56株B族链球菌血清型耐药性及多位点序列分型研究 被引量：11

1

作者 仝净净 王萍 +3 位作者 史伟 姚开虎 俞桑洁 杨永弘 《中国实用儿科杂志》 CSCD 北大核心 2015年第3期194-198,共5页

目的研究B族链球菌（GBS）的血清型、耐药性和多位点序列分型,供防治GBS感染参考。方法 2012—2013年间共收集到56株GBS菌株,自就诊于北京市妇产医院和北京大兴医院的妊娠35-37周孕妇的阴道和直肠拭子的分离培养。采用乳胶凝集试验检测... 目的研究B族链球菌（GBS）的血清型、耐药性和多位点序列分型,供防治GBS感染参考。方法 2012—2013年间共收集到56株GBS菌株,自就诊于北京市妇产医院和北京大兴医院的妊娠35-37周孕妇的阴道和直肠拭子的分离培养。采用乳胶凝集试验检测菌株的血清型,E-test法和纸片扩散法检测细菌对9种抗生素的敏感性,PCR方法检测红霉素耐药基因ermB和mefA,管家基因测序确定菌株的序列型（ST）,eBURST软件分析菌株间亲缘性关系。结果 56株菌共鉴定出5种血清型,常见型为Ⅲ型（32.1%）、Ⅰa型（17.9%）、Ⅰb型（16.1%）和Ⅴ型（14.3%）。分离株对青霉素和头孢曲松均敏感,对左氧氟沙星、红霉素、克拉霉素、阿奇霉素、泰利霉素、克林霉素和四环素的不敏感率依次为39.3%、85.7%、92.9%、98.2%、30.4%、73.2%和91.0%。56株菌株共检测出14种STs,ST19（30.4%）最为常见。Ⅲ型菌株主要属于ST19（14/18）,92.9%的Ⅲ/ST19型菌株对左氧氟沙星耐药,75%的左氧氟耐药菌株属于CC19。44株红霉素耐药菌株中,32株（72.7%）erm B阳性。结论北京GBS菌株以Ⅲ、Ⅰa、Ⅰb、Ⅴ型常见;GBS菌株对青霉素和头孢曲松敏感,对红霉素和克林霉素等耐药率高,超过90%的Ⅲ/ST19型菌株耐左氧氟沙星;红霉素耐药菌株多携带ermB。 展开更多

关键词 B族链球菌 血清型 耐药性 多位点序列分型

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苯唑西林和头孢西丁敏感金黄色葡萄球菌MecA基因检测研究 被引量：5

2

作者 邓向斌 蔡博涛 +10 位作者 蒲彰雅 徐广健 廉婕 潘伟光 白冰 邓名贵 刘晓军 王红燕 李多云 余治健 邓启文 《深圳中西医结合杂志》 2017年第16期1-3,共3页

目的:获得本地区苯唑西林和头孢西丁敏感金黄色葡萄球菌(SA)MecA基因携带率并分析其分子流行病学特征,为临床耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)感染的诊治提供循证学依据。方法:回顾性分析深圳大学附属南山医院微生物室2010年1月至2016年1... 目的:获得本地区苯唑西林和头孢西丁敏感金黄色葡萄球菌(SA)MecA基因携带率并分析其分子流行病学特征,为临床耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)感染的诊治提供循证学依据。方法:回顾性分析深圳大学附属南山医院微生物室2010年1月至2016年12月分离出的435株甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌(MSSA)的临床药敏特点,总结其对苯唑西林和头孢西丁的耐药情况。应用聚合酶链式反应(PCR)方法扩增MecA基因,红霉素耐药基因ermA、ermB和ermC,扩增SA7对管家基因(arcc、aroe、glpf、gmk、pta、tpi、yqiL)。结果:在435株MSSA中发现2株对苯唑西林和头孢西丁敏感但MecA基因阳性的MRSA菌株,其多基因座顺序分型(MLST)分别为ST239和ST2631,标本均来源于痰液。ermA,ermB和ermC基因除ermA在菌株CHS172中检测阳性,其余均为阴性。结论:临床药敏实验提示苯唑西林和头孢西丁敏感的MSSA有必要进一步检测MecA基因,以验证耐药表型和指导临床治疗方案确定。 展开更多

