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山东省首例输入性D8基因型麻疹病例的流行病学调查 被引量:12
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作者 刘晓冬 杨峰 +4 位作者 房学强 王常银 熊萍 徐爱强 许青 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2019年第1期21-23,共3页
目的调查2018年3月在山东省发现的1例D8基因型麻疹病毒病例,评价防控效果。方法对该麻疹病例进行现场流行病学调查,采集病例急性期血标本和咽拭子标本进行血清学检测、病毒分离和基因型鉴定。对周围人群开展麻疹疫苗应急免疫。结果该病... 目的调查2018年3月在山东省发现的1例D8基因型麻疹病毒病例,评价防控效果。方法对该麻疹病例进行现场流行病学调查,采集病例急性期血标本和咽拭子标本进行血清学检测、病毒分离和基因型鉴定。对周围人群开展麻疹疫苗应急免疫。结果该病例发病前8-17d有泰国旅行史,血清麻疹IgM阳性,麻疹病毒分离阳性,鉴定为麻疹病毒D8基因型,与澳大利亚、日本2018年分离到的D8基因型核苷酸和氨基酸同源性均为100%。对病例周围人群采取麻疹疫苗应急免疫等措施,未发生续发病例。结论该病例为山东省首例输入性D8基因型麻疹病例,未引起本土传播。病原学监测是及时发现输入性疫情的关键,高麻疹疫苗接种率是阻断其传播的有效措施。 展开更多
关键词 麻疹病毒 D8基因型 输入性病例
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云南省首起境外输入性D8基因型麻疹病毒暴发疫情调查 被引量:9
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作者 余文 赵智娴 +3 位作者 李立群 周榕溶 张杰 李琼芬 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2018年第1期32-35,47,共5页
目的调查云南省边境地区2017年1起麻疹暴发疫情的原因,评价防控措施效果。方法对病例开展流行病学调查,采集病原学标本进行麻疹病毒分离和鉴定;对疫情地区8月龄-35岁人群开展两轮麻疹风疹联合减毒活疫苗(MR)的应急免疫及其效果评... 目的调查云南省边境地区2017年1起麻疹暴发疫情的原因,评价防控措施效果。方法对病例开展流行病学调查,采集病原学标本进行麻疹病毒分离和鉴定;对疫情地区8月龄-35岁人群开展两轮麻疹风疹联合减毒活疫苗(MR)的应急免疫及其效果评价。结果本起疫情共报告2例麻疹病例,为母子,母亲发病前18d曾去泰国;2例病例均分离到麻疹病毒,首株病毒与D8基因型参考株的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.5%、97.4%;与第二株病毒的同源性分别为99.1%和99.3%。当地人群的MR应急接种率为99.10%(2745/2770),应急免疫后麻疹IgG抗体阳性率为98.61%(71/72)、抗体几何平均滴度为1:9076.19,未再出现麻疹病例。结论本起暴发由境外输入的D8基因型麻疹病毒引起,在云南省首次监测发现;采用MR应急免疫有效控制了疫情。 展开更多
关键词 麻疹病毒 D8基因型 暴发
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2015-2019年北京市麻疹病毒分子流行病学分析 被引量:6
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作者 于霞丽 张朱佳子 +3 位作者 付茵 王雪 黄芳 陈萌 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期623-628,共6页
目的分析2015-2019年北京市麻疹病毒(measles virus,MV)分子流行病学特征,为消除麻疹提供实验室依据。方法通过北京市麻疹实验室网络收集2015-2019年麻疹病毒阳性咽拭子标本,提取病毒核酸后采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增麻疹... 目的分析2015-2019年北京市麻疹病毒(measles virus,MV)分子流行病学特征,为消除麻疹提供实验室依据。方法通过北京市麻疹实验室网络收集2015-2019年麻疹病毒阳性咽拭子标本,提取病毒核酸后采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增麻疹病毒N基因C末端450个核苷酸片段,对扩增产物进行核苷酸序列测定,获得基因序列同WHO麻疹病毒基因型代表株、中国和其他国家D8基因型参考株构建系统进化树,分析核苷酸和氨基酸同源性;对D8和B3基因型麻疹病例进行描述性分析。