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LC-MS/MS分子网络及其对中药研究的启发 被引量:31
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作者 程桃芳 金慧子 +1 位作者 刘昌孝 张卫东 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期265-273,共9页
近年来,LC-MS/MS的分子网络技术已广泛应用于微生物、海洋生物、真菌及植物等来源的天然产物的研究,关于分子网络在中药方面的研究应用却鲜有报道。以分子网络为主题,首先对分子网络进行简要介绍,并对分子网络方面的文献进行了调研;随后... 近年来,LC-MS/MS的分子网络技术已广泛应用于微生物、海洋生物、真菌及植物等来源的天然产物的研究,关于分子网络在中药方面的研究应用却鲜有报道。以分子网络为主题,首先对分子网络进行简要介绍,并对分子网络方面的文献进行了调研;随后,对分子网络策略在化学成分定性表征、化学成分定量表征及质量控制、指导活性化合物的分离、提取工艺的优化以及疾病诊断和个性化治疗5个方面的应用进行综述;最后,对分子网络在中药研究方面的应用进行了展望,旨在为中药研究提供新的思路和方法,以期促进中医药的现代化发展。 展开更多
关键词 LC-MS/MS 分子网络 全球天然产物社会分子网络 中药 中医药
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基于HPLC-Q-TOF-MS/MS的分子网络技术快速分析夏天无生物碱 被引量:15
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作者 黄飞飞 王荣 +5 位作者 陈玥 沈爱金 刘艳芳 梁鑫淼 金红利 阎松 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第3期228-240,I0002,共14页
采用高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(HPLC-Q-TOF-MS/MS)技术结合分子网络快速分析夏天无中生物碱成分。选取Tnature C18色谱柱(4.6 mm×250 mm×5μm),以乙腈-0.5%甲酸为流动相进行梯度洗脱,流速1 mL/min,电喷雾离子源... 采用高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(HPLC-Q-TOF-MS/MS)技术结合分子网络快速分析夏天无中生物碱成分。选取Tnature C18色谱柱(4.6 mm×250 mm×5μm),以乙腈-0.5%甲酸为流动相进行梯度洗脱,流速1 mL/min,电喷雾离子源正离子模式下(ESI^(+))检测。将夏天无提取物的MS/MS数据在全球天然产物社会分子网络(Global Natural Products Social Molecular Networking)平台上进行数据转换,根据碎片离子的相似性建立簇,得到分子网络。结合色谱保留时间、精确分子质量、特征碎片离子、MS/MS裂解规律和文献报道等,在分子网络中识别出7个生物碱类型的粒子簇,包括普罗托品类、原小檗碱类、四氢小檗碱类、苯酞异喹啉类、简单异喹啉类、阿朴啡类和苄基异喹啉类生物碱,并分别鉴定了各化合物的化学结构。结果表明,在夏天无中共鉴定和推测出52个化合物,其中有21个潜在的新化合物,6个化合物为首次在夏天无中发现。该方法快捷、准确,可以为夏天无的药效物质基础研究提供科学依据。 展开更多
关键词 高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(HPLC-Q-TOF-MS/MS) 夏天无 分子网络
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基于质谱的分子网络分析化学调控对土曲霉C23-3次生代谢产物及生物活性的影响 被引量:8
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作者 马小翔 刘亚月 +5 位作者 聂影影 黎燕媚 王远 薛欣怡 洪鹏志 张翼 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期95-110,共16页
以一株高产丁内酯Ⅰ的海洋来源土曲霉C23-3作为出发菌株,筛选出可获得更丰富次生代谢产物的化学调控培养条件。利用2种基础培养基分别添加9种小分子化合物,对菌株进行24孔板上的化学调控培养,在菌丝体形态变化和薄层层析生物活性自显影... 以一株高产丁内酯Ⅰ的海洋来源土曲霉C23-3作为出发菌株,筛选出可获得更丰富次生代谢产物的化学调控培养条件。利用2种基础培养基分别添加9种小分子化合物,对菌株进行24孔板上的化学调控培养,在菌丝体形态变化和薄层层析生物活性自显影基础上,运用液相色谱-串联质谱法以及基于质谱的分子网络进一步分析次生代谢产物的产量和多样性。在糙米培养基中分别加入金合欢醇(1 μmol/L)、法尼焦磷酸铵盐(FPP,5 μmol/L)、亚硫酸氢钠甲萘醌(MSB,10 μmol/L)、3-氨基-L-酪氨酸(1 mmol/L)等4种诱导条件均可调控菌株C23-3次级代谢产物发生较明显变化,其丁内酯、土震素和洛伐他汀类化合物的多样性和产量较为突出。菌株C23-3经化学调控后的次生代谢产物产生了不同程度的变化,为活性化合物的发现提供了基础。 展开更多
关键词 海洋真菌 化学调控 丁内酯 LC-MS/MS 分子网络
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基于UHPLC-Q-TOF MS结合分子网络技术快速分析荷叶中生物碱类成分 被引量:3
