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2018—2022年广州市住院患者呼吸道合胞病毒的流行特征研究 被引量:7
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作者 黄鑫鑫 谢家敏 +4 位作者 杨康 邓慧诗 庾健祥 武婕 邹丽容 《中国病毒病杂志》 CAS 2023年第2期96-100,共5页
目的 分析近几年新型冠状病毒感染(coronavirus disease 2019,COVID-19)流行前后广州市呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的流行特征。方法 2018—2022年在广州2家哨点医院(广东省妇幼保健院和中山大学孙逸仙纪念医院)... 目的 分析近几年新型冠状病毒感染(coronavirus disease 2019,COVID-19)流行前后广州市呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的流行特征。方法 2018—2022年在广州2家哨点医院(广东省妇幼保健院和中山大学孙逸仙纪念医院)采集因急性呼吸道感染住院患者的鼻咽拭子作为样本。采用Luminex呼吸道多病原检测技术对样本进行RSV的检测和分型。结果 共收集鼻咽拭子样本1 243份,RSV总体阳性率为6.11%(76/1243),其中RSV-A为39份(51.32%, 39/76), RSV-B为37份(48.68%,37/76)。3岁以下儿童RSV检出率最高为8.79%(66/751)。与2018年(8.30%,22/265)和2020年(14.78%,30/203)相比,RSV阳性率在2019年(3.13%,10/319)、2021年(4.08%,10/245)和2022年(1.90%,4/211)下降明显。2018、2022年流行亚型以A型为主(19/22 vs 4/4),2020年流行亚型以B型(25/30)为主,2019、2021年AB型共存。四季检出率除2020年差异有统计学意义外[7.14%(3/42)、16.39%(10/61)、27.12%(16/59)和0(0/42),χ^(2)=16.975,P<0.001],其余年份差异均无统计学意义。在76例检出RSV样本中,17例(22.37%,17/76)存在多重感染。其中鼻病毒是最常见的混合感染病毒,占混合感染的58.83%(10/17)。结论 RSV是广州市流行的常见呼吸道病毒,3岁以下儿童是RSV感染的主要人群。RSV感染年度间呈现隔年流行且A型与B型交替流行的特点,且COVID-19疫情后出现了反季节流行。2019年末COVID-19暴发后,国家严格筛查COVID-19疑似病例,2020年RSV检出率显著升高;随着国家COVID-19防控政策变化,2021—2022年RSV的检出率下降显著。 展开更多
关键词 呼吸道合胞病毒 急性呼吸道感染 新冠病毒感染 流行特征
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2019—2021年广东省住院严重急性呼吸道感染病毒病原谱分析 被引量:6
2
作者 谢家敏 张云强 +4 位作者 杨康 黄鑫鑫 邓慧诗 武婕 邹丽容 《公共卫生与预防医学》 2023年第3期38-42,共5页
目的了解2019—2021年广东省住院严重急性呼吸道感染(sever acute respiratory infection,SARI)患者常见病毒病原体的感染状况和流行病学特征,为SARI的临床诊断和防控提供参考依据。方法对2019—2021年收集的SARI患者呼吸道标本,采用Lum... 目的了解2019—2021年广东省住院严重急性呼吸道感染(sever acute respiratory infection,SARI)患者常见病毒病原体的感染状况和流行病学特征,为SARI的临床诊断和防控提供参考依据。方法对2019—2021年收集的SARI患者呼吸道标本,采用Luminex呼吸道多病原检测技术对呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、人鼻病毒/肠道病毒(HRV/EV)和人偏肺病毒(HMPV)等常见呼吸道病毒进行检测分析。结果共收集流感阴性病例1948例,病毒感染总阳性检出率为24.28%,其中HRV/EV检出率最高(10.32%)、其次为RSV(4.31%)。不同年龄组病毒检出率差异有统计学意义(Χ^(2)=176.186,P<0.05),以0~4岁年龄组检出率最高,为41.50%。男性病毒检出率和女性病毒检出率差异无统计学意义(Χ^(2)=0.042,P>0.05)。RSV的检出高峰主要集中在夏秋两季,HMPV以冬季为主要流行季节,HRV/EV和ADV无明显季节性。39份样本存在混合感染,混合感染率为2.00%,混合感染病例中以HPIV和HRV/EV合并感染最为常见。结论2019—2021年广东省SARI流感阴性住院病例主要检出病毒病原体为HRV/EV、RSV、HMPV和ADV,建议重点加强5岁以下儿童的SARI病例监测。 展开更多
关键词 严重急性呼吸道感染 呼吸道病毒 病原谱 住院病例
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2019-2021年广东省严重急性呼吸道感染病例中鼻病毒流行情况及其分子分型研究 被引量:6