关键词 金黄色葡萄球菌 多基因座顺序分型 MECA基因

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B群链球菌多位点序列型及大环内酯类耐药基因相关性分析 被引量：5

3

作者 王佳敏 张丽 +3 位作者 张丽华 王俊娥 王欣 杨维青 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期638-640,I0001,共4页

目的对孕妇携带的大环内酯类耐药的B群链球菌(GBS)进行多位点序列分型及大环内酯类耐药基因检测,探讨其多位点序列型与大环内酯类耐药基因的相关性。方法采用PCR方法检测东莞地区孕妇携带的82株大环内酯类耐药GBS的耐药基因erm B、mef ... 目的对孕妇携带的大环内酯类耐药的B群链球菌(GBS)进行多位点序列分型及大环内酯类耐药基因检测,探讨其多位点序列型与大环内酯类耐药基因的相关性。方法采用PCR方法检测东莞地区孕妇携带的82株大环内酯类耐药GBS的耐药基因erm B、mef A/E、lin B。采用PCR扩增82株大环内酯类耐药GBS的7个管家基因,对其进行DNA测序,并对测序结果进行多位点序列分型(MLST),以e BURSTv3.0分析菌株间的亲缘关系。结果 82株大环内酯类耐药的GBS中,耐药基因erm B、mef A/E和lin B的总检出率分别为73.17%、46.34%和7.32%。MLST分型得到CC1、CC12、CC17、CC19共4个克隆群;17个序列型,主要序列型为ST1(6.10%)、ST12(7.32%)、ST17(9.76%)、ST19(37.8%)和ST23(14.63%)。结论东莞地区孕妇携带的序列型ST19的GBS检测率高;序列型ST12、ST19、ST23的GBS大环内酯类耐药基因携带率高,其分子构型可能与大环内酯类耐药基因的获得关系密切。 展开更多

关键词 B群链球菌 多位点序列型 耐药基因

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耐碳青霉烯类大肠埃希菌耐药基因及同源性分析 被引量：1

4

作者 宋瑞雅 闫小利 +1 位作者 陈清清 林玉玲 《检验医学与临床》 CAS 2023年第15期2206-2209,共4页

目的 分析某院分离的耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CRECO)的耐药基因及同源性,为临床治疗及感控提供参考。方法 收集福建医科大学附属泉州第一医院2017-2021年分离的CRECO 36株,对成功复苏的15株CRECO进行耐药基因及同源性分析;用PCR扩增碳... 目的 分析某院分离的耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CRECO)的耐药基因及同源性,为临床治疗及感控提供参考。方法 收集福建医科大学附属泉州第一医院2017-2021年分离的CRECO 36株,对成功复苏的15株CRECO进行耐药基因及同源性分析;用PCR扩增碳青霉烯酶(CPAs)基因(bla_(KPC)、bla_(IMP)、bla_(NDM)、bla_(VIM)、bla_(OXA-48));多位点序列分型(MLST)用于检测其基因序列(ST型)。结果 (1)36株CRECO标本类型主要为尿液(55.56%)。(2)CRECO对哌拉西林、左氧氟沙星等8种抗菌药物耐药率达100.0%,对庆大霉素、氯霉素等7种抗菌药物耐药率>50.0%,对阿米卡星、多黏菌素耐药率分别为19.4%、2.8%,尚未发现对替加环素耐药。(3)通过PCR扩增15株复苏菌株的耐药基因,共获得14株阳性:2株bla_(KPC-1),11株bla_(NDM-5),1株bla_(NDM-1);1株阴性。(4)MLST将11株携带bla_(NDM-5)的CRECO的ST型分为ST156、ST117、ST2177、ST744、ST405和ST10Cplx(复合群)。结论 CRECO呈多重耐药状态,对碳青霉烯类耐药与携带耐药基因bla_(NDM-5)密切相关,携带bla_(NDM-5)的CRECO以ST10Cplx流行为主。 展开更多