结果2015-2019年全市麻疹病毒基因型鉴定株546株,其中H1a基因型531株,疫苗株5株,B3基因型1株,D8基因型9株,其中8株为2019年流行株。本土株H1a基因型MV核苷酸和氨基酸同源性为91.5%~100.0%和73.6%~100.0%。2019年8例D8基因型麻疹病例均为成人,其中2例为一起暴发疫情,其余6例为散发病例。结论输入性D8基因型成为2019年北京市MV主要流行基因型;2015-2019年随着麻疹发病下降,本土基因型H1a已经不占优势,而其他不同基因型输入,形成混合流行的趋势,建议在消除麻疹工作中,不仅要努力阻断本土麻疹病毒传播,更要防控非本土基因型病毒输入和持续传播,避免其逐渐演化为优势毒株而建立本土传播的风险。 展开更多
关键词 麻疹 麻疹病毒 H1a基因型 D8基因型 B3基因型 分子流行病学
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上海市2018年D8基因型麻疹病毒病例流行病学与病原学特征 被引量:5
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作者 李智 崔晓娴 +13 位作者 任佳 李崇山 沈妍琼 唐伟 费怡 杨天 钱晓华 杨彦基 李晓军 朱奇 张莉萍 陈泓泓 胡家瑜 孙晓冬 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2019年第6期630-634,663,共6页
目的了解2018年D8基因型麻疹病毒(Measles virus,MV)病例的流行病学和病原学特征。方法通过中国麻疹监测信息报告管理系统收集上海市2018年麻疹病例;对病原学标本进行MV核酸检测、病毒分离和基因测序定型;对数据进行描述性分析。结果201... 目的了解2018年D8基因型麻疹病毒(Measles virus,MV)病例的流行病学和病原学特征。方法通过中国麻疹监测信息报告管理系统收集上海市2018年麻疹病例;对病原学标本进行MV核酸检测、病毒分离和基因测序定型;对数据进行描述性分析。结果2018年上海市鉴定发现7例D8基因型MV病例,其中3月发病2例、10-12月5例;6月龄1例、25-31岁6例;无含麻疹成分疫苗(MCV)免疫史2例、免疫史不详5例。7例病例属于3起聚集性疫情:在出疹前7-21d有泰国旅行史2例;有日本旅行史2例及其密切接触感染1例;无外出旅行史1例及其密切接触感染1例。该7株D8基因型MV与本市2016年输入性D8基因型MV的核苷酸、氨基酸序列同源性分别为99.1%-99.3%、98.0%-98.6%;与2015-2018年其他国家D8基因型MV的同源性为99.34%-100%。结论2018年上海市发现的D8基因型MV病例为输入病例或输入相关病例。建议继续做好MCV接种工作,并开展高质量的流行病学和病原学监测。 展开更多
关键词 麻疹 麻疹病毒 D8基因型 流行病学 病原学
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辽宁省首例D8基因型麻疹病毒的分离与鉴定 被引量:4
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作者 王艳 郝爽 +3 位作者 王文思 韩一楠 方兴 姚文清 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2018年第5期484-487,共4页
目的分离并鉴定辽宁省首次监测到D8基因型麻疹病毒。方法本研究采用Vero/Slam细胞对该病例的咽拭子标本进行病毒分离,应用逆转录一聚合酶链反应(RT-PCR)分别扩增麻疹病毒(MEV)血凝素(hemagglutinin,H)基因全长和N基因羧基末端... 目的分离并鉴定辽宁省首次监测到D8基因型麻疹病毒。方法本研究采用Vero/Slam细胞对该病例的咽拭子标本进行病毒分离,应用逆转录一聚合酶链反应(RT-PCR)分别扩增麻疹病毒(MEV)血凝素(hemagglutinin,H)基因全长和N基因羧基末端的450个核苷酸,对扩增产物序列进行分析。结果辽宁D8基因型麻疹病毒分离株和世界卫生组织D8基因型参考株Mvi/Manchester.GBR/30.94在基因亲缘性关系树上同属一个分支,N基因和H基因核苷酸同源性均为98.9%。从GenBank上下载的D8基因型病毒序列进行比对,结果表明本研究分离的D8基因型麻疹病毒与2018年在哥伦比亚分离的MVi/LosPatios.COL/11.18/D8株病毒和2012-2016年在中国香港流行的D8基因型麻疹病毒核苷酸同源性为100%。结论麻疹D8基因型病毒的检出,对积累辽宁省麻疹分子流行病学基线数据具有重要的意义,有助于全国及全球麻疹病毒的传播及溯源研究。 展开更多
