目的了解广西地区猪、鼠、狗、猕猴和鱼5种动物戌型肝炎病毒（HEV）基因型和亚型分布。方法对广西地区猪、鼠、狗HEV抗体阳性血清170份,鼠肝组织150份,3月龄以下狗粪便标本80份,鱼胆汁标本120份,3月龄以下猪粪便标本129份,龙虎山自然景...目的了解广西地区猪、鼠、狗、猕猴和鱼5种动物戌型肝炎病毒（HEV）基因型和亚型分布。方法对广西地区猪、鼠、狗HEV抗体阳性血清170份,鼠肝组织150份,3月龄以下狗粪便标本80份,鱼胆汁标本120份,3月龄以下猪粪便标本129份,龙虎山自然景区猴粪便标本130份,用巢式逆转录聚合酶链反应法（RT-nPCR）检测戊型肝炎病毒核糖核酸（HEV RNA）,对RT-nPCR阳性扩增产物进行克隆测序,用Vector NTI Suite 9.0和Treeview软件与目前新分型方法所选参考序列进行核苷酸序列相似性比较和生物进化树分析。结果广西地区170份猪、鼠和狗血清HEV RNA检测均为阴性。在150份鼠肝组织,120份鱼胆汁标本,80份狗和130份猕猴粪便标本中均未检出HEV RNA;3月龄以下猪粪便标本HEV RNA阳性率10.08（13/129）。对13株猪HEV开放读码框架（ORF）1区部分核酸序列进行分析,其与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型HEV的相似性分别为73%～77%,76%～79%,76%～81%,82%～97%;与6个亚型的相似分别为4a：82%～94%;4b：82%～98%;4c：82%～87%;4d：81%～87%;4f：84%～86%;4g：81%～84%,其中2株与Ⅳa亚型相似性是高为82%～94%,11株与Ⅳb亚型相似性最高为82%～98%。结论广西地区猪HEV均为基因型4,2株属于基因型Ⅳa,Ⅱ株为Ⅳb。HEV在猪、鼠、狗血清、鼠肝组织、鱼胆汁、狗和猕猴粪便标本中均未检出。展开更多
目的调查猪HEV的基因型和亚型。方法收集新疆南部和广西柳州地区3月龄以下猪粪便标本134份,用巢式逆转录聚合酶链反应法(RT-nPCR)检测戊型肝炎病毒核糖核酸(HEV RNA),对RT-nPCR阳性扩增产物进行克隆测序,用Vector NTI Suite 9.0和TreeV...目的调查猪HEV的基因型和亚型。方法收集新疆南部和广西柳州地区3月龄以下猪粪便标本134份,用巢式逆转录聚合酶链反应法(RT-nPCR)检测戊型肝炎病毒核糖核酸(HEV RNA),对RT-nPCR阳性扩增产物进行克隆测序,用Vector NTI Suite 9.0和TreeView软件与目前新的分型方法所选参考序列进行核苷酸序列相似性比较和生物进化树分析。结果新疆和广西猪粪便标本的HEV RNA阳性率分别为3.64%(2/55)和3.80%(3/79),命名为XJ3-2、XJ3-6、GX3-1、GX5-2和GX6-3。5株猪HEV的开放阅读框架1(ORF1)的部分核苷酸序列与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型HEV的相似性分别为74%～77%、76%～77%、73%～81%和82%～98%。同时对开放阅读框架2(ORF2)部分核苷酸序列进行了分析,GX3-1和GX6-3与Ⅳb亚型相似性最高,为88%～95%。GX5-2、XJ3-2和XJ3-6与Ⅳa亚型相似性最高,为90%～96%。结论新疆和广西5株猪HEV均属于基因型Ⅳ,新疆2株为Ⅳa亚型,广西1株为Ⅳa,另2株为Ⅳb亚型。未检测到HEV基因Ⅰ型和Ⅲ型。展开更多
文摘目的了解广西地区猪、鼠、狗、猕猴和鱼5种动物戌型肝炎病毒（HEV）基因型和亚型分布。方法对广西地区猪、鼠、狗HEV抗体阳性血清170份,鼠肝组织150份,3月龄以下狗粪便标本80份,鱼胆汁标本120份,3月龄以下猪粪便标本129份,龙虎山自然景区猴粪便标本130份,用巢式逆转录聚合酶链反应法（RT-nPCR）检测戊型肝炎病毒核糖核酸（HEV RNA）,对RT-nPCR阳性扩增产物进行克隆测序,用Vector NTI Suite 9.0和Treeview软件与目前新分型方法所选参考序列进行核苷酸序列相似性比较和生物进化树分析。结果广西地区170份猪、鼠和狗血清HEV RNA检测均为阴性。在150份鼠肝组织,120份鱼胆汁标本,80份狗和130份猕猴粪便标本中均未检出HEV RNA;3月龄以下猪粪便标本HEV RNA阳性率10.08（13/129）。对13株猪HEV开放读码框架（ORF）1区部分核酸序列进行分析,其与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型HEV的相似性分别为73%～77%,76%～79%,76%～81%,82%～97%;与6个亚型的相似分别为4a：82%～94%;4b：82%～98%;4c：82%～87%;4d：81%～87%;4f：84%～86%;4g：81%～84%,其中2株与Ⅳa亚型相似性是高为82%～94%,11株与Ⅳb亚型相似性最高为82%～98%。结论广西地区猪HEV均为基因型4,2株属于基因型Ⅳa,Ⅱ株为Ⅳb。HEV在猪、鼠、狗血清、鼠肝组织、鱼胆汁、狗和猕猴粪便标本中均未检出。
文摘目的调查猪HEV的基因型和亚型。方法收集新疆南部和广西柳州地区3月龄以下猪粪便标本134份,用巢式逆转录聚合酶链反应法(RT-nPCR)检测戊型肝炎病毒核糖核酸(HEV RNA),对RT-nPCR阳性扩增产物进行克隆测序,用Vector NTI Suite 9.0和TreeView软件与目前新的分型方法所选参考序列进行核苷酸序列相似性比较和生物进化树分析。结果新疆和广西猪粪便标本的HEV RNA阳性率分别为3.64%(2/55)和3.80%(3/79),命名为XJ3-2、XJ3-6、GX3-1、GX5-2和GX6-3。5株猪HEV的开放阅读框架1(ORF1)的部分核苷酸序列与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型HEV的相似性分别为74%～77%、76%～77%、73%～81%和82%～98%。同时对开放阅读框架2(ORF2)部分核苷酸序列进行了分析,GX3-1和GX6-3与Ⅳb亚型相似性最高,为88%～95%。GX5-2、XJ3-2和XJ3-6与Ⅳa亚型相似性最高,为90%～96%。结论新疆和广西5株猪HEV均属于基因型Ⅳ,新疆2株为Ⅳa亚型,广西1株为Ⅳa,另2株为Ⅳb亚型。未检测到HEV基因Ⅰ型和Ⅲ型。
