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利用转录组学数据研究健康人骨髓红系细胞基因表达的差异
1
作者
黄秀娜
邝振展
+2 位作者
张蓉
张志英
程琰
《解放军医药杂志》
CAS
2022年第1期1-6,共6页
目的分析骨髓红系细胞的转录组数据,筛选出差异表达基因并对功能基因进行挖掘和分析,以期为红细胞成熟分化的分子机制提供理论依据。方法从TCGA数据库下载骨髓红系细胞转录组测序数据,对测序数据进行de novo拼接和功能注释;筛选出差异...
目的分析骨髓红系细胞的转录组数据,筛选出差异表达基因并对功能基因进行挖掘和分析,以期为红细胞成熟分化的分子机制提供理论依据。方法从TCGA数据库下载骨髓红系细胞转录组测序数据,对测序数据进行de novo拼接和功能注释;筛选出差异表达基因及在COG、GO、KEGG数据库中进行比对注释;基于Swiss-Prot功能注释结果,分析骨髓红系细胞分化成熟相关基因的功能及表达量变化。结果骨髓原红细胞和幼红细胞转录组样本中,共有5273个差异表达基因注释到Swiss-Prot数据库上,1993个差异表达基因具有详细的COG分类功能注释,5161个差异表达基因在GO数据库具有功能注释,2001个差异表达基因被注释到286条KEGG Pathway中。在筛选差异表达基因中,SDC2、LGALS2、MAFB、HMOX1在骨髓红系细胞中表达升高,ST6GAL2、CD34、FREM1、PKLR在骨髓红系细胞中表达降低。结论本研究提供了全面的骨髓红系细胞转录组信息,筛选出了一批在骨髓红系细胞分化成熟过程中具有重要功能的基因序列,如MAFB、HMOX1、PKLR、CD34等,为骨髓红系细胞分化成熟的调控机制研究提供了参考数据。
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关键词
红系细胞
原红细胞
幼红细胞
骨髓
转录组
基因表达
下载PDF
职称材料
宿主对念珠菌感染的免疫机制研究进展
2
作者
孙晴晴
贺政新
《中国真菌学杂志》
CSCD
2023年第4期359-363,共5页
念珠菌作为一类最常见的人类机会性致病菌,会导致重症和免疫功能低下患者的高发病率和死亡率。其自身有效的策略可入侵宿主并逃避宿主防御系统。而宿主对抗念珠菌的能力取决于天然免疫应答和适应性免疫应答。宿主体内大量免疫细胞和免...
念珠菌作为一类最常见的人类机会性致病菌,会导致重症和免疫功能低下患者的高发病率和死亡率。其自身有效的策略可入侵宿主并逃避宿主防御系统。而宿主对抗念珠菌的能力取决于天然免疫应答和适应性免疫应答。宿主体内大量免疫细胞和免疫分子相互协作针对侵入性的真菌做出反应。该文就宿主对念珠菌感染免疫应答机制作一综述。
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关键词
念珠菌
感染
天然免疫应答
适应性免疫应答
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职称材料
题名
利用转录组学数据研究健康人骨髓红系细胞基因表达的差异
1
作者
黄秀娜
邝振展
张蓉
张志英
程琰
机构
解放军
南部战区总
医院
检验科
解放军
联勤
保障
部队
第
九八
〇
医院
基础医学
院
出处
《解放军医药杂志》
CAS
2022年第1期1-6,共6页
基金
广东省医学科学技术基金项目(B2019139)。
文摘
目的分析骨髓红系细胞的转录组数据,筛选出差异表达基因并对功能基因进行挖掘和分析,以期为红细胞成熟分化的分子机制提供理论依据。方法从TCGA数据库下载骨髓红系细胞转录组测序数据,对测序数据进行de novo拼接和功能注释;筛选出差异表达基因及在COG、GO、KEGG数据库中进行比对注释;基于Swiss-Prot功能注释结果,分析骨髓红系细胞分化成熟相关基因的功能及表达量变化。结果骨髓原红细胞和幼红细胞转录组样本中,共有5273个差异表达基因注释到Swiss-Prot数据库上,1993个差异表达基因具有详细的COG分类功能注释,5161个差异表达基因在GO数据库具有功能注释,2001个差异表达基因被注释到286条KEGG Pathway中。在筛选差异表达基因中,SDC2、LGALS2、MAFB、HMOX1在骨髓红系细胞中表达升高,ST6GAL2、CD34、FREM1、PKLR在骨髓红系细胞中表达降低。结论本研究提供了全面的骨髓红系细胞转录组信息,筛选出了一批在骨髓红系细胞分化成熟过程中具有重要功能的基因序列,如MAFB、HMOX1、PKLR、CD34等,为骨髓红系细胞分化成熟的调控机制研究提供了参考数据。
关键词
红系细胞
原红细胞
幼红细胞
骨髓
转录组
基因表达
Keywords
Erythroid cells
Proerythrocyte
Erythroblasts
Bone marrow
Transcriptome
Gene expression
分类号
R331.122 [医药卫生—人体生理学]
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职称材料
题名
宿主对念珠菌感染的免疫机制研究进展
2
作者
孙晴晴
贺政新
机构
解放军
联勤
保障
部队
第
九八
〇
医院
基础医学
实验室
出处
《中国真菌学杂志》
CSCD
2023年第4期359-363,共5页
基金
河北省自然科学基金(C2021505001)
石家庄市科学技术研究与发展计划(201200623)。
文摘
念珠菌作为一类最常见的人类机会性致病菌,会导致重症和免疫功能低下患者的高发病率和死亡率。其自身有效的策略可入侵宿主并逃避宿主防御系统。而宿主对抗念珠菌的能力取决于天然免疫应答和适应性免疫应答。宿主体内大量免疫细胞和免疫分子相互协作针对侵入性的真菌做出反应。该文就宿主对念珠菌感染免疫应答机制作一综述。
关键词
念珠菌
感染
天然免疫应答
适应性免疫应答
分类号
R519.3 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用转录组学数据研究健康人骨髓红系细胞基因表达的差异
黄秀娜
邝振展
张蓉
张志英
程琰
《解放军医药杂志》
CAS
2022
0
下载PDF
职称材料
2
宿主对念珠菌感染的免疫机制研究进展
孙晴晴
贺政新
《中国真菌学杂志》
CSCD
2023
0
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职称材料
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