大白菜CBF4基因的克隆和遗传进化分析 被引量：5

1

作者 李利斌 刘立锋 +2 位作者 王殿峰 刘国明 高建伟 《山东农业科学》 2009年第4期1-4,共4页

采用RT-PCR法,从大白菜(Brassica rapasubsp.pekinensis)河头早中克隆了拟南芥CBF4的同源基因BrCBF4,并对它的序列特征、蛋白结构和遗传进化进行了分析。结果表明,BrCBF4全长663 bp,编码一个包含220个氨基酸残基和具有典型AP2结构域的蛋... 采用RT-PCR法,从大白菜(Brassica rapasubsp.pekinensis)河头早中克隆了拟南芥CBF4的同源基因BrCBF4,并对它的序列特征、蛋白结构和遗传进化进行了分析。结果表明,BrCBF4全长663 bp,编码一个包含220个氨基酸残基和具有典型AP2结构域的蛋白,并且含有两个潜在的豆蔻酰化位点。遗传进化分析表明,BrCBF4与BjDREB1-2的关系最近,与拟南芥AtCBF4同属一个类群,而AtCBF1,2,3与大白菜的BrCBF1,2,3及其它芸薹属植物相关基因分属另一个类群。推测BrCBF4与BjDREB1-2、AtCBF4为直系同源基因,在功能上相似,而与BrCBF1,2,3存在功能上的分化。本研究为进一步研究BrCBF4在大白菜非生物逆境响应中的功能奠定了基础。 展开更多

关键词 大白菜 CBF4 克隆 蛋白结构分析 遗传进化

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棉铃虫P450基因HarmCYP9A33的克隆、序列分析及原核表达 被引量：2

2

作者 姬继超 安世恒 +3 位作者 李为争 罗梅浩 原国辉 郭线茹 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期465-474,共10页

夜间活动昆虫如夜蛾类主要通过嗅觉来寻找配偶、寄主植物和产卵场所,是研究昆虫嗅觉分子机制的理想材料。P450为多功能单加氧酶,在昆虫对各种内源与外源物质的代谢中起重要作用。为研究P450在昆虫嗅觉中的作用,本研究采用RT-PCR和RACE技... 夜间活动昆虫如夜蛾类主要通过嗅觉来寻找配偶、寄主植物和产卵场所,是研究昆虫嗅觉分子机制的理想材料。P450为多功能单加氧酶,在昆虫对各种内源与外源物质的代谢中起重要作用。为研究P450在昆虫嗅觉中的作用,本研究采用RT-PCR和RACE技术,从夜蛾科昆虫棉铃虫Helicoverpa armigera(Hübner)雄蛾触角中扩增得到一条全长1772bp的P450基因,命名为HarmCYP9A33(GenBank登录号为JX486677)。序列分析表明,HarmCYP9A33开放阅读框全长1590bp,编码529个氨基酸残基,预测蛋白质分子量和等电点分别为61.62kD和7.97;HarmCYP9A33与甘蓝夜蛾Mamestra brassicae触角毛形感器中高表达的MbraCYP9A13蛋白的氨基酸序列一致性最高,达75%,蛋白二级结构相似,6个底物识别位点(substrate recognition sites,SRSs)序列一致性达61%,其中底物与酶结合通道开关Ⅰ螺旋中SRS4序列完全相同,与棉铃虫CYP9A亚家族蛋白有一定的结构相似性。Real-time PCR检测表明,HarmCYP9A33在雌、雄蛾各组织中均有表达,以腹部表达量最高,其次为头部;在卵至成虫各个时期也均表达,以蛹中表达量最高;在触角中的表达量随羽化时间而变化,且多高于卵和幼虫中的表达量。SDS-PAGE检测和Western blot鉴定表明HarmCYP9A33体外融合表达成功。本研究为深入探讨该基因在棉铃虫触角感器细胞中的定位及其生物学功能奠定了基础。 展开更多

关键词 棉铃虫 P450 时空表达 蛋白结构分析 原核表达 蛋白免疫印迹

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人瘦素基因的原核表达载体构建及其蛋白结构分析 被引量：3

