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宏基因组高通量测序技术应用于感染性疾病病原检测中国专家共识 被引量:178
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作者 中华医学会检验医学分会临床微生物学组 中华医学会微生物学与免疫学分会临床微生物学组 +5 位作者 中国医疗保健国际交流促进会临床微生物与感染分会 王辉 陈宏斌 宁永忠 鲁炳怀 尹玉瑶 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期107-120,共14页
宏基因组高通量测序技术通过对临床样本中微生物和宿主核酸的测序分析,可以无偏倚地检测多种病原微生物,正在逐渐应用于临床感染性疾病病原检测,然而业界对该技术的临床适应证、实验流程、质量管理、性能验证和报告解读等方面仍有困惑... 宏基因组高通量测序技术通过对临床样本中微生物和宿主核酸的测序分析,可以无偏倚地检测多种病原微生物,正在逐渐应用于临床感染性疾病病原检测,然而业界对该技术的临床适应证、实验流程、质量管理、性能验证和报告解读等方面仍有困惑。中华医学会检验医学分会临床微生物学组、中华医学会微生物学与免疫学分会临床微生物学组、中国医疗保健国际交流促进会临床微生物与感染分会组织专家对上述问题进行了讨论并撰写了专家共识,对一些关键问题给出了推荐意见和处理方法,希望有益于业界的良性互动,促进该技术规范和发展,为临床抗感染诊治提供帮助。 展开更多
关键词 宏基因组 二代测序 感染性疾病 病原检测
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家养鲤科鱼暴发性传染病的病原研究 被引量:129
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作者 陈怀青 陆承平 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1991年第4期87-91,共5页
从不同地区、不同鱼种的濒死病鱼的实质性脏器中分离到一种革兰氏阴性、有运动力的短杆菌,具有如下特点:氧化酶和V-P反应均呈阳性,发酵葡萄糖产酸、产气,发酵甘露醇、水杨素和阿拉伯糖,不发酵肌醇,鸟氨酸脱羧酶阴性,对新生霉素不敏感。... 从不同地区、不同鱼种的濒死病鱼的实质性脏器中分离到一种革兰氏阴性、有运动力的短杆菌,具有如下特点:氧化酶和V-P反应均呈阳性,发酵葡萄糖产酸、产气,发酵甘露醇、水杨素和阿拉伯糖,不发酵肌醇,鸟氨酸脱羧酶阴性,对新生霉素不敏感。用API-20E系统试剂盒检测,证实其为嗜水气单胞菌。用该菌人工感染健康鱼,可引致与自然发病鱼类似的病症,其半数致死量(LD_(50))为5×10~3个菌。在该菌的培养上清中存在着一种具有溶血活性的毒素。研究证明,家养鲤科鱼暴发性传染病的病原为产毒素的嗜水气单胞菌,该病的准确名称应为嗜水气单胞菌败血症。 展开更多
关键词 鲁鱼 传染病 病原 单胞菌
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小儿感染性腹泻临床特征与病原菌分布及耐药性分析 被引量:64
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作者 胡玲 王宝香 +1 位作者 梅红 赵玉霞 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第14期2237-2240,共4页
目的探讨小儿感染性腹泻的临床特征、病原菌分布及其耐药性情况。方法收集2015年6月-2017年12月儿科门诊诊治的980例感染性腹泻患儿,统计分析临床症状、粪便细菌培养和药敏试验结果。结果患儿均表现为腹泻、粪便性状异常,伴有发热42.24... 目的探讨小儿感染性腹泻的临床特征、病原菌分布及其耐药性情况。方法收集2015年6月-2017年12月儿科门诊诊治的980例感染性腹泻患儿,统计分析临床症状、粪便细菌培养和药敏试验结果。结果患儿均表现为腹泻、粪便性状异常,伴有发热42.24%、恶心呕吐21.63%、腹痛51.33%、脱水4.59%。粪便性状以稀水便、黏液便为主;共检出61例病原菌占6.22%,以沙门菌属31.15%、志贺菌属24.59%、弧菌属18.03%为主;2种主要沙门菌属病原菌对氨曲南、美罗培南、头孢他啶、磺胺甲噁唑/甲氧苄啶、亚胺培南、阿莫西林/克拉维酸敏感,耐药性0.00%~12.50%,福氏志贺菌对美罗培南、亚胺培南、阿莫西林/克拉维酸敏感,耐药性0.00%~8.33%,副溶血弧菌除氨苄西林外其他抗菌药物耐药性均较低0.00%~25.00%,金黄色葡萄球菌具有不均一耐药性。结论本地区感染性腹泻患儿的病原菌谱复杂,以沙门菌属、志贺菌属、弧菌属为主,且不同病原菌对抗菌药物耐药性差异较大,应结合粪便、病原学检查结果等合理选用抗菌药物治疗,抑制耐药性产生。 展开更多