关键词 大肠埃希菌 碳青霉烯酶 耐药基因 多位点序列分型

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致血流与腹腔共同感染大肠埃希菌表型和基因型特征分析

5

作者 宫天野 郭玲 +5 位作者 叶坤 赵强 叶丽艳 马艳宁 王丽凤 杨继勇 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第13期986-990,共5页

目的分析致血流与腹腔共同感染大肠埃希菌(CoECO)的表型和基因型特征,为经验性抗感染治疗提供线索。方法回顾性分析2010至2020年解放军总医院第一医学中心检验科自血液和腹腔标本中分离出的大肠埃希菌菌株。使用质谱鉴定仪鉴定菌种。使... 目的分析致血流与腹腔共同感染大肠埃希菌(CoECO)的表型和基因型特征,为经验性抗感染治疗提供线索。方法回顾性分析2010至2020年解放军总医院第一医学中心检验科自血液和腹腔标本中分离出的大肠埃希菌菌株。使用质谱鉴定仪鉴定菌种。使用全自动细菌鉴定药敏仪测定最小抑菌浓度。采用2×150 bp双末端测序策略对大肠埃希菌进行高通量测序。基因组序列经拼接后,使用kSNP3软件对菌株序列进行单核苷酸多态性(SNP)分析,以明确菌株间的同源关系;若分离自两部位的菌株具有较高同源关系,视为同一菌株,则该病例为CoECO感染病例。使用PubMLST网站确定多位点序列型(MLST),使用CARD网站筛选耐药基因。结果共筛选出70例CoECO感染病例,其中男45例,女25例,年龄(59.2±16.3)岁。每例CoECO感染病例选取1株大肠埃希菌进行后续分析,共计70株,分属于35种ST型,菌株数量较多的ST型包括:ST38(n=6)、ST405(n=6)、ST1193(n=6)、ST131(n=5),其他ST型所含菌株均少于5株。菌株间同源关系比较分散,整体呈现散发趋势,仅有个别菌株引起了小规模爆发。药敏结果显示:大肠埃希菌对氨苄西林的耐药率最高(91.4%,64/70),其次为氨苄西林/舒巴坦(74.3%,52/70)、头孢曲松(72.9%,51/70)、环丙沙星(71.4%,50/70)、左氧氟沙星(71.4%,50/70);对哌拉西林/他唑巴坦、碳青霉烯类和阿米卡星保持较高敏感性。耐药基因携带数量最多的是tet(A/B)(70.0%,49/70),其次分别为bla_(TEM)(58.6%,41/70)、sul1(55.7%,40/70)、sul2(54.3%,38/70)、bla_(CTX-M-14)(25.7%,18/70)、bla_(CTX-M-15)(17.1%,13/70)、bla_(CTX-M-55)(15.7%,11/70)、bla_(CTX-M-64/65)(5.7%,4/70)、bla_(CTX-M-27)(4.3%,3/70)、mcr-1(4.3%,3/70)、bla_(NDM-5)(2.9%,2/70)。结论CoECO整体呈散发分布,无明显优势克隆,未发现具有明显优势的基因型;菌株虽然对部分抗菌药物耐药率较高,但携带耐药基因比例较低,对部分一线抗菌药物有较高敏感� 展开更多

