摘要
采用CTAB法、CTAB-脱脂棉柱法和CTAB-脱脂棉-PVPP柱法提取黄秋葵基因组,并分析其差异,然后扩增黄秋葵ITS2序列,最后对15份黄秋葵进行基于ITS2序列的DNA条形码分析,其目的是比较分析出国内常用黄秋葵栽培品种之间的亲缘关系;结果显示:CTAB-脱脂棉-PVPP柱法提取得到的基因组DNA纯度较高,回收率相对较高,以此为模板能够扩增出高质量的ITS2序列,条形码分析结果显示15份黄秋葵有较近的亲缘关系,平均遗传距离为0. 003。
Three methods of CTAB, CTAB -absorbent cotton column and CTAB -absorbent cotton -PVPP were compared to extract the Okra DNA. And ITS2 sequence - structure was amplified. Finally DNA barcode Based on ITS2 sequence structure were analyzed of 15 Okra samples. The results showed that： CTAB -absorbent cotton PVPP is the best of all, and we could get the high - quality ITS2 sequence for subsequent bar code analysis. The results of barcode analysis showed that 15 samples of Okra were closely related to each other, and the average genetic distance was only 0. 003.
作者
高喜明
施豪
陈忠银
陈丽莎
赵许朋
GAO Xi-ming;LIU Yan;SHI Hao;CHEN Zhong-yin;CHEN Li-she;ZHAO Xu-peng(Biological and Environmental Engineering of Guiyang University,Guizhou Guiyang 550005,China)
出处
《贵阳学院学报（自然科学版）》
2018年第3期103-106,共4页
Journal of Guiyang University：Natural Sciences
基金
贵州省教育厅重点项目(项目编号:黔教合KY字[2015]382号)
贵阳学院2011年教改项目
贵州省科技厅联合基金项目(黔科合LH字[2014]7168号)
贵州省大学生创新创业训练计划一般项目(项目编号:201510976012)
贵州省大学生创新创业训练计划一般项目(项目编号:201510976013)
贵州省一流大学建设项目:"一流师资团队-生物学教学团队"(项目编号:2017158322)
关键词
秋葵
DNA条形码
ITS2
Abelmoschus esculentus L. Moench
DNA barcode
ITS2
