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基于psbA-trnH基因序列的越桔属植物鉴定研究
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作者 杨浩博 王瑜 +2 位作者 仲帅 刘鑫 宗成文 《延边大学农学学报》 2019年第3期16-22,共7页
以长白山东方红林场和汪清兰家林场采集的笃斯越桔叶片为样本,采用PCR方法扩增psbA-trnH基因,与GenBank中的越桔属psbA-trnH序列进行对比分析,分析psbA-trnH基因序列在越桔属植物间的序列差异。结果表明:越桔属psbA-trnH序列遗传距离的... 以长白山东方红林场和汪清兰家林场采集的笃斯越桔叶片为样本,采用PCR方法扩增psbA-trnH基因,与GenBank中的越桔属psbA-trnH序列进行对比分析,分析psbA-trnH基因序列在越桔属植物间的序列差异。结果表明:越桔属psbA-trnH序列遗传距离的范围区间为0.000~0.013,平均遗传距离为0.005。草地越桔共有3个有效鉴别位点,分别在第36碱基位的碱基为C,在第289碱基位插入了1段TATTCATTTTG碱基序列,在第398碱基位的碱基为T,蔓越桔共有2个有效鉴别位点,分别在第195碱基位的碱基为C,第339碱基位缺失1段TTGAAAATAA碱基序列,狭叶越桔共存在3个有效鉴别位点,分别在第8碱基位点缺失1个碱基,第169位点碱基为T,第428位点碱基为A,乌饭树在第288碱基位为T,红豆越桔在第236位碱基缺失,鹿莓越桔第305位点碱基为T。草地越桔与蔓越桔与其他越桔属植物的碱基序列对比存在明显的差异。通过Neighbor-Joining系统发育树分析得知,笃斯越桔与红豆越桔亲缘关系较近。越桔属植物的psbA-trnH序列存在属间差异,故可以用来作为鉴定越桔属植物的DNA条形码。 展开更多
关键词 越桔属 DNA条形码 psba-trnh序列分析 系统发育树
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