3

作者 周朋君 马岩岩 +1 位作者 王一飞 陈宏远 《广东药学院学报》 CAS 2016年第3期355-361,共7页

目的克隆人源Leptin的成熟肽编码序列后基因并构建其原核重组表达菌株,对其产物进行纯化鉴定;生物信息学分析其蛋白质结构并预测功能。方法提取人脂肪干细胞中的总RNA,经RT-PCR反转录获得c DNA序列,PCR扩增Leptin基因并将其克隆入表达载... 目的克隆人源Leptin的成熟肽编码序列后基因并构建其原核重组表达菌株,对其产物进行纯化鉴定;生物信息学分析其蛋白质结构并预测功能。方法提取人脂肪干细胞中的总RNA,经RT-PCR反转录获得c DNA序列,PCR扩增Leptin基因并将其克隆入表达载体p ET-28a（＋）原核质粒,构建该基因的重组原核表达载体p ET-28a-Leptin。随后进行双酶切和测序鉴定。在E.coli BL21（DE3）中诱导表达目的蛋白,通过WB检测Leptin蛋白的表达;利用在线网络生物信息学相关数据库和分析软件对测序结果进行分析,并对重组蛋白结构及功能等进行验证和预测。结果 PCR扩增得到Leptin目标DNA片段;成功构建重组表达质粒p ET-28a-Leptin,经IPTG诱导表达后,目的蛋白在宿主E.coli BL21（DE3）中高效表达Leptin融合蛋白,相对分子质量18 000。生物信息学检索该基因编码蛋白的氨基酸序列与理化参数显示,蛋白无跨膜区,有6个Ser、1个Thr可能为蛋白激酶磷酸化位点,第1~21位可能为信号肽区域。在Leptin氨基酸序列中：α-螺旋93处,无规则卷曲43处,延伸链17处,β-转角14处,分别占总二级结构的55.69%、25.75%、10.18%和8.38%。结论成功克隆了人的Leptin基因。利用原核载体表达系统成功表达并进一步纯化的Leptin蛋白具有免疫原性。其生物信息学分析及结合蛋白质结构与功能预测结果可为深入研究Leptin蛋白的活性作用提供有益借鉴。 展开更多

关键词 LEPTIN基因 分子克隆 蛋白结构分析

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微波/超声辅助常规碱液提取麦麸蛋白 被引量：2

4

作者 刘盼 吉喆 陈夫山 《齐鲁工业大学学报》 2018年第1期6-12,共7页

比较常规碱液提取、微波辅助碱液提取、超声辅助碱液提取麦麸蛋白,通过考马斯亮蓝法测定麦麸蛋白产率结果是:微波辅助与常规碱液提取麦麸蛋白得率一样;超声辅助碱液提取麦麸蛋白得率达到44.55%,是常规碱液法的1.30倍。通过凝胶电泳、红... 比较常规碱液提取、微波辅助碱液提取、超声辅助碱液提取麦麸蛋白,通过考马斯亮蓝法测定麦麸蛋白产率结果是:微波辅助与常规碱液提取麦麸蛋白得率一样;超声辅助碱液提取麦麸蛋白得率达到44.55%,是常规碱液法的1.30倍。通过凝胶电泳、红外光谱、热重分析测定麦麸蛋白的结构,结果显示:三种提取方法得到的麦麸蛋白分子量主要分布范围均为45 000~66 200和66 200~98 000,但超声辅助提取麦麸蛋白的α螺旋与β结构的比例降低并且该蛋白质的热重分析图在450℃时无失重峰,显示出较高的热稳定性及蛋白纯度。结果表明,超声辅助提取是获得具有分子灵活性的高产蛋白质的有效方法。为提高麦麸蛋白的产量,应用响应面分析法获得最佳提取条件,提取率达到68.04%,是常规碱液提取法的2倍。 展开更多

关键词 麦麸蛋白 微波/超声辅助提取 蛋白结构分析 响应面优化

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拟穴青蟹(Scylla paramamosain)NOS蛋白结构分析及同源建模 被引量：2