关键词 感染性腹泻 患儿 临床特征 病原菌 耐药性
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新生儿感染性肺炎危险因素分析与预防措施 被引量:52
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作者 江玉凤 陈敏利 +2 位作者 符慧玉 黎琰 赵玉梅 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期1387-1389,共3页
目的探讨新生儿感染性肺炎病原菌特点及其危险因素,预防措施分析,为临床治疗新生儿感染性肺炎提供依据。方法回顾性分析2012年4月-2015年3月医院新生儿科住院治疗的1064例新生儿临床资料,其中感染性肺炎96例,分析其病原菌分布及相关危... 目的探讨新生儿感染性肺炎病原菌特点及其危险因素,预防措施分析,为临床治疗新生儿感染性肺炎提供依据。方法回顾性分析2012年4月-2015年3月医院新生儿科住院治疗的1064例新生儿临床资料,其中感染性肺炎96例,分析其病原菌分布及相关危险因素,采用SPSS 18.0软件进行统计分析。结果 1 064例新生儿有96例发生感染性肺炎发生率为9.02%,共检出病原菌102株,其中革兰阴性菌占67.65%、革兰阳性菌占30.39%、真菌占1.96%;革兰阴性菌主要以大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、鲍氏不动杆菌为主,革兰阳性菌主要以金黄色葡萄球菌为主;单因素分析发现胎龄小、出生体质量低、血清白蛋白水平低、羊水污染、胎膜早破、宫内窘迫、气管插管是新生儿感染性肺炎的危险因素(P<0.05);多因素非条件logistic回归分析发现出生体质量低、血清白蛋白水平低、羊水污染、胎膜早破、宫内窘迫、气管插管是新生儿感染性肺炎的独立危险因素(P<0.05)。结论新生儿感染性肺炎与多种因素有关,需采取相应措施降低感染性肺炎发病率。 展开更多
关键词 新生儿 感染性肺炎 病原菌 危险因素
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感染性腹泻疾病负担及其病原谱变化研究进展 被引量:39
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作者 梁丹 车荣飞 +3 位作者 石倩萍 黎聪荣 景艺 柯昌文 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1651-1654,共4页
腹泻病是全球公共卫生问题之一,每年造成全球约76万儿童死亡。腹泻病虽是一种常见疾病,却是引起全球<5岁儿童死亡的第二大原因,也是造成儿童营养不良的主要原因。感染性腹泻作为腹泻病病因学的一个分类,其发病率高、流行面广,是危害... 腹泻病是全球公共卫生问题之一,每年造成全球约76万儿童死亡。腹泻病虽是一种常见疾病,却是引起全球<5岁儿童死亡的第二大原因,也是造成儿童营养不良的主要原因。感染性腹泻作为腹泻病病因学的一个分类,其发病率高、流行面广,是危害人类身体健康的重要疾病。引起急性肠道传染病的致泻病原体主要是轮状病毒、诺如病毒、星状病毒、克雷伯菌、副溶血弧菌、沙门菌、肠弯曲菌、气单胞菌、大肠埃希菌,其中大部分的疾病负担源自于病毒性腹泻,而轮状病毒腹泻病是病毒性腹泻疾病负担的主要贡献者,我国约60%以上因胃肠炎住院的6~24月龄的婴幼儿是由轮状病毒感染所致。本文针对感染性腹泻的疾病负担和病原谱变化研究进展进行综述,旨在为了解感染性腹泻对社会、家庭、患者所造成的危害和损失,完善相关预防措施,减轻疾病负担提供依据。 展开更多
关键词 腹泻病 感染性腹泻 疾病负担 病原谱
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2011-2014年浙江省其他感染性腹泻病发病及病原分析 被引量:37
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作者 薛鸣 林君芬 +4 位作者 徐校平 吴晨 鲁琴宝 丁哲渊 吴昊澄 《疾病监测》 CAS 2016年第3期209-214,共6页
