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我国利福平敏感结核杆菌rpoB基因利福平耐药决定区序列循证分析 被引量:11
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作者 孟繁荣 刘志辉 +2 位作者 谢贝 张言斌 谭守勇 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2013年第21期3601-3604,共4页
目的:了解我国利福平敏感结核杆菌rpoB基因利福平耐药决定区(rifampicin resistancedetermining region,RRDR)序列的多态性特征。方法:采用"rpoB AND Mycobacterium tuberculosis AND(China OR Hong Kong OR Macon OR Taiwan)"... 目的:了解我国利福平敏感结核杆菌rpoB基因利福平耐药决定区(rifampicin resistancedetermining region,RRDR)序列的多态性特征。方法:采用"rpoB AND Mycobacterium tuberculosis AND(China OR Hong Kong OR Macon OR Taiwan)"检索策略在Pubmed数据库中检索文献,循证分析Pubmed数据库中截止至2013年4月30日有关我国结核杆菌rpoB基因突变分子特征的研究文献。结果:36篇文献纳入研究,5 136株利福平敏感结核杆菌rpoB基因RRDR序列信息得以分析,38株(0.74%)rpoB基因RRDR序列呈现基因突变,涉及8个位点,分别为511(11株)、533(7株)、531(6株)、526(5株)、516(4株)、518(2株)、519(2株)、521(2株)等,其中1株涉及511/526双位点。结论:我国结核杆菌rpoB基因RRDR序列存在沉默突变现象,并非所有RRDR序列改变均与结核杆菌利福平药物敏感性有关。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 利福平 RPOB基因 利福平耐药决定区(RRDR) 沉默突变
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DLG3基因p.S434S同义变异致智力障碍家系分析及产前诊断1例 被引量:3
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作者 黄佳 朱宏杰 +6 位作者 何嘉欢 李茜 雷星星 王红丹 李聪敏 王悦 刘红彦 《中华围产医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期42-47,共6页
目的对1个智力障碍家系进行致病基因鉴定及产前诊断。方法家系3代17人,4例男性罹患智力障碍,2019年10月先证者之姐于孕8周时就诊于河南省人民医院要求遗传咨询。签署知情同意书后,采集家系成员外周血,采用全外显子组测序分析先证者(Ⅱ-9... 目的对1个智力障碍家系进行致病基因鉴定及产前诊断。方法家系3代17人,4例男性罹患智力障碍,2019年10月先证者之姐于孕8周时就诊于河南省人民医院要求遗传咨询。签署知情同意书后,采集家系成员外周血,采用全外显子组测序分析先证者(Ⅱ-9,男)及父母基因编码序列,筛选候选致病变异,运用Sanger测序进行候选变异与表型共分离分析。采用同源重组构建候选变异表达载体,进行体外剪接实验,应用逆转录聚合酶链反应、TA克隆和Sanger测序分析候选致病变异对剪接的影响。明确智力障碍的遗传学病因后,采用goldeneyeTM20A基因分型系统和Sanger测序为先证者之姐(Ⅱ-7)进行产前诊断。结果全外显子组测序结果显示先证者携带DLG3基因c.1302G>A(p.S434S)半合子同义变异,该变异与家系内患者表型共分离,先证者之母(Ⅰ-1)为该变异杂合携带者。体外剪接实验结果显示c.1302G>A变异明显影响RNA的正常剪接,88.24%的转录本剪接异常,导致阅读框移码,蛋白功能受损。产前诊断胎儿(Ⅲ-7)羊水未检测到该变异,男胎活产,现1岁6月龄,精神行为发育未见异常,继续随访中。结论DLG3基因c.1302G>A同义变异是导致该家系X连锁智力障碍的原因。 展开更多
关键词 智力障碍 核蛋白质类 转录因子 沉默变异 全外显子组测序 产前诊断
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人组织因子途径抑制因子在毕赤酵母中的表达与纯化 被引量:1
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作者 罗师平 宋丽萍 +3 位作者 余波 张海玲 刘兰霞 冷希岗 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期222-227,共6页
目的利用毕赤酵母高效表达人组织因子途径抑制因子(TFPI)。方法利用基因定点突变技术对人TFPIcDNA特定序列进行定点突变(同义突变)。将获得的突变体及野生型cDNA分别插入表达载体pPic9中,转化酵母宿主菌GS115和KM71,用0.5%的甲醇诱导重... 目的利用毕赤酵母高效表达人组织因子途径抑制因子(TFPI)。方法利用基因定点突变技术对人TFPIcDNA特定序列进行定点突变(同义突变)。将获得的突变体及野生型cDNA分别插入表达载体pPic9中,转化酵母宿主菌GS115和KM71,用0.5%的甲醇诱导重组蛋白表达。细胞培养上清经超滤浓缩后,依次用DEAE-sepharose Fast Flow、Heparin-sepharose CL6B及Sephadex G-75柱层析分离纯化得到重组蛋白,分别采用凝胶扫描成像定量分析和底物显色法测定重组蛋白的表达量和活性。结果凝胶扫描成像定量分析显示,同义突变体的表达量(1mg/L)显著高于天然型(0.1mg/L)。活性测定表明GS115重组菌在诱导表达12h后即可于培养上清中检测到TFPI活性,36h达峰值;而KM71重组菌诱导表达24h后才开始于培养上清中检测到TFPI活性,72h达峰值。两个菌株中突变体mTFPI-pPic9转化子的表达量均显著高于TFPI-pPic9转化子。重组蛋白相对分子质量约为42000。结论对TFPI-cDNA特定序列进行同义突变后能显著提高重组蛋白在毕赤酵母细胞中的表达,且显著高于在酿酒酵母和昆虫细胞的表达;重组蛋白具有良好的生物活性。因此,利用毕赤酵母表达TFPI是一种较好的选择。 展开更多