3
作者 杨康 谢家敏 +4 位作者 黄鑫鑫 邓慧诗 李柏生 武婕 邹丽容 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期364-371,共8页
分析广东省人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)的流行情况和型别分布情况。选取了2019年1月至2021年12月收集的1959份SARI病例的咽拭子标本,采用呼吸道多病原检测和巢式PCR的方法进行HRV的检测和分型,使用SPSS 26.0软件分析HRV的流行分布,... 分析广东省人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)的流行情况和型别分布情况。选取了2019年1月至2021年12月收集的1959份SARI病例的咽拭子标本,采用呼吸道多病原检测和巢式PCR的方法进行HRV的检测和分型,使用SPSS 26.0软件分析HRV的流行分布,使用MEGA11等软件对HRV进行分型和亲缘关系的研究。共收集1959例严重急性呼吸道感染病例(Severe acute respiratory infection,SARI),其中男性为1205例,女性为754例。婴幼儿组阳性检出率最高,随着年龄的增长,鼻病毒的阳性检出率会下降。2020年鼻病毒阳性率仅在6月份有一个高峰期,2021年鼻病毒阳性率在4月份和10月份有两个高峰期。人鼻病毒合并其他病毒检出的病例有25例,检出率为12.31%,与人副流感病毒和人冠状病毒的合并检出最为常见。203份鼻病毒阳性样本共获得114条VP4/VP2序列,分型鉴定结果显示HRV-A型68株,HRV-B型8株,HRV-C型27株,HRV-A和HRV-C是广东省HRV流行的主要型别。婴幼儿是HRV感染的高发人群,HRV-A1和HRV-C15是广东省HRV感染的优势基因型。另外,学校开学导致的学生聚集现象是鼻病毒检出率上升的重要原因之一。 展开更多
关键词 鼻病毒 严重急性呼吸道感染病例 系统进化树
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2017-2020年广东省副溶血弧菌引起的食源性暴发事件流行病学及病原特征分析 被引量:5
4
作者 李柏生 李振翠 +5 位作者 梁骏华 何冬梅 柯碧霞 刘美真 龙勇 董活波 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期443-447,共5页
目的分析2017—2020年广东省副溶血弧菌暴发事件的基本流行病学及病原特征。方法对2017—2020年广东省87起副溶血弧菌暴发事件的基本流行病学特征进行统计分析,对分离株进行血清分型,并运用PFGE进行分子分型。结果广东省副溶血弧菌暴发... 目的分析2017—2020年广东省副溶血弧菌暴发事件的基本流行病学及病原特征。方法对2017—2020年广东省87起副溶血弧菌暴发事件的基本流行病学特征进行统计分析,对分离株进行血清分型,并运用PFGE进行分子分型。结果广东省副溶血弧菌暴发事件分布在16个地市,44.8%(39/87)和37.9%(33/87)的暴发事件发生在宾馆饭店和学校单位食堂,食品加工存储不当(40.2%,35/87)和生熟不分引起的交叉污染(25.3%,22/87)是引起副溶血弧菌的食源性疾病暴发的主要原因。患者来源菌株主要血清型为O3:K6(87.5%)和O4:KUT(22.5%)。PFGE谱型提示O3:K6型分离株间的相似值为65.5%~100.0%,O4:KUT型分离株的PFGE谱型相似值为66.5%~100.0%。结论2017—2020年广东省副溶血弧菌引起的食源性暴发事件广泛分布,需加强对宾馆、饭店、学校、单位食堂食品正确处理方面的宣传与教育。O3:K6和O4:KUT血清型是暴发事件的主要血清型,流行菌株之间存在遗传多样性。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 食源性疾病 暴发 脉冲场凝胶电泳
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2018-2021年广州市环境污水脊髓灰质炎病毒和其他肠道病毒监测 被引量:1
5
作者 张薇 李彩霞 +6 位作者 曾汉日 柯碧霞 陈美钟 黄淑芬 邓小玲 李柏生 郑焕英 《中国疫苗和免疫》 CSCD 北大核心 2023年第4期383-387,共5页
目的 了解广州市环境污水中脊髓灰质炎病毒(Poliovirus, PV)和非脊髓灰质炎肠道病毒(Non-polio enterovirus, NPEV)现状。方法 选择广州市某污水处理厂于2018-2021年每月采集环境污水样本,进行PV和NPEV分离和血清型鉴定,分析血清型构成... 目的 了解广州市环境污水中脊髓灰质炎病毒(Poliovirus, PV)和非脊髓灰质炎肠道病毒(Non-polio enterovirus, NPEV)现状。方法 选择广州市某污水处理厂于2018-2021年每月采集环境污水样本,进行PV和NPEV分离和血清型鉴定,分析血清型构成。结果 在2018-2021年192份环境污水样本中共分离到299株PV和505株NPEV。在PV分离株中,PV1、PV2、PV3血清型分别为80株(26.76%)、0株(0.00%)、219株(73.24%);1株PV3为疫苗衍生PV(Vaccine-derived poliovirus, VDPV),其他均为疫苗株,其中3株PV3和1株PV1为疫苗高变异PV(Vaccine hypervariable poliovirus, VHPV)。在NPEV分离株中,E11、CVB5和CVB3血清型分别为210株(41.58%)、88株(17.43%)和88株(17.43%)。结论 2018-2021年广州市环境污水中未发现野生型PV和PV2血清型,NPEV优势血清型为E11、CVB5和CVB3。 展开更多