关键词 麻疹病毒 D8基因型 基因特征
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福建省输入性D8基因型麻疹病毒分子流行病学特征 被引量:4
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作者 李东 杨秀惠 +4 位作者 张苏晗 陈致飞 张海荣 潘伟毅 周勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1066-1073,共8页
为分析福建省输入性D8基因型麻疹病毒分子流行病学特征,采集咽拭子标本采用实时荧光定量反转录⁃聚合酶链反应(Real⁃time RT⁃PCR)筛查麻疹病毒核酸。用反转录⁃聚合酶链反应(RT⁃PCR)扩增麻疹病毒核酸筛查阳性咽拭子及Vero/Slam细胞培养阳... 为分析福建省输入性D8基因型麻疹病毒分子流行病学特征,采集咽拭子标本采用实时荧光定量反转录⁃聚合酶链反应(Real⁃time RT⁃PCR)筛查麻疹病毒核酸。用反转录⁃聚合酶链反应(RT⁃PCR)扩增麻疹病毒核酸筛查阳性咽拭子及Vero/Slam细胞培养阳性产物,对麻疹病毒核蛋白(Nucleoprotein,N)羧基(COOH)端634个核苷酸(Nucleotides,nt)片段进行测序分析,构建系统进化树。最终分离获得1株麻疹病毒株,26条麻疹病毒N蛋白羧基末端450个nt序列。亲缘性分析发现,所有福建麻疹毒株与WHO D8基因型参考株(MVi/Manchester.GBR/30.94)在亲缘关系树上同属一个大分支,两者核苷酸序列和氨基酸(Amino acid,aa)序列同源性分别为96.4%~99.1%和96.7%~98.0%。其中2014年的福建毒株MVs/Fujian.CHN/28.14和MVs/Fujian.CHN/30.14与越南胡志明市2014年分离株MVs/HoChiMinh.VNM/11.14及美国纽约2013年分离株MVs/New_York.USA/19.13的nt同源性为100%;2019年的毒株MVs/Fujian.CHN/25.19与泰国龙仔厝府2018年分离株MVs/Samut_Sakhon.THA/8.18的nt同源性为100%;而剩余的23个监测毒株则与日本神户2019年分离株MVs/KobeC.JPN/28.19的核苷酸同源性和氨基酸同源性最高,分别为99.6%~100.0%和99.3%~100.0%。在病毒N蛋白羧基端150个氨基酸位点上,福建株与WHO D8参考株存在3~5个氨基酸位点差异。而与现用的疫苗株(Shanghai⁃191)相比,存在17~19个氨基酸变异位点,其中有14个氨基酸位点为所有福建株共有的变异位点,这些位点的变异总体上未对编码蛋白的氨基酸造成明显改变。结论是福建省成功分离获得1株D8基因型麻疹毒株。D8基因型为福建省发现的输入性麻疹基因型,病毒N蛋白羧基端氨基酸位点上与疫苗株相比均出现了差异位点。 展开更多
关键词 麻疹病毒 输入性 D8基因型
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2017-2019年江苏省输入性D8和B3基因型麻疹的分子流行病学特征 被引量:3
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作者 邓秀英 胡莹 +1 位作者 陆培善 郭宏雄 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2020年第5期498-503,共6页
目的分析江苏省输入性D8基因型、B3基因型麻疹病毒(Measles virus,MV)病例分子流行病学特征。方法对2017-2019年江苏省疑似麻疹病例开展流行病学调查,采集咽拭子标本进行MV核酸检测、分离培养、N基因RT-PCR扩增和序列测定,分析MV分离株... 目的分析江苏省输入性D8基因型、B3基因型麻疹病毒(Measles virus,MV)病例分子流行病学特征。方法对2017-2019年江苏省疑似麻疹病例开展流行病学调查,采集咽拭子标本进行MV核酸检测、分离培养、N基因RT-PCR扩增和序列测定,分析MV分离株与GenBank中24个基因型参考株的核苷酸和氨基酸同源性,描述输入性MV病例特征。结果从2017-2019年麻疹报告病例中获得12株MV,其中H1a、D8、B3基因型分别为8株、3株、1株。H1a基因型MV间核苷酸、氨基酸同源性均为100%;D8基因型MV与澳大利亚、美国、日本、文莱、阿根廷MV株核苷酸、氨基酸同源性分别为98.7%-100%、97.3%-100%;B3基因型MV与美国、澳大利亚MV株核苷酸、氨基酸同源性均为100%。3例D8基因型病例含麻疹成分疫苗(MCV)免疫史不详,其中1例有埃及旅行史;1例B3基因型病例无MCV免疫史,有菲律宾旅行史和麻疹确诊病例接触史。结论2017-2019年江苏省麻疹流行仍以本土H1a基因型MV为主,并出现输入性D8和B3基因型MV;需加强麻疹分子流行病学监测。 展开更多
