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2017~2018年河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染病例中人副流感病毒3型基因特征分析 被引量:15
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作者 周杉杉 毛乃颖 +4 位作者 姬奕昕 张燕 崔爱利 许文波 扈瑞平 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期730-740,共11页
严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)是引起婴幼儿就诊和住院的常见原因,也是该年龄段人群发病的主要原因,而病毒感染占呼吸道感染病例的60%以上,其中人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIVs)是引起... 严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)是引起婴幼儿就诊和住院的常见原因,也是该年龄段人群发病的主要原因,而病毒感染占呼吸道感染病例的60%以上,其中人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIVs)是引起呼吸道感染的常见病原。为分析河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染(SARI)病例中人副流感病毒3型(HPIV-3)检出状况及血凝素-神经氨酸酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因特征,采用实时荧光定量聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)方法对河南省漯河市中心医院于2017年10月10日至2018年12月27日送检的627份SARI病例咽拭子进行核酸检测,筛查HPIV-3阳性标本,对HPIV-3阳性标本用反转录聚合酶链反应(Reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增其HN基因,并对扩增产物进行序列测定,与GenBank数据库中的国内外HPIV-3 HN基因进行对比分析,绘制系统进化树,并分析基因特征。627份咽拭子标本中,HPIV-3阳性有27份,检出率为4.3%。59%的HPIV-3阳性病例分布于春夏季,发病人群中,6岁以下儿童占96.3%。通过RT-PCR方法共获得18株HPIV-3的HN基因,经过序列测定及对比分析可划分为两个基因亚型:C3a和C3b。C3a亚型有10株,C3b亚型有8株。18株HPIV-3的HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.1%~100.0%和98.8%~100%。与原型株Wash/47885/57相比,本次扩增18株HPIV-3 HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为94.5%~95.0%和97.0%~97.7%。与GenBank中国内外的HPIV-3 HN基因的代表株比较,其核苷酸及氨基酸同源性分别为94.1%~98.5%和96.8%~97.0%。本研究提示HPIV-3是河南省漯河市儿童SARI病例中检出的病原之一,2017年10月至2018年12月期间,至少有C3a、C3b两个基因亚型的HPIV-3毒株在漯河市共流行。 展开更多
关键词 人副流感病毒(HPIVs) 血凝素-神经氨酸酶蛋白(HN)基因 基因特征 同源性分析
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严重急性呼吸道感染病例中人冠状病毒OC43基因特征分析 被引量:3
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作者 孙凯旋 崔爱利 +2 位作者 何佩 许文波 张荣波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期236-245,共10页
人冠状病毒(Human coronavirus,HCoV)是导致人呼吸道感染的重要病原之一。为了从分子水平上探讨严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)病例中HCoV-OC43的基因特征,本研究应用实时荧光定量(Real-time)PCR方法对2... 人冠状病毒(Human coronavirus,HCoV)是导致人呼吸道感染的重要病原之一。为了从分子水平上探讨严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)病例中HCoV-OC43的基因特征,本研究应用实时荧光定量(Real-time)PCR方法对2019年河南省374份SARI病例样本进行HCoV-OC43核酸筛查,并对核酸检测阳性样本进行棘突蛋白(Spike,S)、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)和核衣壳蛋白(Nucleocapsid,N)三个靶基因扩增和序列测定。