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作者 郭忠会 覃春萍 +3 位作者 梁洁 李耀华 陈奎奎 肖红斌 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期893-906,共14页
该研究采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(UHPLC-Q-TOF MS)和分子网络整合技术,快速分析和鉴定了荷叶中的生物碱类化学成分。采用Acquity UPLC HSS T3色谱柱(100 mm×2.1 mm,1.8μm),以0.1%甲酸水和0.1%甲酸乙腈溶液为流... 该研究采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(UHPLC-Q-TOF MS)和分子网络整合技术,快速分析和鉴定了荷叶中的生物碱类化学成分。采用Acquity UPLC HSS T3色谱柱(100 mm×2.1 mm,1.8μm),以0.1%甲酸水和0.1%甲酸乙腈溶液为流动相进行梯度洗脱,流速为0.3 mL/min,在正离子模式下采集质谱数据信息。将经格式转换后的荷叶提取物二级质谱数据上传至全球天然产物社会分子网络(GNPS)平台计算分析,借助Cytoscape 3.6.1软件构建可视化分子网络,获得了单苄基异喹啉类、双苄基异喹啉类和阿朴啡类生物碱类型的粒子簇。根据对照品、色谱保留时间、特征碎片离子、MS/MS裂解规律和文献报道等信息,从荷叶中共鉴定和推测57种生物碱类成分,包括27个单苄基异喹啉类、2个双苄基异喹啉类、25个阿朴啡类和3个其他类生物碱,其中19个成分为潜在新化合物,30个成分在荷叶中首次报道。该方法快速、准确,可为荷叶的药效物质基础研究提供参考,为中药化学成分的快速定性分析提供借鉴。 展开更多
关键词 荷叶 UHPLC-Q-TOF MS 分子网络 生物碱
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整合UPLC-QTOF-MS分子网络与网络药理学探究龙葵化学成分及抗肺癌作用机制 被引量:2
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作者 刘晓利 李平 +6 位作者 王丹 孟超 邢燕 刘芳盈 陈昶 王勤 程忠哲 《中国现代应用药学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1347-1359,共13页
目的采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间串联质谱(UPLC-QTOF-MS)整合分子网络技术对龙葵全草的化学成分进行快速分析与鉴定,利用网络药理学技术初步探究其治疗肺癌的作用机制。方法运用UPLC-QTOF-MS,分别在正负离子模式下进行质谱检测... 目的采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间串联质谱(UPLC-QTOF-MS)整合分子网络技术对龙葵全草的化学成分进行快速分析与鉴定,利用网络药理学技术初步探究其治疗肺癌的作用机制。方法运用UPLC-QTOF-MS,分别在正负离子模式下进行质谱检测与分析,定性龙葵全草中化学成分。同时将二级质谱图转换格式后上传到GNPS网站构建分子网络,对其化学成分进行分析。综合2种方法的定性分析结果结合网络药理学和分子对接,分析龙葵治疗肺癌过程中起主要作用的靶点及通路。结果质谱分析和GNPS分别鉴定和匹配出41个和54个化合物,其中相交11个化合物,共鉴定出84个化合物。综合上述结果筛选出有效活性成分7个,对应不重复靶点298个,疾病靶点1294个,相交靶点66个,富集分析得到28条信号通路、20个生物学过程、16个细胞组分、17个分子功能。分子对接结果显示核心靶点与核心成分均有较强的亲和力。结论运用UPLC-QTOF-MS/MS整合分子网络技术可快速、全面、系统地分析鉴定龙葵全草中的化学成分;网络药理学及分子对接结果为龙葵临床用药和药理研究提供了科学依据。 展开更多
关键词 龙葵 UPLC-QTOF-MS 分子网络 网络药理学 分子对接 肺癌
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中国典型砖形黑茶非挥发物的代谢组学分析
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作者 余士兰 张宁 +5 位作者 闫昊艺 张运军 韩晓玉 任鸿宇 凌铁军 安茂强 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第18期160-167,共8页
为探究我国典型砖形黑茶代谢物轮廓的规律,以及砖形黑茶与黑茶真菌在代谢物种类方面的关系,本研究利用基于液相色谱-质谱联用的非靶向代谢组学和基于特征物信息的质谱分子网络技术,对我国典型的砖形黑茶(湖北青砖茶、四川康砖茶、湖南... 为探究我国典型砖形黑茶代谢物轮廓的规律,以及砖形黑茶与黑茶真菌在代谢物种类方面的关系,本研究利用基于液相色谱-质谱联用的非靶向代谢组学和基于特征物信息的质谱分子网络技术,对我国典型的砖形黑茶(湖北青砖茶、四川康砖茶、湖南的黑砖茶、花砖茶和茯砖茶、陕西的茯砖茶)以及茶鲜叶和分离自黑茶的多种真菌进行代谢组学分析。结果表明,砖形黑茶的非挥发性代谢物轮廓更倾向于按照生产地区进行分类,一组是来自湖南和陕西的砖形黑茶,而另一组是来自四川和湖北的砖形黑茶;决定其代谢物轮廓分组的最主要因素是砖茶含梗率,来自四川和湖北的砖形黑茶含梗率明显高于另一组;造成两组砖形黑茶轮廓差异的主要原因是湖南和陕西的砖形黑茶中有更高含量的黄烷-3-醇类和大部分氨基酸及其衍生物等代谢物;针对砖形黑茶和真菌代谢物的分子网络分析发现,在砖形黑茶中,尤其是在康砖茶中广泛分布着源自真菌的线性和环状二肽;在茯砖茶中有着结构种类丰富的异戊烯基二酮哌嗪类化合物,这类化合物来自于冠突散囊菌,因此,真菌为砖形黑茶贡献了种类丰富的代谢物。本实验结果可为全面了解和认识我国典型砖形黑茶的化学物质基础提供理论参考。 展开更多
