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长白山林下参基因组DNA提取及RAPD体系的优化 被引量:5

Optimization of RAPD system and DNA extraction of Transplanted wild ginseng of Changbai Moutain
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摘要 采用改良的CTAB法提取林下参的基因组DNA,所得的DNA纯度高、质量好,可用于RAPD分析.筛选出的林下参RAPD反应的最佳体系为20μL,反应体系中包括模板DNA 20ng,引物20 pmol,dNTPs 0.187 5 mmol/L,TaqDNA聚合酶1.5 U,Mg2+2.0 mmol/L,10×Reaction Buffer 2.0 mmol/L,其余部分用无菌超纯水补充.PCR扩增程序为94℃预变性5min,94℃变性1 min,37℃退火1 min,72℃延伸2 min,40次循环,72℃最终延伸7 min.应用优化后的反应体系PCR扩增获得的RAPD指纹图谱带型清晰,重复性好,为通过分子标记获得丰富的林下参遗传信息奠定了基础. High purity and quality DNA extracted of Transplanted wild ginseng was used for RAPD analysis. The best RAPD reaction system optimized was: total volume 20 μL, containing template DNA 20 ng, primer 20 pmol, dNTPs 0. 187 5 mmol/L, MgCI2 2.0 mmol/L, DNA polymerase 1. 5 unit, 10× Reaction Buffer 2.0 mmol/L, completed with ddH20. PCR amplification condition was: pre-denaturation at 94 ℃for 5 min, denaturation at 94 ℃ for 1 min, annealing at 37℃ for 1 rain, extension at 72 ℃ for 2 min, cycle for 40 times. Final extension at 72℃ for 7 rain. RAPD finger printing obtained by the optimized system was clear and repetitive, which provided a certain foundation for getting more extensive genetic information of Transplanted wild ginseng of Changbai Mountain.
出处 《延边大学农学学报》 2009年第1期16-20,52,共6页 Agricultural Science Journal of Yanbian University
基金 延边州科技发展基金资助项目(2008YB501A16)
关键词 林下参 基因组DNA RAPD体系 Transplanted wild ginseng genome DNA RAPD system
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