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基因组图谱综述 被引量:5
1
作者 张海英 许勇 王永健 《分子植物育种》 CAS CSCD 2003年第5期741-745,共5页
基因组图谱是基因组学研究的一项重要内容。本文概述了目前基因组图谱的种类 ,作图的基本原理和方法以及基因组图谱的未来发展趋势。
关键词 基因组 基因组学 遗传 物理 转录图 方法 发展趋势
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毒物基因组学的研究现状和对毒理学今后发展的影响 被引量:5
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作者 张天宝 《毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期83-88,共6页
关键词 基因组学 人类基因组计划 后发展 毒理学 2003年4月 人类基因组序列 毒物 后基因组时代 研究项目 遗传 物理 转录图 科学家 HGP
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基因表达连续分析技术及应用研究的进展 被引量:3
3
作者 谢超 刘荷中 裴雪涛 《国外医学(分子生物学分册)》 CSCD 2002年第6期369-372,共4页
随着功能基因组学研究的兴起 ,基因表达连续分析技术 (SAGE)已成为高通量研究基因表达谱的新手段。 SAGE技术不仅可以用来研究大部分基因组序列尚未鉴定的生物个体的基因表达谱 ,其实验结果还可以直接与发表在 SAGEmap表达数据库中不同... 随着功能基因组学研究的兴起 ,基因表达连续分析技术 (SAGE)已成为高通量研究基因表达谱的新手段。 SAGE技术不仅可以用来研究大部分基因组序列尚未鉴定的生物个体的基因表达谱 ,其实验结果还可以直接与发表在 SAGEmap表达数据库中不同来源的已知文库相比较 ,应用日益受到重视。 展开更多
关键词 基因表达连续分析 应用研究 转录图 表达序列靶
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用cDNA-AFLP技术构建白菜转录图谱 被引量:2
4
作者 范淑英 乐建刚 +1 位作者 成广杰 吴才君 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期1735-1741,共7页
【目的】构建白菜(Brasscia campestris ssp.chinensis)分子转录图谱。【方法】以矮脚黄白菜自交系(97-3-2)和白蔓菁芜菁自交系(001-24),以及以两者为亲本杂交建立的F6重组自交系群体为材料,在莲座期取嫩叶提取RNA并反转录成cDNA,采用cD... 【目的】构建白菜(Brasscia campestris ssp.chinensis)分子转录图谱。【方法】以矮脚黄白菜自交系(97-3-2)和白蔓菁芜菁自交系(001-24),以及以两者为亲本杂交建立的F6重组自交系群体为材料,在莲座期取嫩叶提取RNA并反转录成cDNA,采用cDNA-AFLP技术,利用256对cDNA-AFLP引物对亲本97-3-2、001-24之间的多态性进行检测,筛选出56对多态性引物用于F6群体分析,通过对cDNA-AFLPs分子标记的遗传分析构建图谱。【结果】构建了一个包括164个cDNA-AFLPs分子标记的分子转录图谱。该图谱由13个连锁群组成,图谱总长度为1401.2cM,标记间平均图距9.7cM。【结论】这是第一份利用cDNA-AFLP标记构建的白菜分子转录图谱。 展开更多
关键词 白菜 CDNA-AFLP 转录图
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cDNA捕捉法──从大的基因组区域直接分离编码序列 被引量:2
5
作者 杨新平 于常海 贺林 《生命科学》 CSCD 1999年第4期189-191,共3页
cDNA捕捉法或cDNA直选法是一种以表达为基础的基因分离技术,直接利用目的区域的基因组DNA捕捉cDNA,快速从大的基因组区域分离表达序列。该法已成功地应用于定位克隆和详尽的转录图谱的构建。
关键词 cDNA捕捉法 cDNA直选法 定位克隆 转录图
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小鼠基因组研究进展
6
作者 李善如 王冬平 陈永福 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1998年第1期38-41,共4页