目的掌握其他感染性腹泻病发病及肠道病原流行特征。方法收集2011年1月至2014年12月浙江省其他感染性腹泻病的发病数据及有病原学报告的个案资料,以X11方法进行发病及病原数据的季节因子提取,并进行发病与病原的季节因子的关联分析。结... 目的掌握其他感染性腹泻病发病及肠道病原流行特征。方法收集2011年1月至2014年12月浙江省其他感染性腹泻病的发病数据及有病原学报告的个案资料,以X11方法进行发病及病原数据的季节因子提取,并进行发病与病原的季节因子的关联分析。结果浙江省其他感染性腹泻病存在夏季和冬季两个发病高峰,≤3岁组幼儿发病占所有病例比例约为50%;≤4岁组幼儿的发病高峰位于冬季,≥15岁组人群发病高峰在夏季,其余人群发病高峰不明显;报告的病原主要为轮状病毒(94.82%),其中轮状病毒和诺如病毒的发病高峰在冬季,其他病原的高峰出现在夏秋季;≤7岁组儿童发病季节模式与轮状病毒季节模式一致,≥9岁组人群发病模式与细菌类病原季节模式一致。结论≤3岁组儿童是主要发病人群,不同年龄段人群感染病原谱及发病季节模式不同,应根据其不同特征分类进行防制。 展开更多
关键词 感染性腹泻病 肠道病原 季节因子 关联性
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宏基因组测序在感染性疾病病原体检测中的应用 被引量:35
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作者 李林海 陈丽丹 +1 位作者 肖斌 孙朝晖 《传染病信息》 2018年第1期15-18,共4页
感染性疾病的致病因素复杂,临床表现多样。快速、全面、准确地鉴别病原体,是临床医生及时、有针对性地采取治疗措施的前提。传统的病原体检测方法目标单一、耗时长、操作复杂,很难满足当今感染性疾病诊治的要求。宏基因组测序技术克服... 感染性疾病的致病因素复杂,临床表现多样。快速、全面、准确地鉴别病原体,是临床医生及时、有针对性地采取治疗措施的前提。传统的病原体检测方法目标单一、耗时长、操作复杂,很难满足当今感染性疾病诊治的要求。宏基因组测序技术克服了多数病原体不能培养的弊端,能够准确高效地获得全部病原体遗传物质信息,直接检测出感染性疾病的病原体,对疑难感染性疾病的诊断具有重要参考价值。本文对宏基因组测序在感染性疾病病原体检测中的最新研究进展和应用进行综述。 展开更多
关键词 高通量测序 宏基因组测序 感染性疾病 病原体
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新生儿重症感染性肺炎的病因与抗感染治疗 被引量:31
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作者 丁瑛雪 崔红 《中国小儿急救医学》 CAS 2017年第5期340-345,共6页
新生儿感染性肺炎的发病率和病死率在新生儿感染性疾病中占第一位,是新生儿死亡的主要原因之一。重症肺炎时可引起多脏器炎性反应及功能障碍。新生儿重症感染性肺炎的发病原因主要与病原体感染和新生儿免疫力低下有关,其中接触病原体... 新生儿感染性肺炎的发病率和病死率在新生儿感染性疾病中占第一位,是新生儿死亡的主要原因之一。重症肺炎时可引起多脏器炎性反应及功能障碍。新生儿重症感染性肺炎的发病原因主要与病原体感染和新生儿免疫力低下有关,其中接触病原体引起感染的途径主要有出生前、出生时和出生后感染。细菌是新生儿重症肺炎的首位病原,以革兰阴性菌为主要致病菌;院内获得性感染则多为产酶菌和多重耐药菌感染。治疗的关键是合理的抗感染治疗。 展开更多
关键词 感染性肺炎 病因 治疗 新生儿
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2012年5—12月上海市感染性腹泻细菌和病毒病原学监测结果分析 被引量:30
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作者 黎健 肖文佳 +4 位作者 胡家瑜 吴寰宇 薛莹 潘浩 何懿 《疾病监测》 CAS 2014年第11期880-883,共4页
目的了解2012年5—12月上海市感染性腹泻的病原谱和流行病学特征。方法随机抽取6所不同级别医院,对在其肠道门诊就诊的感染性腹泻病例按一定的抽样间隔进行调查,并采集粪便标本,进行细菌培养和病毒检测。结果从1001例病例粪便标本中检... 目的了解2012年5—12月上海市感染性腹泻的病原谱和流行病学特征。方法随机抽取6所不同级别医院,对在其肠道门诊就诊的感染性腹泻病例按一定的抽样间隔进行调查,并采集粪便标本,进行细菌培养和病毒检测。结果从1001例病例粪便标本中检出阳性465例,检出率为46.45%。检出细菌7种、病毒5种。细菌检出率为12.09%,主要为副溶血性弧菌(61例)、沙门菌(35例)。病毒检出率为32.07%,主要为诺如病毒(262例)、轮状病毒(40例)。阳性例数呈较明显的夏季高峰和秋冬季高峰。465例阳性病例的平均年龄为(44.20±17.56)岁,病原阳性组和阴性组的年龄构成差异无统计学意义(P>0.05)。细菌阳性组中有腹痛和发热症状的构成比均高于病毒阳性组,有呕吐和恶心症状的构成比均低于病毒阳性组;细菌阳性组发病前5天有聚餐史和外出史的构成比均高于病毒阳性组,二组有宠物接触史的比例均高于阴性组,上述差异均有统计学意义(P<0.05)。结论上海地区腹泻病原谱较为广泛,季节高峰较为明显,应针对各病原检出率的差异在不同季节开展相应的防控措施。 展开更多