关键词 中国典型砖形黑茶 代谢组学 非挥发性代谢产物 含梗率 真菌 质谱分子网络
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牡蛎共生菌Myceliophthora lutea ML-1发酵液的化学成分研究
7
作者 陶超 袁梦 +3 位作者 朱小丽 郝增君 王凤舞 申丽 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS 北大核心 2024年第2期69-75,共7页
为研究牡蛎共生菌Myceliophthora lutea ML-1发酵液的化学成分,采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析、C18反相柱层析、高效液相色谱等方法对M.lutea ML-1发酵液粗浸膏进行分离纯化;采用高分辨质谱、核磁共振谱等现代波谱技术及文... 为研究牡蛎共生菌Myceliophthora lutea ML-1发酵液的化学成分,采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析、C18反相柱层析、高效液相色谱等方法对M.lutea ML-1发酵液粗浸膏进行分离纯化;采用高分辨质谱、核磁共振谱等现代波谱技术及文献比对方法鉴定化合物结构,并基于LC-MS/MS分子网络分析M.lutea ML-1发酵液粗浸膏的化学成分。结果表明:从M.lutea ML-1发酵液中分离到5个化合物,即3-methoxy-5-pentadecylphenol(1)、3-methoxy-5-heptadecylphenol(2)、3-methoxy-5-nonadecylphenol(3)、3-methoxy-5-heneicosylphenol(4)和尿嘧啶(5)。分子网络分析显示,M.lutea ML-1发酵液富含多种类型化学成分;除间苯二酚类化合物外,还含有环二肽、酰胺、吲哚等生物碱。综上,从牡蛎共生菌M.lutea ML-1中分离得到的化合物1-4为5-烷基-3-甲氧基苯酚化合物,分子网络分析结果为后续化合物的导向分离提供了思路。 展开更多
关键词 牡蛎 共生菌 Myceliophthora lutea 次生代谢产物 分子网络
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Rapid discovery of two unprecedented meroterpenoids from Daphne altaica Pall.using molecular networking integrated with MolNetEnhancer and Network Annotation Propagation
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作者 Wei-Yu Zhou Zi-Han Xi +7 位作者 Ning-Ning Du Li Ye Ming-Hao Jiang Jin-Le Hao Bin Lin Guo-Dong Yao Xiao-Xiao Huang Shao-Jiang Song 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2024年第8期294-298,共5页
Under the guidance of the approach which integrates molecular networking,MolNetEnhancer and Net-work Annotation Propagation(NAP),daphnaltaicanoids A and B(1 and 2)with unprecedented 9-oxa-tetracyclo[6.6.1.0^(2,6).0^(8... Under the guidance of the approach which integrates molecular networking,MolNetEnhancer and Net-work Annotation Propagation(NAP),daphnaltaicanoids A and B(1 and 2)with unprecedented 9-oxa-tetracyclo[6.6.1.0^(2,6).0^(8,13)]pentadecane and tetracyclo[5.3.0.1^(2,5).2^(4,11)]tridecane central frameworks were iso-lated from Daphne altaica Pall.,representing two types of unparalleled meroterpenoid cores.Their struc-tures were elucidated by extensive spectroscopic analysis,nuclear magnetic resonance(NMR)calcula-tions,DP4+analysis and electronic circular dichroism(ECD)calculations.The plausible biosynthetic path-ways for 1 and 2 were postulated.Biologically,2 exerted potent neuroprotective activities which were su-perior to trolox at 12.5 and 25μmol/L.Moreover,1 and 2 exhibited more noticeable acetylcholinesterase inhibitory activities than donepezil.Molecular docking simulations were performed to explore the inter-molecular interaction of compounds 1 and 2 with acetylcholinesterase.The bioactivity evaluation results highlight the prospects of 1 and 2 as a novel category of neurological agents. 展开更多
