摘要
根据几种豆科植物贮藏蛋白基因序列同源性设计简并引物,通过反转录扩增,经琼脂糖凝胶电泳检测和测序,并利用NCBI数据库及Blast工具进行分析,从木豆中克隆得到1个贮藏蛋白基因的cDNA片断,长度为833 bp。采用RACE、RT-PCR技术扩增得到该基因的全长cDNA,含1 595bp,推测编码区为1551 bp(16-1 566bp),编码516个氨基酸,分子量为57.718 ku,等电点为4.68。该基因推导的氨基酸与大豆(1303273A)、野生大豆(CAA55977.1)、羽扇豆(AEB33710.1)、花生(AAU21493.1)、菜豆(ADR30064.1)、野豌豆(CAA83674.1)为、截形苜蓿(XP_003590690.1)的贮藏蛋白同源性分别达到83%、79%、77%、73%、67%、65%、65%。
A special cDNA fragments with 833 base pairs（bp） long from the pigeonpea material was clone by means of designing degenerate primers homology to the sequences of other leguminous plants, RT-PCR amplification and agarose gel electrophoresis, blast tools. The full-length 1 595 bp cDNA encoding pigeonpea glycinlin（PPGLY）was cloned by RT-PCR, 3＇ and 5＇RACE technology. It contained a 1 551 bp（16 to 1 566 bp）ORF, encoding 516 amino acids with PPGLY molecular weight 57.718 ku of an isoelectrie point（pI）4.68. The deduced amino acid sequence of PPGLY showed high homologies 83%, 79%, 77%, 73%, 67%, 65% and 65% with Glycirte max （1303273A）, Glycine max （CAA55977.1）, Lupinus angustifolius （AEB33710.1）, Arochis hypogaea （AAU21493.1）, Phaseolus vulgaris（ADR30064.1）, Vicia fata/（CAA83674.1）, Medicago truneatula（XP 003590690.1）, respectively.
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2012年第4期668-673,共6页
Chinese Journal of Tropical Crops
基金
现代农业产业体系建设专项资金(No.CARS-35)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所)资助(No.1630032012023)
国家十二五科技支撑计划项目资助(No.2011BAD17B01-01-5)
