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实时荧光定量PCR分析中毛果杨内参基因的筛选和验证 被引量:49
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作者 苏晓娟 樊保国 +2 位作者 袁丽钗 崔秀娜 卢善发 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期507-518,共12页
实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术具有高灵敏性、高保真性和高特异性,被广泛应用于基因表达的分析。在数据处理过程中,选用稳定表达的基因作为内参基因对准确分析实验结果非常关键。以毛果杨(Populus trichocarpa)的不同组织以及锌胁迫下... 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术具有高灵敏性、高保真性和高特异性,被广泛应用于基因表达的分析。在数据处理过程中,选用稳定表达的基因作为内参基因对准确分析实验结果非常关键。以毛果杨(Populus trichocarpa)的不同组织以及锌胁迫下的组培苗为材料,使用荧光定量PCR方法分析了TUA8、TUB6、ubiquitin、GAPDH、actin、18S rRNA和EF1α7个看家基因的表达情况。通过geNorm、NormFinder和BestKeeper 3个程序的综合分析,发现actin、ubiquitin、EF1α和18S rRNA的稳定性较好,可用作毛果杨基因表达研究的内参基因;而TUB6在不同组织中稳定性最差;GAPDH在锌胁迫下的组织中稳定性最差,因此不适宜作为内参基因。毛果杨NAC基因的表达分析,进一步验证了上述结果。该研究对采用qRT-PCR方法分析毛果杨基因表达过程中内参基因的选择具有指导作用,同时对揭示NAC基因的功能也有一定的意义。 展开更多
关键词 NAC基因 毛果杨 实时定量PCR 内参基因 锌胁迫
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基于修正摩尔库伦模型的深基坑变形数值分析 被引量:36
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作者 胡建林 孙利成 +1 位作者 崔宏环 高鹏飞 《科学技术与工程》 北大核心 2021年第18期7717-7723,共7页
为了探究深基坑变形数值分析中模型参数的重要性,运用MIDAS-GTS/NX有限元分析软件,分别采用摩尔库伦模型(MC)、参考应力不变的修正摩尔库伦模型(MMC)以及参考应力随基坑深度变化的修正摩尔库伦模型(MMC),进行排桩支护变形和地表沉降的... 为了探究深基坑变形数值分析中模型参数的重要性,运用MIDAS-GTS/NX有限元分析软件,分别采用摩尔库伦模型(MC)、参考应力不变的修正摩尔库伦模型(MMC)以及参考应力随基坑深度变化的修正摩尔库伦模型(MMC),进行排桩支护变形和地表沉降的数值模拟,并与实际监测结果进行对比分析,结果表明:在地表沉降预测上,摩尔库伦模型(MC)预测沉降值与实测值相差较大,预测沉降影响距离是实测沉降影响距离的2倍左右;在排桩水平位移预测上,MC模型预测位移完全大于实测位移,且发生最大水平位移处排桩深度与实际深度不符;MMC模型预测值与实测值相差不大,且两者位移规律曲线较为吻合。因此不同参考应力下的MMC本构模型比单一参考应力下的MMC本构模型预测变形更加精确,故使用不同参考应力下的MMC本构模型进行基坑开挖变形预测更具参考价值。 展开更多
关键词 基坑变形 修正摩尔库伦模型 模量参数 参考应力
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修正摩尔库伦模型下的深基坑变形数值分析 被引量:28
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作者 胡建林 孙利成 +2 位作者 崔宏环 邵博源 王晟华 《辽宁工程技术大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2021年第2期134-140,共7页
为研究修正摩尔库伦模型及其参数对于模拟深基坑变形的影响,运用实验和有限元分析的方法,分析摩尔库伦和修正摩尔库伦模型在模拟深基坑排桩支护变形和地表沉降中的不同特点,通过与实际监测结果进行对比分析,得到了修正摩尔库伦模型对于... 为研究修正摩尔库伦模型及其参数对于模拟深基坑变形的影响,运用实验和有限元分析的方法,分析摩尔库伦和修正摩尔库伦模型在模拟深基坑排桩支护变形和地表沉降中的不同特点,通过与实际监测结果进行对比分析,得到了修正摩尔库伦模型对于模拟深基坑变形的适用性.研究结果表明:在地表沉降和排桩水平位移预测上,摩尔库伦模型预测沉降值与实测值相差较大;不同参考应力下的修正摩尔库伦模型预测值与实测值的位移规律曲线较为吻合.研究结论揭示了使用不同参考应力下的修正摩尔库伦本构模型进行基坑开挖变形预测更具参考价值. 展开更多
