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气相α-丙氨酸二价锌配合物手性转变的密度泛函理论研究 被引量:13
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作者 车立新 张雪娇 +5 位作者 刘芳 徐锐英 马宏源 潘宇 佟华 王佐成 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期966-976,I0002,共12页
采用密度泛函理论的M06和MN15方法,研究了气相α-丙氨酸二价锌(α-Ala·Zn2+)配合物的2种稳定构型(两性的A1和中性的A2)的手性转变.研究发现,A1可通过以氧为桥、氮为桥、锌为桥、氧与氮联合为桥以及氧与甲基碳联合为桥等多种途径进... 采用密度泛函理论的M06和MN15方法,研究了气相α-丙氨酸二价锌(α-Ala·Zn2+)配合物的2种稳定构型(两性的A1和中性的A2)的手性转变.研究发现,A1可通过以氧为桥、氮为桥、锌为桥、氧与氮联合为桥以及氧与甲基碳联合为桥等多种途径进行氢迁移,实现手性转变;A2可通过以氧为桥进行氢迁移,实现手性转变,还可以打开螯合环向A1异构,按A1手性转变的多种途径实现手性转变.势能面研究表明,A1以锌为桥进行氢迁移的手性转变反应具有优势,活化自由能垒是197.2 kJ·mol^-1,A2打开螯合环向A1异构后,再以锌为桥进行氢迁移的手性转变反应具有优势,活化自由能垒是228.7 kJ·mol^-1.结果表明:气相丙氨酸锌可以很好地保持其手性特征. 展开更多
关键词 密度泛函理论 丙氨酸 锌配合物 手性转变 自洽反应场理论 过渡态 能垒
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水液相下两性α-丙氨酸Mg^2+配合物旋光异构的理论研究 被引量:9
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作者 钱研 张雪娇 +4 位作者 刘芳 陈静思 丛建民 马宏源 王佐成 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期769-778,共10页
采用密度泛函理论的M06-2X方法结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性α-Ala(丙氨酸)与Mg^2+配合物的旋光异构.研究发现:α-Ala·Mg^2+的旋光异构反应有3个通道a、b和c,a是质子分别以羰基氧和氨基氮为桥迁移;b是质子... 采用密度泛函理论的M06-2X方法结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性α-Ala(丙氨酸)与Mg^2+配合物的旋光异构.研究发现:α-Ala·Mg^2+的旋光异构反应有3个通道a、b和c,a是质子分别以羰基氧和氨基氮为桥迁移;b是质子只以羰基氧为桥迁移;c是质子从质子化氨基迁移到羰基氧后,再以氨基氮为桥迁移.势能面计算表明:隐性水溶剂效应作用下α-Ala·Mg^2+旋光异构的c通道具有优势,决速步能垒是218.1kJ·mol^-1,a和b通道处于劣势,具有共同的决速步能垒297.1kJ·mol^-1.水分子(簇)的作用使c通道的决速步能垒降到143.0kJ·mol^-1,a和b通道的决速步能垒降到148.7kJ·mol^-1.结果表明:水液相环境下α-Ala·Mg^2+可以较好地保持其手性特征,α-丙氨酸二价镁盐用于生命体镁和丙氨酸同补具有很好的安全性. 展开更多
关键词 丙氨酸 MG^2+ 旋光异构 密度泛函理论 自洽反应场理论 过渡态 能垒
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水液相环境下两性α-丙氨酸Fe(Ⅱ)配合物的构型反转 被引量:8
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作者 刘军 姜春旭 +4 位作者 胡燠铭 黄丽娟 高峰 马宏源 王佐成 《武汉大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期375-385,共11页
