浦东新区疾病预防控制中心进行流感病原检测。[结果]流行病学监测及病原学监测显示,2008年(3月、8月)、2009年(1月、8月、12月)、2010年(9月)的ILI百分率值及ILI流感病毒阳性率均为监测峰值。2008年2月以B(Yam agata)亚型毒株为主,3月以A(H3N2)亚型毒株为主;2008年7月—2009年2月以A(H1N1)亚型毒株为主,2009年7月—8月以A(H3N2)亚型毒株为主,2009年9月—2010年1月以甲型H1N1亚型毒株为主,2010年2月—3月以B(V ictoria)型毒株为主,2010年8月—11月以A(H3N2)型毒株为主。[结论]2008年呈现冬春季和夏秋季的双峰型分布,2009年呈现冬春、夏秋季、冬季延伸至2010年春3峰流行,2010年呈现夏秋季高峰流行。流感毒株亚型循环流行。 展开更多
关键词 流感 A(h1n1)亚型 A(h3n2)亚型 甲型h1n1亚型 B(Victoria)亚型 B(Yamagata)亚型 监测 病原学
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危重型甲型H1N1流感患者外周血白细胞及T细胞亚群的变化及其临床意义 被引量:7
3
作者 徐华 黄建安 +3 位作者 胥萍 金钧 郭强 付建红 《江苏医药》 CAS CSCD 北大核心 2010年第20期2391-2393,共3页
目的探讨危重型甲型H1N1流感患者外周血白细胞和T淋巴细胞亚群的变化及其临床意义。方法检测18例危重型甲型H1N1流感患者(危重组),18例普通型H1N1流感患者(普通组)和18例健康人(对照组)外周血白细胞计数及分类,流式细胞术测上述患者外周... 目的探讨危重型甲型H1N1流感患者外周血白细胞和T淋巴细胞亚群的变化及其临床意义。方法检测18例危重型甲型H1N1流感患者(危重组),18例普通型H1N1流感患者(普通组)和18例健康人(对照组)外周血白细胞计数及分类,流式细胞术测上述患者外周血T淋巴细胞各亚群CD3+、CD4+、CD8+、CD8+CD28+、CD8+CD28-、CD4+CD25+high的百分比。结果与对照组比较,甲型H1N1病毒感染患者,尤其是危重型组,淋巴细胞绝对数及百分比显著下降,且外周血T淋巴细胞各亚群CD3+、CD4+、CD8+、CD8+CD28+、CD4+CD25+high百分比明显降低,而CD8+CD28-百分比明显增高(P<0.05)。结论甲型H1N1流感病毒感染损伤患者淋巴细胞和细胞免疫功能。外周血淋巴细胞及T淋巴细胞各亚群的百分比改变可反映甲型H1N1流感患者病情的严重程度。 展开更多
关键词 甲型h1n1流感病毒 T淋巴细胞亚群
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小儿清解防感颗粒防治甲流的作用机制研究 被引量:5
4
作者 申昕 侯敏 宋延平 《甘肃中医学院学报》 2012年第1期4-7,共4页
目的研究小儿清解防感颗粒抗流感病毒的作用机制。方法采用亚洲甲型鼠肺适应株(A/PR8/H1N1)滴鼻感染小鼠制作小鼠甲流模型,观察小儿清解防感颗粒延长病鼠生命的作用;光学显微镜下观察小鼠肺组织的病变程度并评分,同时计算小鼠肺指数,比... 目的研究小儿清解防感颗粒抗流感病毒的作用机制。方法采用亚洲甲型鼠肺适应株(A/PR8/H1N1)滴鼻感染小鼠制作小鼠甲流模型,观察小儿清解防感颗粒延长病鼠生命的作用;光学显微镜下观察小鼠肺组织的病变程度并评分,同时计算小鼠肺指数,比较各组间肺指数的变化趋势及小鼠肺病变评分差异。采用环磷酰胺建立小鼠免疫抑制模型,观察各组小鼠的淋巴细胞转化情况。结果小儿清解防感颗粒可显著延长病鼠生命,降低死亡率和肺指数、肺病变评分,升高淋巴母细胞、过渡型细胞百分率及淋巴细胞转化率。结论小儿清解防感颗粒对感染流感病毒A/PR8/H1N1小鼠有一定的死亡保护及肺脏保护作用,并具有增强免疫低下小鼠淋巴细胞转化的作用。 展开更多
关键词 小儿清解防感颗粒 h1n1流感病毒 死亡保护 肺指数 淋巴细胞转化