关键词 基坑变形 修正摩尔库伦模型 模量参数 参考应力 实况监测
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健康人群血清总胆红素和直接胆红素参考值范围的临床研究 被引量:21
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作者 宋明辉 孙浩 +5 位作者 周新民 邢桂英 李晓梅 崔征 杨志娜 田卫东 《国际检验医学杂志》 CAS 2011年第7期750-752,共3页
目的 研究建立排除血压、血脂高于正常参考值和胰岛素抵抗以及氧化应激状态的健康人群血清总胆红素(TBIL)和直接胆红素(DBIL)的正常参考值范围.方法 用矾酸盐法在日本奥林巴斯AU640全自动生化分析仪上测定本地区8 728例健康人血清T... 目的 研究建立排除血压、血脂高于正常参考值和胰岛素抵抗以及氧化应激状态的健康人群血清总胆红素(TBIL)和直接胆红素(DBIL)的正常参考值范围.方法 用矾酸盐法在日本奥林巴斯AU640全自动生化分析仪上测定本地区8 728例健康人血清TBIL和DBIL,采用SPSS 17.0统计软件,按年龄和性别分组进行统计学分析.结果 TBIL和 DBIL的正常参考值范围分别为:7.92~23.11、1.98~7.12 μmol/L;男女不同性别组的TBIL和DBIL检测值分别为:8.01~23.51、7.71~21.90,2.07~7.35、1.54~6.70 μmol/L范围.结论 胆红素有较强的抗氧化作用,胆红素处于低水平状态也具有重要的临床价值.因此,各地区建立健康人群的胆红素参考范围对于疾病的预防、诊断及治疗具有重要意义. 展开更多
关键词 胆红素 参考值 氧化性应激
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多重胁迫下玉米实时定量PCR内参基因的筛选与验证 被引量:19
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作者 姜婷 苏乔 安利佳 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1457-1464,共8页
实时定量PCR(qPCR)技术广泛应用于基因表达量的检测,为了保证其结果的准确性,选择合适的内参基因是必不可少的环节。本研究分析了11个玉米候选内参基因的稳定性,其中7个是常用内参基因(GAPDH、ACT、EF-1α、γ-TUB、18S rRNA、5S rRNA和... 实时定量PCR(qPCR)技术广泛应用于基因表达量的检测,为了保证其结果的准确性,选择合适的内参基因是必不可少的环节。本研究分析了11个玉米候选内参基因的稳定性,其中7个是常用内参基因(GAPDH、ACT、EF-1α、γ-TUB、18S rRNA、5S rRNA和U6 snRNA),4个是microRNA(zma-miR171a、zma-miR171b、zma-miR172和zma-miR159a/b)。通过计算11个基因在正常生长条件与干旱、盐和碱共胁迫条件下的循环阈值(Ct),输入软件geNorm、Norm Finder和Best Keeper中进行分析。结果表明,microRNA比其他候选内参基因稳定,其中zma-miR172和zma-miR171a最稳定,18S rRNA最不稳定。另外,选择zma-miR397a及其靶基因LAC4对候选内参基因进行验证,发现不合适的内参基因可能会导致错误的结果。 展开更多
关键词 玉米 内参基因 实时定量PCR 干旱胁迫 盐胁迫 碱胁迫
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黄秋葵实时荧光定量PCR内参基因的克隆与筛选评价 被引量:16
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作者 李永平 叶新如 +4 位作者 王彬 陈敏氡 刘建汀 朱海生 温庆放 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期60-71,共12页
为筛选黄秋葵实时荧光定量PCR的稳定内参基因,本研究以绿白1号为试验材料,根据黄秋葵RNA-seq数据库,筛选并验证获得18SrRNA、ACT、EF-1α、TUA、TUB、GAPDH等6个内参基因ORF序列;以黄秋葵不同组织、不同发育时期果实、不同发育时期叶片... 为筛选黄秋葵实时荧光定量PCR的稳定内参基因,本研究以绿白1号为试验材料,根据黄秋葵RNA-seq数据库,筛选并验证获得18SrRNA、ACT、EF-1α、TUA、TUB、GAPDH等6个内参基因ORF序列;以黄秋葵不同组织、不同发育时期果实、不同发育时期叶片和低温、高温、干旱胁迫处理的叶片为材料,利用实时荧光定量PCR技术分析测定基因表达量,并结合GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件评价6个内参基因的稳定性。结果表明,6个基因在不同组织、各发育阶段及不同胁迫下均有表达,但表达稳定性不尽相同,其中,EF-1α在黄秋葵果荚发育、高温胁迫下表达稳定性最好;18SrRNA在黄秋葵各组织、叶发育和干旱胁迫下表达稳定性最优;ACT在低温胁迫下表现最稳定。此外,在29个处理中,18SrRNA、EF-1α、ACT表达均较稳定,可以用于荧光定量表达分析。本研究结果为黄秋葵基因功能分析和调控机理研究提供了基础。 展开更多