关键词 组织因子途径抑制因子 毕赤酵母 同义突变
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Floral Homeostasis Breakdown in Endangered Plant <i>Valeriana jatamansi</i>Jones (Valerianaceae) in North Eastern Himalayan Region 被引量:1
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作者 Soumendra Chakraborty Dhiman Mukherjee Sibdas Baskey 《American Journal of Plant Sciences》 2015年第19期3119-3138,共20页
An inhabitant of north western Himalayan region and a gynodioceious plant having a lot of medicinal properties, Valeriana jatamansi Jones (Valerianaceae) is an enlisted endangered plant in the world. It was introduced... An inhabitant of north western Himalayan region and a gynodioceious plant having a lot of medicinal properties, Valeriana jatamansi Jones (Valerianaceae) is an enlisted endangered plant in the world. It was introduced in the research station of North Bengal Agricultural University (27.06&degN 88.47&degE) situated in north eastern Himalayan region of Darjeeling district in the state of West Bengal from Sikkim Sangtok (27&deg25'N 88&deg31'E) of north Sikkim area in India for the purpose of conservation. As we noticed some irregular development of floral organs, we investigated some pertinent questions regarding ecological aberrations found in plants. We found plants introduced in north eastern Himalayan region changed their homology of number flower petals and position of stamens seen naturally in north western Himalayan region as per the reports. Was there any genetic or extreme environmental stress condition caused a sudden change in floral structure as it is generally known as a rare phenomenon and frequently not seen? What were the correlations of different floral parts and fitness of population in different morphotypes? We predicted possible outcomes of seed setting by univariate regression models in a particular environment in addition to this investigation. We proposed three models of heterozygousity for answering the reasons of unstable floral form from a general known floral form, where silent mutations help the plants to survive in adverse conditions in spite of deformed or variable formed of floral morphology. 展开更多
关键词 FLORAL HOMEOSTASIS Deformed Flower Morphology Conservation ENDANGERED Medicinal Plant Fitness of Population silent mutation
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PAH基因外显子7上一个中性突变的鉴定
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作者 马继红 黄尚志 +2 位作者 李少英 李月秋 罗佳滨 《黑龙江医药科学》 1997年第5期8-9,共2页
应用单链构型多态(Single strand conformation polymorphism,SSCP)分析技术检测了苯丙酮尿症患者的苯丙氨酸羟化酶基因外显子7,其中一例样品含突变泳带,经直接测序结果发现在密码子245上有一个碱基替换,由 G—A,但氨基酸未发生改变,为... 应用单链构型多态(Single strand conformation polymorphism,SSCP)分析技术检测了苯丙酮尿症患者的苯丙氨酸羟化酶基因外显子7,其中一例样品含突变泳带,经直接测序结果发现在密码子245上有一个碱基替换,由 G—A,但氨基酸未发生改变,为一例中性突变。 展开更多
关键词 苯丙酮尿症 苯丙氨酸羟化酶 中性突变