关键词 麻疹 麻疹病毒 D8基因型 B3基因型 分子流行病学
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四川省首例输入性D8基因型麻疹病毒基因特征分析 被引量:3
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作者 刘李 徐朝花 +2 位作者 谢应国 邓绪东 何吉兰 《中国病毒病杂志》 CAS 2019年第5期361-364,共4页
目的对四川省1例输入性麻疹病例的病毒株进行基因特征分析。方法采用Vero/SLAM细胞分离培养麻疹病毒,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增麻疹病毒N基因羧基末端634个核苷酸片段,并对PCR产物进行序列测定和同源性分析。结果该麻疹... 目的对四川省1例输入性麻疹病例的病毒株进行基因特征分析。方法采用Vero/SLAM细胞分离培养麻疹病毒,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增麻疹病毒N基因羧基末端634个核苷酸片段,并对PCR产物进行序列测定和同源性分析。结果该麻疹病毒分离株与世界卫生组织(WHO)D8基因型参考株在基因亲缘性关系树上同属1个分支,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%和98.0%。结论该病例为四川省首例输入性D8基因型麻疹病例。 展开更多
关键词 麻疹病毒 N基因 D8基因型 序列分析
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福建省2014—2019年麻疹病毒基因型监测情况分析 被引量:2
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作者 李东 张苏晗 +5 位作者 陈致飞 杨秀惠 郑凝旋 张海荣 潘伟毅 周勇 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2022年第1期46-52,共7页
目的分析福建省2014—2019年不同基因型麻疹野病毒流行情况,为制定后续麻疹防控策略,完成消除麻疹目标提供参考。方法收集福建省2014—2019年麻疹发病监测数据及各地市上送的麻疹疑似病例咽拭子样本,采用逆转录-聚合酶链反应扩增麻疹病... 目的分析福建省2014—2019年不同基因型麻疹野病毒流行情况,为制定后续麻疹防控策略,完成消除麻疹目标提供参考。方法收集福建省2014—2019年麻疹发病监测数据及各地市上送的麻疹疑似病例咽拭子样本,采用逆转录-聚合酶链反应扩增麻疹病毒N蛋白羧基端450个核苷酸序列,对扩增产物进行序列鉴定和分析。结果2014—2019年福建省共报告疑似麻疹病例1102例,年发病率为0.47/10万;实验室共接收咽拭子标本884份,获得除疫苗株外麻疹病毒N蛋白羧基端450个核苷酸序列179条,其中110条为H1基因型麻疹毒株序列,43条为B3基因型麻疹毒株序列,26条为D8基因型麻疹毒株序列。福建省H1基因型麻疹病毒属于H1a基因亚型,存在两个分支,有19种不同的变异序列毒株,部分毒株与其他国家和地区的麻疹毒株高度同源(99.8%~100.0%);福建省B3基因型麻疹病毒存在6个变异序列毒株,与国内外流行的B3型麻疹毒株之间核苷酸同源性为98.4%~100.0%,其中部分毒株与2018年的香港HongKong.C HN/35.18/B3毒株同源性为100.0%,与美国、日本、菲律宾等国的B3基因型毒株高度同源(99.8%);而福建省D8基因型麻疹毒株存在5个变异序列毒株,部分毒株与2014年越南的HoChiMinh.VNM/11.14/MV95毒株、2019年日本的MVs/KobeC.JPN/28.19/19MR69毒株、2018年的泰国MVs/Samut_Sakhon.THA/8.18毒株高度同源。结论2014—2019年福建省共发现三种不同基因型别的麻疹野病毒(H1、B3、D8型)流行传播,其中H1a基因型依然是福建省的本土流行基因型,B3和D8基因型麻疹病毒为福建省输入性基因型毒株,并引起有限的传播流行。结果提示福建省近年来麻疹本土病例虽有所减少,但境外输入病例的风险在增大,后续应加强境外输入病例的监测。 展开更多
关键词 麻疹病毒 B3基因型 D8基因型 病原学监测
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2012年上海市虹口区麻疹流行株基因特征分析 被引量:2