采用密度泛函理论的M06和MN15方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性α-丙氨酸与二价铁离子配合物(A·Fe)的构型反转。考察了a、b、c和d共4个反应通道,分别是:α-氢质子以羰基O为桥迁移;α-氢质子迁移到羰基O后,... 采用密度泛函理论的M06和MN15方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性α-丙氨酸与二价铁离子配合物(A·Fe)的构型反转。考察了a、b、c和d共4个反应通道,分别是:α-氢质子以羰基O为桥迁移;α-氢质子迁移到羰基O后,H质子再从氨基N向α-碳迁移;α-氢质子以氨基N为桥迁移;氢负离子以二价铁离子为桥迁移。隐性溶剂效应下d通道最具优势,决速步骤能垒为194.7 kJ/mol;c通道为第二优势通道,决速步骤能垒为222.2 kJ/mol;a和b为劣势通道,决速步骤能垒为262.7 kJ/mol。显性溶剂效应下c通道最具优势,决速步骤能垒降至145.1 kJ/mol;a和b为第二优势通道,决速步骤能垒降至160.4 kJ/mol;d通道为劣势通道,在此通道A·Fe无法消旋。结果表明:水液相环境下A·Fe可以很好地保持其旋光性,α-丙氨酸二价铁盐用于生命体补充二价铁和丙氨酸具有很高的安全性。 展开更多
关键词 Α-丙氨酸 二价铁离子 密度泛函理论 自洽反应场理论 构型反转
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水液相下羟基负离子催化两性赖氨酸分子手性反转的理论研究 被引量:3
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作者 李斌 刘芳 +4 位作者 张雪娇 王涵 范艳杰 姜春旭 王佐成 《中山大学学报(自然科学版)(中英文)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期73-82,共10页
采用密度泛函理论的M06-2X和MN15方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下羟基负离子催化两性赖氨酸分子的手性反转。反应过程研究发现:经过羟基负离子水分子簇抽取α-H质子和碳负离子的α-C抽取水分子簇的H质子过程,赖氨... 采用密度泛函理论的M06-2X和MN15方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下羟基负离子催化两性赖氨酸分子的手性反转。反应过程研究发现:经过羟基负离子水分子簇抽取α-H质子和碳负离子的α-C抽取水分子簇的H质子过程,赖氨酸分子实现手性反转。势能面计算表明:羟基负离子水分子簇与α-H和羰基O氢键作用,赖氨酸分子实现手性反转的决速步能垒为51.1~59.9 kJ/mol;羟基负离子水分子簇与α-H和氨基N氢键作用,赖氨酸分子实现手性反转的决速步能垒为52.8~58.0 kJ/mol,均远低于水液相下两性赖氨酸分子手性反转的能垒110.0 kJ/mol。结果表明,水液相下羟基负离子对赖氨酸的手性反转有催化作用,碱性环境不利于健康。 展开更多
关键词 赖氨酸 手性反转 密度泛函理论 自洽反应场理论 过渡态 能垒
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水液相下两性α-丙氨酸Ca(Ⅱ)配合物旋光异构的理论研究 被引量:6
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作者 刘芳 张雪娇 +3 位作者 刘军 闫红彦 姜春旭 王佐成 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期358-368,共11页
采用密度泛函理论的M06-2X方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性α-丙氨酸与二价钙配合物(S-Ala·Ca^(2+))的旋光异构.研究发现:S-Ala·Ca^(2+)的旋光异构有a、b和c 3个通道,a是α-氢迁移到羰基氧后,质子... 采用密度泛函理论的M06-2X方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性α-丙氨酸与二价钙配合物(S-Ala·Ca^(2+))的旋光异构.研究发现:S-Ala·Ca^(2+)的旋光异构有a、b和c 3个通道,a是α-氢迁移到羰基氧后,质子再从质子化氨基迁移到α-碳;b是质子只以羰基氧为桥迁移;c是质子从质子化氨基迁移到羰基氧后,再以氨基氮为桥迁移.势能面计算表明,隐性溶剂效应下,c通道具有优势,决速步内禀能垒是232.8 kJ·mol^(−1);a和b通道是劣势通道,决速步内禀能垒均是268.6 kJ·mol^(−1).显性溶剂效应下,a和b通道略具优势,决速步内禀能垒在141.3~145.0 kJ·mol^(−1)之间;c通道略具劣势,决速步内禀能垒在153.1~161.0 kJ·mol^(−1)之间.结果表明,水液相下丙氨酸钙配合物很难消旋,用于生命体补充钙和丙氨酸具有较好的安全性. 展开更多