小鼠基因组研究进展李善如1,2王冬平1陈永福2(1.军事医学科学院实验动物中心,北京100071)(2.中国农业大学生物学院,北京100094)TheDevelopmentofMouseGenomeResearchL... 小鼠基因组研究进展李善如1,2王冬平1陈永福2(1.军事医学科学院实验动物中心,北京100071)(2.中国农业大学生物学院,北京100094)TheDevelopmentofMouseGenomeResearchLIShanru1,2WANGDon... 展开更多
关键词 小鼠 基因组 遗传 物理 转录图
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马传染性贫血病毒基因组部分转录图谱 被引量:1
7
作者 刘相冬 张宝山 +6 位作者 孔宪刚 王滨有 孙成群 刘永刚 周家喜 王凯波 刘建华 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期245-249,共5页
以马传贫驴白细胞弱毒和驴强毒分别接种培养细胞和试验动物 ,分别在体外和体内条件下 ,对病毒的各种转录产物进行克隆和序列分析。通过与病毒基因组的序列进行比较 ,用实验的方法绘制出了两株病毒在相应试验条件下的转录图谱 ,确定了各... 以马传贫驴白细胞弱毒和驴强毒分别接种培养细胞和试验动物 ,分别在体外和体内条件下 ,对病毒的各种转录产物进行克隆和序列分析。通过与病毒基因组的序列进行比较 ,用实验的方法绘制出了两株病毒在相应试验条件下的转录图谱 ,确定了各拼接产物的外显子构成以及拼接供体和拼接受体位点的具体位置。发现两种病毒在外显子 3的上游拼接受体位点 (SA2 )的位置与已报道的EIAV毒株均不相同 。 展开更多
关键词 马传染性贫血病毒 转录图 拼接位点 拼接信号 病毒基因组
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马铃薯基因组计划研究进展
8
作者 吕山花 樊颖伦 +1 位作者 金彩霞 刘立科 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第14期6356-6357,6374,共3页
马铃薯是重要的茄科作物,在自然界中存在二倍体、三倍体、四倍体、五倍体和六倍体,同时是块茎形成、淀粉合成、对病原物应答研究的模式植物。由于茄科植物基因组存在高度的共线性,为此,开展番茄基因组计划及功能基因组学研究可以为其他... 马铃薯是重要的茄科作物,在自然界中存在二倍体、三倍体、四倍体、五倍体和六倍体,同时是块茎形成、淀粉合成、对病原物应答研究的模式植物。由于茄科植物基因组存在高度的共线性,为此,开展番茄基因组计划及功能基因组学研究可以为其他蔬菜、水果等重要经济作物的研究提供理论和方法上的直接借鉴。从马铃薯的遗传图谱、物理图谱、序列图谱和转录图谱,以及已从马铃薯中克隆的重要基因等方面详细阐述了马铃薯基因组研究的最新进展。 展开更多
关键词 马铃薯 基因组 遗传 物理 序列 转录图
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分子遗传学与肝脏学讲座——第一讲 人类基因图
9
作者 车文良 傅继梁 《肝脏》 2000年第2期101-102,共2页
随着分子遗传学研究突飞猛进地发展 ,肝脏疾病的相关本质日益得以揭示。为了让广大基础和临床工作者了解这方面的信息和知识 ,本刊特邀请第二军医大学副校长 ,医学遗传学教研室主任傅继梁教授组织撰写一组“分子遗传学与肝脏学”的系列... 随着分子遗传学研究突飞猛进地发展 ,肝脏疾病的相关本质日益得以揭示。为了让广大基础和临床工作者了解这方面的信息和知识 ,本刊特邀请第二军医大学副校长 ,医学遗传学教研室主任傅继梁教授组织撰写一组“分子遗传学与肝脏学”的系列讲座。本期起始陆续刊出以飨读者。 展开更多
关键词 人类基因 HGP 遗传 物理 转录图
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人类基因组转录图谱研究趋向
10
作者 Hochgeschwender U 刘霜 郑毅 《国外医学(遗传学分册)》 1992年第4期205-209,共5页
最近的一次工作会议的目的是为了获得有关识别人类基因组内基因的方法的总体概况。在人类(?)团组的遗传、物理图谱研究方面已取得较大进展,目前需要的是识别其所包含的蛋白质编码顺序的方法。
关键词 人类基因组 转录图
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用cDNA-AFLP技术构建基因组转录图谱 被引量:16
11
作者 付凤玲 李晚忱 《分子植物育种》 CAS CSCD 2003年第4期523-529,共7页