关键词 血流感染 腹腔感染 大肠埃希菌 高通量测序 多位点序列分型 横断面研究

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某医院流感嗜血杆菌的耐药性及分子流行病学特征

6

作者 吴玲玲 张志军 +3 位作者 李震 姜梅杰 周广飞 赵书平 《分子诊断与治疗杂志》 2023年第3期417-421,共5页

目的 探讨本院流感嗜血杆菌(HI)的耐药性、血清型分型和多位点序列分型(MLST),为指导临床合理用药提供依据。方法 收集2019年1至5月泰安市中心医院临床分离30株HI,采用纸片扩散法检测其对抗菌药物的敏感性,采用玻片凝集法进行血清学分型... 目的 探讨本院流感嗜血杆菌(HI)的耐药性、血清型分型和多位点序列分型(MLST),为指导临床合理用药提供依据。方法 收集2019年1至5月泰安市中心医院临床分离30株HI,采用纸片扩散法检测其对抗菌药物的敏感性,采用玻片凝集法进行血清学分型,头孢硝噻吩纸片法检测细菌β-内酰胺酶表型,PCR扩增耐药基因,MLST鉴定菌株之间的亲缘关系。结果 30株细菌血清型均为不定型(NTHI),对氨苄西林、复方新诺明和头孢呋辛耐药率分别为70.00%、70.00%和46.67%,阿奇霉素的非敏感率为36.67%,对其他抗菌药物敏感性高。70.00%(21/30)菌株检测到β-内酰胺酶基因,与表型一致,基因型均为TEM-1型,未检测到ROB-1型。MLST结果显示30株细菌共检出18种ST型,ST12型检出率最高。结论 本院分离HI对氨苄西林和复方新诺明呈现出严重耐药性,三代头孢菌素和β内酰胺酶抑制剂可作为临床治疗的首选药物。β-内酰胺酶基因分型均为TEM-1型且菌株以散发为主。 展开更多

关键词 流感嗜血杆菌 血清分型 耐药性 多位点序列分型

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13株肺炎链球菌标准菌株分子生物学特征分析 被引量：2

7

作者 李康 黄洋 +5 位作者 石继春 王春娥 徐潇 陈琼 赵丹 叶强 《临床检验杂志》 CAS 2021年第8期573-576,共4页

目的对中国医学细菌保藏管理中心保藏的13株肺炎链球菌标准菌株进行分子生物学特征分析。方法对13株肺炎链球菌标准菌株首先进行传统的培养特性、显微观察、血清凝集和质谱鉴定,然后进行16S rRNA基因分析和多位点序列分型(MLST)。结果1... 目的对中国医学细菌保藏管理中心保藏的13株肺炎链球菌标准菌株进行分子生物学特征分析。方法对13株肺炎链球菌标准菌株首先进行传统的培养特性、显微观察、血清凝集和质谱鉴定,然后进行16S rRNA基因分析和多位点序列分型(MLST)。结果13株标准菌株的培养特性、显微观察、血清凝集及质谱鉴定的结果均符合肺炎链球菌的特征;13株标准菌株均扩增出预期大小的16S rRNA基因片段,且与肺炎链球菌模式株NCTC 7465的16S rRNA基因序列(LN831051)的相似性在99.00%以上;MLST分型结果显示,13株标准菌株共分为13个ST型,分别为ST2296、ST180、ST2759、ST3844、ST12973、ST12977、ST3545、ST16632、ST875、ST10189、ST870、ST342和ST7234。菌株CMCC(B)31547的ST16632为新发现的ST型。结论获得了13株不同型别的肺炎链球菌标准菌株的16S rRNA基因序列信息和MLST分型数据,为肺炎链球菌菌株溯源和质量标准的进一步完善提供了数据支撑。 展开更多

关键词 肺炎链球菌 质谱鉴定 16S rRNA基因分析 多位点序列分型

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广州市食品中蜡样芽胞杆菌生化分型和多位点测序分型分析 被引量：2

8

作者 陈惠玲 刘俊华 +4 位作者 张晶 陈佳璇 张健 吴新伟 白志军 《实用预防医学》 CAS 2020年第5期530-533,共4页

目的了解广州市食品中蜡样芽胞杆菌的生化分型、多位点测序分型(multilocus sequence type,MLST)情况和优势序列型。方法根据国标将79株食品来源蜡样芽孢杆菌进行生化分型,并根据PubMLST网站提供的蜡样芽胞杆菌MLST分型方案,扩增7个管... 目的了解广州市食品中蜡样芽胞杆菌的生化分型、多位点测序分型(multilocus sequence type,MLST)情况和优势序列型。方法根据国标将79株食品来源蜡样芽孢杆菌进行生化分型,并根据PubMLST网站提供的蜡样芽胞杆菌MLST分型方案,扩增7个管家基因,经测序后,在PubMLST网站上比对获得菌株的序列型,利用eBURST V3和START2和MEGA6.0软件进行分析。结果广州市食品中的蜡样芽胞杆菌优势序列型为ST26,占16.46%。结论蜡样芽胞杆菌具有高度的遗传多样性。 展开更多