关键词 肠道病毒 脊髓灰质炎病毒 非脊髓灰质炎肠道病毒 环境污水 监测
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广东省两个地区2021-2022年百日咳鲍特菌分离株的抗菌药物敏感性和抗原基因型
6
作者 李振翠 马炜森 +4 位作者 王安娜 张昌 余青紫 马伟峰 刘美真 《中国疫苗和免疫》 CSCD 北大核心 2023年第5期498-502,共5页
目的了解广东省两个地区百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis,Bp)抗菌药物敏感性和抗原基因型。方法通过MALDI-TOF-MS微生物质谱、荧光定量PCR和血清凝集试验对广州市和佛山市2021-2022年Bp分离株进行鉴定,采用E-test法进行10种抗菌药物... 目的了解广东省两个地区百日咳鲍特菌(Bordetella pertussis,Bp)抗菌药物敏感性和抗原基因型。方法通过MALDI-TOF-MS微生物质谱、荧光定量PCR和血清凝集试验对广州市和佛山市2021-2022年Bp分离株进行鉴定,采用E-test法进行10种抗菌药物的敏感性检测,利用二代测序平台和生物信息学分析软件进行全基因组测序和拼接,采用BLASTn软件分析抗原基因型和23 S rRNA基因突变。结果在15株Bp分离株中,12株(80.0%)对大环内酯类抗菌药物(红霉素、阿奇霉素和克拉霉素)耐药,且与Bp疫苗株相比存在23 S rRNA A2047 G突变,所有菌株对磺胺类、β-内酰胺类和喹诺酮类抗菌药物敏感;13株和2株分离株的抗原基因型分别为prn2/ptxA1/ptxC2/ptxP3/fim2-1/fim3-1/tcfA2和prn1/ptxA1/ptxC1/ptxP1/fim2-1/fim3-1/tcfA2。结论研究地区Bp分离株对大环内酯类抗菌药物的耐药率高,抗原基因型与疫苗株存在差异;需持续加强Bp流行株抗原基因型和药物敏感性监测。 展开更多
关键词 百日咳 百日咳鲍特菌 抗菌药物敏感性 抗原基因型
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2018-2021年广东省急性弛缓性麻痹病例肠道病毒病原学监测 被引量:4
7
作者 张薇 李彩霞 +5 位作者 曾汉日 柯碧霞 陈美钟 黄淑芬 邓小玲 郑焕英 《中国疫苗和免疫》 CSCD 北大核心 2022年第4期385-389,共5页
目的分析广东省<15岁儿童急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例肠道病毒病原学特征。方法对广东省2018-2021年AFP报告病例采集粪便标本,进行脊灰病毒(Poliovirus,PV)和非脊灰肠道病毒(Non-polio enterovirus,NPEV)分离... 目的分析广东省<15岁儿童急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例肠道病毒病原学特征。方法对广东省2018-2021年AFP报告病例采集粪便标本,进行脊灰病毒(Poliovirus,PV)和非脊灰肠道病毒(Non-polio enterovirus,NPEV)分离和血清型鉴定,分析分离阳性率和血清型构成。结果广东省2018-2021年AFP病例肠道病毒分离总阳性率为5.26%(96/1824),其中PV、NPEV分别为0.27%(5例)、4.99%(91例);0岁、1-4岁、5-8岁、9-14岁病例NPEV分离阳性率分别为1.49%、9.17%、3.95%、0.97%,春季、夏季、秋季、冬季NPEV分离阳性率分别为6.57%、11.32%、2.22%、1.62%。共分离出9株PV,均为脊灰疫苗株,其中PV1、PV3、PV1+PV3血清型分别为1株、6株、2株。共分离出91株NPEV,其中肠道病毒A组6个血清型31株(34.07%)、B组15个血清型56株(61.54%)、C组2个血清型3株(3.30%)、待分型1株(1.10%);柯萨奇病毒(Coxsackie virus,CV)B3、CVA4、CVA2、CVB5血清型分别占20.88%、12.09%、8.79%、6.59%。结论广东省2018-2021年AFP病例监测未发现脊灰野病毒,继续维持无脊灰状态;NPEV感染以1-4岁儿童为主且呈夏季高峰,CVB3为NPEV优势流行血清型。 展开更多
关键词 急性弛缓性麻痹 肠道病毒 脊髓灰质炎病毒 非脊髓灰质炎肠道病毒 阳性率 血清型
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流感病毒空气传播和扩散的研究进展 被引量:1
