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生防菌株贝莱斯芽孢杆菌HNU24全基因组测序及分析 被引量：3
1
作者 曹秀兰 叶雨婷 +5 位作者 马天浩 胡安娜 曹宇 陈鹏泽 伍壮生 李鹏 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期905-913,共9页
本研究旨在解析对茄雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)具有较强拮抗活性的生防菌株HNU24的基因组特征。采用BGISEQ-500和ONT PromethION平台相结合的策略,对HNU24的全基因组进行了测序、组装、基因预测与功能注释、蛋白质同源分析。遗... 本研究旨在解析对茄雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)具有较强拮抗活性的生防菌株HNU24的基因组特征。采用BGISEQ-500和ONT PromethION平台相结合的策略,对HNU24的全基因组进行了测序、组装、基因预测与功能注释、蛋白质同源分析。遗传进化分析结果表明:HNU24为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis),其完整基因组序列长度为3932768 bp,GC含量46.48%,编码3822个基因,其中有43个碳水化合物活性酶基因家族。纤维素酶活性实验进一步表明其具有分解纤维素的能力。在HNU24基因组中预测到13个次级代谢产物生物合成基因簇,其中包含表面活性素(surfactin)、泛革素(fengycin)、植物唑霉素(plantazolicin)、大环内酰亚胺(macrolactin)、杆菌烯(bacillaene)、地非西丁(difficidin)、杆菌毒素(bacillibactin)和杆溶菌素(bacilysin)8种已报道的对青枯菌等病原菌有拮抗活性的化合物。5个未能比对到同源基因或相似度较低,可能为未鉴定和报道的新化合物。此外,盆栽试验表明HNU24对番茄具有显著的促生长作用。综上,HNU24可能通过分泌活性化合物来拮抗茄雷尔氏菌并促进番茄生长,是一种潜在的生物肥料菌株,相关结果为进一步开展HNU24在生物防治方面的研究和应用奠定基础。 展开更多
关键词 贝莱斯芽孢杆菌 番茄青枯病 全基因组 次级代谢产物
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