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作者 李淑华 汤显 +5 位作者 钱晓华 袁政安 李崇山 杨彦基 于晓楠 龚向真 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期429-432,共4页
目的 鉴定2012年上海市虹口区麻疹流行株基因型,了解2000-2012年上海市麻疹流行株基因特性.方法 采集疑似麻疹病例咽拭子标本,使用Vero-SLAM细胞分离麻疹病毒,使用RT-PCR扩增分离培养阳性病毒N基因羧基末端450 bp片段并测序,与GenBank... 目的 鉴定2012年上海市虹口区麻疹流行株基因型,了解2000-2012年上海市麻疹流行株基因特性.方法 采集疑似麻疹病例咽拭子标本,使用Vero-SLAM细胞分离麻疹病毒,使用RT-PCR扩增分离培养阳性病毒N基因羧基末端450 bp片段并测序,与GenBank中的部分流行株构建系统进化树,分析麻疹病毒基因型,同时进行流行病学调查.结果 34份咽拭子标本中分离到麻疹病毒7株,进化树分析显示,6株为H1基因型,1株为D8基因型.流行病学调查显示,D8基因型为上海自2000年开展病毒监测以来的首次外来输入病毒.结论 2012年虹口区麻疹分离株与历年上海市麻疹流行株属于同一基因型,Hla亚型为优势流行株,首次出现D8基因型,为外来输入病毒. 展开更多
关键词 麻疹病毒 输入病例 D8基因型
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河北省两起由D8基因型麻疹病毒引起的家庭聚集性疫情特征分析 被引量:1
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作者 杜慧 丛艳丽 +3 位作者 王伟 张敬坡 郭玉 张振国 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2022年第3期235-239,共5页
目的分析河北省邯郸市两起麻疹家庭聚集性疫情的特征。方法采集患者血清标本和急性期咽拭子标本,分别进行麻疹IgM和Ig G抗体亲和力检测及病毒分离培养。提取分离的麻疹病毒RNA,采用RT-PCR法扩增麻疹病毒核蛋白(N)基因羧基末端450个核苷... 目的分析河北省邯郸市两起麻疹家庭聚集性疫情的特征。方法采集患者血清标本和急性期咽拭子标本,分别进行麻疹IgM和Ig G抗体亲和力检测及病毒分离培养。提取分离的麻疹病毒RNA,采用RT-PCR法扩增麻疹病毒核蛋白(N)基因羧基末端450个核苷酸序列,用Mega 6.0软件和麻疹病毒标准株参考序列构建亲缘性关系树,确定分离株的基因型。结果两起疫情共确诊麻疹病例5例,每起均出现了二代病例。其中1例病例有两剂次麻疹类疫苗免疫史,麻疹Ig G相对亲和力指数(relative avidity index,RAI)<40%,属于原发性免疫失败。5例病例咽拭子标本经基因亲缘性关系分析,均为D8基因型麻疹病毒;5株病毒序列与D8基因型参考株(D8-Manchester.UNK/30.94)的核苷酸和氨基酸同源性较高,分别为98.4%~98.6%和97.3%,与中国本土H1基因型参考株核苷酸和氨基酸同源性较低,分别为92.8%~93.1%和93.3%,与同时期流行于东南亚地区的D8基因型核苷酸和氨基酸同源性均为100.0%。结论引起两起家庭聚集性疫情的麻疹病毒为D8基因型,经直接或间接接触传播。积极开展应急接种能够避免更广泛的传播。 展开更多
关键词 麻疹 麻疹病毒 D8基因型 亲和力
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浙江省平湖市1起D8基因型麻疹暴发疫情病例的经济负担分析 被引量:1
12
作者 姚凤燕 向泽林 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2019年第1期24-27,共4页
目的了解浙江省平湖市1起D8基因型麻疹暴发疫情病例的疾病经济负担。方法收集平湖市2017年1起D8基因型麻疹暴发疫情病例信息,分析经济负担及其影响因素,并与2015年浙江省嘉兴市本土流行株麻疹病例的经济负担进行比较。结果 10例D8基因... 目的了解浙江省平湖市1起D8基因型麻疹暴发疫情病例的疾病经济负担。方法收集平湖市2017年1起D8基因型麻疹暴发疫情病例信息,分析经济负担及其影响因素,并与2015年浙江省嘉兴市本土流行株麻疹病例的经济负担进行比较。结果 10例D8基因型麻疹病例的平均直接、间接和总经济负担分别为9 418.55元、2 430.92元和11 849.47元;其中男性、常住人口、住院病例的总经济负担分别高于女性、非常住人口、未住院病例(Z=-2.19,P=0.032;Z=-2.09,P=0.044;Z=-2.09,P=0.044)。45例本土流行株麻疹病例的平均直接、间接和总经济负担分别为4598.12元、2720.76元、7 318.88元(与D8基因型病例相比,Z=-2.53,P=0.011;Z=-0.31,P=0.760;Z=-1.81,P=0.070)。多重线性回归分析显示,所有55例病例的总经济负担以住院、有医保、常住人口病例分别高于未住院、无医保、非常住人口病例(t=3.11,P=0.003;t=2.38,P=0.021;t=2.38,P=0.021),而D8基因型与本土流行株病例之间无显著性差异(t=1.69,P=0.097)。结论 D8基因型麻疹病例经济负担较高,且直接经济负担高于本土流行株病例,而麻疹病例总经济负担与基因型别无关。 展开更多