以分离群体mRNA反转录的cDNA为模板进行AFLP分析 ,在保留AFLP多态性丰富、稳定性高、无需了解序列信息等优点的同时 ,集中显示基因组表达序列的多态性差异 ,已逐渐发展成为基因差异表达显示、表达基因遗传连锁作图和基因克隆的常用方法... 以分离群体mRNA反转录的cDNA为模板进行AFLP分析 ,在保留AFLP多态性丰富、稳定性高、无需了解序列信息等优点的同时 ,集中显示基因组表达序列的多态性差异 ,已逐渐发展成为基因差异表达显示、表达基因遗传连锁作图和基因克隆的常用方法。本文介绍了作图群体组配、总RNA提取与mRNA分离、cDNA合成、AFLP分析、转录图谱多态性分析作图等cDNA AFLP分析的主要技术。 展开更多
关键词 基因组转录图 cDNA—AFLP技术 群体组配 总RNA提取 mRNA分离 CDNA合成
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基于单细胞测序技术分析缺血性脑卒中的转录图谱与疾病进展的生物信息学分析
12
作者 刘飞 叶民 《神经损伤与功能重建》 2024年第7期385-391,434,共8页
目的:通过单细胞测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术刻画缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)的转录图谱并分析特定细胞亚群的特征。方法:从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中获取IS小鼠的脑组织和同侧的正常... 目的:通过单细胞测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术刻画缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)的转录图谱并分析特定细胞亚群的特征。方法:从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中获取IS小鼠的脑组织和同侧的正常脑组织(Sham)scRNA-seq公共数据集GSE174574,对其中的3个IS病灶和3个Sham组织分别进行样本整合,完成过滤和质控后通过Harmony法去除批次效应进行下游分析。通过UMAP进行细胞亚群聚类。通过SingleR软件和手工完成各细胞亚群的注释。接着完成差异化表达和GSVA功能富集分析。使用Monocle2算法评估细胞的进化状态和发育轨迹。使用Cellchat算法刻画细胞间的通讯作用。结果:经严格质控后,3个IS样本共有29 920个细胞,经UMAP降维后共获得22个细胞亚群和10个注释出的亚群。其中内皮细胞和巨噬细胞在IS样本中比例较高。3个Sham样本共有27 259个细胞,UMAP降维获取18个细胞亚群和9个注释出的亚群。与IS相比,Sham组有明显较高的小胶质细胞比例,但巨噬细胞、单核细胞、上皮细胞的比例相对偏低。对IS样本进行进一步分析,星形细胞可分为7个细胞亚群(C0~C6),C0~C3组具有明显正相关关系,C0组发育较早而C4、C5组发育较晚。少突细胞可被分为6个细胞亚群(C0~C5),C3组的发育较早而C2组的发育较晚。少突胶质细胞间的信号传导主要在PSAP通路,C0和C1组与其他少突胶质细胞亚组的信号传导更加密切。免疫细胞包括粒细胞、巨噬细胞、单核细胞和自然杀伤(natural killer,NK)细胞,粒细胞和单核细胞可介导巨噬细胞耐受和抗病毒免疫反应,NK细胞则对内源性刺激信号不敏感。轨迹分析提示粒细胞和单核细胞处于免疫细胞的发育早期阶段而NK细胞和巨噬细胞处于发育晚期阶段。细胞间的信号通路包括CCL、SPP1、CXCL等,其中CCL通路占比最大,单核细胞与其他细胞的互动较多,而NK细胞较少。结论:� 展开更多
关键词 缺血性脑卒中 单细胞测序 转录图全景 生物信息学分析
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戊型肝炎病毒亚基因组RNA的研究 被引量:2
13
作者 夏小兵 黄如统 李德荣 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第6期622-627,共6页
本文利用同位素代谢标记在HEV感染 8 5~ 1 0 5,6 5~ 7 5h分别检测到 1及 2个亚基因组RNA ,而感染 2 1h后及在成熟的病毒颗粒内未能检测到亚基因组RNA。通过杂交实验 ,发现HEV的亚基因组RNA具有典型的共 3′端的半套式结构 ,且基因组... 本文利用同位素代谢标记在HEV感染 8 5~ 1 0 5,6 5~ 7 5h分别检测到 1及 2个亚基因组RNA ,而感染 2 1h后及在成熟的病毒颗粒内未能检测到亚基因组RNA。通过杂交实验 ,发现HEV的亚基因组RNA具有典型的共 3′端的半套式结构 ,且基因组RNA与亚基因组RNA的 5′端不存在共同的引导序列。通过紫外转录图谱发现HEV的亚基因组RNA是通过独立转录的方式产生的。利用引物延伸反应发现两种亚基因组RNA的转录起始位点分别位于RNA聚合酶区及非结构区、结构区的基因间序列。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 亚基因组RNA 紫外转录图