8
作者 邓慧诗 谢家敏 +2 位作者 杨康 黄鑫鑫 武婕 《华南预防医学》 2023年第8期1000-1004,共5页
流感病毒是现今世界上传播较为迅速的呼吸道病毒之一,主要以飞沫传播和气溶胶传播为主。目前针对流感病毒空气传播的研究主要以病毒学领域的病毒稳定性研究和工程学领域的呼吸飞沫的运动和扩散研究为主。然而,流感病毒的空气传播需要满... 流感病毒是现今世界上传播较为迅速的呼吸道病毒之一,主要以飞沫传播和气溶胶传播为主。目前针对流感病毒空气传播的研究主要以病毒学领域的病毒稳定性研究和工程学领域的呼吸飞沫的运动和扩散研究为主。然而,流感病毒的空气传播需要满足人体呼出携带病毒颗粒的飞沫或气溶胶,其次是载体颗粒中的病毒到达易感宿主发生感染之前必须具有感染性,单靠病毒学或工程学某一领域难以全面系统地了解流感病毒在空气中传播扩散机制。本研究将总结和分析当前流感病毒室内传播和扩散的研究情况,并为今后相关领域的深入研究提供思路。 展开更多
关键词 流感病毒 传播 扩散
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2018年广东省人群百日咳毒素IgG抗体水平调查 被引量:4
9
作者 刘美真 彭晓放 +4 位作者 张薇 李振翠 李柏生 柯碧霞 何冬梅 《华南预防医学》 2022年第2期210-213,共4页
目的了解广东省人群百日咳毒素IgG抗体(PT-IgG)水平,评估百日咳流行风险,为疫苗免疫策略的调整提供依据。方法在广东省19个地级市23家县级以上医院收集就诊人群血清样本。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)间接法检测百日咳PT-IgG抗体,分析... 目的了解广东省人群百日咳毒素IgG抗体(PT-IgG)水平,评估百日咳流行风险,为疫苗免疫策略的调整提供依据。方法在广东省19个地级市23家县级以上医院收集就诊人群血清样本。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)间接法检测百日咳PT-IgG抗体,分析不同特征人群百日咳PT-IgG抗体的分布情况。结果共收集2719份血清样本中,百日咳PT-IgG抗体阳性47份,阳性率为1.73%,抗体平均浓度为11.78 IU/mL(95%CI:10.57~12.98)。粤东、西、北以及珠三角地区百日咳PT-IgG抗体阳性率和平均浓度分别为1.31%、1.97%和10.93 IU/mL、12.26 IU/mL,差异均无统计学意义(均P>0.05)。男、女百日咳PT-IgG抗体阳性率分别为1.67%和1.87%,抗体平均浓度分别为12.28、11.21 IU/mL,差异均无统计学意义(均P>0.05)。除7岁年龄组未检出百日咳PT-IgG抗体阳性外,其余各年龄组抗体阳性率为0.47%~3.91%。结论本次血清学监测发现广东省百日咳感染普遍,百日咳实际发病水平远高于报告水平。提示要加强监测,维持高水平的百日咳疫苗接种率,提高百日咳病例监测敏感性和实验室检测水平。 展开更多
关键词 百日咳 百日咳毒素 抗体
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细胞培养和分子生物学方法在急性弛缓性麻痹病例病原学监测中的应用比较
10
作者 李彩霞 张薇 +4 位作者 郭雪 曾汉日 方苓 李晖 郑焕英 《中国疫苗和免疫》 CSCD 北大核心 2023年第4期388-391,共4页
目的 比较细胞培养和分子生物学方法在急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis, AFP)病例病原学监测中的应用。方法 利用细胞培养和分子生物学方法对广东省2015-2017年AFP病例粪便标本进行脊髓灰质炎病毒(Poliovirus, PV)和非脊髓灰质... 目的 比较细胞培养和分子生物学方法在急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis, AFP)病例病原学监测中的应用。方法 利用细胞培养和分子生物学方法对广东省2015-2017年AFP病例粪便标本进行脊髓灰质炎病毒(Poliovirus, PV)和非脊髓灰质炎肠道病毒(Non-polio enterovirus, NPEV)检测,比较两种检测方法的阳性率。结果 在2015-2017年1 156份AFP病例粪便标本中,细胞培养、分子生物学方法检测PV阳性率分别为1.90%、2.42%,NPEV阳性率分别为5.97%、14.71%。分子生物学方法相对于细胞培养方法检测PV的灵敏度和特异度分别为100%和99.50%,检测NPEV分别为100%和90.70%。结论 分子生物学方法较细胞培养方法的PV和NPEV检出率高。在相关聚集性疫情处置中可联合使用两种方法以提高检测灵敏度和特异度。 展开更多
关键词 急性弛缓性麻痹 脊髓灰质炎病毒 非脊髓灰质炎肠道病毒 细胞培养 分子生物学方法 阳性率
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禽流感病毒适应性进化研究进展
11
作者 杨康 谢家敏 +2 位作者 黄鑫鑫 邓慧诗 武婕 《华南预防医学》 2023年第11期1355-1358,共4页