关键词 黄秋葵 内参基因 胁迫 不同组织
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碘过量的危害及相关机制 被引量:15
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作者 冯艳妮 姚小梅 《天津医药》 CAS 2016年第11期1322-1325,共4页
碘是合成甲状腺激素和维持机体正常生理功能的重要元素。碘过量可引起甲状腺功能减退、甲状腺功能亢进、自身免疫性甲状腺疾病等,不同个体对碘过量的易感性不同,过度的氧化应激及继发的免疫反应可能是碘过量引起甲状腺细胞毒性的潜在机... 碘是合成甲状腺激素和维持机体正常生理功能的重要元素。碘过量可引起甲状腺功能减退、甲状腺功能亢进、自身免疫性甲状腺疾病等,不同个体对碘过量的易感性不同,过度的氧化应激及继发的免疫反应可能是碘过量引起甲状腺细胞毒性的潜在机制。本文对碘过量的流行病学现状、推荐摄入量和摄入来源、机体对碘过量的调节机制及其相关致病机制做一综述。 展开更多
关键词 甲状腺素 促甲状腺素 碘过量 流行病学 参考值 致病机制 氧化应激 免疫反应
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冬瓜实时荧光定量PCR内参基因的筛选与评价 被引量:15
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作者 叶新如 朱海生 +4 位作者 林珲 刘建汀 王彬 陈敏氡 温庆放 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期473-481,共9页
为筛选适合冬瓜稳定表达的内参基因,以黑皮冬瓜低温、高温、干旱胁迫处理不同时间的叶片和正常处理不同组织为试验材料,利用RT-qPCR技术,结合GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件评价7个候选内参基因(28SrRNA、UBQ、RPⅡ、GAPDH、EF-1α... 为筛选适合冬瓜稳定表达的内参基因,以黑皮冬瓜低温、高温、干旱胁迫处理不同时间的叶片和正常处理不同组织为试验材料,利用RT-qPCR技术,结合GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件评价7个候选内参基因(28SrRNA、UBQ、RPⅡ、GAPDH、EF-1α、UBC21和TUA)稳定性。结果表明,7个候选内参基因在不同组织和不同胁迫处理下表达丰度及稳定性存在差异; EF-1α在低温胁迫处理下表达稳定性最好; UBQ和TUA在高温和干旱胁迫处理下表达稳定性最好; EF-1α在不同组织中表达稳定性最好。本研究结果为冬瓜内参基因的选择提供了一定的理论参考。 展开更多
关键词 冬瓜 内参基因 非生物胁迫
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热胁迫下糙皮侧耳实时荧光定量PCR内参基因的选择 被引量:12
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作者 侯志浩 赵梦然 +3 位作者 陈强 张妍 黄晨阳 邬向丽 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2019年第3期11-18,F0003,共9页
在组成型表达基因和热胁迫转录组数据中选择12个基因作为热胁迫下糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)实时荧光定量PCR的候选基因。以40℃热处理0.5、1、3、6、12、24、48 h的糙皮侧耳菌丝体为材料,采用候选基因的特异性引物进行实时荧光定量... 在组成型表达基因和热胁迫转录组数据中选择12个基因作为热胁迫下糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)实时荧光定量PCR的候选基因。以40℃热处理0.5、1、3、6、12、24、48 h的糙皮侧耳菌丝体为材料,采用候选基因的特异性引物进行实时荧光定量PCR,运用geNorm、NormFinder和BestKeeper 3种软件对结果进行分析,评估12个候选基因的稳定性。结果显示β-微管蛋白基因、β-肌动蛋白基因和丝/苏氨酸蛋白磷酸酶基因可以作为糙皮侧耳热胁迫下理想的内参基因,而丝氨酸蛋白酶基因、磷酸化酶基因和细胞周期蛋白不适合作为糙皮侧耳热胁迫下的内参基因。 展开更多
关键词 糙皮侧耳 内参基因 热胁迫 实时荧光定量PCR
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盐胁迫下大豆根组织定量PCR分析中内参基因的选择 被引量:11