关键词 感染性腹泻 病原谱 流行病学 监测
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2013-2017年感染性腹泻的病原体特点和流行特征 被引量:27
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作者 李艳 张晓蕾 +2 位作者 李金平 朱东 张田玲 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1732-1736,共5页
目的分析2013-2017年医院感染性腹泻的病原体特点和流行特征,为其防治提供科学参考依据。方法收集2013年1月-2017年12月医院肠道门诊腹泻患者1 937例的粪便标本进行病原体检测,对其结果进行分析。结果 1 937例粪便标本中阳性病例376例,... 目的分析2013-2017年医院感染性腹泻的病原体特点和流行特征,为其防治提供科学参考依据。方法收集2013年1月-2017年12月医院肠道门诊腹泻患者1 937例的粪便标本进行病原体检测,对其结果进行分析。结果 1 937例粪便标本中阳性病例376例,阳性率为19.41%,其中致泻性大肠埃希菌110株占29.26%,副溶血性弧菌83株占22.07%,沙门菌119株占31.65%,志贺菌64株占17.02%;<10岁患者无病原菌检出,21~30岁、41~50岁及51~60岁患者阳性检出率均≥15%,其余年龄组检出率均较低;1、2、11和12月病原菌检出率较低,而6~8月检出率较高,6月份检出231例,7月份检出493例,8月份检出462例;64株志贺菌中宋内志贺菌49株占76.56%,其余为F2a(12.50%)、F4c(7.81%)、F2b(3.13%);83株副溶血性弧菌以O3:K6型为主,共60株占72.29%,其余血清型较分散;致泻性大肠埃希菌分为致病性大肠埃希菌和产肠毒素性大肠埃希菌,分别占65.45%和34.55%;沙门菌血清型分布中肠炎39株占32.77%,鼠伤寒28株占23.53%,猪霍乱21株占17.65%。结论感染性病原菌主要以致泻性大肠埃希菌、副溶血性弧菌、沙门菌和志贺菌为主,且存在明显的季节性,应加强优势病原型别的变化。 展开更多
关键词 感染性腹泻 病原菌 沙门菌 大肠埃希菌 副溶血性弧菌 志贺菌
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2016-2018年北京市通州区感染性腹泻细菌病原谱监测分析 被引量:26
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作者 张萍 杨郝亮 +7 位作者 甄博珺 高翔 赵凤玲 高洁 张扬 李朝辉 王多春(指导) 周景林 《疾病监测》 CAS 2019年第9期800-804,共5页
目的了解北京市通州区感染性腹泻细菌多病原监测中致病菌的病原谱,为细菌性感染性腹泻的防控提供依据。方法收集2016—2018年北京市通州区哨点医院肠道门诊腹泻患者监测病例粪便标本,采用血清分型、毒力基因等方法对沙门菌、副溶血弧菌... 目的了解北京市通州区感染性腹泻细菌多病原监测中致病菌的病原谱,为细菌性感染性腹泻的防控提供依据。方法收集2016—2018年北京市通州区哨点医院肠道门诊腹泻患者监测病例粪便标本,采用血清分型、毒力基因等方法对沙门菌、副溶血弧菌、致泻性大肠埃希菌进行分子生物学鉴定,并分析其流行特征。结果收集粪便标本1 269例,分离致病菌298株,检出率为23.48%,不同年龄组病例致病菌检出率差异有统计学意义(χ2=33.584,P<0.001)。阳性菌株中致泻性大肠埃希菌检出最多(46.98%),以肠道集聚性大肠埃希菌和产肠毒素大肠埃希菌为主;其次为副溶血弧菌(24.50%)和沙门菌(19.46%)。细菌流行的季节性比较明显,以夏秋季为主。沙门菌血清型以肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为主,副溶血弧菌血清型以O3∶K6为主。结论 2016—2018年北京市通州区感染性腹泻致病菌以致泻性大肠埃希菌为主,副溶血弧菌和沙门菌感染也是腹泻常见病原菌。应加强感染性腹泻致病菌常规监测,在流行季节做好重点人群健康宣教工作,同时进一步加强危险因素调查及其防控。 展开更多
关键词 感染性腹泻 病原谱 致病菌 血清型
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宏基因组测序在感染性疾病病原学诊断中的应用 被引量:26
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作者 徐智察 赵冬冬 +1 位作者 周华 俞云松 《中华临床感染病杂志》 CSCD 2019年第4期302-308,共7页