禽流感病毒是有严格宿主特异性的负链RNA病毒,但在禽流感病毒进化过程中其基因片段与猪流感或人流感的基因片段发生重配,可获得跨宿主传播的能力,由禽传播给人,并在人间流行,从而发生人感染禽流感病毒事件,对人类健康造成危害。本研究... 禽流感病毒是有严格宿主特异性的负链RNA病毒,但在禽流感病毒进化过程中其基因片段与猪流感或人流感的基因片段发生重配,可获得跨宿主传播的能力,由禽传播给人,并在人间流行,从而发生人感染禽流感病毒事件,对人类健康造成危害。本研究对禽流感病毒适应性进化的相关研究进行综述,总结其基因进化规律,为预防禽流感流行提供科学依据。 展开更多
关键词 禽流感病毒 适应性进化 血凝素 碱性蛋白2
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广东省2006-2021年流行性脑脊髓膜炎流行病学和病原学监测 被引量:3
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作者 刘美真 梁剑 +5 位作者 李振翠 何思敏 李柏生 柯碧霞 何冬梅 邵晓萍 《中国疫苗和免疫》 CSCD 北大核心 2022年第6期659-665,共7页
目的分析广东省流行性脑脊髓膜炎(流脑)流行病学和脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)血清群谱。方法收集广东省2006-2021年流脑报告病例、2006-2012年健康人群Nm带菌率调查、2016-2017年脑膜炎和脑炎监测(Acute meningitis and e... 目的分析广东省流行性脑脊髓膜炎(流脑)流行病学和脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)血清群谱。方法收集广东省2006-2021年流脑报告病例、2006-2012年健康人群Nm带菌率调查、2016-2017年脑膜炎和脑炎监测(Acute meningitis and encephalitis surveillance,AMES)、2007-2019年Nm耐药性试验等数据,分析流脑流行特征、Nm血清群分布和耐药率。结果广东省2006-2021年报告流脑118例,年均报告发病率为0.007/10万;0-4、5-9、10-14、15-19、≥20岁分别占总病例数的37.29%、4.24%、5.93%、18.64%、33.90%。流脑病例Nm检出率为71.19%(84/118),其中A、B、C、W、Y、不可分群分别占4.76%、52.38%、26.19%、8.33%、7.14%、1.19%;健康人群Nm带菌率为0.56%(32/5743),各血清群分别占0.00%、65.63%、9.38%、3.13%、0.00%、21.88%;AMES病例Nm检出率为1.33%(13/981),均为B群。Nm菌株对甲氧苄啶/磺胺甲恶唑、萘啶酸、环丙沙星、青霉素、氨苄青霉素的耐药率分别为80.2%、47.7%、33.3%、3.2%、0.0%。结论广东省流脑发病率维持在较低水平,优势流行Nm血清群由A群和C群向B群、Y群和W群转变。应继续加强流脑流行病学和病原学监测以及Nm菌株耐药性监测。 展开更多
关键词 流行性脑脊髓膜炎 脑膜炎奈瑟菌 流行病学 病原学 血清群 耐药性 监测
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两种新型冠状病毒免疫学检测方法的应用评价
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作者 郑仲华 黄鑫鑫 +7 位作者 张欢 邹丽容 胡瑶 李振翠 郭前方 刘美真 梁丽君 李柏生 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期395-398,共4页
目的:为有效检测新型冠状病毒特异性抗体(新冠抗体),利用化学发光法和胶体金法分别检测已完成中和试验的92份血清,对两种方法的敏感度和特异度等进行初步比较和评价,为大规模人群免疫后血清SARS-CoV-2抗体水平监测提供参考。方法:采用... 目的:为有效检测新型冠状病毒特异性抗体(新冠抗体),利用化学发光法和胶体金法分别检测已完成中和试验的92份血清,对两种方法的敏感度和特异度等进行初步比较和评价,为大规模人群免疫后血清SARS-CoV-2抗体水平监测提供参考。方法:采用病毒中和试验、胶体金试剂盒和全自动化学发光分析仪分别对样本开展SARS-CoV-2特异性抗体检测,计算诊断特异度、敏感度、阴阳性预测值和符合率。结果:化学发光法的灵敏度为100.00%,高于胶体金法的71.64%;胶体金法的特异度为92.00%,高于化学发光法的64.00%;胶体金法阴阳性预测值分别为54.76%和96.00%,而化学发光法的阴阳性预测值分别为100.00%和88.16%;胶体金法和化学发光法的Kappa值分别为0.525和0.721。结论:以微量病毒中和抗体试验为金标准,化学发光法的灵敏度和Kappa值较高,适用于SARS-CoV-2病例辅助性快速检测;胶体金法测定SARS-CoV-2特异度总抗体的灵敏度一般,特异度较高,其使用简便快速、成本低廉,在条件限制、需要及时监测等情况下,适用于快速大规模筛查以及阳性样本初步检测。随着新冠疫苗在人群中大规模免疫,有必要开发一种更加高效便捷可用的检测方法用于监测人群保护性抗体水平。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 中和试验 化学发光法 胶体金法