关键词 蜡样芽胞杆菌 生化分型 多位点测序分型 食品监测

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不同MLST型禽源空肠弯曲菌致病性研究 被引量：1

9

作者 吕嘉敏 黄武 +2 位作者 张宗尧 王媚 罗开健 《动物医学进展》 北大核心 2015年第11期11-15,共5页

为研究不同MLST型禽源空肠弯曲菌的致病性,挑取6个地区分离到的9种不同MLST分型的10株空肠弯曲菌代表株对SPF雏鸡进行攻毒试验及对细胞进行感染试验。结果显示,试验鸡肛拭子带菌率比较高(83%以上),不同组别的试验鸡体重增长差异不显著(P... 为研究不同MLST型禽源空肠弯曲菌的致病性,挑取6个地区分离到的9种不同MLST分型的10株空肠弯曲菌代表株对SPF雏鸡进行攻毒试验及对细胞进行感染试验。结果显示,试验鸡肛拭子带菌率比较高(83%以上),不同组别的试验鸡体重增长差异不显著(P>0.05),半数以上(60%)菌株对Vero细胞的入侵力和对Hela细胞的入侵能力均低于从腹泻病人分离得到人源标准株NCTC11168(P<0.001),但菌株CJ079株攻毒SPF鸡后死亡超过50%,且对Vero细胞的侵袭力高于NCTC11168。CJ001和CJ079同属于ST51型,而菌株CJ001与其他MLST分型的菌株相比差异不显著(P>0.05)。表明来源不同环境中同一种MLST分型中的不同菌株也可能具备不同的毒力特征,MLST序列型与毒力特征之间不存在某种确定的关系。 展开更多

关键词 空肠弯曲菌 多位点序列分型 禽源 致病性

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国内部分地区多杀性巴氏杆菌荚膜血清型和基因型的研究 被引量：21

10

作者 王林柏 孙久鹤 +5 位作者 郭东春 曹培丽 刘家森 刘春国 刘大飞 曲连东 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期116-119,共4页

为了解国内部分地区不同动物多杀性巴氏杆菌(P.multicida)流行情况,本研究以36株P.multicida为研究对象,通过多重荚膜PCR、多位点序列分型(MLST)和脂多糖多重PCR(LPS-m PCR)对其荚膜型和基因型进行鉴定。采用多重荚膜PCR方法将36株细菌... 为了解国内部分地区不同动物多杀性巴氏杆菌(P.multicida)流行情况,本研究以36株P.multicida为研究对象,通过多重荚膜PCR、多位点序列分型(MLST)和脂多糖多重PCR(LPS-m PCR)对其荚膜型和基因型进行鉴定。采用多重荚膜PCR方法将36株细菌的荚膜血清型分为A、B和D 3种,其中禽源P.multicida主要以A为主;以LPS-m PCR方法将P.multicida分为L1、L2、L3和L6 4种LPS基因型,禽源P.multicida主要为L1型;通过MLST技术将P.multicida分为ST-129、ST-8、ST-58、ST-5、ST-13、ST-50和ST-122 7种ST型,禽源P.multicida主要为ST-129型。本研究为P.multicida的流行病学监测和基因多样性提供了技术支撑。 展开更多

关键词 多杀性巴氏杆菌 多位点序列分型 脂多糖多重PCR LPS基因型

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19群肺炎链球菌国家标准菌株分子特征分析及在菌株质量控制中的应用 被引量：9

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作者 李康 黄洋 +5 位作者 徐潇 陈琼 王春娥 石继春 陈翠萍 叶强 《微生物学免疫学进展》 2019年第6期20-27,共8页