5

作者 王世佳 林浩鹏 李升康 《汕头大学学报（自然科学版）》 2013年第2期39-44,共6页

为了进一步认识拟穴青蟹一氧化氮合成酶(S.paramamosain nitric oxide synthetase,SpNOS)蛋白的结构和功能,深入研究该蛋白的生物学特性,本研究采用生物信息学方法,对SpNOS蛋白质的理化性质、二级结构及三级结构等进行生物信息学分析,... 为了进一步认识拟穴青蟹一氧化氮合成酶(S.paramamosain nitric oxide synthetase,SpNOS)蛋白的结构和功能,深入研究该蛋白的生物学特性,本研究采用生物信息学方法,对SpNOS蛋白质的理化性质、二级结构及三级结构等进行生物信息学分析,并在获得三级结构的基础上进行同源建模.分析结果表明,拟穴青蟹NOS蛋白与眼斑龙虾NOS蛋白组成较为接近.二级结构以α螺旋和随机卷曲为主.NOS全长1214个氨基酸,其空间结构分别以2G60、3HR4、1QGY的A链为模板,分三段进行建模,得到合理的空间结构.实验数据为深入研究一氧化氮合成酶的蛋白结构和免疫功能的关系奠定了基础. 展开更多

关键词 拟穴青蟹 一氧化氮合成酶 蛋白结构分析 同源建模

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恶臭假单胞菌铜抗性操纵子生物信息学分析

6

作者 刘小刚 苟斌全 林宇菁 《广东化工》 CAS 2017年第16期28-30,45,共4页

用生物信息学方法对恶臭假单胞菌铜抗性操纵子基因相似性,蛋白质的亲疏水性,蛋白质高级结构,蛋白质的功能进行分析。结果表明:恶臭假单胞菌铜抗性操纵子与丁香假单胞菌有较高的同源性,而与大肠杆菌距离较远,这意味着该操纵子可能来源于... 用生物信息学方法对恶臭假单胞菌铜抗性操纵子基因相似性,蛋白质的亲疏水性,蛋白质高级结构,蛋白质的功能进行分析。结果表明:恶臭假单胞菌铜抗性操纵子与丁香假单胞菌有较高的同源性,而与大肠杆菌距离较远,这意味着该操纵子可能来源于丁香假单胞菌。 展开更多

关键词 生物信息学 铜抗性蛋白 序列比对 蛋白结构分析 系统发生树

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肺癌呼吸标志物筛选及其生物信息学分析

7

作者 吴谦 王平 《浙江大学学报（工学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第12期2389-2395,共7页

采用结合转录组、代谢通路、蛋白结构的呼出气体检测生物信息学分析方法来确定肺癌气体标志物,用于肺癌的筛选诊断.采用标准仪器(GCMS)检测肺癌病人和正常人的呼吸气体样本;经统计分析,筛选出10种特异性挥发性有机物(VOC).采用转录组分... 采用结合转录组、代谢通路、蛋白结构的呼出气体检测生物信息学分析方法来确定肺癌气体标志物,用于肺癌的筛选诊断.采用标准仪器(GCMS)检测肺癌病人和正常人的呼吸气体样本;经统计分析,筛选出10种特异性挥发性有机物(VOC).采用转录组分析得到肺癌和健康人的差异表达基因,其富集的代谢通路与人体内产生VOC的代谢通路一致,证明所筛选的VOC标志物与肺癌病人代谢具有相关性.基于此VOC建立的肺癌诊断模型的灵敏度、特异性和整体正确率分别为86.2%,91.2%和89.6%,说明所提方法能简便、有效区分正常人和肺癌病人,为早期肺癌筛查提供方便、可靠的检测方法. 展开更多