结合从GenBank数据库筛选的国内外42条代表序列和本研究所获得的S、RdRp和N三个靶基因全长序列构建基因亲缘性关系树,对本研究所获得的HCoV-OC43样本进行基因型别鉴定和基因特征分析,并对HCoV-OC43重要抗原S蛋白进行氨基酸位点变异分析。结果显示:在374份SARI病例样本中共检测出15份HCoV-OC43核酸阳性样本(15/374,4.01%),并在4份临床样本中获得S、RdRp和N基因全长序列。通过构建基因亲缘性关系树,结果显示有3株属于G基因型,1株属于H基因型。S蛋白氨基酸位点变异分析结果提示,2019年G基因型流行株(包括本研究的3株和美国株USA/MN306041/SC0810/2019)有特异性的3个氨基酸位点变异:L272P、P516S和S902A。2019年H基因型流行株(包括本研究的1株和美国株USA/MN306043/SC0841/2019)特异的氨基酸位点变异为N484D。本研究通过对2019年河南省流行的HCoV-OC43进行基因型别鉴定与基因特征分析,为我国HCoV-OC43的分子变异变迁研究提供了基线数据。 展开更多
关键词 人冠状病毒OC43(HCoV-OC43) 基因型别 基因特征
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鼻病毒A21基因型的划分及全基因组特征分析 被引量:1
3
作者 张强 张燕 +4 位作者 胡满丽 谢智博 王慧玲 宋金华 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期1-13,共13页
人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是导致儿童急性呼吸道感染的主要病毒之一。最近的研究报道发现HRV-A21可导致危重症急性呼吸道感染。本研究将2013~2015年河北省发热呼吸道症候群哨点监测病例中获得的一株HRV-A21病毒标本(本课题组之前... 人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是导致儿童急性呼吸道感染的主要病毒之一。最近的研究报道发现HRV-A21可导致危重症急性呼吸道感染。本研究将2013~2015年河北省发热呼吸道症候群哨点监测病例中获得的一株HRV-A21病毒标本(本课题组之前的研究已获得VP4/2区序列),结合从GenBank数据库下载的全球98株HRV-A21代表株,基于VP4/2区构建亲缘性关系树。本研究首次将HRV-A21划分为A、B、C、D、E五个基因型,其中E基因型进一步划分为E1、E2和E3亚型,并发现E1、E2和E3亚型在年代分布上呈现出一定的时间进化趋势。我国流行的HRV-A21以C和E基因型为主。基于VP1区划分基因型的结果与VP4/2区相似。本研究进而对这一株HRV-A21进行了全基因组序列测定,并结合GenBank数据库下载的HRV-A21全基因组序列,对HRV-A21进行基因亲缘性关系分析、氨基酸变异和糖基化位点分析。结果显示VP2区、VP3区、VP1区和3D区都属于高变区,但变异程度VP1区>VP2区>VP3区>3D区,同时发现了保守的14个N-糖基化位点和26个O-糖基化位点,和新增的5个N-糖基化位点和5个O-糖基化位点。本研究在GenBank数据库的基础上结合本课题组获得的一株HRV-A21序列,对HRV-A21进行基因型和基因亚型的划分,对HRV-A21在全球和我国部分地区的分布情况和流行特点进行了初步的分析,并对HRV-A21全基因组序列特征进行了分析,丰富了HRV-A21基因数据库,为HRV-A21诊断、分子流行病学等的研究以及疾病的防控和治疗提供了基础数据。 展开更多
关键词 人鼻病毒A21型(HRV-A21) 基因型 基因特征 全基因组 分子流行病学 糖基化
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2019年中国麻疹风疹实验室网络运转状况 被引量:10
4
作者 宋金华 郭晋源 +6 位作者 王慧玲 朱贞 毛乃颖 崔爱利 曹蕾 许文波 张燕 《中国疫苗和免疫》 CSCD 北大核心 2021年第3期246-249,共4页
目的评价2019年中国麻疹风疹实验室网络(China Measles and Rubella Laboratory Network,CMRLN)运转状况。方法利用中国麻疹监测信息报告管理系统(Measles Surveillance System,MSS)和CMRLN实验室监测数据库,分析CMRLN运转指标和麻疹风... 目的评价2019年中国麻疹风疹实验室网络(China Measles and Rubella Laboratory Network,CMRLN)运转状况。方法利用中国麻疹监测信息报告管理系统(Measles Surveillance System,MSS)和CMRLN实验室监测数据库,分析CMRLN运转指标和麻疹风疹病例实验室监测结果。结果2019年全国报告监测病例78787例,其中散发病例65507例,散发病例的血标本、病原学标本采集率分别为95.86%、50.16%,3d内送达网络实验室的比例分别为97.89%、84.13%。监测病例的麻疹、风疹病毒IgM检测阳性率分别为4.65%(3226/69436)、31.14%(21784/69963)。散发监测病例麻疹、风疹病毒核酸检测阳性率分别为3.28%(1090/33254)、31.31%(10367/33112)。全国报告麻疹、风疹暴发疫情分别为24起、177起,实验室确诊率分别为100%、99.44%。共分离到265株麻疹病毒,其中D8、A(疫苗相似株)、B3和H1基因型分别为176株、18株、51株和30株;分离到风疹病毒2822株,其中1E和2B基因型分别为1608株和1214株。国家、32个省级、27个地市级网络实验室均通过了麻疹和风疹血清盲样、核酸盲样和/或基因定型考核。结论2019年中国麻疹风疹实验室网络运转良好,为中国麻疹和风疹的消除提供了技术支撑。 展开更多
