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新疆沙湾冷泉沉积物中免培养古菌多样性初步研究 被引量：6
1
作者 曾军 杨红梅 +4 位作者 吴江超 徐建华 张涛 孙建 娄恺 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期574-579,共6页
【目的】了解新疆沙湾冷泉沉积物的古菌组成及多样性。【方法】采用免培养法,液氮研磨提取冷泉沉积物总DNA,使用古菌通用引物进行16S rRNA基因扩增,构建16S rRNA基因文库。对阳性克隆进行HhaI限制性酶切分型,选出具有不同酶切图谱的序... 【目的】了解新疆沙湾冷泉沉积物的古菌组成及多样性。【方法】采用免培养法,液氮研磨提取冷泉沉积物总DNA,使用古菌通用引物进行16S rRNA基因扩增,构建16S rRNA基因文库。对阳性克隆进行HhaI限制性酶切分型,选出具有不同酶切图谱的序列进行测序,将所得序列与GenBank数据库中序列比对并构建16S rRNA基因系统发育树。【结果】从冷泉沉积物古菌16S rRNA基因文库中随机挑选了121个阳性克隆,共得到22个不同的可操作分类单元,BLAST结果表明全部克隆子归属于泉古菌门(Crenarchaeote)中免培养类群。系统发育分析归类为Soil-Freshwater-subsurface group和MarinegroupI,2个亚群并且各占整个文库的50%。其中40%左右的克隆子与具有无机碳和硝酸盐同化能力的泉古菌有高的相似性。此外还发现40%的克隆子与低温泉古菌类群具有很高的相似性。【结论】新疆沙湾冷泉沉积物中古菌类群多样性较低,但存有大量高度适应此低温、贫营养环境的泉古菌类群。 展开更多
关键词 冷泉 地下水 古菌多样性 16S rrna同源性
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新疆地区不同酸奶中优势乳酸菌的分离与鉴定 被引量：28
2
作者 魏艳 曾小群 +2 位作者 潘道东 曹锦轩 李和生 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第12期161-166,共6页
在乳制品工业中乳酸菌被认为是重要的益生菌之一。本文对来自新疆的酸驼奶、酸牛奶、酸马奶、酸羊奶以及俄罗斯酸奶中的优势乳酸菌进行分离,结合16S rRNA序列同源性分析和生理生化试验,鉴定出几种优势乳酸杆菌,即发酵乳杆菌、干酪乳杆... 在乳制品工业中乳酸菌被认为是重要的益生菌之一。本文对来自新疆的酸驼奶、酸牛奶、酸马奶、酸羊奶以及俄罗斯酸奶中的优势乳酸菌进行分离,结合16S rRNA序列同源性分析和生理生化试验,鉴定出几种优势乳酸杆菌,即发酵乳杆菌、干酪乳杆菌、植物乳杆菌、戊糖乳杆菌。 展开更多
关键词 乳酸菌 分离 生理生化鉴定 16S rrna同源性分析
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鲭鱼中组胺降解菌的筛选鉴定和发酵条件初探 被引量：5
3
作者 欧昌荣 管娟 +4 位作者 汤海青 曹锦轩 黄玲 谢诚 廖媛媛 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第8期158-164,共7页
组胺是影响水产品食用安全和贸易的重要风险因子之一,目前关于组胺相关菌的研究大多集中在组胺产生菌方面。本文从冰鲜鲭鱼中分离筛选到1株高活力组胺降解菌T6,通过形态特征,生理生化检测和16S rRNA基因序列的系统发育学分析,确定该菌... 组胺是影响水产品食用安全和贸易的重要风险因子之一,目前关于组胺相关菌的研究大多集中在组胺产生菌方面。本文从冰鲜鲭鱼中分离筛选到1株高活力组胺降解菌T6,通过形态特征,生理生化检测和16S rRNA基因序列的系统发育学分析,确定该菌株属于嗜冷杆菌属Psychrobacter sp.。采用单因素对发酵条件进行优化。最佳发酵条件是:温度28℃,接种量4%,起始pH 7,种龄16 h,装液量50 mL/250 mL。本文筛选出的组胺降解菌,为利用生物方法控制水产品中组胺含量提供新思路。 展开更多
关键词 组胺 组胺降解菌 鲭鱼 16S rrna同源性分析 鉴定 发酵条件