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河北省2005~2006年H1N1亚型流感病毒血凝素HA1基因特征研究 被引量:4
5
作者 郭瑞玲 齐顺祥 +1 位作者 刘艳芳 刘兰芬 《现代预防医学》 CAS 北大核心 2008年第15期2956-2958,2963,共4页
[目的]研究2005~2006年河北省分离的H1N1型流感病毒毒株HA1基因特性。阐明HA1基因的变异与流感流行的关系。[方法]用MDCK分离培养流感病毒,提取病毒核糖核酸(RNA),采用RT-PCR扩增病毒HA1基因,纯化产物进行核苷酸序列测定,用DNAStar软... [目的]研究2005~2006年河北省分离的H1N1型流感病毒毒株HA1基因特性。阐明HA1基因的变异与流感流行的关系。[方法]用MDCK分离培养流感病毒,提取病毒核糖核酸(RNA),采用RT-PCR扩增病毒HA1基因,纯化产物进行核苷酸序列测定,用DNAStar软件作分析处理。[结果]2005~2006年在河北省流行的H1N1型流感病毒HA1基因核苷酸和氨基酸序列与同时期的H1N1亚型疫苗株A/NewCaledonia/20/1999相比已发生较大变异,核苷酸同源性为97.0%~98.1%,氨基酸同源性为97.9%~98.7%,有5~7个氨基酸发生了替换,但均不在抗原表位。种系进化结果显示A/河北南市/37/2005与A/河北新市/56/2005和A/河北新市/129/2006位于2个小分支,均距A/NewCaledonia/20/1999较远,A/河北南市/37/2005与A/NewYork/221/2003有较近的亲缘关系。[结论]H1N1型流感病毒HA1基因已发生明显变异,但对抗原性改变意义不大;近几年H1N1持续低流行使人群易感性得以积累是今年H1N1型流感流行的主要原因;2005~2006年河北省同时流行着至少2支种系发生距离较远的H1N1型流感病毒。 展开更多
关键词 h1n1亚型流感病毒 血凝素基因 核苷酸序列
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不同品系小鼠感染甲型流感病毒肺小血管内血栓形成 被引量:1
6
作者 刘颖 徐艳峰 +5 位作者 邓巍 朱华 黄澜 马春梅 鲍琳琳 秦川 《中国比较医学杂志》 CAS 2012年第2期1-5,I0001,共6页
目的本实验旨在观察不同品系小鼠感染甲型流感病毒后肺组织内血栓形成的情况。方法使用H1N1病毒A/California/7/2009(CA7)株和H3N2病毒A/Brisbane/10/07株,对BALB/C小鼠、Scid小鼠、NOD/LTJ小鼠、BALB/C-nu小鼠、NOD-Scid小鼠和icosl-K... 目的本实验旨在观察不同品系小鼠感染甲型流感病毒后肺组织内血栓形成的情况。方法使用H1N1病毒A/California/7/2009(CA7)株和H3N2病毒A/Brisbane/10/07株,对BALB/C小鼠、Scid小鼠、NOD/LTJ小鼠、BALB/C-nu小鼠、NOD-Scid小鼠和icosl-KO小鼠经乙醚麻醉后进行滴鼻攻毒。检测小鼠感染后肺组织病毒拷贝数并观察肺组织病理学改变。结果 H1N1和H3N2滴鼻攻毒的各组小鼠均染毒,病理表现为程度略有差异的间质性肺炎。13只H1N1病毒感染小鼠和6只H3N2感染小鼠在肺组织中观察到多个小血管内有血栓形成,血栓成分主要为纤维素和血小板。结论各品系小鼠感染H1N1和H3N2流感病毒后均可能出现肺组织内血栓形成。 展开更多
关键词 h1n1 h3n2 静脉血栓 nOD-Scid小鼠 SCID小鼠 nOD/LtJ小鼠
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甲型H1N1流感监测及其HA1基因特性分析,以2013~2014年新余市为例 被引量:2
7
作者 潘虹 刘瑞弘 +3 位作者 文奇 刘琴 周银古 熊英 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期247-251,共5页