关键词 麻疹风疹实验室网络 病毒学监测 质量控制
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免疫芯片检测技术应用研究进展
5
作者 向钰洁 马学军 申辛欣 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期869-876,共8页
免疫芯片(Immune chips)是一种特殊的蛋白质芯片,该技术本质上是将抗原-抗体结合反应的特异性与电子芯片高密度集成的原理相结合,形成了一种新型的生物检测技术,具有高灵敏度、操作简便、反应速度快等优势。随着科学技术的进步和创新,... 免疫芯片(Immune chips)是一种特殊的蛋白质芯片,该技术本质上是将抗原-抗体结合反应的特异性与电子芯片高密度集成的原理相结合,形成了一种新型的生物检测技术,具有高灵敏度、操作简便、反应速度快等优势。随着科学技术的进步和创新,免疫芯片技术正在不断突破原有的局限,向着更高的灵敏度、更宽的检测范围、更快的检测速度和更低的成本方向发展,成为检测领域强有力的工具。本文综述了几类免疫芯片的基本原理和技术特点,主要分析了其在病毒、细菌、疾病标志物、真菌、寄生虫等检测中的应用。 展开更多
关键词 免疫芯片 微流控 液相芯片 非核酸物质 即时检测
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一株引起严重急性呼吸道感染病例的A亚型人呼吸道合胞病毒全基因组基因特征分析 被引量:4
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作者 杜佳 徐瑾 +2 位作者 崔爱利 许文波 张燕 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期27-36,共10页
人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是导致儿童急性呼吸道感染的最重要的呼吸道病毒之一。根据对单克隆抗体的反应,HRSV分为A、B两个亚型。为探讨严重急性呼吸道感染(Severe acute respi-ratory infection,SARI... 人呼吸道合胞病毒(Human respiratory syncytial virus,HRSV)是导致儿童急性呼吸道感染的最重要的呼吸道病毒之一。根据对单克隆抗体的反应,HRSV分为A、B两个亚型。为探讨严重急性呼吸道感染(Severe acute respi-ratory infection,SARI)病例中HRSV全基因组基因特征,本研究对2017年河南省漯河市住院SARI病例中检测到的1株HRSV A亚型病毒通过Sanger测序方法对其全基因组序列进行了测定和分析。通过Sequencher 5.4.5、MEGA 5.05、BioEdit 7.0.5等生物信息学软件进行序列拼接和比对,进行了基因亲缘性关系分析、氨基酸变异和糖基化位点分析。基于HRSV全基因组序列和11个单个蛋白基因序列构建的亲缘性关系分析结果提示本研究中检测到的这株HRSVA病毒(RSVAs/Luohe.Henan/CHN/42.17)属于ON1基因型,该型是我国近年流行的优势基因型。该病毒全基因组序列与35条全球代表株的核苷酸和氨基酸同源性分别为92.69%~99.82%和93.63%~99.67%;G蛋白编码区氨基酸变异最高,而F蛋白相对保守。糖基化位点分析发现,该病毒的F蛋白有6个N-糖基化位点,未发现O-糖基化位点,此结果与原型株long株相同;G蛋白N-糖基化位点有6个,O-糖基化位点为82个,而原型株long株有11个N-糖基化位点,15个O-糖基化位点。本研究对2017年河南省漯河市SARI病例中一株HRSVA病毒全基因组序列进行了测定,与世界其他地区报道的HRSVA亚型病毒全基因组序列进行了对比分析,揭示了SARI病例中我国HRSV优势流行ON1基因型病毒全基因组的核苷酸和氨基酸变异特征,以及G蛋白和F蛋白编码区糖基化情况,丰富了我国HRSV基因数据库,也为HRSV的核酸检测方法的建立、疫苗研发和预防性单克隆抗体的评价提供了核苷酸和氨基酸的基础数据。 展开更多
关键词 人呼吸道合胞病毒(HRSV) 全基因组 基因特征 糖基化
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五株人冠状病毒NL63的基因型鉴定及S1 domain基因特征分析 被引量:3
7
作者 何佩 崔爱利 +5 位作者 徐瑾 高立冬 余鹏博 孙凯旋 许文波 许晓光 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期202-210,共9页