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作者 姜琼 王幼宁 +2 位作者 王利祥 孙政玺 李霞 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期754-764,共11页
实时荧光定量PCR已广泛用于基因表达的分析,适当的内参基因选择是获得准确分析结果的关键。在大豆(Glycinemax)分子生物学研究中,逆境响应基因和microRNA(miRNA)表达的内参辅助检测基因均有哪些目前尚不清楚。该研究选用不同盐梯度和时... 实时荧光定量PCR已广泛用于基因表达的分析,适当的内参基因选择是获得准确分析结果的关键。在大豆(Glycinemax)分子生物学研究中,逆境响应基因和microRNA(miRNA)表达的内参辅助检测基因均有哪些目前尚不清楚。该研究选用不同盐梯度和时间点组合处理的大豆根组织为材料,对已报道的其它条件下表达相对稳定的内参基因(ACT、ACT2/7、CYP2、ELF1A、ELF1B、F-Box、TUA和UBC2)以及miRNA内参基因(U6、miR1515a、miR1520c、miR1520d、miR171a和miR171b)的表达情况进行了全面检测;并采用?-Ct、Bestkeeper、NormFinder和Genorm四种方法对检测结果进行了综合分析,发现ELF1B和CYP2适合作为大豆根系盐胁迫响应基因研究的内参基因,miR1515a和U6适合作为盐胁迫下大豆根组织miRNA研究的内参。上述研究结果为大豆盐胁迫响应基因和miRNA表达及其进一步的功能研究奠定了基础。 展开更多
关键词 MIRNA QRT-PCR 内参基因 根组织 盐胁迫 大豆
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铜胁迫下紫鸭跖草根组织实时定量PCR内参基因的选择 被引量:9
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作者 杨坤 黄超 +2 位作者 卢山 彭国颖 黄长干 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期195-204,共10页
利用实时定量PCR技术分析不同铜浓度胁迫下紫鸭跖草(Setcreasea purpurea)根系的PCR标准化内参基因。从紫鸭跖草根系转录组数据库选取8个候选内参基因,运用BestKeeper、Normfinder和GeNorm三款软件分析它们在不同铜浓度胁迫条件下紫鸭... 利用实时定量PCR技术分析不同铜浓度胁迫下紫鸭跖草(Setcreasea purpurea)根系的PCR标准化内参基因。从紫鸭跖草根系转录组数据库选取8个候选内参基因,运用BestKeeper、Normfinder和GeNorm三款软件分析它们在不同铜浓度胁迫条件下紫鸭跖草根系的表达稳定性,并利用2个目的基因MT和PCS对筛选出的内参基因组合进行验证。结果表明,最佳的内参基因组合为18SrRNA、TUB和UBI;2个目的基因MT和PCS在铜胁迫下的表达模式验证内参基因组合具有可靠性,表明使用不合适的参考基因作为内控会导致结果不显著。 展开更多
关键词 紫鸭跖草 内参基因 铜胁迫 实时定量PCR
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苦豆子实时荧光定量PCR内参基因筛选与验证 被引量:7
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作者 苏丹丹 刘玉萍 +4 位作者 张雨 郑长远 王亚男 苏旭 孙成林 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1295-1306,共12页
为了筛选苦豆子不同组织中适应非生物胁迫的内参基因,本研究采用实时荧光定量PCR技术,分析了苦豆子中GAPDH、ACT、TUA、ELF1α、ELF1β、G6PDH、UBC、F-box、UBQ、CYP等10个内参基因在根、茎、叶中表达量的变化,并应用ge Norm、Norm Fin... 为了筛选苦豆子不同组织中适应非生物胁迫的内参基因,本研究采用实时荧光定量PCR技术,分析了苦豆子中GAPDH、ACT、TUA、ELF1α、ELF1β、G6PDH、UBC、F-box、UBQ、CYP等10个内参基因在根、茎、叶中表达量的变化,并应用ge Norm、Norm Finder、Best Keeper软件以及在线工具Ref Finder对其在不同非生物胁迫下根、茎、叶中的表达稳定性进行了分析。结果表明,苦豆子内参基因F-box、TUA和ELF1β分别是冷胁迫处理下根、茎、叶中最稳定的内参基因;干旱胁迫处理下根、茎、叶中最稳定的内参基因分别是ELF1α、ELF1β和ELF1β;而UBC、UBC和ELF1α则是盐胁迫处理下根、茎、叶中最稳定的内参基因。此外,本研究还评价了苦豆子抗旱基因MYB的表达量,发现不同胁迫处理下获得的内参基因稳定性的排序是正确可靠的。这一研究为今后苦豆子耐逆基因的表达分析提供了参考基因和理论依据。 展开更多