感染性疾病是世界范围内一类主要致死性疾病,基于目前临床检验实验室传统检测手段,其中大部分病原体仍是诊断不明的。宏基因组测序具备无偏移、全覆盖、高效率等优势,正被应用于临床病原学诊断。研究表明,宏基因组测序在呼吸道感染、中... 感染性疾病是世界范围内一类主要致死性疾病,基于目前临床检验实验室传统检测手段,其中大部分病原体仍是诊断不明的。宏基因组测序具备无偏移、全覆盖、高效率等优势,正被应用于临床病原学诊断。研究表明,宏基因组测序在呼吸道感染、中枢神经系统感染及血流感染等有着良好的病原学诊断能力,虽然不能完全取代临床检验实验室传统检测手段在现有临床病原学诊断中的地位,但可考虑作为一种确实有效的补充。本文回顾了近年来宏基因组测序在各类感染病原诊断中的临床应用进展,探讨其当前应用中面临的制约瓶颈,旨在更好引导其临床应用。 展开更多
关键词 感染性疾病 宏基因组测序 病原学诊断 临床应用
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上海市浦东新区2013-2017年感染性腹泻病原流行特征分析 被引量:22
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作者 王闻卿 刘丹 +8 位作者 赵冰 傅慧琴 张子科 余建兴 叶楚楚 薛曹怡 朱渭萍 朱林英 郝莉鹏 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期417-422,共6页
目的:了解2013-2017年上海市浦东新区感染性腹泻病原流行特征,为制定监测方案和开展感染性腹泻防治工作提供科学依据。方法:2013年1月至2017年12月,根据地理位置、覆盖人群和就诊量,在本区3所三级医院、9所二级医院和2所社区卫生服务中... 目的:了解2013-2017年上海市浦东新区感染性腹泻病原流行特征,为制定监测方案和开展感染性腹泻防治工作提供科学依据。方法:2013年1月至2017年12月,根据地理位置、覆盖人群和就诊量,在本区3所三级医院、9所二级医院和2所社区卫生服务中心开展腹泻病原主动监测,填写门诊病例个案调查表,采集粪便样品进行5类病毒和8类细菌的病原学检测。结果:共纳入感染性腹泻病例9301例,病原阳性率为55.7%(5179)。单一病毒、单一细菌和混合感染的阳性率分别为26.7%(2481)、17.0%(1579)和12.0%(1119)。单一病毒阳性病例中,诺如病毒阳性率最高(15.4%,1428/9301),其次为轮状病毒(7.2%,667/9301);单一细菌阳性病例中,致泻性大肠埃希菌阳性率最高(6.7%,619/9301),其次为非伤寒沙门菌(3.3%,305/9301);混合感染病例中,病毒-细菌阳性率最高(4.9%,459/9301)。诺如病毒(17.0%,838/4938)和致泻性大肠埃希菌(7.2%,354/4938)阳性率在20~59岁年龄组最高,轮状病毒(9.4%,178/1896)和非伤寒沙门菌(4.9%,93/1896)阳性率在0~4岁年龄组最高。诺如病毒年度流行呈现春季和秋季2个高峰,轮状病毒呈现冬季高峰,致泻性大肠埃希菌呈现夏季高峰,非伤寒沙门菌呈现夏季小高峰。结论:2013-2017年上海市浦东新区感染性腹泻病原阳性率高,诺如病毒、轮状病毒和致泻性大肠埃希菌是本地区优势病原体,病原在不同年龄组分布存在差异,优势病原季节性流行特征明显。 展开更多
关键词 感染性腹泻 病原 流行特征 门诊病例
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2011—2013年北京某城区感染性腹泻患者致病菌检测分析 被引量:18
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作者 白书媛 刘淑岭 +3 位作者 高波 胡三梅 霍哲 张浩 《中国感染控制杂志》 CAS 北大核心 2015年第6期361-365,共5页
目的分析北京某城区2011—2013年感染性腹泻患者致病菌分布及脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱特征,为感染溯源提供依据。方法收集2011年1月—2013年12月该区域肠道门诊感染性腹泻患者粪便标本1 179份,对其培养分离的致病菌进行血清分型及PFGE... 目的分析北京某城区2011—2013年感染性腹泻患者致病菌分布及脉冲场凝胶电泳(PFGE)图谱特征,为感染溯源提供依据。方法收集2011年1月—2013年12月该区域肠道门诊感染性腹泻患者粪便标本1 179份,对其培养分离的致病菌进行血清分型及PFGE分析。结果 1 179份标本,共培养肠道病原菌330株,其中检出居前4位的肠道致病菌依次为志贺菌属93株(28.18%)、沙门菌属69株(20.91%)、副溶血性弧菌44株(13.33%)及致泻性大肠埃希菌11株(3.33%)。18株宋内志贺菌PFGE分为8个型别,聚类相似度接近88%;69株沙门菌属细菌分为18个血清型,共41种PFGE型别,其中山夫登堡沙门菌和肠炎沙门菌具有明显的优势带型;23株副溶血性弧菌PFGE型别较为分散。结论 3年间感染性腹泻患者致病菌的血清型和PFGE带型分布较为广泛,应注意沙门菌属和志贺菌属细菌的PFGE优势菌型,警惕其引发的感染性腹泻暴发流行。 展开更多