为阐明我国部分地区人冠状病毒(Human coronavirus,HCoV)NL63基因特征,本研究对2013年陕西省、2018年河南省和湖南省送检的5株HCoV-NL63核酸检测阳性的呼吸道样本进行HCoV-NL63基因型别鉴定及S1 do-main基因特征分析。通过对HCoV-NL63... 为阐明我国部分地区人冠状病毒(Human coronavirus,HCoV)NL63基因特征,本研究对2013年陕西省、2018年河南省和湖南省送检的5株HCoV-NL63核酸检测阳性的呼吸道样本进行HCoV-NL63基因型别鉴定及S1 do-main基因特征分析。通过对HCoV-NL63棘突蛋白(Spike glycoprotein,S)基因的S1 domain区域进行基因扩增和序列测定,同时结合GenBank数据库下载的1983~2018年其他国家74条HCoV-NL63代表株序列和2007~2010年中国流行的12条HCoV-NL63代表株序列,构建基因亲缘性关系树,并对S蛋白的S1 domain区域进行核苷酸序列比对分析。结果提示全球HCoV-NL63流行株可划分为A和B两个基因型;A基因型可进一步划分为A0,A1,A2和A3四个基因亚型,其中本研究将GenBank中2008年中国流行的2株HCoV-NL63毒株划分为新基因亚型(A3);B基因型可进一步划分为B0,B1和B2三个基因亚型。A和B基因型的HCoV-NL63代表株序列在地域分布上无明显差异,但A基因型不同基因亚型的HCoV-NL63序列在年代分布上呈现出一定的时间进化趋势。在我国A和B基因型HCoV-NL63均已被检测到,但主要以A基因型流行为主,且主要集中在A1和A2基因亚型。不同基因型HCoV-NL63序列在S1 domain区域核苷酸和氨基酸序列上存在特征性差异。本研究通过对五株HCoV-NL63基因型鉴定及S1 domain基因特征分析,初步阐明了我国部分地区流行的HCoV-NL63基因型/基因亚型分布情况及基因特征,丰富了我国本土流行的HCoV-NL63基因数据库,为我国HCoV-NL63分子流行病学研究及分子检测和监测技术的改进和验证提供了基础基因数据。 展开更多
关键词 人冠状病毒NL63(HCoV-NL63) 基因型 基因特征 分子流行病学
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风疹病毒核酸检测在风疹消除阶段应用的必要性 被引量:3
8
作者 赵培蓓 任虎 +2 位作者 朱贞 曹蕾 扈瑞平 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期343-350,共8页
风疹是由风疹病毒(Rubella virus,RV)引起的一种以发热、出疹为主要表现的急性呼吸道传染病,孕早期感染RV可引起先天性风疹综合征(Congenital rubella syndrome,CRS)。风疹是疫苗可预防性传染病,2008年我国将风疹疫苗纳入国家扩大免疫规... 风疹是由风疹病毒(Rubella virus,RV)引起的一种以发热、出疹为主要表现的急性呼吸道传染病,孕早期感染RV可引起先天性风疹综合征(Congenital rubella syndrome,CRS)。风疹是疫苗可预防性传染病,2008年我国将风疹疫苗纳入国家扩大免疫规划,通过连续10年免疫规划的实施,风疹发病率迅速下降,2014~2017年已接近风疹消除的目标(风疹发病率为0.8/10万~0.12/10万)。加强对风疹可疑病例的报告和实验室鉴别诊断,对隔离传染源、指导疫苗使用以及阻断RV传播具有重要的作用。《麻疹和风疹病毒感染实验室诊断手册》要求在风疹暴发流行阶段,只针对每起暴发采集5~10份血标本,检测风疹IgM是风疹病例确诊的金标准;而在消除风疹和CRS阶段要求对每一例散发疑似病例采集血清标本和鼻咽拭子,分别进行IgM抗体和RV核酸的检测。本文对我国在消除风疹和CRS阶段将RV核酸检测应用于风疹病例早期诊断的必要性进行了阐述。 展开更多
关键词 先天性风疹综合征(CRS) 风疹病毒(RV) 核酸检测 消除风疹
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带状疱疹流行病学及疫苗的研究进展 被引量:45
9
作者 闵小雨 许松涛 许文波 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期109-114,共6页
带状疱疹(Herpes zoster,HZ)是由潜伏的水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)重新激活引起的感染性皮肤病,好发于中老年人,常表现为沿感觉神经支配的区域形成单侧皮疹,并伴有神经病理性疼痛。随着我国人口老龄化趋势日益加重... 带状疱疹(Herpes zoster,HZ)是由潜伏的水痘-带状疱疹病毒(Varicella-zoster virus,VZV)重新激活引起的感染性皮肤病,好发于中老年人,常表现为沿感觉神经支配的区域形成单侧皮疹,并伴有神经病理性疼痛。随着我国人口老龄化趋势日益加重,带状疱疹的发病率呈显著上升趋势,带状疱疹的防治已经成为重要的公共卫生问题,接种带状疱疹疫苗来防止该病发生是最为行之有效的手段。本文将对带状疱疹的流行病学以及对已上市带状疱疹疫苗的有效性、安全性和成本效益等方面作一综述,为我国带状疱疹疫苗的研制以及带状疱疹的预防提供参考。 展开更多
关键词 带状疱疹(HZ) 疫苗 流行病学