关键词 呼出气体检测 肺癌标志物 生物信息学 转录组分析 蛋白结构分析 肺癌早期筛查

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鳗弧菌flaE基因的克隆及蛋白结构分析

8

作者 王海娟 王利 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期5-9,共5页

[目的]:克隆鳗弧菌flaE基因并分析其蛋白结构,为研究该蛋白的生物学功能及免疫原性奠定基础。[方法]通过PCR方法对鳗弧菌flaE基因进行扩增,利用生物学软件对其序列及蛋白质结构进行分析。[结果]所得flaE基因的大小为841bp,其开放阅读框... [目的]:克隆鳗弧菌flaE基因并分析其蛋白结构,为研究该蛋白的生物学功能及免疫原性奠定基础。[方法]通过PCR方法对鳗弧菌flaE基因进行扩增,利用生物学软件对其序列及蛋白质结构进行分析。[结果]所得flaE基因的大小为841bp,其开放阅读框长度为798 bp,编码262个氨基酸。蛋白分子质量为28 411.4,理论等电点p I为5.70,脂肪系数为81.60,不稳定系数为31.81;为疏水性蛋白;没有信号肽和跨膜螺旋结构;保守区结构域属于flagellin家族;二级结构中以α螺旋为主,其次是无规则卷曲和β片层,少量β转角;三级结构与3k8v.1.A的结构模型相似率为90%。[结论]成功克隆了鳗弧菌flaE基因,Gen Bank登录号为KM091934。 展开更多

关键词 鳗弧菌 flaE基因 克隆 蛋白结构分析

原文传递

重组人促卵泡激素(rhFSH)肽图分析方法研究 被引量：4

9

作者 梁成罡 沈舒 杨化新 《中国生化药物杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期333-335,共3页

目的建立重组人促卵泡激素(rh-FSH)的标准肽图分析方法。方法通过超滤、透析、冷冻干燥法富集制备rh-FSH对照品。通过尿素变性、二硫苏糖醇(DTT)还原、碘乙酸酰基化制备供试品溶液。采用N型-糖苷酶F(PNGaseF)酶解去除rh-FSH糖侧链,经SDS... 目的建立重组人促卵泡激素(rh-FSH)的标准肽图分析方法。方法通过超滤、透析、冷冻干燥法富集制备rh-FSH对照品。通过尿素变性、二硫苏糖醇(DTT)还原、碘乙酸酰基化制备供试品溶液。采用N型-糖苷酶F(PNGaseF)酶解去除rh-FSH糖侧链,经SDS-PAGE验证切糖结果后,用胰蛋白酶水解,酶解所得肽段通过RP-HPLC分析,得到rh-FSH肽图。结果利用国外原研厂rh-FSH制剂富集制备的rh-FSH结构完整,可用作rh-FSH肽图分析的对照品。国产样品的肽图谱与对照品一致。结论建立的肽图分析方法可作rh-FSH产品的结构确证。 展开更多

关键词 重组人促卵泡激素 肽图 质量控制 糖蛋白结构分析

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水稻瘤矮病毒P8蛋白的结构分析及其表达 被引量：3

10

作者 高芳銮 范国成 +4 位作者 沈建国 谢荔岩 林奇英 吴祖建 谢联辉 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期51-56,共6页

为揭示水稻瘤矮病毒(RGDV)外层衣壳蛋白P8的结构特点及其在大肠杆菌中的表达特性。利用生物学软件和在线分析工具,对RGDVP8蛋白结构特征进行了生物信息学分析;同时将通过RT-PCR扩增的P8基因克隆到pGEX-4T-1上,构建pGP8转化大肠杆菌E.col... 为揭示水稻瘤矮病毒(RGDV)外层衣壳蛋白P8的结构特点及其在大肠杆菌中的表达特性。利用生物学软件和在线分析工具,对RGDVP8蛋白结构特征进行了生物信息学分析;同时将通过RT-PCR扩增的P8基因克隆到pGEX-4T-1上,构建pGP8转化大肠杆菌E.coliBL21(DE3),在IPTG诱导下表达。利用表达的融合蛋白免疫家兔,制备了抗血清,并以RGDV、水稻矮缩病毒(RDV)、水稻条纹病毒(RSV)、水稻锯齿叶矮缩病毒(RRSV)4种病毒作为供试材料进行特异性检测。分析显示P8蛋白在C端位置有一个典型的跨膜螺旋区,整个蛋白也具有Phytoreo P8家族共有的典型结构域Phytoreo P8 domain。SDS-PAGE和蛋白印记分析表明,RGDVP8融合蛋白分子量约为73kDa,以包涵体的形式获得了高效表达。获得的效价高、特异性强的抗血清,为水稻瘤矮病毒的快速检测及P8蛋白的功能研究奠定了基础。 展开更多