关键词 Daphne altaica Pall. molecular networking MolNetEnhancer NAP Unprecedented meroterpenoid frameworks Neuroprotective activities Acetylcholinesterase inhibitors
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基于HPLC-Q-TOF MS的网络化技术对宁夏枸杞根皮的化学成分研究 被引量:4
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作者 何春娴 陈靖枝 +4 位作者 杨静玲 李舂龙 马晓莉 南泽东 江志波 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第6期792-803,I0006,共13页
建立了高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱(HPLC-Q-TOF MS)法分析宁夏枸杞根皮的主要化学成分。采用Agilent ZORBAX Extend C18柱(250 mm×4.6 mm×5μm),以水(含10 mmol/L醋酸铵)-乙腈为流动相进行等度洗脱,流速1.0 mL/min,柱... 建立了高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱(HPLC-Q-TOF MS)法分析宁夏枸杞根皮的主要化学成分。采用Agilent ZORBAX Extend C18柱(250 mm×4.6 mm×5μm),以水(含10 mmol/L醋酸铵)-乙腈为流动相进行等度洗脱,流速1.0 mL/min,柱温30℃,进样量5μL;电喷雾离子源正、负离子模式检测,质量扫描范围m/z 100~300和300~2000。利用数据转换软件将原始数据转换成mzXML格式,在GNPS上建立分子网络,并运用Cytoscape软件对结果进行可视化解读,结合文献数据推测化合物结构。通过手动检索发现了宁夏枸杞根皮中的21个化合物,与已报道的枸杞根皮中化合物一致。通过分子网络化聚类分析发现11个化合物,为地骨皮中首次报道,其中化合物24和25为新发现的环九肽类化合物。该方法可快速分析宁夏枸杞根皮的化学成分,为其质量控制奠定基础。 展开更多
关键词 高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱(HPLC-Q-TOF MS) 宁夏枸杞根皮 分子网络化
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宁夏枸杞根际土壤链霉菌Ⅱ-2-2-2的基因组测序和次级代谢产物分析 被引量:1
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作者 胡运琪 许建韧 +5 位作者 沈晓华 林文星 吴秀丽 南泽东 马晓莉 江志波 《中国医药生物技术》 2023年第2期99-109,共11页
目的 分析链霉菌Ⅱ-2-2-2基因序列,挖掘潜在次级代谢能力生物合成基因簇。方法 采用IlluminaHiSeq+PacBio测序技术获得链霉菌Ⅱ-2-2-2的基因组草图序列,经antiSMASH(v6.0.1)平台分析次级代谢产物合成基因簇,采用高效液相色谱-四极杆-飞... 目的 分析链霉菌Ⅱ-2-2-2基因序列,挖掘潜在次级代谢能力生物合成基因簇。方法 采用IlluminaHiSeq+PacBio测序技术获得链霉菌Ⅱ-2-2-2的基因组草图序列,经antiSMASH(v6.0.1)平台分析次级代谢产物合成基因簇,采用高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱技术对发酵液进行网络化分析。结果 自宁夏枸杞须根附近的土壤中分离得到一株菌株Ⅱ-2-2-2,经鉴定其与缺乏研究的Streptomycesacrimycini CSSP430 16S rRNA基因序列的相似度达99.64%。其基因组草图序列4 409 970 bp,G+C含量占66.43%,3974个蛋白质编码基因,10个rRNA操纵子和72个tRNA。Anti SMASH分析基因序列至少包含5条次级代谢产物合成基因簇,可能编码线性含唑肽类、核糖体合成和翻译后修饰的肽、非核糖体肽、聚酮类和萜类化合物。获得82个正负模式的离子,并将二级碎片离子在全球天然产物交互分子网络平台进行聚类分析和数据库搜索,发现了24个化学结构。结论 链霉菌Ⅱ-2-2-2具有丰富的次级代谢能力并可能成为研究和开发新抗生素的重要资源。 展开更多
关键词 链霉菌Ⅱ-2-2-2 生物合成基因簇 基因组挖掘 分子网络 次级代谢物
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利用液相色谱-质谱联用法结合分子网络技术分析杉叶的化学成分 被引量:1