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2009—2021年中国九省份发热呼吸道症候群监测病例中常见病毒感染情况分析 被引量:21
10
作者 崔爱利 朱贞 +12 位作者 毛乃颖 谢智博 关路媛 胡孔新 朱汝南 吴巨龙 李岩 马英伟 李芳彩 王文洋 郜振国 张燕 许文波 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期912-918,共7页
目的了解我国九省份发热呼吸道症候群(FRS)监测病例中常见病毒感染情况。方法研究资料来源于中国疾病预防控制中心"传染病监测技术平台信息管理系统"中九省份(安徽、北京、广东、河北、湖南、吉林、山东、陕西和新疆)2009年1... 目的了解我国九省份发热呼吸道症候群(FRS)监测病例中常见病毒感染情况。方法研究资料来源于中国疾病预防控制中心"传染病监测技术平台信息管理系统"中九省份(安徽、北京、广东、河北、湖南、吉林、山东、陕西和新疆)2009年1月至2021年6月间的FRS病例监测数据,最终将具有8种病毒[人流感病毒(HIFV)、人呼吸道合胞病毒(HRSV)、人腺病毒(HAdV)、人副流感病毒(HPIV)、人鼻病毒(HRV)、人偏肺病毒(HMPV)、人冠状病毒(HCoV)以及人博卡病毒(HBoV)]核酸检测结果的8 243例FRS监测病例纳入研究。采用χ2检验/Fisher确切概率法分析不同年龄组、不同地区和不同季节病例的病毒检出率差异。结果 8 243例FRS病例年龄M(Q1,Q3)为4(1,18)岁,<5岁以下儿童占56.56%(4 662例);男性占58.1%(4 792例);病例主要来源于门、急诊病例和住院病例,其中门急诊病例数为2 043例,住院病例数为6 200例。FRS病例的病毒检出率从高到低依次为HRSV、HIFV、HPIV、HRV、HAdV、HMPV、HCoV和HBoV。有524例病例同时检出两种及两种以上病毒,占病毒检测阳性病例数的15.66%。不同年龄组中病毒检出率的差异具有统计学意义(均P<0.05),<5岁以下儿童的病毒检出率较高(49.96%)。南方任一病毒阳性检出率高于北方(P<0.001)。FRS病毒阳性病例全年均有检出,HRSV检出率在秋、冬季较高,HIFV检出率在冬季较高,HMPV检出率在冬、春季较高;而HPIV、HRV、HCoV和HBoV的检出率在夏、秋季节较高,而HAdV在不同季节检出率的差异无统计学意义。与2009—2019年相比,2020—2021年的任一病毒阳性检出率有所下降,由原来的41.37%下降至37.86%;HIFV检出率由原来的10.62%急剧下降至1.37%;HPIV检出率由原来的8.24%下降至5.88%。而HRV和HBoV的检出率则由原来的5.43%和1.79%,分别上升至9.67%和3.19%。结论 2009—2021年中国九省份FRS病例以HRSV和HIFV感染较为常见,8种常见呼吸道病毒的流行特� 展开更多
关键词 呼吸道感染 发热呼吸道症候群 新型冠状病毒肺炎 监测
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亚洲轮状病毒腹泻流行病学特征 被引量:13
11
作者 张佳莹 田祎 +1 位作者 高志勇 刘娜 《国际病毒学杂志》 2021年第2期166-169,共4页
轮状病毒是全球5岁以下儿童重症腹泻的最主要病原,亚洲地区是全球轮状病毒腹泻疾病负担较高的地区。本文对亚洲地区轮状病毒腹泻的疫苗接种、疾病负担、人群分布、季节特征和基因型分布等进行综述。
关键词 轮状病毒 腹泻 流行病学
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人腺病毒感染的病原学研究现状 被引量:9
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作者 朱贞 毛乃颖 《传染病信息》 2022年第3期206-213,227,共9页
人腺病毒(human adenovirus, HAdV)是人类重要的病毒性致病原,可被划分为7个亚属(A~G)和至少113个型别,由于不同型别HAdV的组织嗜性不同,可导致多种疾病,主要包括急性呼吸道感染、眼结膜炎、胃肠道疾病等。2022年1月以来,全球多个国家... 人腺病毒(human adenovirus, HAdV)是人类重要的病毒性致病原,可被划分为7个亚属(A~G)和至少113个型别,由于不同型别HAdV的组织嗜性不同,可导致多种疾病,主要包括急性呼吸道感染、眼结膜炎、胃肠道疾病等。2022年1月以来,全球多个国家相继报道了不明原因儿童严重急性肝炎病例,截至5月3日,WHO已接收到20个国家报告的228例病例。目前认为,HAdV感染是引起此次儿童严重急性肝炎的可能病因之一。我国由于缺乏系统的监测和研究而对HAdV感染所致肝炎的疾病负担认识不足,因此应尽快通过医防合作,开展以HAdV为主的非嗜肝病毒的病原学监测,为我国儿童严重急性肝炎的防控提供支持。 展开更多
关键词 不明原因儿童严重急性肝炎 人腺病毒 病原学 急性呼吸道感染 眼结膜炎 胃肠炎 腺病毒肝炎 实验室监测
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世界卫生组织轮状病毒疫苗立场文件—2021年7月 被引量:8