因HA基因的头部重链区(HA1)是流感病毒的抗原位点和受体结合位点,所以了解流感病毒的HA1基因特性可以评估当前WHO推荐的疫苗株的预防效果。本文选取新余市2013-2014年通过狗肾传代细胞(MDCK)培养分离到的H1N1流感毒株12株,提取病毒R... 因HA基因的头部重链区(HA1)是流感病毒的抗原位点和受体结合位点,所以了解流感病毒的HA1基因特性可以评估当前WHO推荐的疫苗株的预防效果。本文选取新余市2013-2014年通过狗肾传代细胞(MDCK)培养分离到的H1N1流感毒株12株,提取病毒RNA,反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增HA1基因片段。对序列分析发现2013-2014年新余市甲型H1N1流感病毒HA1基因序列与疫苗推荐株有较高的同源性,核苷酸同源性97.9%-98.5%。2013年的6株毒株HA1区与疫苗株比较,氨基酸变异位点7-11个,其中3株有2个变异位点在不同的抗原决定簇区。而2014年毒株单独集中在进化树的一支。以上提示,目前流感疫苗对2014年的流感人群仍有保护作用,对2013年的部分流行的H1N1预防效果有限;甲型H1N1爆发流行的可能性很大,应加强防控。 展开更多
关键词 h1n1甲型流感病毒 血凝素基因 进化分析
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2000-2009年H1N1甲型流感病毒神经氨酸酶的进化分析和序列解析 被引量:2
8
作者 王妮莎 马文丽 +3 位作者 危敏 张宝 郑文岭 向星宇 《热带医学杂志》 CAS 2011年第2期155-157,164,共4页
目的研究2000-2009年世界各地不同物种流感病毒神经氨酸酶的进化特征和关键位点的变异情况。结论从NCBI数据库下载所需序列,采用生物信息软件对其氨基酸序列进行种系发生树的构建,以及序列特性的分析。结果新型流感病毒和猪/禽流感病毒N... 目的研究2000-2009年世界各地不同物种流感病毒神经氨酸酶的进化特征和关键位点的变异情况。结论从NCBI数据库下载所需序列,采用生物信息软件对其氨基酸序列进行种系发生树的构建,以及序列特性的分析。结果新型流感病毒和猪/禽流感病毒NA蛋白在进化关系上非常接近,并且抗原决定簇和糖基化位点的变异也大致相同。结论新型毒株NA蛋白可能由早期的H1N1猪/禽流感病毒进化而来,在进化过程中,一些重要位点的变异导致NA蛋白发生抗原性变异,从而导致流感的大爆发。 展开更多
关键词 h1n1甲型流感病毒 nA 种系发生树 变异位点
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珠海市2008年H1N1亚型流感病毒血凝素HA1基因特征分析 被引量:2
9
作者 林毅雄 张丽荣 +5 位作者 魏泉德 张静涛 李红霞 周兰兰 郑予柯 方艳梅 《实用预防医学》 CAS 2010年第2期230-232,共3页
目的了解2008年珠海地区流行的H1N1亚型流感病毒血凝素重链区HA1基因特征。方法按照时间不同选取7株2008年珠海市分离到的H1N1亚型流感毒株,选取的毒株进行血凝素HA1片段序列测定并推导出其氨基酸序列进行基因进化特性分析。结果H1N1亚... 目的了解2008年珠海地区流行的H1N1亚型流感病毒血凝素重链区HA1基因特征。方法按照时间不同选取7株2008年珠海市分离到的H1N1亚型流感毒株,选取的毒株进行血凝素HA1片段序列测定并推导出其氨基酸序列进行基因进化特性分析。结果H1N1亚型流感毒株为珠海市2008年的优势株,与该年WHO推荐疫苗株比较有多个氨基酸发生了替换,造成抗原性发生一定的变化。结论2008年根据WHO疫苗推荐株生产的疫苗对该年珠海市H1N1亚型流感预防效果并不理想,导致2008年珠海市H1N1亚型的流行强度增加。 展开更多
关键词 h1n1甲型流感病毒 血凝素 基因分析
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石荠苧总黄酮治疗流感病毒性肺炎小鼠的实验研究 被引量:2
10