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作者 陆国寿 黄周锋 +4 位作者 张赟赟 李冬梅 苏铁 高美美 閤雪晴 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期47-53,61,共8页
为了获取杉叶的化学成分,以广西种植的杉木杉叶为材料,采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术采集杉叶中化学成分的一、二级质谱数据,将质谱数据在全球天然产物社会分子网络(GNPS)平台上进行数据转换,根据碎片离子的相似性建立簇,得到分子... 为了获取杉叶的化学成分,以广西种植的杉木杉叶为材料,采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术采集杉叶中化学成分的一、二级质谱数据,将质谱数据在全球天然产物社会分子网络(GNPS)平台上进行数据转换,根据碎片离子的相似性建立簇,得到分子网络。结合色谱保留时间、精确分子质量、特征碎片离子裂解规律以及文献报道等,分别鉴定各化合物的化学结构。结果表明:①根据液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术对杉叶的检测及分子网络分析结果,识别出双黄酮类、原花青素类、黄酮类、黄酮苷类、二萜类等5种类型分子簇;②在杉叶样品中共鉴定和推测出88个化合物,如穗花杉双黄酮、原花青素B1、金圣草黄素、槲皮苷、美丽红豆杉素G等成分;③推测分析出杉叶中含有2个潜在的新化合物,均为萜类化合物。 展开更多
关键词 杉叶 液-质联用法 分子网络 化学成分
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液相色谱-串联质谱技术与分子网络的成分检测方法在植物性饲料添加剂领域的应用进展 被引量:3
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作者 王瑶瑶 高品一 +1 位作者 李丹琦 刘学贵 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期6943-6952,共10页
在“饲料禁抗”的时代,研究安全高效、无残留的新型植物性饲料添加剂对畜牧业的发展至关重要。植物提取物因具有资源丰富、生物功效多样、绿色安全及易于吸收等优势,已成为饲料添加剂领域的研究热点,而其成分分析及含量测定一直是饲料... 在“饲料禁抗”的时代,研究安全高效、无残留的新型植物性饲料添加剂对畜牧业的发展至关重要。植物提取物因具有资源丰富、生物功效多样、绿色安全及易于吸收等优势,已成为饲料添加剂领域的研究热点,而其成分分析及含量测定一直是饲料添加剂质量标准建立的技术问题。液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术结合分子网络(MN)在植物提取物成分检测方面具有精密度高、可视化程度强等特色。本文综述了近年来LC-MS/MS技术结合MN在植物提取物成分定性及定量分析中的应用,旨在为饲用植物提取物的成分检测提供理论依据,同时也为饲料添加剂质量标准的建立提供参考。 展开更多
关键词 液相色谱-串联质谱技术 分子网络 植物提取物 饲料添加剂 质量标准
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Targeted isolation of antitubercular cycloheptapeptides and an unusual pyrroloindoline-containing new analog,asperpyrroindotide A,using LC–MS/MS-based molecular networking
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作者 Yi-Qian Han Qun Zhang +8 位作者 Wei-Feng Xu Yang Hai Rong Chao Cui-Fang Wang Xue-Mei Hou Mei-Yan Wei Yu-Cheng Gu Chang-Yun Wang Chang-Lun Shao 《Marine Life Science & Technology》 SCIE CAS CSCD 2023年第1期85-93,共9页
Further insights on the secondary metabolites of a soft coral-derived fungus Aspergillus versicolor under the guidance of MS/MS-based molecular networking led to the isolation of seven known cycloheptapeptides,namely,... Further insights on the secondary metabolites of a soft coral-derived fungus Aspergillus versicolor under the guidance of MS/MS-based molecular networking led to the isolation of seven known cycloheptapeptides,namely,asperversiamides A–C(1–3)and asperheptatides A–D(4–7)and an unusual pyrroloindoline-containing new cycloheptapeptide,asperpyrroindotide A(8).The structure of 8 was elucidated by comprehensive spectroscopic data analysis,and its absolute configuration was