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作者 毛彤瑶(编译) 段招军(审校) 《中国疫苗和免疫》 CSCD 北大核心 2022年第1期128-134,共7页
依据为成员国提供卫生政策指导意见的职责,世界卫生组织(World Health Organization,WHO)定期发布预防具有全球公共卫生影响疾病的疫苗的立场文件。这些文件重点关注疫苗在大规模免疫规划中的使用,总结疾病和疫苗的基本背景信息。本文... 依据为成员国提供卫生政策指导意见的职责,世界卫生组织(World Health Organization,WHO)定期发布预防具有全球公共卫生影响疾病的疫苗的立场文件。这些文件重点关注疫苗在大规模免疫规划中的使用,总结疾病和疫苗的基本背景信息。本文件表明了WHO对如何在全球使用轮状病毒疫苗目前的立场。立场文件经外部专家和WHO工作人员审阅,并由WHO免疫策略咨询专家组(Strategic Advisory Group of Experts on Immunization,SAGE)审核和认可(https://www.who.int/groups/strategic-advisory-group-of-experts-on-immunization/)。 展开更多
关键词 轮状病毒疫苗 外部专家 卫生政策 免疫规划 免疫策略 全球公共卫生
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不同食物中诺如病毒检测方法的优化与评估 被引量:8
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作者 王宏 盖婧璇 +4 位作者 靳淼 李慧莹 段招军 王飞 苟丽霞 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期505-511,共7页
近年来,由病毒引起的食源性疾病越来越多,其中诺如病毒(Noroviruses,NoVs)是全球急性胃肠炎暴发的主要致病原。污染的食品是NoVs主要的传播途径之一。本文对不同食品中NoVs检测方法进行优化和评估,为我国NoVs引起的食源性病毒病的应对... 近年来,由病毒引起的食源性疾病越来越多,其中诺如病毒(Noroviruses,NoVs)是全球急性胃肠炎暴发的主要致病原。污染的食品是NoVs主要的传播途径之一。本文对不同食品中NoVs检测方法进行优化和评估,为我国NoVs引起的食源性病毒病的应对提供实验室检测技术支撑。以鼠诺如病毒(Murine norovirus-1,MNV-1)为模式病毒和过程对照病毒,优化和评估洗脱-浓缩法和直接RNA提取法,考察Trallk洗液、NaPP洗液、TGBE洗液和TPB洗液对新鲜果蔬食品(包括草莓、葡萄、洋葱和生菜)中MNV-1的洗脱效果,以及不同浓缩方法(PEG沉淀法和超滤法)对病毒洗脱液中MNV-1的浓缩效果;比较洗脱-浓缩法和直接RNA提取法对蛋白、脂肪类食品(蛋糕和午餐肉)中MNV-1的检测效果;评估优化后的方法对新鲜果蔬食品和蛋白、脂肪类食品中NoVs GII的检测效果。结果表明草莓、葡萄、生菜、洋葱中MNV-1的最优洗脱-浓缩方法分别是TGBE洗液-PEG沉淀组合、TGBE洗液-超滤组合、Trallk洗液-PEG沉淀组合和Trallk洗液-超滤组合。草莓和生菜中NoVs GII的检测限可达103基因拷贝数/10g,而葡萄和洋葱中NoVs GII的检测限为10~4基因拷贝数/10g。洗脱-浓缩法和直接RNA提取法回收蛋糕和午餐肉中MNV-1后的效果显示,前者没有回收到MNV-1,后者却成功回收到MNV-1,但是NoVs GII的检测限高于其他种类食品,分别为10~6基因拷贝数/2g和10~4基因拷贝数/2g。本研究建立了新鲜果蔬食品和蛋白脂肪类食品中NoVs GII的检测方法,从而优化和完善了我国食品中NoVs检测体系。 展开更多
关键词 诺如病毒(NoVs) 新鲜果蔬食品 蛋白脂肪类食品 富集方法
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轮状病毒感染患者外周血单个核细胞的转录组学分析 被引量:3
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作者 李伯阳 赵艳玲 +7 位作者 田玉玲 李慧莹 章青 李丹地 孙利伟 庞立丽 裴银辉 段招军 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期139-148,共10页
轮状病毒(Rotavirus,RV)是引起急性肠胃炎的主要病原体,分析RV感染患者的人外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)有利于探讨人PBMC在清除RV中的作用。为此,... 轮状病毒(Rotavirus,RV)是引起急性肠胃炎的主要病原体,分析RV感染患者的人外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)有利于探讨人PBMC在清除RV中的作用。为此,本研究采集2019年2月-2019年6月长春儿童医院中RV感染患者和健康儿童血液,分离PBMC,通过转录组测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术比较RV感染患者与健康儿童之间的RNA表达图谱,借助基因本体论(Gene Ontology,GO)数据库功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)、Reactome通路富集分析DEGs,使用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,qPCR)技术进行验证。