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A NEW SILENT MUTATION FOUND IN THE CHINESE PAH LOCUS AND ITS ROLE IN THE PRENATAL DIAGNOSIS OF PHENYLKETONURIA
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作者 黄淑帧 周霞娣 +2 位作者 任兆瑞 曾溢滔 胡流清 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 1991年第5期606-610,共5页
A silent mutation or sequence polymorphism, A to T substitution at codon 399 in exon11 of the PAH gene from a Chinese PKU patient, was found by sequence analysis. The fre-quencies of this new mutation in normal and ab... A silent mutation or sequence polymorphism, A to T substitution at codon 399 in exon11 of the PAH gene from a Chinese PKU patient, was found by sequence analysis. The fre-quencies of this new mutation in normal and abnormal (PKU) genes were 0.005 and 0.09,respectively, based on the analyses of 100 normal individuals and 39 PKU patients usingDNA amplification with polymerase chain reaction (PCR) and oligonucleotide hybridizationmethods. This silent mutation can be used as a "genetic marker" for PKU prenatal diagno-sis. Recently, a fetus at risk for PKU, who could not be completely predicted by RFLPslinkage analysis, was prenatally diagnosed with this genetic marker. 展开更多
关键词 PHENYLKETONURIA phenylalanine HYDROXYLASE (PAH) DNA sequence polymorphism prenatal diagnosis silent mutation polymerase chain reaction (PCR) allele-specific oligonucleotide (ASO) probe CHINESE
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不同栖息环境的两种啮齿动物Vkorc1基因多态性
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作者 杨新根 王艳龙 +5 位作者 邹波 常文英 侯玉 赵悠悠 王庭林 张健旭 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期687-697,共11页
维生素K环氧化物还原酶复合物亚基1基因(Vkorc1)的变异与啮齿动物对抗凝血灭鼠剂的抗药性密切相关。为掌握Vkorc1基因变异在野栖类和家栖类啮齿动物中的流行情况,从山西省13个县(市、区)的农田和14个县(市、区)的养殖场采样,检测长尾仓... 维生素K环氧化物还原酶复合物亚基1基因(Vkorc1)的变异与啮齿动物对抗凝血灭鼠剂的抗药性密切相关。为掌握Vkorc1基因变异在野栖类和家栖类啮齿动物中的流行情况,从山西省13个县(市、区)的农田和14个县(市、区)的养殖场采样,检测长尾仓鼠(Cricetulus longicaudatus)和黄胸鼠(Rattus tanezumi) Vkorc1基因编码区的变异位点及携带不同变异位点的个体的分布情况。结果显示,长尾仓鼠在13个采样地均有捕获,整体占野栖类啮齿动物的23.29%;黄胸鼠分布于8个采样地,整体占家栖类啮齿动物的68.63%。在长尾仓鼠样本(n=105)中检测到6个沉默突变位点和5个错义突变位点,其中,沉默突变C438T (His146His)的变异率最高,为67.62%;共有17只长尾仓鼠样本存在错义突变位点。黄胸鼠样本(n=70)中存在6个沉默突变位点和1个错义突变位点,其中,最常见的沉默突变位点A321C (Ile107Ile)和T411C (Thr137Thr)的变异率均达到18.57%;8只黄胸鼠样本存在与其抗药性相关的A416G (Tyr139Cys)错义突变,其中7只来源于太原市小店区(XID),变异率为35.00%。本研究表明在家居和自然环境中均存在Vkorc1基因的变异,并在太原市小店区检测到黄胸鼠抗性种群的存在,需加强对此种群的监测。 展开更多
关键词 长尾仓鼠 黄胸鼠 Vkorc1基因 抗药性 沉默突变 错义突变
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一种变异啮合机制的新型齿形链的设计方法和试验研究 被引量:7
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作者 付振明 金玉谟 《机械设计》 CSCD 北大核心 2010年第1期22-25,共4页
提出一种变异啮合机制的新型齿形链的设计方法,并进行了试验研究。该设计方法阐述了新型齿形链、链轮、链轮滚刀的啮合设计和齿形链节距、边心距的求解。运用实例对新型齿形链和链轮的主要技术参数进行了计算。试验结果表明该新型齿形... 提出一种变异啮合机制的新型齿形链的设计方法,并进行了试验研究。该设计方法阐述了新型齿形链、链轮、链轮滚刀的啮合设计和齿形链节距、边心距的求解。运用实例对新型齿形链和链轮的主要技术参数进行了计算。试验结果表明该新型齿形链的设计方法是科学的、切实可行的,其耐磨性能明显优于普通外啮合齿形链。该设计方法的应用可以从根本上提高齿形链的高速传动性能。 展开更多
关键词 新型齿形链 变异啮合机制 设计方法 磨损试验