关键词 苦豆子 内参基因 实时荧光定量PCR 组织器官 非生物胁迫
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藜科植物藜和灰绿藜实时荧光定量PCR内参基因的选择 被引量:7
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作者 刘艳霞 兰欣欣 +2 位作者 曹婧 张晶华 兰海燕 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期1511-1518,1459,共9页
选择合适的内参基因是实时荧光定量PCR(qRT-PCR)研究的关键,目前对藜科耐盐(盐生)植物胁迫相关基因的表达分析中所用内参基因的报道较为有限。该研究利用Ge Norm、Norm Finder和Best Keeper 3个内参基因分析软件,对已选择过的β-TUBULI... 选择合适的内参基因是实时荧光定量PCR(qRT-PCR)研究的关键,目前对藜科耐盐(盐生)植物胁迫相关基因的表达分析中所用内参基因的报道较为有限。该研究利用Ge Norm、Norm Finder和Best Keeper 3个内参基因分析软件,对已选择过的β-TUBULIN、β-ACTIN、GAPDH 3个常用候选内参基因进行了比较分析,筛选出在Na Cl和PEG胁迫下藜和灰绿藜中表达相对稳定的内参基因。结果表明:Ge Norm、Norm Finder内参软件分析在Na Cl和PEG胁迫下,GAPDH是藜和灰绿藜中均共同稳定表达的内参基因,同时在藜和灰绿藜中也有各自表达较稳定的内参基因,β-ACTIN在藜中稳定表达,β-TUBULIN则在灰绿藜中稳定表达。对相同科不同种的植物内参基因表达差异进行比较,内参基因在相同科中具有相同稳定表达的内参;对相同胁迫下两种不同植物内参基因表达稳定性进行分析,内参基因的选择需根据实际的实验材料和实验条件而定。基于3个分析软件对以上3个常用内参基因的分析结果,初步确定了在藜科植物藜和灰绿藜中相对稳定的内参基因,为藜和灰绿藜胁迫相关基因的定量表达分析提供了参考依据。 展开更多
关键词 灰绿藜 实时荧光定量PCR 内参基因 胁迫
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不同温度胁迫下瓜实蝇RT-qPCR内参基因筛选 被引量:7
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作者 王凤英 杨朗 +3 位作者 黎柳锋 廖世纯 廖仁昭 姜建军 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2018年第5期1097-1105,共9页
特定条件下稳定表达内参基因的筛选是利用实时荧光定量PCR研究基因表达的关键基础。本研究以不同温度胁迫后后的瓜实蝇Bactrocera cucurbitae 2龄幼虫、雌虫和雄虫为试验材料,对其9个候选内参基因表达进行了RT-qPCR分析,并利用ge Norm、... 特定条件下稳定表达内参基因的筛选是利用实时荧光定量PCR研究基因表达的关键基础。本研究以不同温度胁迫后后的瓜实蝇Bactrocera cucurbitae 2龄幼虫、雌虫和雄虫为试验材料,对其9个候选内参基因表达进行了RT-qPCR分析,并利用ge Norm、Norm Finder、Best Keeper和Ref Finder 4款软件分析各候选内参基因在3种虫态中的表达稳定性。结果表明,18S rRNA基因Ct值(≤5)较小,不适合作为内参基因使用,其它8个内参基因在瓜实蝇2龄幼虫中的稳定性排序为Rp L32> RPS13> TBP>β-tubulin> TUBE> Actin2> G6PDH> Actin3。雌虫表达稳定性由高到低为:RPS13> Rp L32>β-tubulin> TBP> TUBE> Actin2> Actin3> G6PDH。雄虫表达稳定性为Rp L32> RPS13>β-tubulin> TBP> TUBE> Actin2> G6PDH> Actin3。ge Norm软件分析各个虫态内参基因最佳组合均为2个。RPS13和Rp L32组合可作为瓜实蝇不同虫态下温度胁迫后的内参基因。 展开更多
关键词 瓜实蝇 内参基因 温度胁迫 RT-QPCR
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小桐子低温胁迫下microRNA实时荧光定量PCR内参的筛选与比较 被引量:7
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作者 孔春艳 陈永坤 +3 位作者 王莎莎 郝大海 杨宇 龚明 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期25-31,共7页