作者 徐义云 陈京 +1 位作者 徐攀 陈蕊蕊 《中国中医急症》 2013年第10期1705-1706,共2页
目的观察石荠苧总黄酮对甲型H1N1流感病毒PR8株感染小鼠肺炎的影响。方法滴鼻感染小鼠建立流感病毒性肺炎模型,采用预防性给药,以利巴韦林为阳性对照,观察给药后各组对小鼠死亡率、生存时间、肺指数的影响。结果石荠苧总黄酮给药后能明... 目的观察石荠苧总黄酮对甲型H1N1流感病毒PR8株感染小鼠肺炎的影响。方法滴鼻感染小鼠建立流感病毒性肺炎模型,采用预防性给药,以利巴韦林为阳性对照,观察给药后各组对小鼠死亡率、生存时间、肺指数的影响。结果石荠苧总黄酮给药后能明显降低流感病毒PR8株感染后小鼠的肺指数、减少死亡率并延长生存时间(P<0.05或0.01)。与阳性组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论石荠苧总黄酮在体内对甲型H1N1流感病毒PR8株感染小鼠造成的病毒性肺炎具有明显的治疗作用。 展开更多
关键词 石荠苧总黄酮 h1n1流感病毒 病毒性肺炎
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2005年-2009年大连市季节性甲型H1N1流感病毒HA基因序列分析
11
作者 肖冰 张倩文 +2 位作者 刘丹红 王秀萍 薄志坚 《中国卫生检验杂志》 CAS 2011年第6期1426-1428,共3页
目的:分析大连市2005年-2009年流感病毒H1N1亚型血凝素抗原性及其基因变异情况,为流感防治提供技术支持。方法:采集流感样病例的鼻咽拭子标本,用MDCK细胞进行流感病毒的病原分离,采用红细胞凝集实验测定病毒的滴度,用血凝抑制试验和RT-... 目的:分析大连市2005年-2009年流感病毒H1N1亚型血凝素抗原性及其基因变异情况,为流感防治提供技术支持。方法:采集流感样病例的鼻咽拭子标本,用MDCK细胞进行流感病毒的病原分离,采用红细胞凝集实验测定病毒的滴度,用血凝抑制试验和RT-PCR进行流感病毒型别鉴定,通过RT-PCR扩增血凝素HA片段的基因,电泳、纯化后进行基因序列测定,利用生物信息学进行序列分析。结果:2005年-2009年共分离到季节性甲型H1N1流感病毒39株,其中28株进行了测序。与当年的疫苗株相比,2005年、2006年、2007年和2008年分离株的HA1区分别发生了11个、9个、15、15个突变。结论:在近几个年度的流行季节中,该地区有H1N1亚型流感的存在。该地H1N1流感病毒分离株有多处氨基酸发生替换,氨基酸的替换导致毒株的抗原性发生了漂移。 展开更多
关键词 甲型h1n1流感病毒 hA基因 基因序列
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福州2009-2014年甲型H1N1流感病毒株HA基因进化分析
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作者 陈智伟 姚栩 +1 位作者 谢乃鸿 张晓阳 《中国医学创新》 CAS 2017年第7期5-8,共4页
目的:分析福州地区2009-2014年甲型H1N1流感病毒株的HA基因序列和遗传特征。方法:采集流感样病例的咽拭子标本,用MDCK细胞培养法和Real-time RT-PCR法对6株分别来自2009-2014年的病毒株进行病毒分离、鉴定,HA基因片段通过RT-PCR法进行... 目的:分析福州地区2009-2014年甲型H1N1流感病毒株的HA基因序列和遗传特征。方法:采集流感样病例的咽拭子标本,用MDCK细胞培养法和Real-time RT-PCR法对6株分别来自2009-2014年的病毒株进行病毒分离、鉴定,HA基因片段通过RT-PCR法进行扩增后克隆到p MD18-T载体上,并测定6株病毒株的HA基因序列。通过生物软件Bio Edit对该分离株和Gen Bank中相关毒株的序列进行基因进化树分析。结果:6株分离株的HA基因推导氨基酸序列与参考株A/California/04/2009相比,2009-2014年HA1区氨基酸发生了突变,主要是位于136、145、188、189、192和193位点。结论:近几年,福州地区H1N1流感的HA基因序列与世界流行的病毒参考株具有高度同源性,并多处氨基酸发生替换而产生抗原性漂移。 展开更多