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广东省2株白喉棒状杆菌的鉴定与分析 被引量:2
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作者 李振翠 刘美真 +4 位作者 方艳梅 贡梓军 王旭麟 陈经雕 李柏生 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期427-432,共6页
目的对广东省2株C.diphtheriae白喉棒状杆菌进行精准鉴定与分析。方法通过API Coryne棒状杆菌生化卡对2010年广州和2020年珠海分离的C.diphtheriae进行生化及质谱鉴定;利用Illumina平台进行测序,CLC软件拼接,JSpeciesWS线上工具进行平... 目的对广东省2株C.diphtheriae白喉棒状杆菌进行精准鉴定与分析。方法通过API Coryne棒状杆菌生化卡对2010年广州和2020年珠海分离的C.diphtheriae进行生化及质谱鉴定;利用Illumina平台进行测序,CLC软件拼接,JSpeciesWS线上工具进行平均核苷酸同源性识别;BLASTN进行narKGHIJ和tox基因检测,使用MEGA-X构建wgSNP系统发育进化树。结果GD-Guangzhou-2010为Belfanti型,GD-Zhuhai-2020为Gravis型。棒状杆菌种间ANI值计算结果显示,GD-Guangzhou-2010与C.belfantii间ANIb=99.61%,GD-Zhuhai-2020与C.diphtheriae间ANIb=97.64%。BLASTN结果显示,GD-Guangzhou-2010硝酸盐还原基因narKGHIJ均为阴性且未携带tox基因,GD-Zhuhai-2020硝酸盐还原基因narKGHIJ均为阳性,未携带tox基因。C.diphtheriae的wgSNP进化树显示两个主要进化分支,第一个分支包含所有Mitis型和Gravis型以及GD-Zhuhai-2020,第二个分支包含所有的C.belfantii、C.diphtheriae subsp.lausannense分离株及GD-Guangzhou-2010。结论广东省成功分离鉴定出两株非产毒性C.diphtheriae,系统发生树提示GD-Guangzhou-2010和GD-Zhuhai-2020位于两个不同的进化分支。 展开更多
关键词 白喉棒状杆菌 全基因组测序 wgSNP进化树 鉴定
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开展人群大规模新冠核酸筛查的混合检测方法研究 被引量:2
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作者 梁艺文 郭前方 +5 位作者 梁丽君 张欢 庾健祥 张云强 宋铁 武婕 《华南预防医学》 2022年第10期1298-1300,共3页
目的为在大规模人群中进行新型冠状病毒核酸筛查时提高检测效率、缩短检测时间,探索混采混检、单采混检检测的合理比例数。方法对当天采集的56份新鲜样本进行单独检测,再分为混采混检组和单采混检组,各组中均有3∶1、5∶1、10∶1混合样... 目的为在大规模人群中进行新型冠状病毒核酸筛查时提高检测效率、缩短检测时间,探索混采混检、单采混检检测的合理比例数。方法对当天采集的56份新鲜样本进行单独检测,再分为混采混检组和单采混检组,各组中均有3∶1、5∶1、10∶1混合样本,每份混合样本中含1份阳性样本并配备双份样本进行平行试验,比较混采混检和单采混检检测结果的差异。结果混采混检方案:3∶1、5∶1混采混检阳性样本检测结果与单采单检相比Ct值基本不变,检测灵敏度无差异;10∶1混采混检阳性样本Ct值平均升高2.95个单位(0.71~5.47),检测灵敏度略有降低,检测结果在临界值(37~40)的样本会成为假阴性。单采混检方案:3∶1、5∶1、10∶1的单采混检阳性样本检测结果与单检相比Ct值平均升高1.13、2.57、4.92个单位(0.30~7.66),检测灵敏度降低。结论建议在针对高风险地区的大规模人群筛查时采用5∶1混采混检方案。特殊情况下需要快速提升核酸检测能力时可采取10∶1混采混检方案。对发热门诊、重点人员以及密接人员仍采用单人单采单检的检测方案。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 核酸检测 混采混检 单采混检
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广州市生活污水中埃可病毒11型循环动态变化及基因特征分析 被引量:2
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作者 黄淑芬 张薇 +8 位作者 陈美钟 郭雪 祝双利 李彩霞 曾汉日 方苓 张勇 郑焕英 邓小玲 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1108-1116,共9页
埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)属于B组肠道病毒,是最常见的人类肠道病毒(Enterovirus,EV)之一,是引起无菌性脑膜炎,新生儿感染的重要病原体之一。为探讨广州市生活污水监测中E11分离株循环动态变化及其基因组特征,本研究对2009-2021... 埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)属于B组肠道病毒,是最常见的人类肠道病毒(Enterovirus,EV)之一,是引起无菌性脑膜炎,新生儿感染的重要病原体之一。为探讨广州市生活污水监测中E11分离株循环动态变化及其基因组特征,本研究对2009-2021年广州市生活污水EV监测获得的E11分离株进行VP1区基因扩增及测序,结合2019年广东省发生的两起E11新生儿感染事件及部分散发病例中获得的E11分离株,与全球E11参考株进行序列相似性分析和系统发生学分析。结果显示,2009-2021年生活污水EV监测中E11分离株的核苷酸及氨基酸相似性分别为72.8%~99.3%和84.5%~99.6%。监测发现,广州市2018-2019年在污水中检出大量E11,与两起新生儿感染事件及散发病例的分离株核苷酸相似性高达96.2%~99.2%,但序列间仍存在差异,两起新生儿感染及散发病例感染的毒株为不同来源。通过系统进化树分析发现,2018-2019年污水E11分离株及两起新生儿感染与散发病例E11亲缘关系较近,分子分型结果均为E11 D5基因型。2017年及以前的污水分离株以A1基因型为主,但也有C3和D5基因型,2018年开始则以D5基因型为主,与同时期EV感染病例基因型结果一致。而在2021年污水中则发现了E11 E基因型,但广州暂未有该基因型的感染病例报道,仍需持续进行病例和环境监测。结果表明,生活污水监测能够及时反映EV在环境和人群中的循环动态变化,对EV引起的相关疾病起到预测预警作用。 展开更多
关键词 埃可病毒11型 污水监测 基因特征 循环动态变化
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新型冠状病毒奥密克戎变异株及其亚系的流行病学及病原学特征 被引量:1
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作者 徐俊贤 张昌 +3 位作者 邓小玲 黄淑芬 陈美钟 卢晓贤 《国际流行病学传染病学杂志》 CAS 2022年第6期426-431,共6页
新型冠状病毒奥密克戎变异株首次由南非报告,随后迅速在全世界传播,成为全球新型冠状病毒主要优势株,给疫情防控工作带来沉重压力。奥密克戎变异株包括BA.1,BA.2、BA.3、BA.4和BA.5等多种亚系,各亚系之间既有多个共同突变,也有各自独特... 新型冠状病毒奥密克戎变异株首次由南非报告,随后迅速在全世界传播,成为全球新型冠状病毒主要优势株,给疫情防控工作带来沉重压力。奥密克戎变异株包括BA.1,BA.2、BA.3、BA.4和BA.5等多种亚系,各亚系之间既有多个共同突变,也有各自独特的突变,这些突变具有不同的传播力。本文对奥密克戎变异株各亚型的流行情况和主要病原学特征做简要综述,为更好地防控疫情提供参考。 展开更多
关键词 SARS-CoV-2 Omicron 流行病学 突变 亚型
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抗新型冠状病毒卵黄抗体对病毒及变异株的体外中和作用
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作者 林烨暄 张欢 +5 位作者 胡方焱 雷雨 杨秀兰 陈婷 武婕 林小军 《国际生物制品学杂志》 CAS 2022年第3期121-126,共6页
目的研究抗新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)卵黄抗体(egg yolk immunoglobulin,IgY)在体外对SARS-CoV-2及其变异株的中和抑制作用,探讨其作为鼻腔/口腔喷雾剂用于预防和阻断SARS-CoV-2感染... 目的研究抗新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)卵黄抗体(egg yolk immunoglobulin,IgY)在体外对SARS-CoV-2及其变异株的中和抑制作用,探讨其作为鼻腔/口腔喷雾剂用于预防和阻断SARS-CoV-2感染的可能性。方法采用间接ELISA检测抗SARS-CoV-2 IgY原液及成品对刺突(spike,S)蛋白的抗体效价;用微量细胞病变法检测其对SARS-CoV-2的中和活性;用萤光素酶发光法检测其对SARS-CoV-2假病毒的中和作用。结果抗SARS-CoV-2 IgY原液的抗S抗原效价为1∶32000~1∶64000,成品的效价为1∶16000~1∶32000;两批原液对活病毒的中和效价分别为1∶128和1∶256,相应的抑制中浓度(median inhibitory concentration,IC_(50))分别为36.22和36.50μg/ml;成品对SARS-CoV-2假病毒的IC_(50)均值分别为4.57μg/ml(WT)和6.07μg/ml(D614G);对变异株假病毒的IC_(50)分别为15.09~29.94μg/ml(B.1.1.7)、41.71~55.56μg/ml(B.1.351)和16.66~32.33μg/ml(B.1.617.2)。结论抗SARS-CoV-2 IgY与SARS-CoV-2重组S蛋白具有良好的结合活性,在体外能显著地中和SARS-CoV-2活病毒、假病毒及变异株假病毒,有望用于SARS-CoV-2感染的预防和阻断。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 假病毒 卵黄抗体 变异株 中和活性