结果显示,与健康对照组相比,RV感染轻症患者PBMC中有1619个DEGs;重症患者PBMC中有2816个DEGs,主要与干扰素(Interferon,IFN)反应、中性粒细胞、溶酶体、核小体、染色质等相关。qPCR验证轻症患者干扰素刺激基因(IFN-stimulated genes,ISGs)15表达上调,白介素(Interleukin,IL)1β表达下调;重症患者IL15、ISG15表达上调,IL1β表达下调,与转录组结果相一致。本研究提示,RV感染可能激活人I型和II型IFNs反应抵御病毒感染,但也会抑制溶酶体相关基因,对细胞自噬过程产生影响。 展开更多
关键词 轮状病毒(RV) 外周血单个核细胞(PBMC) RNA-SEQ 差异表达基因(DEGs) 免疫反应
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山东省嘉祥县鼠类肠道病毒组分析 被引量:2
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作者 李利利 刘蒙蒙 +3 位作者 王志强 林琳 徐亚陇 段招军 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期332-340,共9页
鼠类是重要的病毒储存库和多种病毒的自然宿主,是对人类病毒传播极具威胁的野生动物之一,因此对鼠类携带病毒进行研究并挖掘其携带新病毒对于病毒病的防治具有重要意义。本研究于2016年在山东省嘉祥县采集99只褐家鼠、仓鼠和黑线姬鼠肠... 鼠类是重要的病毒储存库和多种病毒的自然宿主,是对人类病毒传播极具威胁的野生动物之一,因此对鼠类携带病毒进行研究并挖掘其携带新病毒对于病毒病的防治具有重要意义。本研究于2016年在山东省嘉祥县采集99只褐家鼠、仓鼠和黑线姬鼠肠道内容物,通过高通量测序对其病毒组成进行研究。分析结果显示,采集的鼠类样本携带病毒主要包括冠状病毒科、呼肠孤病毒科、星状病毒科、小RNA病毒科、小双节病毒科、圆环病毒科、细小病毒科等。挑选可能与疾病相关的病毒进行进一步的序列分析和进化分析。分析结果显示,本研究中发现的冠状病毒为甲型冠状病毒属,与中国浙江发现的Lucheng-19病毒株和英国UKRn3病毒株具有共同祖先;本研究还发现包括Rosavirus、Rabovirus和Kobuvirus三个种在内的6株小RNA病毒科病毒,其中Rabovirus包含4株序列差异较大的病毒株,表明小RNA病毒在鼠类中具有丰富的基因多样性。研究发现该地区鼠类中同时流行多株星状病毒,表明极其丰富的基因多样性,系统发育分析显示,其中1株与猪的星状病毒4型聚在一起,提示可能的跨种传播。此外,样本中发现一株G3P[3]型A组轮状病毒,其VP4和VP7基因与猴的病毒株具有90%左右核苷酸同源性,而其余片段与鼠类的片段同源性最高,说明该病毒株可能是一株猴-鼠重配病毒株。本研究的鼠类病毒组数据为我国提供更丰富的本底资料,为我国应对相关的新发传染病提供了基础数据支持。 展开更多
关键词 病毒组 啮齿类 跨种传播 基因多样性 新病毒
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热力及紫外线对轮状病毒的消毒作用分析 被引量:2
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作者 李伯阳 李慧莹 +7 位作者 章青 王萌璇 孙晓曼 孔翔羽 王宏 李丹地 庞立丽 裴银辉 《国际病毒学杂志》 2021年第2期108-110,共3页
目的检验热力及紫外线(ultraviolet,UV)辐照对轮状病毒(rotavirus,RV)的消毒效果,为环境消毒RV提供技术支撑。方法通过计算半数组织培养感染剂量(median tissue culture infective dose,TCID50)检测在热力及紫外线处理后RV的滴度变化,... 目的检验热力及紫外线(ultraviolet,UV)辐照对轮状病毒(rotavirus,RV)的消毒效果,为环境消毒RV提供技术支撑。方法通过计算半数组织培养感染剂量(median tissue culture infective dose,TCID50)检测在热力及紫外线处理后RV的滴度变化,判断消毒效果。结果RV在37℃下24 h内病毒活性无明显变化。在56℃及以上温度下对RV作用10 min即可达到消毒效果。在距离紫外光源15 cm、30 cm处辐射7 min均可对RV产生消毒作用,分别辐射10 min、15 min可达灭活效果。在距离紫外光源1 m处辐射30 min或距离紫外光源2 m处辐射60 min以上均可以达到消毒作用。结论通过56℃及以上温度、近距离UV辐射可对RV进行有效消毒,但距离UV光源较远时则需更长时间的辐射达到消毒作用,为消毒和灭活RV提供了参考方法。 展开更多
关键词 轮状病毒 物理消毒 紫外线 热力
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热力及紫外线对鼠诺如病毒的消毒作用分析 被引量:1