选择合适的内参对实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果的准确性极其重要,在microRNA(miRNA)的qRT-PCR分析中尤为如此。通过筛选适宜分析小桐子低温胁迫下miRNA定量表达的内参,为小桐子及其他物种miRNA的qRT-PCR分析提供有用的理论参考。基于... 选择合适的内参对实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果的准确性极其重要,在microRNA(miRNA)的qRT-PCR分析中尤为如此。通过筛选适宜分析小桐子低温胁迫下miRNA定量表达的内参,为小桐子及其他物种miRNA的qRT-PCR分析提供有用的理论参考。基于以前的小RNA-seq结果,以低温处理的小桐子为材料,挑选11个候选内参基因,用实时荧光定量PCR技术检测它们在不同样本中的表达量,采用GeNorm、NormFinder和BestKeeper软件进行表达稳定性综合分析。结果表明,表达最稳定的基因是miR6448和U6,miR6448的Ct值为23左右,表达丰度适中;U6的Ct值为10左右,表达丰度高;因此,miR6448可作为小桐子低温胁迫下表达丰度适中的miRNA qRT-PCR的内参基因;U6可作为小桐子低温胁迫下丰度较高的miRNA qRT-PCR的内参基因。 展开更多
关键词 小桐子 实时荧光定量PCR 内参基因 miRNA 低温胁迫
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基于参考应力法的海底腐蚀管道剩余强度评价 被引量:7
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作者 黄坤 李沅桦 孔令圳 《中国安全生产科学技术》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期163-167,共5页
在役海底管道所处海洋环境恶劣,管道发生腐蚀后剩余强度降低。为了更加准确地计算管道的剩余强度,基于ANSYS非线性有限元模拟,采用参考应力法,研究了参考应力分别为(SMYS+SMTS)/2,1.1SMYS,SMYS+69,0.8SMTS,0.9SMTS,SMTS的海底管道剩余强... 在役海底管道所处海洋环境恶劣,管道发生腐蚀后剩余强度降低。为了更加准确地计算管道的剩余强度,基于ANSYS非线性有限元模拟,采用参考应力法,研究了参考应力分别为(SMYS+SMTS)/2,1.1SMYS,SMYS+69,0.8SMTS,0.9SMTS,SMTS的海底管道剩余强度,将结果与爆破实验数据作对比,提出了参考应力和流变应力取值的推荐算法。研究结果表明,在海底腐蚀管道剩余强度有限元分析中,对于X46,X60和X80管道,建议分别使用(SMYS+SMTS)/2,0.9SMTS和SMTS作为参考应力;推荐使用(SMYS+SMTS)/2,SMYS+69和1.1SMYS三者中的最大值作为流变应力。 展开更多
关键词 海底管道 腐蚀 剩余强度 参考应力
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不同非生物胁迫下香樟实时定量PCR内参基因的选择 被引量:7
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作者 张佳佳 张力维 +3 位作者 李勇鹏 焦晓琳 朱逢玲 杜丽 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期205-211,共7页
旨在获得香樟(Cinnamomum camphora L.)在不同非生物胁迫下表达稳定的内参基因,以香樟实生苗为材料,利用实时定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,q RT-PCR)技术研究分析了两个香樟候选内参基因CcACTc和CcEF1α... 旨在获得香樟(Cinnamomum camphora L.)在不同非生物胁迫下表达稳定的内参基因,以香樟实生苗为材料,利用实时定量PCR(quantitative real-time polymerase chain reaction,q RT-PCR)技术研究分析了两个香樟候选内参基因CcACTc和CcEF1α在不同非生物胁迫下的表达量,并通过Best Keeper软件对CcACTc和CcEF1α的稳定性进行了分析。结果表明,在低温处理中,CcACTc的稳定性较好,在干旱、高盐和ABA处理中则CcEF1α的稳定性较好,并且其在低温处理中也相对稳定。由此可知,CcEF1α更适合作为内参基因应用于香樟非生物胁迫相关基因的定量分析。 展开更多
关键词 香樟 QRT-PCR 内参基因 非生物胁迫
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‘砀山酥梨’实时荧光定量PCR内参基因的筛选 被引量:7
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作者 陈杨杨 吴潇 +2 位作者 谷超 殷豪 张绍铃 《中国果树》 北大核心 2018年第1期16-22,35,共8页