关键词 甲型流感病毒 血凝素 序列分析 进化树
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人感染H7N9禽流感病毒流行特征分析 被引量:11
13
作者 李宗 张勇 +1 位作者 李熠 陆正清 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2014年第1期25-28,共4页
目的分析人感染H7N9禽流感病毒患者的发病、诊治和流行情况,自然因素与社会因素对流行3个环节的影响,提出疫情控制措施。方法描述流行病学和分析流行病学方法,收集人感染H7N9禽流感患者三间分布情况及组合等资料,分析流行特点、影响因... 目的分析人感染H7N9禽流感病毒患者的发病、诊治和流行情况,自然因素与社会因素对流行3个环节的影响,提出疫情控制措施。方法描述流行病学和分析流行病学方法,收集人感染H7N9禽流感患者三间分布情况及组合等资料,分析流行特点、影响因素和控制措施。结果共收集确诊人感染H7N9禽流感134例病例,死亡43例,分布11个省市,沪皖苏为多,占发病数的79.1%;4月发病108例,占80.6%,3、4月发病占96.3%;收集到年龄、性别、接触史等资料的病例为128例,平均年龄为56.8岁,51岁以上达91例,占71.1%,>60岁65例,占50.8%;男性发病是女性的2.2倍;入院重症病例占患者的75.6%;收集到86例病例职业信息,农民和退休人员占统计数的61.6%;收集到1737名密切接触者均无发病;气温升高,湿度降低、雨水减少、停止活禽交易等措施,能有效控制疫情。结论人感染H7N9禽流感又是一起新出现的传染病(emerging infectiois diseases;EID)EID的典型案例,传染和流行特征未明,要加强疫情监测,研究自然因素与社会因素的作用,提出防控措施。 展开更多
关键词 感染 h7n9禽流感 流行病学 社会和自然因素
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季节性流感病毒H1N1实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:10
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作者 许黎黎 鲍琳琳 秦川 《中国比较医学杂志》 CAS 2011年第7期62-66,共5页
目的建立一种快速定量检测季节性流感病毒H1N1核酸的实时荧光定量PCR检测方法及试剂盒。方法选择季节性流感病毒H1N1的保守基因NP基因作为检测靶目标,应用Clustal W软件进行序列同源性比对分析,筛选出季节性流感病毒H1N1特异性的保守序... 目的建立一种快速定量检测季节性流感病毒H1N1核酸的实时荧光定量PCR检测方法及试剂盒。方法选择季节性流感病毒H1N1的保守基因NP基因作为检测靶目标,应用Clustal W软件进行序列同源性比对分析,筛选出季节性流感病毒H1N1特异性的保守序列作为引物候选区域,然后应用Primer Express及PrimerPremier 5.0软件包对候选引物进行进一步配对及筛选,得到最优特异性检测引物。同时,由病毒全长cDNA扩增出NP基因,琼脂糖凝胶电泳检测NP基因的扩增情况并对目的条带进行切胶回收及纯化,对回收后的NP全长基因进行核酸浓度测定,并换算成拷贝数,作为定量标准品。结果应用ABI公司的Power SYBR Green PCR MasterMix及StepOne实时荧光定量PCR仪,该检测系统灵敏度可达102 copies/μL,不同梯度标准品间线性关系(R2)达0.999,斜率为-0.3433,扩增效率为95.572%,所有标准品均在83.2℃出现尖且窄的特异性熔解峰。结论利用该检测系统可以快速定量检测季节性流感病毒H1N1,灵敏度高,可用作基础及临床实验室对季节性流感病毒H1N1感染的辅助诊断方法和临床效果的监测手段,对实验操作者要求相对较低,具有实际的应用价值。 展开更多