determined by advanced Marfey’s method.The semisynthetic transformation of 1 into 8 was successfully achieved and the reaction conditions were optimized.Additionally,a series of new derivatives(10−19)of asperversiamide A(1)was semi-synthesized and their anti-tubercular activities were evaluated against Mycobacterium tuberculosis H37Ra.The preliminary structure−activity relationships revealed that the serine hydroxy groups and the tryptophan residue are important to the activity. 展开更多
关键词 Marine natural product MS/MS-based molecular networking Cycloheptapeptides SEMI-SYNTHESIS Anti-tubercular activity
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Chemical diversity of scleractinian corals revealed by untargeted metabolomics and molecular networking
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作者 Jiying Pei Yuxia Zhou +4 位作者 Shiguo Chen Kefu Yu Zhenjun Qin Ruijie Zhang Yitong Wang 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2023年第11期127-135,共9页
The chemical diversity of scleractinian corals is closely related to their physiological,ecological,and evolutionary status,and can be influenced by both genetic background and environmental variables.To investigate i... The chemical diversity of scleractinian corals is closely related to their physiological,ecological,and evolutionary status,and can be influenced by both genetic background and environmental variables.To investigate intraspecific variation in the metabolites of these corals,the metabolomes of four species(Pocillopora meandrina,Seriatopora hystrix,Acropora formosa,and Fungia fungites)from the South China Sea were analyzed using untargeted mass spectrometry-based metabolomics.The results showed that a variety of metabolites,including amino acids,peptides,lipids,and other small molecules,were differentially distributed among the four species,leading to their significant separation in principal component analysis and hierarchical clustering plots.The higher content of storage lipids in branching corals(P.meandrina,S.hystrix,and A.formosa)compared to the solitary coral(F.fungites)may be due to the high densities of zooxanthellae in their tissues.The high content of aromatic amino acids in P.meandrina may help the coral protect against ultraviolet damage and promote growth in shallow seawater,while nitrogen-rich compounds may enable S.hystrix to survive in various challenging environments.The metabolites enriched in F.fungites,including amino acids,dipeptides,phospholipids,and other small molecules,may be related to the composition of the coral's mucus and its life-history,such as its ability to move freely and live solitarily.Studying the chemical diversity of scleractinian corals not only provides insight into their environmental adaptation,but also holds potential for the chemotaxonomy of corals and the discovery of novel bioactive natural products. 展开更多
