目的探讨中医辨证治疗晚期结直肠癌化疗失败患者循环肿瘤DNA(ctDNA)状态、突变基因及其与预后相关性。方法收集83例晚期结直肠癌化疗失败患者外周血10ml,利用定制的覆盖416个肿瘤相关基因探针的Geneseeq One NGS面板进行杂交富集。高效...目的探讨中医辨证治疗晚期结直肠癌化疗失败患者循环肿瘤DNA(ctDNA)状态、突变基因及其与预后相关性。方法收集83例晚期结直肠癌化疗失败患者外周血10ml,利用定制的覆盖416个肿瘤相关基因探针的Geneseeq One NGS面板进行杂交富集。高效捕获后进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,在HiSeq NGS平台(Illumina)上对目标富集的文库进行测序。结果在纳入的83例经中医辨证治疗的晚期结直肠癌化疗失败患者中,有54例(65.06%)血浆中检测出肿瘤相关突变基因,共152个基因。根据突变频率筛选出APC、TP53、KRAS、PIK3CA等前20位的基因;ctDNA突变频率、肿瘤突变负荷(TMB)、KRAS、PIK3CA均与预后显著相关(P<0.05);临床相关因素分析显示,肝转移与多个肿瘤基因不良突变相关(P<0.05或P<0.01),脾肾两虚证与ctDNA突变频率、TMB、TP53相关(P<0.05),八纲辨证中阴证、阳证与TMB相关(P<0.05)。结论外周血ctDNA可以较好地反映中医辨证治疗的晚期结直肠癌化疗失败患者分子生物学状态,脾肾两虚证与较低的ctDNA突变频率、较低的抑癌基因突变存在相关性;阴证患者TMB较低,阳证患者TMB较高。展开更多
文摘目的探讨中医辨证治疗晚期结直肠癌化疗失败患者循环肿瘤DNA(ctDNA)状态、突变基因及其与预后相关性。方法收集83例晚期结直肠癌化疗失败患者外周血10ml,利用定制的覆盖416个肿瘤相关基因探针的Geneseeq One NGS面板进行杂交富集。高效捕获后进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,在HiSeq NGS平台(Illumina)上对目标富集的文库进行测序。结果在纳入的83例经中医辨证治疗的晚期结直肠癌化疗失败患者中,有54例(65.06%)血浆中检测出肿瘤相关突变基因,共152个基因。根据突变频率筛选出APC、TP53、KRAS、PIK3CA等前20位的基因;ctDNA突变频率、肿瘤突变负荷(TMB)、KRAS、PIK3CA均与预后显著相关(P<0.05);临床相关因素分析显示,肝转移与多个肿瘤基因不良突变相关(P<0.05或P<0.01),脾肾两虚证与ctDNA突变频率、TMB、TP53相关(P<0.05),八纲辨证中阴证、阳证与TMB相关(P<0.05)。结论外周血ctDNA可以较好地反映中医辨证治疗的晚期结直肠癌化疗失败患者分子生物学状态,脾肾两虚证与较低的ctDNA突变频率、较低的抑癌基因突变存在相关性;阴证患者TMB较低,阳证患者TMB较高。