关键词 Α-丙氨酸 钙离子 旋光异构 密度泛函理论 自洽反应场理论 过渡态 能垒
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水液相环境下两性脯氨酸分子旋光异构的理论研究 被引量:5
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作者 刘军 潘宇 +5 位作者 李加欢 赵祥云 戚铭 刘新越 刘芳 王佐成 《武汉大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期572-582,共11页
采用密度泛函理论的M06-2X方法结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究水液相下两性脯氨酸(Pro)分子的旋光异构,考察了Pro以氨基氮和羰基氧为氢迁移桥梁的旋光异构反应通道。势能面计算表明:Pro异构成中性亚氨基酸,羧羟基再旋转后,以氨... 采用密度泛函理论的M06-2X方法结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究水液相下两性脯氨酸(Pro)分子的旋光异构,考察了Pro以氨基氮和羰基氧为氢迁移桥梁的旋光异构反应通道。势能面计算表明:Pro异构成中性亚氨基酸,羧羟基再旋转后,以氨基氮为氢迁移桥梁的反应通道最具优势,决速步的自由能垒是237.8 kJ·mol-1;Pro异构成中性亚氨基酸后,以氨基氮为氢迁移桥梁的反应通道是亚优势通道,决速步的自由能垒是245.9 kJ·mol-1;Pro直接以羰基氧为氢迁移桥梁的反应通道是季优势通道,决速步的自由能垒是250.6 kJ·mol-1;Pro异构成中性亚氨基酸,再以羰基氧为氢迁移桥梁的反应通道是劣势通道,决速步的自由能垒是306.0 kJ·mol-1。二聚水的催化使优势通道的决速步能垒降到101.9 kJ·mol-1。 展开更多
关键词 脯氨酸 旋光异构 密度泛函理论 自洽反应场理论 过渡态 能垒
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水液相下两性α-Ala与Na^(+)配合物旋光异构的理论研究 被引量:4
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作者 赵宇 刘芳 +4 位作者 柯卓锋 刘军 高峰 马宏源 王佐成 《中山大学学报(自然科学版)(中英文)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期141-151,共11页
采用密度泛函理论的M06-2X方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性S型α-丙氨酸与钠离子配合物(S-α-Ala·Na^(+))的旋光异构。研究发现:S-α-Ala·Na^(+)的旋光异构有a、b和c 3个通道,a通道是两性S-α-Ala&#... 采用密度泛函理论的M06-2X方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性S型α-丙氨酸与钠离子配合物(S-α-Ala·Na^(+))的旋光异构。研究发现:S-α-Ala·Na^(+)的旋光异构有a、b和c 3个通道,a通道是两性S-α-Ala·Na^(+)异构成中性S-α-Ala·Na^(+)后,质子以氨基氮为桥迁移;b通道是质子只以羰基氧为桥迁移;c通道是α-氢迁移到羰基氧后,质子再从质子化氨基迁移到α-碳。势能面计算表明:隐性溶剂效应下,a通道具有优势,决速步能垒是234.8 kJ·mol^(-1);b和c通道处于劣势,具有共同的决速步能垒均267.9 kJ·mol^(-1)。显性溶剂效应下,a通道变为劣势通道,决速步能垒为155.9~156.5 kJ·mol^(-1);b和c通道略具优势,决速步能垒为132.2~138.6 kJ·mol^(-1)。结果表明:水液相下丙氨酸钠配合物只能以极慢的速度消旋。 展开更多