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广东省2015-2022年流感暴发疫情特征分析 被引量:4
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作者 庄雅丽 卢捷 +6 位作者 吴树凯 张展辉 魏志梅 李依红 胡婷 康敏 邓爱萍 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期942-948,共7页
目的分析广东省2015年1月至2022年8月报告的流感样病例暴发疫情,掌握广东省流感暴发疫情的流行病学特征。方法针对2015-2022年广东省发生的暴发疫情,收集疫情现场处置信息,对疫情特征进行描述流行病学分析,采用logistic回归模型确定影... 目的分析广东省2015年1月至2022年8月报告的流感样病例暴发疫情,掌握广东省流感暴发疫情的流行病学特征。方法针对2015-2022年广东省发生的暴发疫情,收集疫情现场处置信息,对疫情特征进行描述流行病学分析,采用logistic回归模型确定影响暴发疫情强度及持续时间的因素。结果广东省共报告流感暴发疫情1901起,总罹患率为2.05%;疫情报告时间主要集中在11月至次年1月(50.24%,955/1901),4-6月(29.88%,568/1901);珠江三角洲地区的报告暴发疫情占59.23%(1126/1901);中、小学校为疫情发生的主要场所(88.01%,1673/1901)。暴发疫情以发病数10~29例为主(66.18%,1258/1901),持续时间以7 d内为主(50.93%,906/1779)。幼儿园(aOR=0.38,95%CI:0.15~0.93)、珠江三角洲地区(aOR=0.60,95%CI:0.44~0.83)、首例发病时间距离报告时间(与≤3 d相比,>7 d的aOR=3.01,95%CI:1.84~4.90)、甲型H1N1(aOR=2.02,95%CI:1.15~3.55)、B(Yamagata)系(aOR=2.94,95%CI:1.50~5.76)引起与暴发疫情发病人数有关;停课(aOR=0.65,95%CI:0.47~0.89)、珠江三角洲地区(aOR=0.65,95%CI:0.50~0.83)、报告时间距离首例发病时间(与≤3 d相比,>7 d的aOR=13.33,95%CI:8.80~20.19;4~7 d的aOR=2.56,95%CI:1.81~3.61)与暴发疫情持续时间有关。结论广东省流感暴发疫情存在冬春季和夏季2个高峰。中、小学校是高发场所,尽早报告疫情是控制学校流感暴发疫情的关键措施,同时应该采取综合性措施防止疫情蔓延。 展开更多
关键词 流感 暴发 流行病学特征 影响因素
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2020年广东省诺如病毒感染性腹泻监测分子流行病学特征分析 被引量:3
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作者 梁玉凤 方苓 +3 位作者 徐静 李彩霞 周惠琼 柯昌文 《华南预防医学》 2023年第3期382-385,共4页
目的了解2020年广东省诺如病毒感染性腹泻的分子流行病学特征。方法收集广东省2020年1—12月感染性腹泻监测数据及粪便样本,采用实时荧光定量PCR法鉴定样本中的诺如病毒,筛选出诺如病毒阳性样本进行PCR扩增和测序,序列拼接处理后对其进... 目的了解2020年广东省诺如病毒感染性腹泻的分子流行病学特征。方法收集广东省2020年1—12月感染性腹泻监测数据及粪便样本,采用实时荧光定量PCR法鉴定样本中的诺如病毒,筛选出诺如病毒阳性样本进行PCR扩增和测序,序列拼接处理后对其进行分型分析,同时对病例数据进行流行病学特征分析。结果2020年1—12月共收集到广东省23家哨点医院感染性腹泻样本1415份,诺如病毒检出率为22.05%(312/1415)。不同月份及季度的诺如病毒检出率差异有统计学意义(均P<0.01),其中第4季度检出率最高,为44.16%(174/394),第2季度检出率最低,为8.64%(31/359)。不同地区、性别的感染性腹泻病例诺如病毒检出率差异均无统计学意义(均P>0.05),不同年龄组间的诺如病毒检出率差异有统计学意义(P<0.01)。基因分型分析表明2020年广东省诺如病毒感染性腹泻主要由诺如病毒GII型引起,占81.73%,其中以GII.2[P16]和GII.4[P31]为主,分别占70.47%、12.08%。结论诺如病毒是引起广东省感染性腹泻的主要病原之一。不同季度的诺如病毒流行型别有变化,GII.2[P16]逐渐成为2020年广东省诺如病毒优势型别。 展开更多
关键词 诺如病毒 感染性腹泻 基因型 分子流行病学
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