关键词 麻疹 D8基因型 经济负担
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山西省首起境外输入性D8基因型麻疹病毒疫情调查 被引量:1
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作者 王海娇 李虹 +6 位作者 王慧 郜慧 光明 杨婷婷 陈霄 王晓芳 常少英 《首都公共卫生》 2021年第6期356-358,共3页
目的 调查山西省首起境外输入性D8基因型麻疹病毒疫情暴发的原因,评价防控措施效果。方法 对病例进行个案调查,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)对血清学样本进行麻疹IgM抗体检测。采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法对咽拭子样本进行核酸... 目的 调查山西省首起境外输入性D8基因型麻疹病毒疫情暴发的原因,评价防控措施效果。方法 对病例进行个案调查,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)对血清学样本进行麻疹IgM抗体检测。采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法对咽拭子样本进行核酸检测。采用Vero/slam细胞培养麻疹核酸阳性咽拭子样本,分离出麻疹病毒后进行核酸序列测定。结果 本次疫情从2018年3月16日首发病例发热开始,到4月30日续发病例痊愈后经过一个最长潜伏期未出现新病例结束,共报告麻疹确诊病例2例,为一起家庭聚集性麻疹暴发疫情。经鉴定首发病例感染的是D8基因型麻疹病毒,为山西省首次发现。结论 山西省麻疹病毒出现了除H1a基因型外的其他基因型,D8基因型是否会成为山西省的优势毒株,须继续进行麻疹病原学监测。积极治疗传染源,阻断传播途径是控制麻疹疫情的重要措施。 展开更多
关键词 麻疹病毒 D8基因型 输入病例
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中山市2014年麻疹病毒分子生物学特征分析
14
作者 谢颖 高赛珍 +2 位作者 师舞阳 欧慧 王翠玲 《社区医学杂志》 2020年第12期840-843,共4页
目的麻疹病毒学监测数据表明,H1基因型是中国本土优势基因型。本研究分析广东省中山市2014年麻疹病毒分子生物学流行特征,为麻疹消除策略修订或制定提供数据依据。方法采集广东省中山市2014-01-01-2014-12-31全年疑似患者的急性期咽拭子... 目的麻疹病毒学监测数据表明,H1基因型是中国本土优势基因型。本研究分析广东省中山市2014年麻疹病毒分子生物学流行特征,为麻疹消除策略修订或制定提供数据依据。方法采集广东省中山市2014-01-01-2014-12-31全年疑似患者的急性期咽拭子,通过RT-PCR和基因测序分析N基因碳末端450个核苷酸片段;应用BLASTn对序列进行相似性检索,分析麻疹病毒基因特征,并与WHO推荐的参考株进行对比;采用MEGA对麻疹核蛋白核苷酸构建NJ种系进化树。结果广东省中山市麻疹监测网络实验室收检疑似麻疹咽拭子306份,核酸阳性213份,阳性率69.61%。对213份咽拭子核酸阳性样品进行病毒分离,共分离出98株麻疹病毒,病毒分离率46.01%。除zhongshan2014-5为D8基因型外,其他均是H1基因型。zhongshan2014-5与越南病毒株(Viet Nam:Ho Chi Minh CityAB928200)序列同源性100%,属于D8型。结论 H1基因型是中山市2014年流行麻疹病毒的绝对优势基因型,中山市首次发现输入性D8型麻疹病毒感染病例。 展开更多
关键词 麻疹病毒 序列同源性 D8基因型 逆转录-聚合酶链反应 中山市
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河北省首例D8基因亚型麻疹病毒株的分子流行病学分析