关键词 季节性流感病毒h1n1 荧光定量PCR 病毒载量
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荧光探针Ru(phen)^2(dppx)^2+测定H1N1禽流感病毒DNA 被引量:5
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作者 曾国平 向东山 +1 位作者 蔡金杖 何治柯 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1737-1743,共7页
利用荧光探针Ru(phen)2(dppx)2+与ssDNA作用时无荧光或产生弱荧光,而与dsDNA作用时荧光增强的机理,将H1N1禽流感病毒ssDNA和与其完全互补的ssDNA'杂交形成dsDNA实现Ru(phen)2(dppx)2+对H1N1禽流感病毒DNA特定序列(5'-CTACCATGCG... 利用荧光探针Ru(phen)2(dppx)2+与ssDNA作用时无荧光或产生弱荧光,而与dsDNA作用时荧光增强的机理,将H1N1禽流感病毒ssDNA和与其完全互补的ssDNA'杂交形成dsDNA实现Ru(phen)2(dppx)2+对H1N1禽流感病毒DNA特定序列(5'-CTACCATGCGAACAATTCAACCGACACTGTT-3')的定量检测.在优化的实验条件下,测定H1N1禽流感病毒DNA的线性范围为9.3×10-10~7.4×10-8 mol/L,线性方程为y=3.3829x+8.3948,R2=0.9982,检出限为5.3×10-10 mol/L.该方法具有操作简单、检测快速、灵敏度高和选择好等优点. 展开更多
关键词 荧光探针Ru(phen)2(dppx)2+ h1n1禽流感病毒 荧光光谱 定量检测
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福建省首例人感染H5N6禽流感病例实验室诊断与病毒序列初步分析 被引量:4
16
作者 罗宏活 林琦 +7 位作者 庄金凤 杜琳琅 张炎华 陈宏彬 赵琳 翁育伟 郑奎城 谢剑锋 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2018年第3期263-267,共5页
目的分析福建省首例人感染H5N6禽流感病例的实验室检测结果,为今后实验室检测和疫情防控提供依据。方法采集患者咽拭子和外环境标本,提取病毒RNA,采用Real-time PCR方法检测标本H5N6亚型流感病毒,对病毒HA和NA基因片段采用一步法RT-... 目的分析福建省首例人感染H5N6禽流感病例的实验室检测结果,为今后实验室检测和疫情防控提供依据。方法采集患者咽拭子和外环境标本,提取病毒RNA,采用Real-time PCR方法检测标本H5N6亚型流感病毒,对病毒HA和NA基因片段采用一步法RT-PCR进行扩增并测序,利用生物信息学软件初步分析病毒进化特征。结果病例咽拭子标本经实验室确诊为H5N6亚型流感病毒,命名为:A/Fujian-Sanyuan/21099/2017(H5N6);不同时间先后5次采集患者咽拭子标本,前3次仍检出H5N6流感阳性;采集43份外环境标本,检测出16份H5阳性标本;同源性分析发现A/Fujian-Sanyuan/21099/2017(H5N6)病毒的HA和NA基因分别高度同源于A/Cygnus atratus/Hubei/2Z2-O/2016(H5N8)病毒和A/chicken/Hubei/ZYSJF16/2016(H5N6)病毒,同源性分别达99.6%和99.0%;氨基酸分析发现,病毒HA基因切割位点具有多个连续的碱性氨基酸,氨基酸序列为:PLREKRRKR﹡GLF。结论该患者为福建省首例人感染高致病性H5N6禽流感病毒病例,该病毒HA和NA基因分别与H5N8和H5N6病毒基因高度相似。 展开更多
关键词 人感染h5n6禽流感 实验室检测 血凝素和神经氨酸酶 进化树
