利用LC-MS/MS对F.nucleatum的蛋白质表达谱进行了深入研究,共鉴定到1198个蛋白质的表达,占基因组58%的编码基因.通过在p H 6.5(癌症组织p H环境)和p H 7.5(正常组织p H环境)两种条件下F.nucleatum蛋白质表达的定量蛋白质组学分析,发现...利用LC-MS/MS对F.nucleatum的蛋白质表达谱进行了深入研究,共鉴定到1198个蛋白质的表达,占基因组58%的编码基因.通过在p H 6.5(癌症组织p H环境)和p H 7.5(正常组织p H环境)两种条件下F.nucleatum蛋白质表达的定量蛋白质组学分析,发现处于癌症微环境p H条件下蛋白质表达的变化明显集中于金属离子转运,硫胺素代谢,糖代谢等过程和功能.产丁酸发酵的能量代谢通路中的七个代谢酶在蛋白质组数据中找到,其中有五个在癌症p H条件下显著下调,这五个酶包含了丁酸盐代谢的整个过程,这为结直肠癌患者肠道丁酸盐含量降低提供了新的证明.此外,癌症p H条件下F.nucleatum的丁酸代谢受到抑制,造成产丁酸能力下降,可能是其促进结直肠癌发展在代谢水平上的原因之一.展开更多
本研究应用差异凝胶电泳(Difference gel electrophoresis,DIGE)和质谱鉴定技术,系统分析了4种具有不同转移潜能的人肝癌细胞系的蛋白质表达差异。胶上鉴定了约1700个蛋白质斑点,经过比对后发现167个蛋白质点存在差异,经过质谱分析成功...本研究应用差异凝胶电泳(Difference gel electrophoresis,DIGE)和质谱鉴定技术,系统分析了4种具有不同转移潜能的人肝癌细胞系的蛋白质表达差异。胶上鉴定了约1700个蛋白质斑点,经过比对后发现167个蛋白质点存在差异,经过质谱分析成功鉴定了146个蛋白质点,对应96个与肝癌转移相关的非冗余差异蛋白。对差异蛋白进行生物信息学分析,结果表明细胞组装和运动相关的蛋白在转移过程中被富集。差异蛋白前列腺脱氢酶(Hydroxyprostaglandin dehydrogenase,HPGD)首次被证明与肝癌转移正相关,具有抗凋亡和促侵袭的能力。展开更多
文摘利用LC-MS/MS对F.nucleatum的蛋白质表达谱进行了深入研究,共鉴定到1198个蛋白质的表达,占基因组58%的编码基因.通过在p H 6.5(癌症组织p H环境)和p H 7.5(正常组织p H环境)两种条件下F.nucleatum蛋白质表达的定量蛋白质组学分析,发现处于癌症微环境p H条件下蛋白质表达的变化明显集中于金属离子转运,硫胺素代谢,糖代谢等过程和功能.产丁酸发酵的能量代谢通路中的七个代谢酶在蛋白质组数据中找到,其中有五个在癌症p H条件下显著下调,这五个酶包含了丁酸盐代谢的整个过程,这为结直肠癌患者肠道丁酸盐含量降低提供了新的证明.此外,癌症p H条件下F.nucleatum的丁酸代谢受到抑制,造成产丁酸能力下降,可能是其促进结直肠癌发展在代谢水平上的原因之一.
文摘本研究应用差异凝胶电泳(Difference gel electrophoresis,DIGE)和质谱鉴定技术,系统分析了4种具有不同转移潜能的人肝癌细胞系的蛋白质表达差异。胶上鉴定了约1700个蛋白质斑点,经过比对后发现167个蛋白质点存在差异,经过质谱分析成功鉴定了146个蛋白质点,对应96个与肝癌转移相关的非冗余差异蛋白。对差异蛋白进行生物信息学分析,结果表明细胞组装和运动相关的蛋白在转移过程中被富集。差异蛋白前列腺脱氢酶(Hydroxyprostaglandin dehydrogenase,HPGD)首次被证明与肝癌转移正相关,具有抗凋亡和促侵袭的能力。