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重金属复合污染农田土壤DNA的快速提取及其PCR-DGGE分析 被引量：57
1
作者 滕应 骆永明 +3 位作者 赵祥伟 李振高 宋静 吴龙华 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期343-347,共5页
国内首次运用FastPrep○R 核酸快速提取系统提取了重金属复合污染农田土壤的DNA ,并对其进行了聚合酶链反应—变性梯度凝胶电泳 (PCR DGGE)分析。结果表明 ,FastPrep○R核酸提取仪与相应的FastD NASPINKitforSoil试剂盒联用时 ,能有效... 国内首次运用FastPrep○R 核酸快速提取系统提取了重金属复合污染农田土壤的DNA ,并对其进行了聚合酶链反应—变性梯度凝胶电泳 (PCR DGGE)分析。结果表明 ,FastPrep○R核酸提取仪与相应的FastD NASPINKitforSoil试剂盒联用时 ,能有效地分离到纯度较高的重金属污染农田土壤的DNA。PCR DGGE电泳图谱表明 ,PCR产物经DGGE检测后得到的电泳条带清晰且分离效果好 ,可以明显反映出重金属复合污染导致了农田土壤微生物在基因上的损伤 ,影响到农田土壤生态系统的细菌丰富度 ,改变了土壤环境的优势菌群 ,从而使农田土壤微生物群落结构多样性发生变化。可见 ,FastPrep○R核酸提取系统同样适用于重金属污染农田土壤环境中微生物基因组DNA的快速分离和纯化 ,得到的DNA可直接用于PCR DGGE分析。 展开更多
关键词 重金属复合污染 土壤污染 提取技术 pcr-dgge 农田土壤DNA FastPrep核酸快速提取系统 土壤微生物
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直流电场对根际土壤微生物群落的影响及其机理 被引量：19
2
作者 沈根祥 周海花 +3 位作者 罗启仕 赵庆节 梁丹涛 刘芳 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期920-925,共6页
电场作用下根际土壤微生物群落的变化与利用电场强化植物修复效率密切相关。利用改进的PCR-DGGE方法研究了不同电场条件下根际土壤微生物群落多样性和相似性的变化,分析了直流电场对土壤微生物群落的影响机理。结果表明,电场对根际土壤... 电场作用下根际土壤微生物群落的变化与利用电场强化植物修复效率密切相关。利用改进的PCR-DGGE方法研究了不同电场条件下根际土壤微生物群落多样性和相似性的变化,分析了直流电场对土壤微生物群落的影响机理。结果表明,电场对根际土壤微生物群落的影响与电场条件有关,合适的电场条件有助于增加土壤微生物群落的多样性,但是电场形式、强度和施加方式不当则会使土壤微生物群落的多样性和结构受到明显影响。电场作用下土壤性质的变化、电场对土壤微生物的迁移作用和致死效应,以及微生物对环境压力的生理响应等是电场影响土壤微生物群落的主要机制。为了避免电场对根际土壤微生物的不利影响,利用电场强化植物修复时需要采用合适的电场条件。 展开更多
关键词 直流电场 根际土壤微生物 pcr—dgge分析 微生物群落多样性 微生物群落相似性
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不同栽培时间三叶赤楠根际微生物多样性及其PCR-DGGE分析 被引量：11
3
作者 刘玮 张嘉超 邓光华 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期582-587,共6页
应用聚合酶链式反应—变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）研究了不同栽培时间三叶赤楠根际微生物多样性特征。结果表明：采用改进的蛋白酶K-CTAB法提取的三叶赤楠土壤DNA经PCR扩增的产物经DGGE检测后得到的电泳条带清晰且分离效果好,可以明... 应用聚合酶链式反应—变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）研究了不同栽培时间三叶赤楠根际微生物多样性特征。结果表明：采用改进的蛋白酶K-CTAB法提取的三叶赤楠土壤DNA经PCR扩增的产物经DGGE检测后得到的电泳条带清晰且分离效果好,可以明显反映出三叶赤楠生长过程中土壤微生物多样性的变化。栽培时间对三叶赤楠根际微生物特征有很大影响：随着栽培时间增加,土壤微生物多样性增加,在第4年多样性指数达到最高值2.741,第8年时多样性指数降为1.378。不同栽培时间三叶赤楠根际微生物类群组成有所变化。根际微生物特征可以作为盆景换盆的一个指导因素,三叶赤楠盆景的换盆在其生长46年时进行可能最为合适,此时三叶赤楠根际微生物的多样性最为丰富,进行换盆会加快其根际微生态系统的建成。 展开更多
关键词 三叶赤楠 根际微生物 栽培时问 pcr—dgge分析
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噬菌弧菌N1对淡水和海水养殖水体细菌群落影响PCR-DGGE分析 被引量：6
4
作者 陈慧黠 韩民泳 +1 位作者 于佳豪 刘琳 《广东海洋大学学报》 CAS 2019年第5期8-15,共8页