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赣州市2014年新型甲型H1N1流感病毒NA基因特征及耐药性分析 被引量:3
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作者 熊衍峰 李如 +3 位作者 李健雄 施勇 胡晓军 龙彩云 《实验与检验医学》 CAS 2016年第4期458-460,465,共4页
目的分析江西省赣州市2014年新型甲型H1N1流感病毒NA基因的特点,掌握其耐药情况,为临床治疗和疾病控制提供参考依据。方法随机选择17株新型甲型H1N1流感病毒,经核酸提取和one-step RT-PCR扩增NA基因片段,双向序列测定,采用DNAStar5.0和M... 目的分析江西省赣州市2014年新型甲型H1N1流感病毒NA基因的特点,掌握其耐药情况,为临床治疗和疾病控制提供参考依据。方法随机选择17株新型甲型H1N1流感病毒,经核酸提取和one-step RT-PCR扩增NA基因片段,双向序列测定,采用DNAStar5.0和Mage4.0序列分析软件分析NA基因特征以及耐药性位点。结果 17株毒株的NA基因片段与代表株A/California/07/2009(H1N1)的序列核苷酸序列进行比对,核苷酸序列同源性高达98.4%以上,氨基酸的同源性也高达97.0%以上。17株毒株的NA活性中心位点氨基酸及周围的辅助位点氨基酸均未发生氨基酸替换。结论 17株毒株的NA基因片段保持高度的同源性并均对流感病毒神经氨酸酶抑制剂药物敏感,但仍应加强对流感病毒的耐药性监测,为制定新型甲型H1N1流感的防制措施提供技术支持。 展开更多
关键词 新型甲型h1n1流感病毒 nA 耐药性
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2013年宜春市甲型H1N1流感病毒分离鉴定及HA基因分子进化分析 被引量:3
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作者 陈玉红 李美蓉 +5 位作者 陆红云 张红波 吴绍武 刘雪莲 谢海珍 钟玲 《疾病监测》 CAS 2016年第2期101-105,共5页
目的对2013年江西省宜春市甲型H1N1流感病毒HA基因序列及其编码的氨基酸序列进行分子进化分析,为防控甲型H1N1流感大流行和常规监测提供科学根据。方法随机选择11株2013年宜春市疾病预防控制中心流感监测实验室分离到的甲型H1N1流感病... 目的对2013年江西省宜春市甲型H1N1流感病毒HA基因序列及其编码的氨基酸序列进行分子进化分析,为防控甲型H1N1流感大流行和常规监测提供科学根据。方法随机选择11株2013年宜春市疾病预防控制中心流感监测实验室分离到的甲型H1N1流感病毒毒株,提取病毒RNA,One-step RT-PCR扩增HA基因并双向测序。以世界卫生组织疫苗推荐株A/California/07/2009(H1N1)(Gen Bank:CY121680)和几株国内外近几年分离的流感甲型H1N1毒株的HA基因为参考序列,采用DNAStar 7.0和Mega 5.0软件对HA基因及其编码的氨基酸序列进行比对,绘制分子进化树,进行HA变异分析。结果 2013年宜春市11株所测甲型H1N1流感病毒与疫苗推荐株亲缘性较近,进一步参考几株国内外近几年分离到的流感甲型H1N1毒株,HA没有发生较大变异;其HA基因序列二硫键、糖基化位点未发生变异;尽管有7株毒株同时在抗原决定簇区A区和受体结合位点130环或其附近发生单个位点氨基酸替换变异,但未形成流行病学变异新种。结论目前的甲型H1N1流感疫苗仍对人群有保护作用,而抗原决定簇和受体结合位点的变异提示仍需要密切关注甲型H1N1流感的再次流行。 展开更多
关键词 甲型h1n1流感病毒 hA基因 序列分析 分子进化
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One-step RT-PCR-RFLP方法筛查新型甲型H1N1流感病毒Oseltamivir耐药株 被引量:2