对'砀山酥梨'不同组织器官及不同非生物胁迫条件下叶片中可以稳定表达的内参基因进行筛选,为后续荧光定量PCR试验提供参考基因。分别对生长45 d的'砀山酥梨'嫁接苗进行低温、高温和盐胁迫处理,采集不同处理时间的叶片;... 对'砀山酥梨'不同组织器官及不同非生物胁迫条件下叶片中可以稳定表达的内参基因进行筛选,为后续荧光定量PCR试验提供参考基因。分别对生长45 d的'砀山酥梨'嫁接苗进行低温、高温和盐胁迫处理,采集不同处理时间的叶片;还分别采集'砀山酥梨'4个果实发育时期的果肉(分别为花后32、65、99、143d)、叶片、成熟果皮、花粉、花柱共26个样品。利用实时荧光定量PCR技术对4个传统内参基因:β微管蛋白基因(TUB)、多聚泛素酶基因(UBQ)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(GAPDH)和转录延伸因子基因(EF1α),以及通过转录组数据筛选出来的3个新内参基因Cytochrome b561(CyB)、WD-repeat protein(WDP)和mRNA capping enzyme(mRCE),共计7个内参基因在26个样品中的表达差异情况进行测定。结果表明:通过geNorm、NormFinder和Bestkeeper 3个软件对其表达稳定性进行分析,最终筛选出在不同组织及非生物胁迫条件下稳定表达的最优内参基因。UBQ在高温和盐胁迫处理的'砀山酥梨'叶片中表达最稳定,可作为优选内参基因;在低温胁迫处理下,TUB和WDP在'砀山酥梨'叶片中表达较稳定,可作优选内参基因;WDP在'砀山酥梨'不同组织器官中表达最稳定。不同内参基因在同一物种不同组织及胁迫处理条件下表达稳定性具有较大差异,在进行荧光定量PCR试验时,应根据具体的试验材料和方法选择最优内参基因。 展开更多
关键词 '砀山酥梨’ 不同组织 内参基因 QRT-PCR 非生物胁迫
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盐和干旱胁迫下杨树新内参基因的筛选 被引量:6
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作者 储文渊 王玉娇 +3 位作者 朱东悦 陈竹 严涵薇 项艳 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第10期70-79,共10页
【目的】通过杨树的多个基因芯片数据,筛选出在盐和干旱胁迫下能够稳定表达的基因作为杨树的新内参基因,为挖掘出更稳定、更理想的内参基因提供途径。【方法】利用已公布的基因芯片数据库获取不同生长时期、不同逆境处理下的杨树表达数... 【目的】通过杨树的多个基因芯片数据,筛选出在盐和干旱胁迫下能够稳定表达的基因作为杨树的新内参基因,为挖掘出更稳定、更理想的内参基因提供途径。【方法】利用已公布的基因芯片数据库获取不同生长时期、不同逆境处理下的杨树表达数据,将这些数据进行归一化处理,对基因在不同试验条件下表达量的稳定性进行排序。结合基因的功能注释信息,筛选新的内参基因。为进一步验证基因表达的稳定性,以经过NaCl,PEG处理的南林95杨(组培苗)的叶片材料为研究对象,利用实时荧光定量PCR方法,对6个传统内参基因(PtUKN1,PtUBQ,Actin,EF1α,18S rRNA,TUA8)和本研究筛选的6个新内参基因在处理后的0,1,4,8,12,24 h的基因表达量进行分析,再利用geNorm,NormFinder和BestKeeper内参基因分析软件对试验数据进行统计和排序,以比较这12个基因的表达稳定性,从而筛选到合适的内参基因。【结果】筛选6个稳定表达的新内参基因(PtRG1,PtRG2,PtRG3,PtRG4,PtRG5,PtRG6)。将这6个新内参基因与6个传统内参基因进行稳定性比较后发现,在geNorm程序分析中盐胁迫下PtRG2和PtRG3稳定性较好,干旱胁迫下PtRG3和PtRG5的稳定性较好;在NormFinder程序分析中盐胁迫下TUA8和PtRG1稳定性较好,干旱胁迫下PtRG1和PtRG2稳定性较好;在BestKeeper程序分析中盐胁迫下PtRG1和PtRG5稳定性较好,干旱胁迫下PtRG3和PtRG5稳定性较好。综合以上3个内参基因分析软件的结果,PtRG1,PtRG3和PtRG5的稳定性较好。为了进一步验证新内参基因的可靠性,以在NaCl和PEG处理条件下受诱导表达的PtVQ6,PtVQ13和PtVQ37作为对照进行荧光定量PCR试验,发现3个VQ基因的总体表达趋势与使用其他内参基因的结果一致。【结论】本研究鉴定的PtRG1,PtRG3和PtRG5适宜作为杨树在盐和干旱胁迫下的内参基因,这些新内参基因的挖掘对准确校正实时荧光定量PCR试验中目的基因的表达水 展开更多
关键词 杨树 实时荧光定量PCR 内参基因 盐胁迫 干旱胁迫
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Severe drought strongly reduces water use and its recovery ability of mature Mongolian Scots pine(Pinus sylvestris var. mongolica Litv.) in a semi-arid sandy environment of northern China 被引量:5