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作者 王伟 杜慧 +5 位作者 史卫卫 丛艳丽 崔世恒 刘岩 郭玉 张振国 《医学动物防制》 2021年第7期617-620,共4页
目的开展麻疹患者的病原学和分子监测,加强麻疹病毒基因型的监测。方法利用Vero/SLAM细胞(淋巴信号激活因子转染的非洲绿猴肾细胞),按常规方法分离病毒;利用RT-PCR扩增麻疹病毒N基因,然后测序并构建基因亲缘性关系树。对麻疹疫苗株S191... 目的开展麻疹患者的病原学和分子监测,加强麻疹病毒基因型的监测。方法利用Vero/SLAM细胞(淋巴信号激活因子转染的非洲绿猴肾细胞),按常规方法分离病毒;利用RT-PCR扩增麻疹病毒N基因,然后测序并构建基因亲缘性关系树。对麻疹疫苗株S191和此次分离的D8野毒株进行抗体中和试验,计算中和抗体滴度,比较疫苗对不同毒株的保护效果。结果该麻疹病毒分离株与世界卫生组织(WHO)D8基因亚型参考株在基因亲缘性关系树上同属1个分支,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.7%和97.3%;与2019年第44周我国香港监测到的D8基因亚型麻疹病毒流行株的核苷酸和氨基酸相似性均为100%。所选血清标本对麻疹疫苗株和此次分离的D8野毒株的中和抗体几何平均滴度分别为1∶50.80和1∶40.32,中和抗体滴度无明显差异。结论河北省首次监测到输入型D8基因亚型麻疹患者。 展开更多
关键词 麻疹病毒 N基因 D8基因亚型 亲缘性分析
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河北省2020年1例接种麻疹风疹联合减毒活疫苗后D8基因型麻疹野病毒感染的鉴定
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作者 杜慧 王伟 +5 位作者 丛艳丽 张敬坡 郭玉 王亚菲 张振国 李琦 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2020年第4期395-398,共4页
目的对河北省2020年1例接种麻疹风疹联合减毒活疫苗(MR)后发热出疹病例进行麻疹病毒基因型鉴定。方法对该病例进行流行病学调查,采集血清和咽拭子标本,分别检测麻疹IgM抗体和麻疹病毒核酸,麻疹病毒核酸阳性标本进行核苷酸序列测定和分... 目的对河北省2020年1例接种麻疹风疹联合减毒活疫苗(MR)后发热出疹病例进行麻疹病毒基因型鉴定。方法对该病例进行流行病学调查,采集血清和咽拭子标本,分别检测麻疹IgM抗体和麻疹病毒核酸,麻疹病毒核酸阳性标本进行核苷酸序列测定和分析。结果该病例8月龄,接种MR后8d出现发热、出疹、咳嗽、卡他、结膜炎、柯氏斑和淋巴结肿大;血清麻疹IgM抗体阳性,咽拭子标本麻疹病毒核酸阳性;该例麻疹病毒株与WHO D8基因型参考株的核苷酸、氨基酸同源性分别为98.6%、97.3%,与中国香港D8基因型株的核苷酸和氨基酸同源性均为100%。结论该例接种MR后麻疹病例为非本土的D8基因型麻疹野病毒感染所致,与MR接种无关。 展开更多
关键词 麻疹 麻疹病毒 D8基因型 麻疹风疹联合减毒活疫苗
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人工合成小麦与普通小麦杂交后代衍生群体的Rht8基因分析 被引量:5
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作者 杨松杰 王岩军 +2 位作者 李俊 刘世贵 杨武云 《中国农学通报》 CSCD 2007年第2期50-55,共6页
【目的】四倍体小麦与节节麦杂交培育的人工合成小麦已广泛应用于国内外小麦品种改良。通过研究人工合成小麦与普通小麦杂交后代的Rht8基因型,有助于提高分子标记育种效率,也有助于Rht8基因型的多态性研究,并为人工合成小麦在中国小麦... 【目的】四倍体小麦与节节麦杂交培育的人工合成小麦已广泛应用于国内外小麦品种改良。通过研究人工合成小麦与普通小麦杂交后代的Rht8基因型,有助于提高分子标记育种效率,也有助于Rht8基因型的多态性研究,并为人工合成小麦在中国小麦品种改良和分子标记育种中的应用提供依据和方法;【方法】以引自CIMMYT的人工合成小麦分别与中国四川成都平原主栽普通小麦品种杂交、回交的BC2F2:6后代群体中选育的113份优良高代系和川麦38、川麦42、川麦43和川麦47育成品种为材料,采用特异引物的PCR扩增和改进的聚丙烯酰胺凝胶电泳对其Rht8基因型进行了研究;【结果】在以syn768、Syn769、Syn780和Syn786人工合成小麦为亲本的117份后代衍生群体检测材料中,Rht8基因型频率为77.78%。从每一个人工合成小麦形成的小的后代衍生群体看,Rht8基因型频率各不相同。以syn768为亲本的后代衍生群体,Rht8基因型频率最高,为96.70%;在以syn769为亲本而育成的优良高代系和川麦38、川麦42与川麦43育成品种中,Rht8基因型频率最低,为71.64%;以Syn780为亲本的后代衍生群体中,Rht8基因型频率为73.68%,分离比率约为3:1;以Syn786为亲本育成的材料只有川麦47,该品种不含有Rht8该基因;【结论】不论父本或母本的Rht8的基因型状况如何,它们所产生的杂交后代材料Rht8基因的遗传是随机的。 展开更多