关键词 感染性腹泻 肠道致病菌 志贺菌属 沙门菌属 副溶血性弧菌 致泻性大肠埃希菌 病原菌 脉冲场凝胶电泳 分子流行病学
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2015~2017年湖南省感染性腹泻病原谱特征分析 被引量:18
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作者 罗垲炜 赵善露 +7 位作者 胡世雄 邓志红 欧阳云 张孝洪 龙奇志 姚正才 高立冬 李俊华 《热带病与寄生虫学》 2018年第2期71-74,共4页
目的了解湖南省感染性腹泻的病原谱及流行特征。方法设立监测点,采集腹泻患者粪便标本进行沙门菌、志贺菌、耶尔森氏菌、致泻性大肠杆菌、副溶血性弧菌等细菌病原和轮状病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒、肠道腺病毒等病毒病原的检... 目的了解湖南省感染性腹泻的病原谱及流行特征。方法设立监测点,采集腹泻患者粪便标本进行沙门菌、志贺菌、耶尔森氏菌、致泻性大肠杆菌、副溶血性弧菌等细菌病原和轮状病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒、肠道腺病毒等病毒病原的检测。结果共采集1123份腹泻患者标本,总阳性率为31. 34%,病毒性病原检出高于细菌。细菌性病原检出以沙门菌为主,病毒则以轮状病毒A组和诺如病毒GⅡ型阳性为主。5岁以下儿童和50岁以上老人的检测阳性率较高。不同地区的病原谱差别较大。结论湖南省感染性腹泻病原体中病毒占比高于细菌,沙门菌、轮状病毒A组和诺如病毒GⅡ型是引起湖南省感染性腹泻最主要的病原体。 展开更多
关键词 感染性腹泻 病原谱 流行特征
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北京地区感染性腹泻病原菌监测 被引量:16
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作者 孙立珍 孙立平 丁淑芹 《热带医学杂志》 CAS 2018年第1期97-99,103,共4页
目的研究北京地区感染性腹泻病原菌监测结果及临床特点分析,进而提出治疗感染性腹泻的方法,避免抗生素的过度使用。方法收集2014年12月至2016年12月北京地区肠道门诊1 500例感染性腹泻患者粪便,按照国家行业标准进行常见的肠道病原菌检... 目的研究北京地区感染性腹泻病原菌监测结果及临床特点分析,进而提出治疗感染性腹泻的方法,避免抗生素的过度使用。方法收集2014年12月至2016年12月北京地区肠道门诊1 500例感染性腹泻患者粪便,按照国家行业标准进行常见的肠道病原菌检测,对病原菌的致病时间、致病人群、病例血清类型进行重点调查并对结果进行统计学分析,并调查患者的药敏结果。结果 1 500例标本中分离出470株致病菌,阳性率为31.33%;其中检出最多的病原菌为副溶血性弧菌和沙门菌,分别占49.35%和17.23%;不同年龄组间的病原菌检出率的差异有统计学意义(P<0.05),且在7-9月病原菌的检出率较高,药敏分析发现,各种病菌普遍对头孢西丁和阿莫西林-克拉维酸、氨曲南敏感。结论北京地区的感染性腹泻病原菌主要为副溶血性弧菌和沙门菌,各致病菌的耐药性有差异,应加强检查。 展开更多
关键词 感染性腹泻 病原菌 北京
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2014年无锡市感染性腹泻的病原学分析 被引量:16
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作者 管红霞 肖勇 沙丹 《检验医学》 CAS 2016年第11期953-958,共6页