关键词 水稻瘤矮病毒 P8蛋白结构分析 融合蛋白 抗血清

原文传递

牦牛MT-Ⅰ/-Ⅱ cDNA分子克隆及其蛋白质结构分析 被引量：5

11

作者 马彬云 任宏伟 +5 位作者 吴建平 徐明旭 张利平 向云 贺鹏飞 蔡欣 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期62-68,共7页

利用基因特异引物YMTSP1和YMTSP2,通过RT-PCR从牦牛肝脏组织RNA中克隆出了牦牛 MT-Ⅰ(Genbank Accession No:AY513744)和MT-Ⅱ(Genbank Accession No:AY513745)基因编码区全 长。将牦牛MT-Ⅰ和MT-Ⅱ cDNA序列在CBI上进行同源性搜索发现... 利用基因特异引物YMTSP1和YMTSP2,通过RT-PCR从牦牛肝脏组织RNA中克隆出了牦牛 MT-Ⅰ(Genbank Accession No:AY513744)和MT-Ⅱ(Genbank Accession No:AY513745)基因编码区全 长。将牦牛MT-Ⅰ和MT-Ⅱ cDNA序列在CBI上进行同源性搜索发现,牦牛MT-Ⅰ/-Ⅱ编码区序列在 不同哺乳动物中相当保守。牦牛MT-Ⅰ和MT-Ⅱ编码的MT-Ⅰ和MT-Ⅱ蛋白分别由61个氨基酸组 成,其具有保守的短肽结构如:C-X-C,C-C-X-C-C,C-X-X-C等,其决定MT蛋白分子的整个三维结 构,在分子进化上十分保守。同时对牦牛MT的疏水性和跨膜区分析表明,牦牛MT蛋白可能不 存在跨膜区,也不存在信号肽,是1种非分泌蛋白。并通过同源比较模建,预测和构建了牦牛 MT-Ⅰ和MT-Ⅱ蛋白的分子空间结构,表明牦牛MT-Ⅰ和MT-Ⅱ由α-和β-两个结构域组成,在α-结构 域含有5个Cys短肽结构,β-结构域有4个Cys短肽结构,且2个结构域由保守的三肽序列KKS 相连。 展开更多

关键词 cDNA分子克隆 蛋白质结构分析 牦牛 CDNA序列 基因编码区 氨基酸组成 结构域 特异引物 肝脏组织 哺乳动物 三维结构 蛋白分子 分子进化 分泌蛋白 同源比较 空间结构 跨膜区 CYS MT RNA PCR 同源性 CBI 短肽 分析表 疏水性

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树胆固醇酯转运蛋白的cDNA和蛋白质结构分析 被引量：5

12

作者 曾武威 张坚 +2 位作者 陈保生 吴钢 薛红 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第21期1316-1320,共5页

目的　获得不易感动脉粥样硬化动物树胆固醇酯转运蛋白 (CETP)的cDNA和蛋白质序列 ,分析其结构特点 ,寻找其可能的抗动脉粥样硬化分子机制。方法　以从树肝脏mRNA反转录获得的cDNA一链为模板 ,应用SMART RACE技术 ,获得了树CETP的... 目的　获得不易感动脉粥样硬化动物树胆固醇酯转运蛋白 (CETP)的cDNA和蛋白质序列 ,分析其结构特点 ,寻找其可能的抗动脉粥样硬化分子机制。方法　以从树肝脏mRNA反转录获得的cDNA一链为模板 ,应用SMART RACE技术 ,获得了树CETP的cDNA序列 ,并推导出其蛋白质氨基酸序列 ,应用分子生物学软件对该蛋白的一级、二级结构进行分析和比较。结果　获得的树CETPcDNA(在GenBank中的注册号为AF334 0 33)长 16 36bp ,编码 485个氨基酸 ,其成熟蛋白由 477个氨基酸组成 ,比人多一个氨基酸 (Gly318) ,该蛋白与人、家兔的同源性分别为 88%和 82 %。序列中与CETP结合和转运中性脂质功能相关的区域均非常保守 ,但在Asn34 2位的N 糖基化位点缺失 ,可能使其转运胆固醇酯的活性增加 ,利于外周组织和血浆中的胆固醇及其酯的清除。通过对不同种属蛋白序列的比较 ,初步分析了树CETP蛋白与功能相关的结构特点。 展开更多