关键词 人工合成六倍体小麦 株高 分子标记辅助育种 Rht8基因型 微卫星标记
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中国中南部G8P[8]型A组轮状病毒全基因组遗传特征研究 被引量:1
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作者 熊光萍 田毅 +10 位作者 范佳欣 唐晓苹 董梦洁 车如意 李伟红 唐梅荣 周珺 刘颂 王铭月 李丹地 段招军 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期27-37,共11页
G8基因型轮状病毒已在我国出现并迅速增加。本研究拟对采集于中国中南部5岁以下急性胃肠炎患儿的7例G8P[8]型RVA毒株进行全基因组分子特征分析。对轮状病毒特异性扩增结合高通量测序方法对中国中南部14株G8P[8]型RVA毒株进行全基因组测... G8基因型轮状病毒已在我国出现并迅速增加。本研究拟对采集于中国中南部5岁以下急性胃肠炎患儿的7例G8P[8]型RVA毒株进行全基因组分子特征分析。对轮状病毒特异性扩增结合高通量测序方法对中国中南部14株G8P[8]型RVA毒株进行全基因组测序。利用MEGA11.0、Geneious Prime、Geneious9.0.2和DNASTAR软件对RVA毒株进行全序列及遗传变异和进化分析。7株G8P[8]型RVA的基因分型为G8-P[8]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E1-H2,显示为DS-1样基因型。系统进化树结果显示,本研究中国中南部7株G8P[8]分为两大谱系G8-I(13株)和谱系G8-Ⅱ(1株),VP7的最大分支可信度(MCC)树表明,G8的平均进化率估计为1.4×10^(-3)替换/位点/年。G8P[8]基因型RVA在我国包括两个谱系,从该病毒在中国的出现到该病毒在中国的流行传播将经过1~2年,持续的全国RVA监测至关重要。 展开更多
关键词 轮状病毒 基因型 分子特征 平均进化率
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2021—2022年上海<5岁住院儿童病毒性腹泻的病原学特征 被引量:1
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作者 匡小舟 肖文佳 +2 位作者 潘浩 陈敏 滕峥 《上海预防医学》 CAS 2024年第2期143-149,共7页
【目的】了解新型冠状病毒感染(简称“新冠”)疫情防控期间住院儿童病毒性腹泻病原谱变化及主要病原体基因型别的流行变迁。【方法】采集上海市某哨点儿科医院本地<5岁腹泻住院患儿的粪便标本,采用荧光聚合酶链反应(PCR)方法对轮状... 【目的】了解新型冠状病毒感染(简称“新冠”)疫情防控期间住院儿童病毒性腹泻病原谱变化及主要病原体基因型别的流行变迁。【方法】采集上海市某哨点儿科医院本地<5岁腹泻住院患儿的粪便标本,采用荧光聚合酶链反应(PCR)方法对轮状病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒和肠道腺病毒进行分子检测,对主要病原体进行分子分型和序列分析。【结果】共收集546份标本,总体病毒阳性检出率为37.55%,依次为诺如病毒GⅡ型(22.16%)、A组轮状病毒(16.12%)、星状病毒(2.93%)、肠道腺病毒(2.38%)、札如病毒(0.92%)和诺如病毒GⅠ型(0.18%)。诺如病毒GⅡ型以GⅡ.4[P31]和GⅡ.4[P16]为主要流行株(占比分别为24.79%和14.05%),其中GⅡ.4[P31]检出占比明显下降(χ2=16.140,P<0.001)。此外,还发现国内罕见轮状病毒基因型G8P[8]型在本地的首次流行,且占比呈上升趋势,总体达到7.95%。该基因型代表株在基因进化分析上与东南亚的DS⁃1⁃like G8P[8]毒株进化距离更近。【结论】诺如病毒基因亚型的分布变化和轮状病毒罕见型别的发现都凸显持续性病原监测和基因分型检测的重要性。少见株的本地化流行对上市疫苗的效果评价和潜在疫苗的开发提出了新的要求。 展开更多
关键词 住院儿童 A组轮状病毒 基因型 诺如病毒GⅡ型
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