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浮霉菌门严格厌氧产氢细菌(Thermopirellula anaerolimosa)的分离及其生理特性 被引量：14
4
作者 刘冬英 刘奕 +3 位作者 门学慧 郭群群 郭荣波 邱艳玲 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期994-1001,共8页
【目的】厌氧颗粒污泥中含有大量未知微生物资源,利用低浓度底物及添加抗生素的培养基进行厌氧发酵细菌的筛选,并对分离菌株进行生理生化特性研究。【方法】利用系列稀释法及亨盖特厌氧滚管技术从制糖废水厌氧处理反应器的颗粒污泥中分... 【目的】厌氧颗粒污泥中含有大量未知微生物资源,利用低浓度底物及添加抗生素的培养基进行厌氧发酵细菌的筛选,并对分离菌株进行生理生化特性研究。【方法】利用系列稀释法及亨盖特厌氧滚管技术从制糖废水厌氧处理反应器的颗粒污泥中分离到一株高温厌氧产氢细菌VM20-7T,通过16S rRNA基因序列同源性确定其系统发育地位。【结果】菌株VM20-7T为高温、严格厌氧、革兰氏阴性梨形细菌,细胞大小为(0.7-2.0)μm×(0.7-2.0)μm,不运动,不产芽胞。其生长温度范围为35℃-50℃(最适温度45℃),pH范围为6.0-8.3(最适pH 7.0-7.5),NaCl耐受范围为0%-0.5%(w/v,最适浓度0%)。菌株VM20-7T可利用葡萄糖、麦芽糖、核糖等多种糖类为唯一碳源生长,葡萄糖发酵终产物是乙酸和H2。该菌株不利用硝酸盐、硫酸盐等作为电子受体生长。G+C含量为60.9 mol%,16S rRNA基因序列同源性显示菌株属于浮霉菌门,但与已培养菌株的同源性较低,与梨形菌属-红小梨形菌属-芽殖小小梨形菌属(Pirellula-Rhodopirellula-Blastopirellula,PRB)分支的亲缘关系最近,但序列相似性也仅为82.7%-84.3%。【结论】利用低浓度糖类并添加抗生素分离厌氧颗粒污泥中的微生物,获得了浮霉菌门首例严格厌氧细菌VM20-7T。生理生化特性和系统发育分析显示,菌株VM20-7T为浮霉菌目的新属新种,命名为Thermopirellula anaerolimosa。该菌株的菌种保藏号为CGMCC 1.5169T=JCM 17478T=DSM 24165T。 展开更多
关键词 浮霉菌门 高温厌氧产氢菌 16S rrna基因同源性
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云南个旧锡矿区可培养细菌多样性及其重金属抗性 被引量：5
5
作者 肖炜 张仕颖 +4 位作者 赵琴 王永霞 赖泳红 李治滢 崔晓龙 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1158-1165,共8页
【目的】揭示个旧锡矿区尾矿库和矿坑土壤中可培养细菌的多样性;发掘一批锡矿区土壤细菌菌株并对其Pb2+、Cd2+耐受性进行评价。【方法】采用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对样品中可培养细菌多样性进行研究,平板法评价... 【目的】揭示个旧锡矿区尾矿库和矿坑土壤中可培养细菌的多样性;发掘一批锡矿区土壤细菌菌株并对其Pb2+、Cd2+耐受性进行评价。【方法】采用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对样品中可培养细菌多样性进行研究,平板法评价代表菌株对Pb2+、Cd2+的耐受性。【结果】使用2种培养基从尾矿库和矿坑土壤中分离到214株细菌,对其中107株代表菌株的16S rRNA基因序列系统发育分析结果显示,菌株分属细菌域的5个门、12个目、25个科、42个属;其中变形菌门(Proteobacteria)是优势类群,占总菌株数的69.2%;假单胞菌属(Pseudomonas)菌株是优势物种,占24.8%;2株菌代表了2个潜在新类群。对105株代表性菌株的重金属耐受性研究表明,耐受浓度1000 mg/LPb2+或Cd2+的菌株分别占73.3%和8.6%,菌株对Pb2+的耐受性明显好于Cd2+;分离自锡尾矿库的菌株耐受不同浓度Pb2+和Cd2+菌株比例明显高于矿坑来源的菌株;分离自锡尾矿区的2株菌(DT47-2A和DT50-1)对1000 mg/L浓度Pb2+和Cd2+均具耐受性。【结论】个旧锡矿区土壤可培养细菌具有丰富的多样性,而且蕴含着不少潜在新类群;该环境中含有大量Pb2+、Cd2+耐受菌株,并对Pb2+、Cd2+具有较强的抗性或适应性。 展开更多