关键词 Α-丙氨酸 钠离子 旋光异构 密度泛函理论 自洽反应场理论 过渡态 能垒
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水液相下两性α丙氨酸K+配合物旋光异构的理论研究 被引量:5
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作者 赵丽红 彭国强 +4 位作者 姜丰 郝成欣 刘芳 丛建民 王佐成 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期540-550,共11页
采用密度泛函理论的M06-2X方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性S型α丙氨酸与一价钾离子配合物(S-α-Ala·K^(+))的旋光异构.反应通道研究发现:S-α-Ala·K^(+)旋光异构反应有a、b和c 3个通道,a是质子只... 采用密度泛函理论的M06-2X方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性S型α丙氨酸与一价钾离子配合物(S-α-Ala·K^(+))的旋光异构.反应通道研究发现:S-α-Ala·K^(+)旋光异构反应有a、b和c 3个通道,a是质子只以羰基氧为桥迁移;b是α氢迁移到羰基氧后,质子再从质子化氨基向α碳迁移;c是质子从质子化氨基迁移到羰基氧后,再以氨基氮为桥迁移.势能面计算表明:隐性溶剂效应下,c通道具有优势,决速步能垒是241.7 kJ·mol^(-1);a和b通道为劣势通道,具有共同的决速步能垒261.3 kJ·mol^(-1).显性溶剂效应下,a、b和c 3个通道的决速步能垒基本相同,大约在136.6至142.0 kJ·mol^(-1)之间.结果表明:水液相下S-α-Ala·K^(+)的旋光异构反应进行的极其缓慢,生命体利用S-α-Ala·K^(+)同补K^(+)和丙氨酸具有较好的安全性. 展开更多
关键词 α丙氨酸 钾离子 旋光异构 密度泛函理论 自洽反应场理论 能垒
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丙氨酸Mg2+配合物的手性转变机理水分子(簇)的作用及水溶剂效应 被引量:13
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作者 张雪娇 刘芳 +4 位作者 吴梓昊 徐锐英 马宏源 杨晓翠 王佐成 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期156-168,共13页
采用密度泛函理论的M06方法结合自洽反应场理论的SMD模型方法对标题反应进行了研究。研究发现:具有分子内单氢键的两性离子丙氨酸(Ala1)与Mg2+二配位形成的螯合物S-A1最稳定,具有分子内双氢键的中性Ala2分子与Mg2+二配位形成的螯合物S-A... 采用密度泛函理论的M06方法结合自洽反应场理论的SMD模型方法对标题反应进行了研究。研究发现:具有分子内单氢键的两性离子丙氨酸(Ala1)与Mg2+二配位形成的螯合物S-A1最稳定,具有分子内双氢键的中性Ala2分子与Mg2+二配位形成的螯合物S-A2的稳定性次之。S-A1和S-A2的手性转变都有3个通道。势能面研究表明:气相环境下,S-A1和S-A2手性转变优势通道的反应活化能分别是297.5和266.5 kJ/mol;在水分子(簇)的作用下S-A1和S-A2手性转变优势通道的反应活化能分别是157.9及165.7 kJ/mol;水溶剂环境下丙氨酸Mg2+螯合物主要以两性离子形式存在,手性转变优势通道的反应活化能为157.5 kJ/mol。结果表明,丙氨酸Mg2+螯合物可以很好地保持其手性特征,便于保存,可以作为理想的补充丙氨酸及镁离子的药品或营养品。 展开更多
关键词 丙氨酸 镁离子 手性转变 密度泛函理论 过渡态 自洽反应场理论 能垒
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水液相环境脯氨酸Ca(Ⅱ)配合物旋光异构的密度泛函理论研究 被引量:11