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作者 DANG Hongzhong ZHANG Lizhen +3 位作者 YANG Wenbin FENG Jinchao HAN Hui CHEN Yiben 《Journal of Arid Land》 SCIE CSCD 2019年第6期880-891,共12页
Trees growing in a semi-arid sandy environment are often exposed to drought conditions due to seasonal variations in precipitation, low soil water retention and deep groundwater level.However, adaptability and plastic... Trees growing in a semi-arid sandy environment are often exposed to drought conditions due to seasonal variations in precipitation, low soil water retention and deep groundwater level.However, adaptability and plasticity of individuals to the changing drought conditions greatly vary among tree species.In this study, we estimated water use(Ts) of Mongolian Scots pine(MSP;Pinus sylvestris var.mongolica Litv.) based on sap flux density measurements over four successive years(2013–2016) that exhibited significant fluctuations in precipitation in a semi-arid sandy environment of northern China.The results showed that fluctuations in daily Ts synchronously varied with dry-wet cycles of soil moisture over the study period.The daily ratio of water use to reference evapotranspiration(Ts/ET0) on sunny days in each year showed a negative linear relationship with the severity of drought in the upper soil layer(0–1 m;P<0.01).The decrease in Ts induced by erratic drought during the growing season recovered due to precipitation.However, this recovery ability failed under prolonged and severe droughts.The Ts/ET0 ratio significantly declined with the progressive reduction in the groundwater level(gw) over the study period(P<0.01).We concluded that the upper soil layer contributed the most to the Ts of MSP during the growing season.The severity and duration of droughts in this layer greatly reduced Ts.Nevertheless, gw determined whether the Ts could completely recover after the alleviation of long-term soil drought.These results provide practical information for optimizing MSP management to stop ongoing degradation in the semi-arid sandy environments. 展开更多
关键词 groundwater soil water availability water stress sap flow reference evapotranspiration
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