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作者 李伯阳 李慧莹 +4 位作者 章青 孔翔羽 庞立丽 裴银辉 段招军 《国际病毒学杂志》 2020年第6期466-468,共3页
目的检验热力及紫外线对鼠诺如病毒(murine norovirus,MNV)的消毒效果,完善预防人诺如病毒(human norovirus,HuNV)感染的消毒措施。方法通过半数组织培养感染剂量(median tissue culture infective dose,TCID50)检测在不同温度、不同作... 目的检验热力及紫外线对鼠诺如病毒(murine norovirus,MNV)的消毒效果,完善预防人诺如病毒(human norovirus,HuNV)感染的消毒措施。方法通过半数组织培养感染剂量(median tissue culture infective dose,TCID50)检测在不同温度、不同作用时间等条件下热力及紫外线对MNV的消毒效果。结果MNV在4℃、25℃下可以稳定存在14 d,在37℃下可以维持5 d。在56℃下30 min、58℃下5 min、60℃下1 min作用MNV均可达到消毒效果。在距离紫外光源15 cm或30 cm处辐射7.5 min,以及在距离紫外光源1 m或2 m处辐射60 min,均可对MNV产生消毒效果。结论通过热力及紫外线均可对MNV进行有效消毒,为消毒和灭活HuNV提供了参考方法和依据。 展开更多
关键词 诺如病毒 物理消毒 紫外线 热力
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北京地区住院患儿WU多瘤病毒感染的流行病学研究 被引量:1
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作者 王超 麻粉莲 +4 位作者 高寒春 姚立红 王浩 魏田力 郑丽舒 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期64-70,共7页
自2007年Gaynor A M等人通过高通量测序在肺炎患儿呼吸道样本中发现了WU多瘤病毒(Washington University polyomavirus,WUPyV)以来,WUPyV在世界各地被广泛检出。为了解北京地区急性呼吸道感染住院儿童中WUPyV感染情况及其临床特征,收集... 自2007年Gaynor A M等人通过高通量测序在肺炎患儿呼吸道样本中发现了WU多瘤病毒(Washington University polyomavirus,WUPyV)以来,WUPyV在世界各地被广泛检出。为了解北京地区急性呼吸道感染住院儿童中WUPyV感染情况及其临床特征,收集北京地区2017年4月至2018年3月共1 276份呼吸道感染住院患儿的鼻咽抽吸物样本,使用real time PCR方法对样本进行WUPyV检测,同时对WUPyV阳性样本进行17种常见呼吸道病毒筛查。共检出WUPyV阳性样本76份(5.96%,76/1 276),4岁以下儿童居多(92.11%,70/76);WUPyV感染全年可见,无显著季节性;多伴随其他呼吸道病毒混合感染(60.53%,46/76),最常见混合感染为鼻病毒和A型流感病毒;WUPyV单一感染者与混合感染者病毒载量无显著性差异,临床诊断和表现基本一致;WUPyV感染患儿的常见诊断为支气管炎(68.42%,52/76)和肺炎(30.26%,23/76);临床症状主要表现为高热、咳嗽、咳痰。研究结果提示WUPyV是北京地区急性呼吸道感染住院患儿呼吸道样本中常见病毒之一,多见于4岁以下儿童。 展开更多
关键词 急性呼吸道感染(ARTI) WU多瘤病毒(WUPyV) 流行病学
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人诺如病毒NS6蛋白的表达、纯化及活性验证
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作者 袁越 新燕 +1 位作者 庞立丽 段招军 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2019年第6期646-649,共4页
目的 在大肠埃希菌中表达人诺如病毒(norovirus,NoV)NS6非结构蛋白,为了获得高纯度且具有酶活性的人诺如病毒NS6蛋白。方法 将NoV NS6蛋白基因克隆至原核表达载体pDE1中,转化至E.coli BL21感受态细胞中进行表达,产物经亲和及分子筛层析... 目的 在大肠埃希菌中表达人诺如病毒(norovirus,NoV)NS6非结构蛋白,为了获得高纯度且具有酶活性的人诺如病毒NS6蛋白。方法 将NoV NS6蛋白基因克隆至原核表达载体pDE1中,转化至E.coli BL21感受态细胞中进行表达,产物经亲和及分子筛层析纯化。NS6蛋白在37 ℃条件下,酶切融合蛋白15VP1-6P,检测其酶切活性。结果 NS6蛋白在大肠埃希菌中获得了稳定、高效表达,纯化后纯度可达95%以上。NS6蛋白能够切割含3C酶切位点的融合蛋白。结论 在大肠埃希菌中成功表达了具有酶切活性的NoV非结构蛋白NS6,为进一步研究NoV的致病机制奠定了基础。 展开更多
关键词 人诺如病毒 非结构蛋白NS6 亲和层析 分子筛 酶切
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