关键词 锡矿区 纯培养方法 细菌多样性 16S rrna基因同源性 重金属
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女性生殖道乳杆菌的分离及鉴定 被引量：4
6
作者 刘婷婷 傅思武 杨毓琴 《中国妇幼保健》 CAS 北大核心 2010年第27期3950-3953,共4页
目的:从正常女性生殖道中分离乳杆菌,为开发复方益生菌制剂提供新型菌株。方法:采用传统方法鉴定出乳杆菌,进一步筛选出产生过氧化氢的优势菌株,并运用分子生物学方法,对其进行基因型鉴定。并对优势菌进行初步的性能鉴定试验。结果:从1... 目的:从正常女性生殖道中分离乳杆菌,为开发复方益生菌制剂提供新型菌株。方法:采用传统方法鉴定出乳杆菌,进一步筛选出产生过氧化氢的优势菌株,并运用分子生物学方法,对其进行基因型鉴定。并对优势菌进行初步的性能鉴定试验。结果:从18名体检女性阴道分泌物内分离纯化得到11株菌,检出率为61.1%。分别为嗜酸乳杆菌4株,格氏乳杆菌3株,詹氏乳杆菌2株,卷曲、唾液乳杆菌各1株。结论:运用传统的细菌学分离方法与分子生物学对分离的菌株进行了鉴定。其中一株为产生过氧化氢的卷曲乳杆菌,经过初步测试,该菌株具有良好的耐酸、耐高温及体外拮抗其他病原微生物的能力。 展开更多
关键词 乳杆菌 分离 鉴定 过氧化氢 16S rrna序列同源性
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16SrRNA基因序列分析用于诊断病原性细菌感染初步研究 被引量：12
7
作者 周永运 戎建荣 +4 位作者 白雪梅 叶长芸 邵祝军 王艳华 徐建国 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期639-642,共4页
目的建立一种可适用于多种病原菌检测的方法,以提高病原学诊断率,有利于传染病的病原学监测。方法细菌16SrRNA基因通用引物对直接从血液、尿液、脑脊液标本中提取的细菌DNA进行PCR扩增,并对16SrRNA基因扩增产物进行克隆和序列分析。结... 目的建立一种可适用于多种病原菌检测的方法,以提高病原学诊断率,有利于传染病的病原学监测。方法细菌16SrRNA基因通用引物对直接从血液、尿液、脑脊液标本中提取的细菌DNA进行PCR扩增,并对16SrRNA基因扩增产物进行克隆和序列分析。结果检测了28份临床标本,16SrRNA基因序列分析与尿液细菌培养结果不完全吻合;血液和脑脊液的16SrRNA的检出率均高于细菌培养。结论16SrRNA基因检测分析和细菌培养均具有良好的诊断效果,而针对16SrRNA基因的PCR直接扩增核酸并进行序列分析可对分离培养阴性的标本进行有效的补充诊断,可检测到多种病原菌如肠球菌,大肠杆菌,表皮葡萄球菌,牛链球菌,猪链球菌,布鲁氏菌,表皮葡萄球菌和脑膜炎球菌等,为疾病的诊断提供良好的线索。 展开更多
关键词 病原性细菌 16S rrna序列同源性比较
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分子生物学在细菌分类中的应用
8
作者 孙永红 王树根 《信阳农业高等专科学校学报》 1992年第2期52-55,共4页
目前对细菌的分类有多个分类系统。它们都是以表型特征为基础的(系统分类法)。尚未有一种细菌分类法被人们普遍接受。近20年来,通过细菌遗传型特性的鉴定,能更好地确定它们的系统发育关系和分类地位。随着分子生物学越来越广泛的应用于... 目前对细菌的分类有多个分类系统。它们都是以表型特征为基础的(系统分类法)。尚未有一种细菌分类法被人们普遍接受。近20年来,通过细菌遗传型特性的鉴定,能更好地确定它们的系统发育关系和分类地位。随着分子生物学越来越广泛的应用于细菌分类上,有可能建立一个合乎自然发展规律的新的分类体系。 本文论述了分子生物学方法及其分类中的应用和分类意义。 展开更多
关键词 分子生物学 细菌分类学 G+Cmol%测定 DNA—DNA(rrna)同源性测定 rrna序例分析
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