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用基因表达连续分析进行基因组转录图谱分析 被引量:1
14
作者 杨泉胜 杨歧生 《生命的化学》 CAS CSCD 2001年第4期321-325,共5页
关键词 基因表达 连续分析 基因组转录图 RIDGE
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白菜重要园艺性状的QTL定位分析
15
作者 吴才君 施翔 刘冬梅 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期244-249,共6页
为从转录水平上准确定位显著影响各性状的QTLs,及其遗传效应和互作规律,以矮脚黄白菜自交系(97-3-2)和白蔓菁芜菁自交系(001-24)为亲本及其杂交建立F6重组自交系群体为材料,采用cDNA-AFLP、cDNA-SRAP技术,构建了一个总长度为1 048.4 cM... 为从转录水平上准确定位显著影响各性状的QTLs,及其遗传效应和互作规律,以矮脚黄白菜自交系(97-3-2)和白蔓菁芜菁自交系(001-24)为亲本及其杂交建立F6重组自交系群体为材料,采用cDNA-AFLP、cDNA-SRAP技术,构建了一个总长度为1 048.4 cM包含311个分子标记,14个连锁群的高密度转录图谱。并采用基于混合线性模型的QTL作图分析软件QTLmaper2.0对F6群体进行QTL作图分析,检测到控制蛋白质、Vc、株高、伸展度、叶片数、单株质量等12个主要园艺性状的42个QTL,定位于分子转录图谱的14个连锁群中,并阐明了单个QTL的遗传效应及QTLs间的互作遗传效应。 展开更多
关键词 白菜 高密度转录图 QTL 互作遗传效应
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美科研人员绘制出2份脑图谱
16
《生物医学工程与临床》 CAS 2014年第3期270-270,共1页
据英国《自然》杂志2014年4月3日报道,美国两组科研人员分别绘制出胚胎期人脑转录图谱和老鼠大脑神经连接图谱的脑科学领域的最新成果。这两项成果有助为研究人脑发育及神经回路提供参考。
关键词 科研人员 《自然》杂志 人脑发育 神经连接 转录图 神经回路 脑科学
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绘制人胎儿的全脑转录图谱
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作者 杨智 《科学》 北大核心 2014年第3期34-34,共1页
据英国№ure,2014,508:199报道,美国的雷恩(EdS.Lein)科学家团队绘制了妊娠中期胎儿全脑样本的基因转录图谱,这对于一年前奥巴马总统提出的“尖端创新神经技术脑研究计划”倡议是积极的回应。
关键词 转录图 脑研究 人胎儿 科学家 奥巴马 基因 神经
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小鼠全基因组转录图谱揭示新遗传观
18
《生命世界》 2005年第10期11-11,共1页
由100位科学工作者组成的团队发现,哺乳动物的遗传机制远比先前想像中复杂。此研究结论发表在《科学》杂志上。
关键词 小鼠 全基因组 转录图 哺乳动物 遗传机制 动物实验
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干细胞性标记:关于恶性肿瘤的“神奇标记物”
19
作者 姚杰 王志刚 《临床医药杂志》 2005年第2期45-45,共1页
患者肿瘤细胞基因转录图谱的测定在肿瘤治疗研究中无疑是激励人心的一大进步。由此可使我们能够预测肿瘤患者对不同力度、不同治疗方法可获得的疗效,从而使实现肿瘤患者个体化治疗成为可能。但要将这种可能转化为现实并使患者从中受益... 患者肿瘤细胞基因转录图谱的测定在肿瘤治疗研究中无疑是激励人心的一大进步。由此可使我们能够预测肿瘤患者对不同力度、不同治疗方法可获得的疗效,从而使实现肿瘤患者个体化治疗成为可能。但要将这种可能转化为现实并使患者从中受益,仍具一定的挑战性。基于“具有干细胞样性质的肿瘤预后较差”这一假说,Glinsky及其同事尝试以人鼠科动物为模型对一种可能的干细胞mRNA标记物进行了检测和鉴定。 展开更多
关键词 干细胞性标记 恶性肿瘤 肿瘤细胞基因转录图 测定 肿瘤 治疗研究
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