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基于网络药理学的松香酸治疗银屑病的作用机制研究
被引量：
3
1
作者
刘勇
闫小宁
《世界临床药物》
2022年第1期19-25,共7页
目的运用网络药理学的方法探讨松香酸治疗银屑病的分子作用机制。方法采用STRING数据库和Cytoscape软件绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络。借助DAVID数据库对靶点进行基因本体分析和京都基因与基因组的百科全书通路分析,将核心靶点与松香...
目的运用网络药理学的方法探讨松香酸治疗银屑病的分子作用机制。方法采用STRING数据库和Cytoscape软件绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络。借助DAVID数据库对靶点进行基因本体分析和京都基因与基因组的百科全书通路分析,将核心靶点与松香酸进行分子对接,以验证松香酸与核心靶点的结合能力。结果筛选得到松香酸治疗银屑病的60个作用靶点,主要为肿瘤坏死因子、丝裂原活化蛋白激酶3、肿瘤蛋白53和过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferationactivated receptor,PPAR)γ。靶点主要涉及细胞锌离子结合、类固醇激素受体活性、维甲酸受体活性等生物过程。PPAR信号通路和花生四烯酸代谢信号通路为松香酸治疗银屑病的主要作用通路。结论松香酸治疗银屑病体现了多靶点、多途径的作用特点,该研究为深入阐释松香酸治疗银屑病作用机制提供了科学依据。
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关键词
松香酸
银屑病
网络药理学
蛋白质-蛋白质相互作用网络
分子机制
原文传递
使用DNA微阵列分析研究系统性血管炎潜在的基因靶点
被引量：
5
2
作者
史卫军
冯怡雯
汤敬东
《血管与腔内血管外科杂志》
2017年第6期1028-1035,共8页
本研究旨在确定系统性血管炎中关键基因,从而获得新的潜在的基因靶向位点来治疗系统性血管炎。从Gene Expression Omnibus数据库中下载了GSE16945的双色cDNA微阵列数据,由来自13名系统性血管炎患者和16名健康对照组成员的外周单核细胞...
本研究旨在确定系统性血管炎中关键基因,从而获得新的潜在的基因靶向位点来治疗系统性血管炎。从Gene Expression Omnibus数据库中下载了GSE16945的双色cDNA微阵列数据,由来自13名系统性血管炎患者和16名健康对照组成员的外周单核细胞标本组成。通过BRB Array Tools,在系统性血管炎中筛选差异表达基因(DEG),随后使用cluster Profiler包构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络以及选择显著功能相互作用(FI)模块。此外,预测了确定的DEG之间的转录因子(TF),并构建了转录调控网络。鉴定了总共173个上调基因和93个下调的基因,主要与免疫应答途径相关。FBJ小鼠骨肉瘤病毒基因同源物(FOS),泛素B(UBB),信号转导和转录激活因子1(STAT1)和MX dynamin样GTPase 1(MX1)在PPI网络中被鉴定为中枢蛋白。此外,UBB、FOS和STAT1分别是三个确定的FI模块中的中枢蛋白。在DEGs中总共预测了9个转录因子。在预测为转录因子的DEG中,鉴定了相互作用的STAT1,v-maf禽类肌肉痉挛性纤维肉瘤癌基因同源物B(MAFB)和酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶活化蛋白Z(YWHAZ),这些转录因子作为靶点进一步调节其他DEGs。包括FOS、UBB、MX1、STAT1、MAFB和YWHAZ在内的各种基因可能是用于治疗系统性血管炎的潜在靶标。
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关键词
差异表达基因
蛋白质-蛋白质相互作用网络
功能相互作用
系统性血管炎
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职称材料
题名
基于网络药理学的松香酸治疗银屑病的作用机制研究
被引量：
3
1
作者
刘勇
闫小宁
机构
陕西省中医医院皮肤科
北京中医药大学生命科学学院
出处
《世界临床药物》
2022年第1期19-25,共7页
基金
国家重点研发计划“中医药现代化研究重点专项”(2018YFC1705303)