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作者 孟雪飞 张雪娇 +5 位作者 刘芳 胡燠铭 陶思宇 黄煜纯 马宏源 王佐成 《武汉大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期467-477,共11页
采用基于密度泛函理论(DFT)的M06-2X和MN15方法结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相环境两性S-型脯氨酸(S-Pro)与Ca^(2+)配合物(S-Pro·Ca^(2+))的旋光异构。考察了S-Pro·Ca^(2+)在3个反应通道a、b和c的旋光异构过... 采用基于密度泛函理论(DFT)的M06-2X和MN15方法结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相环境两性S-型脯氨酸(S-Pro)与Ca^(2+)配合物(S-Pro·Ca^(2+))的旋光异构。考察了S-Pro·Ca^(2+)在3个反应通道a、b和c的旋光异构过程:a通道是以羰基氧为质子迁移媒介;b通道是α-C上的质子先迁移至羰基氧,然后氨基氮上的质子在纸面内向α-C迁移;c通道是以羰基氧和氨基氮为质子迁移媒介。势能面研究表明:隐性溶剂效应下c通道明显具有优势,决速步能垒为221.4 k J/mol;显性溶剂效应下c通道略具优势,决速步能垒降到131.2 k J/mol。结果表明,脯氨酸钙在水液相环境只能很少量地消旋,其用于生命体同补脯氨酸和钙离子具有较好的安全性。 展开更多
关键词 氨基酸金属配合物 密度泛函理论 自洽反应场理论 旋光异构 过渡态 能垒
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水液相下羟基自由基(水分子簇)诱导脯氨酸分子损伤的机理 被引量:9
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作者 罗香怡 高浩溟 +4 位作者 姜丰 刘军 范艳杰 姜春旭 王佐成 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期104-114,共11页
本工作采用密度泛函理论的M06-2X和MN15方法结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下羟基自由基(水分子簇)诱导的两性脯氨酸分子损伤。反应通道研究表明:Pro的损伤可以通过羟基自由基(水分子簇)抽取α-H原子和五元杂环上不同位... 本工作采用密度泛函理论的M06-2X和MN15方法结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下羟基自由基(水分子簇)诱导的两性脯氨酸分子损伤。反应通道研究表明:Pro的损伤可以通过羟基自由基(水分子簇)抽取α-H原子和五元杂环上不同位置的H原子实现。势能面计算表明:羟基自由基(水分子簇)抽取α-H的自由能垒在41.3至48.3 kJ·mol^(-1)之间,抽取五元杂环上不同位置的H的自由能垒在33.3至48.9 kJ·mol^(-1)之间。抽取五元杂环的与α-C邻位C上的H的损伤反应最具优势,自由能垒在33.3至36.5 kJ·mol^(-1)之间。损伤修复的最低自由能垒是126.9 kJ·mol^(-1)。结果表明,水液相下羟基自由基存在时脯氨酸分子很容易损伤,且损伤后很难修复。 展开更多
关键词 脯氨酸 羟基自由基 损伤 密度泛函理论 自洽反应场理论 过渡态 自由能垒
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水液相环境下α-丙氨酸二价锌配合物的手性转变机理 被引量:9
12
作者 苏丹 孙玉锋 +4 位作者 郝成欣 姜春旭 张雪娇 丛建民 王佐成 《中山大学学报(自然科学版)(中英文)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期50-59,共10页