关键词 树QU 动脉硬化 胆固醇酯类 序列分析 DNA 转运蛋白 蛋白质结构分析

原文传递

结构基因组学中的衍射相位问题 被引量：5

13

作者 范海福 梁栋材 《生命科学》 CSCD 2003年第2期65-69,共5页

简要介绍了结构基因组学研究中,用于测定蛋白质结构的X射线分析在解决衍射相位问题方面的最新进展。

关键词 结构基因组学 蛋白质结构分析 晶体学中的直接法

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连翘多胺氧化酶基因家族的鉴定及干旱和盐胁迫下的表达分析

14

作者 陈佳茜 郭广洋 +5 位作者 谭新杰 吕淑芳 胥华伟 原梦 邓萍 侯典云 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期3077-3084,共8页

目的研究连翘多胺氧化酶(polyamine oxidase,PAO)基因家族在盐和干旱胁迫下的响应特征。方法通过分析连翘转录组数据鉴定出5个连翘PAO基因家族成员,结合蛋白质理化性质和基序分析、蛋白质结构分析、系统进化分析、结构域等方式进行相关... 目的研究连翘多胺氧化酶(polyamine oxidase,PAO)基因家族在盐和干旱胁迫下的响应特征。方法通过分析连翘转录组数据鉴定出5个连翘PAO基因家族成员,结合蛋白质理化性质和基序分析、蛋白质结构分析、系统进化分析、结构域等方式进行相关性分析,并探究了盐和干旱胁迫下PAO基因的表达水平。结果连翘PAO基因家族氨基酸数介于235~541 aa,相对分子质量在26069~59328,等电点在5.27~5.86;不稳定系数为35.68~44.14,总平均亲水性皆为负值,推测连翘PAO家族蛋白均为不稳定型、酸性、亲水性蛋白,α-螺旋与无规则卷曲为蛋白主要二级结构形式。结论鉴定出的5个连翘PAO基因家族成员均具有特异性表达模式;在盐和干旱胁迫下5个连翘PAO基因家族成员的表达均受到诱导,可能参与连翘的盐胁迫及干旱胁迫响应调控,为深入探讨连翘PAO基因家族的功能奠定了基础。 展开更多

关键词 连翘 PAO基因家族 基因表达 胁迫 蛋白质结构分析

原文传递

一种基于空间密度特征的蛋白质结构相似性判定方法 被引量：6

15

作者 胡敏 彭群生 《工程图学学报》 CSCD 北大核心 2005年第1期90-95,共6页

基于蛋白质分子基本组成元素的空间区域密度特征,进行两种蛋白质结构的一致性比较。对 PDB 蛋白质数据验证的结果表明,作者所使用的方法可以作为任意结构的蛋白质相似性比较的有效辅助手段。对不具备序列相似性的蛋白质或难以直接抽取... 基于蛋白质分子基本组成元素的空间区域密度特征,进行两种蛋白质结构的一致性比较。对 PDB 蛋白质数据验证的结果表明,作者所使用的方法可以作为任意结构的蛋白质相似性比较的有效辅助手段。对不具备序列相似性的蛋白质或难以直接抽取几何规则的蛋白质分子之间的相似性比较具有现实意义。 展开更多

关键词 计算机应用 蛋白质结构分析 分布密度特征 相似形判定

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生物信息学研究概述 被引量：5

16

作者 李淮 《开封教育学院学报》 2017年第6期283-284,共2页

生物信息学(Bioinformatics)是一门结合信息学、数学和计算机技术,主要研究生命科学领域中生物学信息的采集、存储、处理、传播和分析的学科。随着现代科学技术的发展,生物信息学在生命科学领域的作用显得尤为重要。本文综述了生物信息... 生物信息学(Bioinformatics)是一门结合信息学、数学和计算机技术,主要研究生命科学领域中生物学信息的采集、存储、处理、传播和分析的学科。随着现代科学技术的发展,生物信息学在生命科学领域的作用显得尤为重要。本文综述了生物信息学的起源、生物信息学发展简史和生物信息学的研究内容,介绍了生物信息学的应用前景,并简述了生物信息学发展面临的挑战。 展开更多