陕西省重点产业创新链(2019ZDLSF04-08)
+1 种基金
陕西省重点研发计划重点项目(2018ZDXM-SF-010,2017ZDXM-SF-018)
陕西省重点研发计划一般项目(2019SF-312)。
文摘
目的运用网络药理学的方法探讨松香酸治疗银屑病的分子作用机制。方法采用STRING数据库和Cytoscape软件绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络。借助DAVID数据库对靶点进行基因本体分析和京都基因与基因组的百科全书通路分析,将核心靶点与松香酸进行分子对接,以验证松香酸与核心靶点的结合能力。结果筛选得到松香酸治疗银屑病的60个作用靶点,主要为肿瘤坏死因子、丝裂原活化蛋白激酶3、肿瘤蛋白53和过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferationactivated receptor,PPAR)γ。靶点主要涉及细胞锌离子结合、类固醇激素受体活性、维甲酸受体活性等生物过程。PPAR信号通路和花生四烯酸代谢信号通路为松香酸治疗银屑病的主要作用通路。结论松香酸治疗银屑病体现了多靶点、多途径的作用特点,该研究为深入阐释松香酸治疗银屑病作用机制提供了科学依据。
关键词
松香酸
银屑病
网络药理学
蛋白质-蛋白质相互作用网络
分子机制
Keywords
abietic
acid
psoriasis
network
pharmacology
proteinprotein
interaction
networks
molecular
mechanism
分类号
R758.63 [医药卫生—皮肤病学与性病学]
原文传递
题名
使用DNA微阵列分析研究系统性血管炎潜在的基因靶点
被引量：
5
2
作者
史卫军
冯怡雯
汤敬东
机构
上海市浦东医院血管外科
上海市第一人民医院普外科中心
出处
《血管与腔内血管外科杂志》
2017年第6期1028-1035,共8页
文摘
本研究旨在确定系统性血管炎中关键基因,从而获得新的潜在的基因靶向位点来治疗系统性血管炎。从Gene Expression Omnibus数据库中下载了GSE16945的双色cDNA微阵列数据,由来自13名系统性血管炎患者和16名健康对照组成员的外周单核细胞标本组成。通过BRB Array Tools,在系统性血管炎中筛选差异表达基因(DEG),随后使用cluster Profiler包构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络以及选择显著功能相互作用(FI)模块。此外,预测了确定的DEG之间的转录因子(TF),并构建了转录调控网络。鉴定了总共173个上调基因和93个下调的基因,主要与免疫应答途径相关。FBJ小鼠骨肉瘤病毒基因同源物(FOS),泛素B(UBB),信号转导和转录激活因子1(STAT1)和MX dynamin样GTPase 1(MX1)在PPI网络中被鉴定为中枢蛋白。此外,UBB、FOS和STAT1分别是三个确定的FI模块中的中枢蛋白。在DEGs中总共预测了9个转录因子。在预测为转录因子的DEG中,鉴定了相互作用的STAT1,v-maf禽类肌肉痉挛性纤维肉瘤癌基因同源物B(MAFB)和酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶活化蛋白Z(YWHAZ),这些转录因子作为靶点进一步调节其他DEGs。包括FOS、UBB、MX1、STAT1、MAFB和YWHAZ在内的各种基因可能是用于治疗系统性血管炎的潜在靶标。
关键词
差异表达基因
蛋白质-蛋白质相互作用网络
功能相互作用
系统性血管炎
Keywords
differentially
expressed
genes
proteinprotein
interaction
network
functional
interaction
systemic
vasculitis
分类号
R543 [医药卫生—心血管疾病]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学的松香酸治疗银屑病的作用机制研究
刘勇
闫小宁
《世界临床药物》
2022
3
原文传递
2
使用DNA微阵列分析研究系统性血管炎潜在的基因靶点
史卫军
冯怡雯
汤敬东
《血管与腔内血管外科杂志》
2017
5
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
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