采用密度泛函理论的M06和MN15方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性α-丙氨酸二价锌(α-Ala·Zn^(2+))配合物的手性转变反应。主要考察了3个反应通道a、b和c,a通道是α-H以羰基O为桥迁移,b通道是α-H以Zn为桥迁... 采用密度泛函理论的M06和MN15方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下两性α-丙氨酸二价锌(α-Ala·Zn^(2+))配合物的手性转变反应。主要考察了3个反应通道a、b和c,a通道是α-H以羰基O为桥迁移,b通道是α-H以Zn为桥迁移,c通道是α-H以氨基N为桥迁移。势能面研究表明,c通道的手性转变反应最具优势,决速步自由能垒是140.7 kJ·mol^(-1),来自α-H从α-C向氨基N迁移的过渡态;a通道的手性转变反应是第2优势通道,决速步自由能垒是159.9 kJ·mol^(-1),来自α-H从α-C向羰基O迁移的过渡态;b通道的手性转变反应为劣势通道,决速步自由能垒是194.2 kJ·mol^(-1),来自α-H从α-C向Zn迁移的过渡态。结果表明:水液相环境下的α-Ala·Zn^(2+)可以较好地保持手性特征。 展开更多
关键词 丙氨酸(α-alanine α-Ala) 锌离子 手性转变 密度泛函理论 自洽反应场理论 过渡态 能垒
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水液相下脯氨酸Cu^(2+)配合物手性反转的密度泛函理论研究 被引量:5
13
作者 孙士红 陈凤清 +3 位作者 高浩溟 王亚玲 姜春旭 王佐成 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期472-484,共13页
采用密度泛函理论的M06和MN15方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下脯氨酸二价铜(Pro·Cu^(2+))配合物的手性反转反应。研究发现:Pro·Cu^(2+)的手性反转可以在H质子利用水分子(簇)做媒介,以氨基N、羰基O和Cu... 采用密度泛函理论的M06和MN15方法,结合自洽反应场理论的SMD模型方法,研究了水液相下脯氨酸二价铜(Pro·Cu^(2+))配合物的手性反转反应。研究发现:Pro·Cu^(2+)的手性反转可以在H质子利用水分子(簇)做媒介,以氨基N、羰基O和Cu为桥梁迁移的反应通道实现。势能面计算表明:H质子以氨基N为桥迁移的反应通道最具优势,反应的吉布斯自由能垒是121.4kJ·mol^(-1)。结果表明,水液相下的Pro·Cu^(2+)分子只能极缓慢地旋光异构。 展开更多
关键词 脯氨酸 Cu^(2+) 密度泛函理论 自洽反应场理论 过渡态 手性反转 能垒
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水液相下羟基负离子(水分子簇)催化脯氨酸旋光异构的理论研究 被引量:1
14
作者 刘军 唐晓文 +4 位作者 潘宇 刘芳 张雪娇 马宏源 王佐成 《中山大学学报(自然科学版)(中英文)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期85-94,共10页
采用密度泛函理论的M06-2X和MN15方法与自洽反应场理论的SMD模型方法,研究水液相下羟基负离子水分子簇催化S-型两性脯氨酸分子(S-Pro)的旋光异构。首先考察了S-Pro异构成中性亚氨基酸后,羟基负离子(水分子簇)抽取α-H,脯氨酸-碳负离子... 采用密度泛函理论的M06-2X和MN15方法与自洽反应场理论的SMD模型方法,研究水液相下羟基负离子水分子簇催化S-型两性脯氨酸分子(S-Pro)的旋光异构。首先考察了S-Pro异构成中性亚氨基酸后,羟基负离子(水分子簇)抽取α-H,脯氨酸-碳负离子抽取水分子(簇)的质子,S-Pro旋光异构的反应通道;然后考察了羟基负离子(水分子簇)直接抽取S-Pro的α-H,脯氨酸-碳负离子抽取水分子(簇)的质子,以及S-Pro旋光异构的反应通道。势能面计算表明:S-Pro异构成中性亚氨基酸后,羟基负离子(水分子簇)抽α-H的通道最具优势,决速步的自由能垒为46.9~59.1 kJ·mol^(−1)。羟基负离子(水分子簇)直接抽两性S-Pro的α-H的反应通道是劣势通道,决速步的自由能垒为70.8 kJ·mol^(−1)。结果表明,碱性环境下脯氨酸的消旋反应会温和地进行。 展开更多
关键词 脯氨酸 羟基负离子 水分子簇 密度泛函理论 自洽反应场理论 旋光异构 过渡态 能垒
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