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血小板受体糖蛋白Ⅲa基因与心肌梗塞关系的研究 被引量:2
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作者 陆林 于金德 +6 位作者 乐玮 陶蓉 尤蓓 何汝敏 蔡煦 朱鼎良 龚兰生 《中华心血管病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期111-112,共2页
目的探讨血小板受体糖蛋白(GPIIa)基因变异与心肌梗塞(MI)发病的关系。方法运用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对40例MI患者和相应数量健康人作对照行GPIIa基因全部外显子筛查。同时,以RFLP和ASO技术检... 目的探讨血小板受体糖蛋白(GPIIa)基因变异与心肌梗塞(MI)发病的关系。方法运用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对40例MI患者和相应数量健康人作对照行GPIIa基因全部外显子筛查。同时,以RFLP和ASO技术检测82例MI和68例健康人对照的GPIIa基因PlA多态性,并与50例美国健康白种人比较。结果发现GPIIa基因外显子5中存在核苷酸静止突变;150例中国人的GPIIaPIA多态基因型均为PlA1/PlA1,与美国白种人比较,差异有显著性。结论表明中国人群的血小板受体GPIIa基因与MI发病无相关性。 展开更多
关键词 心肌梗塞 血小板受体 糖蛋白 基因变异
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SIRT1基因启动子区rs3758391位点突变与不同分级老年高血压易感性及疗效关系
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作者 徐炜棉 杨凯瑞 +1 位作者 李宁 王国峰 《蚌埠医学院学报》 CAS 2023年第11期1537-1540,共4页
目的:探讨沉默信息调节因子1(SIRT1)基因启动子区rs3758391位点突变与不同分级老年高血压易感性的关系以及基因型与应用硝苯地平治疗效果的关系。方法:选取老年高血压病人220例作为观察组,同期健康体检者185名作为对照组。采用TaqMan法... 目的:探讨沉默信息调节因子1(SIRT1)基因启动子区rs3758391位点突变与不同分级老年高血压易感性的关系以及基因型与应用硝苯地平治疗效果的关系。方法:选取老年高血压病人220例作为观察组,同期健康体检者185名作为对照组。采用TaqMan法检测SIRT1基因rs3758391位点多态性,分析SIRT1基因多态性与老年原发性高血压的关系。观察组病人接受硝苯地平治疗,比较不同基因型病人治疗前后舒张压(DBP)、收缩压(SBP),分析基因型对疗效的预测价值。结果:SIRT1基因rs3758391位点存在T、C 2种等位基因,观察组和对照组基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义(P<0.01),观察组不同高血压分级病人基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义(P<0.01)。观察组1~3级高血压病人经硝苯地平治疗后,SBP、DBP均较治疗前明显降低(P<0.01),且TT基因型病人治疗后SBP和DBP均低于CT、CC基因型(P<0.05~P<0.01)。220例病人中控制不良者34例,控制良好者186例,TT型病人的控制良好率高于CT+CC型病人(P<0.05)。结论:SIRT1基因启动子区rs3758391位点突变与不同分级老年高血压易感性以及血压控制效果密切相关,其中含有C等位基因的病人高血压分级较高,血压控制效果较差,可考虑纳入SIRT1作为高血压疗效评估标志物。 展开更多
关键词 高血压 沉默信息调节因子1 位点突变 易感性
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大肠埃希菌及肺炎克雷伯菌超广谱β-内酰胺酶基因的核苷酸序列测定及分子进化研究
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作者 陈炫 吕晓菊 +2 位作者 范昕建 雷秉钧 张再伟 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期470-472,495,共4页
目的 调查四川大学华西医院分离的产超产谱β-内酰胺酶 (ESBL s)肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌的TEM型及 SHV型 ESBL s亚型 ,并探讨其分子进化规律。方法 对用 PCR法扩增的产 ESBL s大肠埃希菌及肺炎克雷伯菌的 TEM型及 SHV型 ESBL s基因... 目的 调查四川大学华西医院分离的产超产谱β-内酰胺酶 (ESBL s)肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌的TEM型及 SHV型 ESBL s亚型 ,并探讨其分子进化规律。方法 对用 PCR法扩增的产 ESBL s大肠埃希菌及肺炎克雷伯菌的 TEM型及 SHV型 ESBL s基因进行核苷酸序列测定 ,通过网上相似性检索确定其编码的酶的亚型 ,并利用生物信息学的方法探讨 ESBL s分子进化的规律。结果 检出的 ESBL s亚型为 SHV- 2和 TEM- 1 9。本研究检出的 1 0个 bla SHV- 2 沉默突变位点分布彼此相同 ,2个 bla TEM - 1 9沉默突变位点分布也彼此相同。与国外其它地方检出的 bla SHV- 2 比较 ,沉默突变位点分布不同。本研究检出的 bla TEM- 1 9与 bla TEM- 1 沉默突变位点分布相同。结论 本研究检出的 ESBL s亚型以 SHV- 2为主。检出的 bla SHV- 2 及 bla TEM- 1 9各自由同一可转座突变体传播而来。世界各地流行的SHV- 2与本研究检出的 SHV- 2存在趋同进化。本研究检出的 bla TEM- 1 9可能直接由本研究检出的可转座 bla TEM- 1 单点突变而来。 展开更多
关键词 超广谱Β-内酰胺酶 生物信息学 沉默突变 分子进化
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