【目的】研究噬菌弧菌Bacteriovorax sp.N1 在一个投放周期内对淡水和海水养殖环境中细菌、弧菌总数及细菌群落结构的影响。【方法】自市售微生态制剂分离蛭弧菌N1 并进行分子鉴定,测定其裂解效果,制备高浓度N1 菌液分别投放至淡水红鲤... 【目的】研究噬菌弧菌Bacteriovorax sp.N1 在一个投放周期内对淡水和海水养殖环境中细菌、弧菌总数及细菌群落结构的影响。【方法】自市售微生态制剂分离蛭弧菌N1 并进行分子鉴定,测定其裂解效果,制备高浓度N1 菌液分别投放至淡水红鲤鱼(red carp)和海水仿刺参(Apostichopus japonicus)养殖水体,采用细菌平板计数法及PCR-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术分析48 h 内水体环境中细菌、弧菌总数及细菌群落结构变化。【结果】经鉴定蛭弧菌N1 为噬菌弧菌,其对大肠杆菌(Escherichia coli)、溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)、黄海希瓦氏菌(Shewanella smarisflavi)、灿烂弧菌(Vibrio splendidus)、哈氏弧菌(Vibrio harveyi)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)均有裂解效果。将噬菌弧菌N1 投放进淡水和海水养殖环境的12~24 h,其能显著降低两种环境中弧菌含量(P<0.05)。DGGE 分析显示添加噬菌弧菌N1 后淡水组优势菌群弧菌属(Vibrio,a1)和不可培养杆菌属(Uncultured bacterium, a5)在 12 h 以后含量有明显的减少,假单胞菌属(Pseudomonas, a3)和红杆菌科Shimia 属(Shimia, a6)菌含量增加。海水组优势菌群不可培养杆菌属(c2)菌在 12 h 时变成非优势菌群,而白杆菌属(Albirhodobacter,c1)增加成为优势菌群。噬菌弧菌N1 在水中含量在24 h 时降至最低。【结论】噬菌弧菌N1 对海水和淡水环境中的弧菌属和不可培养杆菌属菌群有明显的裂解作用导致其含量下降,但也使假单胞菌属(Pseudomonas),红杆菌科Shimia 属和白杆菌属(Albirhodobacter)菌群含量增加,但生物效应不明。为维持噬菌弧菌N1 对弧菌的控制,需要24h 左右重新补充投放。 展开更多
关键词 噬菌弧菌N1 养殖水体 pcr-dgge分析 细菌群落 弧菌 不可培养杆菌属
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不同施肥处理对毛竹根际微生物影响及其PCR-DGGE分析 被引量：6
5
作者 刘玮 邓光华 +1 位作者 张嘉超 杨清培 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期50-53,共4页
采用PCR-DGGE技术对不同施肥处理毛竹根际微生物多样性特征进行研究。结果表明:采用改进的蛋白酶K-CTAB法提取的毛竹土壤DNA经PCR扩增的产物经DGGE检测后得到的电泳条带清晰且分离效果好,可以明显反映出毛竹根际微生物多样性的变化。根... 采用PCR-DGGE技术对不同施肥处理毛竹根际微生物多样性特征进行研究。结果表明:采用改进的蛋白酶K-CTAB法提取的毛竹土壤DNA经PCR扩增的产物经DGGE检测后得到的电泳条带清晰且分离效果好,可以明显反映出毛竹根际微生物多样性的变化。根际微生物种群组成特征受施肥量、肥料种类影响很大,施肥能够增加毛竹根际微生物的多样性指数,在同等氮、磷养分情况下,钾肥的加入会对毛竹根际微生物种群组成产生很大的影响,并且根际微生物多样性有随钾肥施用量增加而升高的趋势。 展开更多
关键词 毛竹 根际微生物 pcr-dgge分析 施肥处理
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5种江西特色盆景植物根际微生物群落特征比较研究 被引量：2
6
作者 毛坤财 邹贵武 +1 位作者 邓光华 刘玮 《森林工程》 2016年第1期33-36,53,共5页
应用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)方法对三叶赤楠、火棘、三角枫、鸡爪槭和金边瑞香这5种江西特色盆景树种根际微生物特征进行了比较研究。结果表明:PCR-DGGE对于盆景树种根际微生物特征响应良好,DGGE图谱可以明显反映出... 应用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)方法对三叶赤楠、火棘、三角枫、鸡爪槭和金边瑞香这5种江西特色盆景树种根际微生物特征进行了比较研究。结果表明:PCR-DGGE对于盆景树种根际微生物特征响应良好,DGGE图谱可以明显反映出5种盆景树种根际微生物的差异。不同树种根际微生物特征有很大区别,鸡爪槭、三角枫根际微生物多样性指数最高,为3.121和2.876,并且根际微生物群落相似程度很高;而火棘根际微生物多样性指数最低,为1.038。这种根际微生物群落的差异可能是由不同盆景植物的根系分泌物差异所造成的,鸡爪槭、三角枫根际微生物群落相似可能是由于其系统发育地位较近(槭树科槭属)所造成的。而火棘(蔷薇科)根际微生物多样性较低可能是由于蔷薇科植物根系分泌物富含三萜酸类物质,对微生物具有抑制作用的原因。 展开更多
关键词 盆景树种 根际微生物多样性 pcr—dgge分析
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