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茶树过氧化氢酶基因CsCAT1克隆与生物信息学分析 被引量:1

Cloning of Tea Tree Catalase Gene CsCAT1 and Its Bioinformatics Analysis
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摘要 为了解茶树过氧化氢酶(CAT)基因的相关信息,以茶树叶片为原始材料,克隆获得茶树CsCAT基因全长,并进行生物信息学分析。结果表明:茶树CsCAT基因cDNA全长1682bp,完整的开放阅读框(ORF)长度为1479bp,共编码492个氨基酸。生物信息学分析显示:CAT蛋白分子量为56.81kD,理论等电点(pI)6.78,总平均疏水系数为-0.546,预测亚细胞定位于过氧化物酶体,为稳定的酸性亲水蛋白。茶树CAT氨基酸序列与棉花、毛果杨、胡麻的相似性分别为93%、92%、91%。 In order to know about genes of tea tree catalase,a Cs CAT gene was cloned and analyzed bio- informatically using leaves of tea trees. The results show that the length of Cs CAT gene c DNA is 1 682 bp,the complete length of open read frame( ORF)is 1 479 bp,encoding 492 amino acids. Bioinformatics analysis shows that the protein molecular mass is 56.81 kD,isoelectric point( p I) is 6.78,and total average dewatering coefficient is-0.546. It is estimated that subcellular fraction lies in peroxysome,being a stable acidic hydrophilic protein. The similarity of tea trees' CAT amino acid sequence to cotton,western balsam poplar and flax are93%,92% and 91% respectively.
机构地区 福建农林大学
出处 《龙岩学院学报》 2016年第2期111-115,共5页 Journal of Longyan University
基金 福建省自然科学基金(K51310843) 福建省重大科技专项(2015NZ0002-1) 福建省教育厅(K8015038A)
关键词 铁观音茶树 CsCAT 过氧化氢酶 基因克隆 Tieguanyin tea trees CsCAT catalase gene cloning
  • 相关文献

参考文献21

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二级参考文献163

共引文献212

同被引文献19

引证文献1

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