目的明确19群肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)国家标准菌株的分子特征,为完善中国肺炎链球菌国家标准菌株的质量标准提供依据。方法在传统肺炎链球菌菌种检定方法的基础上,应用16S rRNA基因分析、聚合酶链式反应(polymerase chain... 目的明确19群肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)国家标准菌株的分子特征,为完善中国肺炎链球菌国家标准菌株的质量标准提供依据。方法在传统肺炎链球菌菌种检定方法的基础上,应用16S rRNA基因分析、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)血清分型、多位点序列分型(multilocus sequence type,MLST)和脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分型等多种分子生物学质控方法,对来源于中国医学细菌保藏管理中心的20株19群肺炎链球菌国家标准菌株进行分析。结果20株19群肺炎链球菌的16S rRNA基因序列与肺炎链球菌模式株NCTC 7465的16S rRNA基因序列的相似性在99.64%~100%之间,碱基差异0~5 bp。PCR血清分型结果表明:11株19F型菌株均检测到大小为304 bp的19F型特异性扩增条带,6株19A型菌株均检测到大小为478 bp的19A型特异性扩增条带,PCR血清分型结果与血清凝集试验结果一致。MLST分型结果表明,相同血清型的菌株可以具有不同的序列型(sequence type,ST)。共获得12个ST型,其中6个ST型(10496、10497、10501、10502、10503和10509)为首次报道。PFGE分型结果显示:各型别菌株各具有其特征性PFGE带型(9~17条带),相同血清型或ST型菌株可能具有不同的PFGE带型。共存在18种不同的PFGE带型,其中19F型和19A型菌株中各有一对菌株的ST型和PFGE图谱完全一致。菌株的传代稳定性考察结果显示:在25代以内31708菌株的PFGE带型未发生变化,遗传特征是稳定的。结论16S rRNA基因分析、PCR血清分型、MLST分型和PFGE分型等分子生物学方法应用于中国肺炎链球菌国家标准菌株的质量控制,可获得更加全面的肺炎链球菌标准菌株身份信息数据(包括序列、PCR扩增片段、序列型、图谱等),为进一步完善中国肺炎链球菌国家标准菌株的质量标准提供依据和数据支撑。 展开更多

关键词 19群肺炎链球菌 聚合酶链式反应血清分型 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳 质量控制

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三亚某三甲医院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药性及分子流行病学特征

12

作者 陈如寿 钟佳芳 +3 位作者 石挺丽 王婧婧 吴吉芳 颜礼完 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期1134-1139,共6页

目的了解三亚某医院7年间肺炎克雷伯菌(KP)及耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药性变迁及分子流行病学特征。方法收集2016-2022年三亚中心医院(海南省第三人民医院)分离的KP及CRKP菌株药敏试验结果,通过多位点序列分型(MLST)分析及... 目的了解三亚某医院7年间肺炎克雷伯菌(KP)及耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药性变迁及分子流行病学特征。方法收集2016-2022年三亚中心医院(海南省第三人民医院)分离的KP及CRKP菌株药敏试验结果,通过多位点序列分型(MLST)分析及检测碳青霉烯类耐药基因型等分子特征,并分析流行菌株特征。结果2016-2022年共分离KP3994株,神经外科检出率最高(14.65%),主要分离自痰液(76.56%),对阿米卡星和替加环素耐药率较低,对头孢类药物耐药率高;7年间对常用抗菌药物耐药率呈下降趋势(P<0.05);2016-2022年共分离CRKP45株,儿科检出率最高(28.89%),主要来自痰液(60.00%);对酶抑制剂药物耐药率均>88.00%,对头孢类药物高度耐药,耐药率均>93.00%;替加环素耐药率较低;碳青霉烯酶基因检测结果为NDM型、KPC型、IMP型、VIM型,同时携带有2种基因型;儿科分离的CRKP以KPC型为主,占23.08%;MLST分型共获得26种ST型,以ST571(20.00%)为优势型别,是主要流行株,在本地社区流行传播具有密切亲缘关系。结论2016-2022年该医院分离的KP对常用抗菌药物耐药率呈下降趋势。CRKP对常用抗菌药物高度耐药,主要携带NDM型碳青霉烯酶为主要耐药机制;菌株分子分型动态性多样,存在优势克隆ST571型CRKP在医院流行和传播,需加强医院感染防控。 展开更多

关键词 肺炎克雷伯菌 多位点序列分型 碳青霉烯耐药 耐药基因型 分子流行病学

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