目的:了解无锡市感染性腹泻的病原谱及流行特征。方法连续采集2014年1至12月无锡市腹泻监测哨点医院门诊腹泻病例的粪便样本,采用实时荧光聚合酶链反应(PCR)检测诺如病毒、轮状病毒、肠道腺病毒、人星状病毒和札如病毒的核酸,采用... 目的:了解无锡市感染性腹泻的病原谱及流行特征。方法连续采集2014年1至12月无锡市腹泻监测哨点医院门诊腹泻病例的粪便样本,采用实时荧光聚合酶链反应(PCR)检测诺如病毒、轮状病毒、肠道腺病毒、人星状病毒和札如病毒的核酸,采用传统的分离培养方法检测致泻性大肠埃希菌、沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌和霍乱弧菌,分析病原构成、季节变化和人群分布。结果全年共监测粪便样本915例。病毒核酸阳性率为14.4%,诺如病毒(9.4%)和轮状病毒(3.4%)的流行有明显的季节分布特点,冬、春季为发病高峰。0-5岁组患儿病毒感染率显著高于其他年龄组患者。细菌检测阳性率为15.0%,集中在6至9月检出,以沙门菌为主(6.0%),优势菌型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌,其次为致泻性大肠埃希菌(4.6%)。结论无锡市冬、春季节腹泻以病毒性感染为主,诺如病毒和轮状病毒是主要病原;夏季腹泻主要为细菌性感染,沙门菌和致泻性大肠埃希菌感染多见。应加强监测优势病原型别的变化。5岁以下儿童是病毒性腹泻的重点防控人群。 展开更多
关键词 感染性腹泻 病原谱 流行特征
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广州地区儿童空肠弯曲菌感染的病原学研究 被引量:14
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作者 谢永强 周珍文 +2 位作者 虢艳 邓秋连 黄勇 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期422-424,共3页
目的了解广州地区腹泻儿童空肠弯曲菌(CJ)的感染及耐药情况,为临床及时、合理诊断和治疗提供实验室依据。方法对2005年7月至2008年6月该院门诊3 351份腹泻患儿的粪便标本进行CJ的分离培养,并对分离菌株进行Lior分型及耐药试验。结果 3 ... 目的了解广州地区腹泻儿童空肠弯曲菌(CJ)的感染及耐药情况,为临床及时、合理诊断和治疗提供实验室依据。方法对2005年7月至2008年6月该院门诊3 351份腹泻患儿的粪便标本进行CJ的分离培养,并对分离菌株进行Lior分型及耐药试验。结果 3 351份腹泻患儿粪便标本共检出267株CJ,分离率为8.0%;婴幼儿(1个月至1岁)是CJ的易感人群,占91.0%(243/267);夏秋季是高发季节,占76.8%(205/267)。该菌对亚胺培南、阿米卡星、头孢哌酮/舒巴坦和氯霉素敏感,对大环内酯类和林可霉素类耐药率<5%,对氨苄西林、喹诺酮类和四环素耐药率在20% ~40%之间,对复方新诺明和头孢哌酮均耐药。Lior分型以Ⅰ型为主,占75.3%(201/267)。结论 CJ是婴幼儿腹泻的重要病原菌,其耐药形势日趋严重,应引起重视。临床应结合药敏试验结果选择抗菌药物治疗CJ感染。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 感染性腹泻 病原菌 儿童
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Post-infectious irritable bowel syndrome:Mechanistic insights into chronic disturbances following enteric infection 被引量:12
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作者 Jennifer K Beatty Amol Bhargava Andre G Buret 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2014年第14期3976-3985,共10页
Irritable bowel syndrome(IBS)is a commonly encountered chronic functional gastrointestinal(GI)disorder.Approximately 10%of IBS patients can trace the onset of their symptoms to a previous a bout of infectious dysenter... Irritable bowel syndrome(IBS)is a commonly encountered chronic functional gastrointestinal(GI)disorder.Approximately 10%of IBS patients can trace the onset of their symptoms to a previous a bout of infectious dysentery.The appearance of new IBS symptoms following an infectious event is defined as post-infectiousIBS.Indeed,with the