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作者 熊英 施勇 +3 位作者 李健雄 龚甜 周珺 徐刚 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2014年第23期3409-3411,共3页
目的分析2013年江西省甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因第275位氨基酸变异情况,掌握甲型H1N1流感病毒耐药特性,为甲型H1N1流感临床治疗和疾病控制提供参考。方法收集江西省流感监测哨点医院采集的流感样病例的鼻咽拭子标本,采用狗肾... 目的分析2013年江西省甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因第275位氨基酸变异情况,掌握甲型H1N1流感病毒耐药特性,为甲型H1N1流感临床治疗和疾病控制提供参考。方法收集江西省流感监测哨点医院采集的流感样病例的鼻咽拭子标本,采用狗肾传代细胞(MDCK)对标本进行病毒分离,对分离的31株新型甲型H1N1流感病毒进行核酸提取,采用一步法逆转录-聚合酶链反应(One-step RT-PCR)扩增病毒NA基因部分片段,采用限制性内切酶片段长度多态性分析(RFLP)方法,分析扩增的部分NA基因第275位是否发生组氨酸(H)到酪氨酸(Y)的突变。结果2013年江西省31株甲型H1N1流感病毒NA基因第275位氨基酸均为组氨酸,未发生变异。结论 2013年31株毒株均对Oseltamivir敏感,One-step RT-PCR-RFLP方法筛查新型甲型H1N1流感病毒Oseltamivir耐药株简便可行。 展开更多
关键词 新型甲型h1n1流感病毒 神经氨酸酶基因 耐药性 一步法逆转录聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性分析方法
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H5N6禽流感病毒双重实时荧光RT-PCR的建立与应用 被引量:2
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作者 谭翰清 程洁萍 +6 位作者 朱颖梅 谭海芳 黄强 苏乐斌 林凤 邓廷国 黎碧坚 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2017年第1期62-65,共4页
目的 建立H5N6禽流感病毒TaqMan-MGB探针双重实时荧光RT-PCR,用于疑似病例快速诊断及活禽交易市场外环境监测.方法 根据GenBank中H5N6禽流感病毒HA和NA高保守序列设计特异引物和TaqMan-MGB探针,建立和优化双重实时荧光RT-PCR体系,进行... 目的 建立H5N6禽流感病毒TaqMan-MGB探针双重实时荧光RT-PCR,用于疑似病例快速诊断及活禽交易市场外环境监测.方法 根据GenBank中H5N6禽流感病毒HA和NA高保守序列设计特异引物和TaqMan-MGB探针,建立和优化双重实时荧光RT-PCR体系,进行特异性、灵敏度、重复性试验,并在临床应用中与商品化试剂盒比较.结果 H5N6双重实时荧光RT-PCR体系可在80 min内完成检测,与其它亚型流感病毒及常见呼吸道病原体无交叉反应,最低检测限达到10拷贝/反应,H5和N6靶基因标准曲线的相关系数R2分别为0.999和0.993,Ct值的变异系数分别为0.151%-0.549%和0.213%-0.575%,验证试验的阳性和阴性符合率均为100%.结论 H5N6禽流感病毒TaqMan-MGB探针双重实时荧光RT-PCR特异、灵敏、稳定,可在疑似病例的早期快速应急检测及活禽交易市场外环境持续性监测方面具有较好的应用价值. 展开更多
关键词 h5n6禽流感病毒 实时荧光RT—PCR TaqMan.MGB探针 血凝素基因 神经氨酸酶 基因
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