关键词 生物信息学 数据库 序列比对 蛋白质结构分析

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分形在蛋白质结构分析中的应用 被引量：1

17

作者 李明兰 闫继红 《合肥学院学报（自然科学版）》 2005年第2期50-52,共3页

通过介绍分形原理和方法在蛋白质分子结构分析中的应用,表明用分形的方法不仅可以对蛋白质分子结构的复杂性给予定量地描述,而且为人们进一步认识蛋白质的性质和特征提供一些有益的启示和新的信息。

关键词 蛋白质结构分析 分形 应用 蛋白质分子 分子结构 复杂性

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咖啡豆α-半乳糖苷酶的同源建模及分析 被引量：1

18

作者 陶佳妮 李赟 +3 位作者 姚娣 沈汪洋 陈轩 周坚 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期326-330,共5页

为进一步了解咖啡豆α-半乳糖苷酶的结构,对咖啡豆α-半乳糖苷酶的理化性质、二级结构及三级结构等进行了理论分析和预测,并在三级结构的基础上进行同源建模研究。分析表明,该酶呈酸性,亲水,稳定。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,... 为进一步了解咖啡豆α-半乳糖苷酶的结构,对咖啡豆α-半乳糖苷酶的理化性质、二级结构及三级结构等进行了理论分析和预测,并在三级结构的基础上进行同源建模研究。分析表明,该酶呈酸性,亲水,稳定。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,其空间结构与大米α-半乳糖苷酶相似度较高,以此为模版构建了可靠的三维结构模型。模型的一侧是由8个α-螺旋和8个β-转角形成的球状结构,另一侧是8个β-转角。实验结果为咖啡豆α-半乳糖苷酶的空间结构和催化活性位点的研究提供了理论依据。 展开更多

关键词 咖啡豆α-半乳糖苷酶 蛋白质结构分析 同源建模

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细胞窖-1的多重调控机制 被引量：1

19

作者 陈涛 刘亮 虞先濬 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期2099-2100,共2页

1953年美国科学家George EP等在观察细胞内吞过程时发现了存在于内皮细胞上的质膜瓶形内陷小窝，将其定义为细胞窖（Caveolae）。后证实Caveolae由鞘糖脂（GSL）、胆固醇、鞘磷脂（SPH）以及糖基锚定膜蛋白组成，其大量存在于内皮细胞... 1953年美国科学家George EP等在观察细胞内吞过程时发现了存在于内皮细胞上的质膜瓶形内陷小窝，将其定义为细胞窖（Caveolae）。后证实Caveolae由鞘糖脂（GSL）、胆固醇、鞘磷脂（SPH）以及糖基锚定膜蛋白组成，其大量存在于内皮细胞、肌细胞、脂肪细胞、肺上皮细胞的细胞膜上，通过蛋白质结构分析， 展开更多

关键词 内皮细胞 CAVEOLAE 蛋白质结构分析 调控 多重 GEORGE 美国科学家 肺上皮细胞

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生物信息学中的计算智能

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作者 Arpad Kelemen 刘翟 《国外科技新书评介》 2008年第9期14-15,共2页

生物信息学作为一门利用计算手段来研究分子水平层面的生物学问题，采用了包括计算智能、应用数学、统计学、信息学和现代生物学等方法。目前主要的应用集中在序列分析、基因预测、基因组注释、蛋白质结构分析和预测、基因表达谱分析、... 生物信息学作为一门利用计算手段来研究分子水平层面的生物学问题，采用了包括计算智能、应用数学、统计学、信息学和现代生物学等方法。目前主要的应用集中在序列分析、基因预测、基因组注释、蛋白质结构分析和预测、基因表达谱分析、蛋白质相互作用和进化模型等领域。计算智能包括神经网络、模糊系统、粗糙集、进化计算、群体智能、概率推理和多智能体系统等技术方法，它的发展趋势是整合不同的方法以达到一个协同的系统。 展开更多

关键词 生物信息学 计算智能 蛋白质结构分析 蛋白质相互作用 现代生物学 基因预测 多智能体系统 应用数学

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