World Health Organization estimating between 2 and 4 billion cases annually,infectious diarrheal disease represents an incredible international healthcare burden.Additionally,compounding evidence suggests many commonly encountered enteropathogens as unique triggers behind IBS symptom generation and underlying pathophysiological features.A growing body of work provides evidence supporting a role for pathogen-mediated modifications in the resident intestinal microbiota,epithelial barrier integrity,effector cell functions,and innate and adaptive immune features,all proposed physiological manifestations that can underlie GI abnormalities in IBS.Enteric pathogens must employ a vast array of machinery to evade host protective immune mechanisms,and illicit successful infections.Consequently,the impact of infectious events on host physiology can be multidimensional in terms of anatomical location,functional scope,and duration.This review offers a unique discussion of the mechanisms employed by many commonly encountered enteric pathogens that cause acute disease,but may also lead to the establishment of chronic GI dysfunction compatible with IBS. 展开更多
关键词 Post-infectious irritable bowel syndrome infectious diarrhea Enteric pathogen Inflammatory disorders Immune alterations
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2017-2019年北京市感染性腹泻细菌病原谱与流行特征分析 被引量:13
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作者 黄瑛 田祎 +5 位作者 吕冰 张新 严寒秋 贾蕾 王全意 曲梅 《中国预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期93-97,共5页
目的了解北京市感染性腹泻细菌病原谱的构成和流行特征。方法选取2017-2019年北京市16区哨点医院肠道门诊腹泻患者粪便样本,通过分离培养、血清分型及毒力基因检测方法对5种肠致泻性大肠埃希菌、沙门菌、副溶血性弧菌、志贺菌、O1/O139... 目的了解北京市感染性腹泻细菌病原谱的构成和流行特征。方法选取2017-2019年北京市16区哨点医院肠道门诊腹泻患者粪便样本,通过分离培养、血清分型及毒力基因检测方法对5种肠致泻性大肠埃希菌、沙门菌、副溶血性弧菌、志贺菌、O1/O139群霍乱弧菌和弯曲菌等多种肠道致病菌的检测和分析。结果北京市2017-2019年共监测腹泻患者18 182例,其中4 025例患者肠道致病菌检测阳性,检出率为22.14%。阳性菌株中,肠致泻性大肠埃希菌检出最多(38.20%),其次为沙门菌(20.80%)和副溶血性弧菌(15.92%)。肠道致病菌的人群分布主要集中在成年组,病原菌的检出具有明显的季节性,7—9月为高峰。结论 2017-2019年北京市感染性腹泻致病菌以肠致泻性大肠埃希菌为主,其次为沙门菌和副溶血性弧菌,病原菌在不同年龄组分布存在差异,且有明显的季节性流行特征。 展开更多
关键词 感染性腹泻 病原谱 流行特征
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