关键词 scleractinian coral chemical diversity metabolomics molecular networking environmental adaptation
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基于液相色谱-串联质谱分子网络的牡蛎共生真菌Myceliophthora lutea ML-1发酵液的化学成分分析
15
作者 陈春颖 陶超 +3 位作者 丁木子 王凤舞 朱小丽 申丽 《实用临床医药杂志》 2023年第20期105-112,117,共9页
目的基于液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)分子网络技术分析牡蛎共生真菌Myceliophthora lutea(M.lutea)ML-1发酵液的化学成分,以明确其次生代谢产物谱。方法将M.lutea ML-1使用真菌1号培养基进行发酵,发酵液粗浸膏的LC-MS/MS原始数据经MSco... 目的基于液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)分子网络技术分析牡蛎共生真菌Myceliophthora lutea(M.lutea)ML-1发酵液的化学成分,以明确其次生代谢产物谱。方法将M.lutea ML-1使用真菌1号培养基进行发酵,发酵液粗浸膏的LC-MS/MS原始数据经MSconvert软件转换为.mzXML格式文件,再上传至全球天然产物社会分子网络(GNPS)平台构建经典分子网络(CMN),进行化学成分识别和结构预测。将原始质谱数据经MZmine 2软件预处理后上传至GNPS平台构建特征峰分子网络(FBMN)。将CMN和FBMN分别导入Cytoscape软件进行可视化分析。结果基于CMN,从M.lutea ML-1发酵液中识别出49个化合物,包括18个脂肪酸类化合物、8个蒽醌类化合物、12个环二肽类化合物和11个其他类化合物,其中可能有2个新二蒽醌类化合物。基于FBMN进行发酵液化学成分的相对定量分析,目前已识别出其中的3个化合物。结论M.lutea ML-1真菌1号培养基发酵液的化学成分丰富,其中不乏极具潜力的活性化合物,可为后续化学成分的导向分离和菌株发酵条件优化提供思路。 展开更多
关键词 牡蛎 共生真菌 Myceliophthora lutea 次生代谢产物 液相色谱-串联质谱 分子网络
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非靶向代谢组学结合特征分子网络对不同等级抹茶非挥发性化合物的研究 被引量:2
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作者 王晶晶 朱尧 +5 位作者 夏雨 孔亚帅 陈凌芝 卫艺炜 尹鹏 郭桂义 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2022年第23期7750-7757,共8页
目的探究不同等级抹茶的非挥发性物质成分,分析影响样品代谢轮廓差异的非挥发性化合物。方法使用高效液相色谱-质谱仪对抹茶样品中的非挥发代谢物进行检测,结合全范围天然产物社群分子网络对不同等级抹茶的差异化合物定性。结果本研究... 目的探究不同等级抹茶的非挥发性物质成分,分析影响样品代谢轮廓差异的非挥发性化合物。方法使用高效液相色谱-质谱仪对抹茶样品中的非挥发代谢物进行检测,结合全范围天然产物社群分子网络对不同等级抹茶的差异化合物定性。结果本研究在抹茶样品中共检测到784个化合物,其中553个化合物具有二级质谱图。样品等级影响抹茶的化学轮廓,样品依据轮廓相似性可分为两组。影响化学轮廓且有显著变化的差异代谢物共筛选出30个,其中29个化合物在样品3中含量更高,通过标准品和质谱图等方式定性了19个化合物,表儿茶素没食子酸酯、天冬氨酸、茶氨酸、精氨酸等。同时对4个等级抹茶中的儿茶素类进行探究,发现没食子儿茶素、没食子儿茶素没食子酸酯和表没食子儿茶素没食子酸酯的含量随等级的下降而减少。结论本研究发现并定性了不同等级抹茶之间的差异化合物,为抹茶等级判定及标准化生产提供理论基础。 展开更多
关键词 抹茶 非靶向代谢组学 分子网络 等级
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Comprehensive profiling of Lingzhihuang capsule by liquid chromatography coupled with mass spectrometry-based molecular networking and target prediction 被引量:2
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作者 Mengliang Huang Sijia Yu +5 位作者 Qing Shao Hao Liu Yingchao Wang Hongzhang Chen Yansheng Huang Yi Wang 《Acupuncture and Herbal Medicine》 2022年第1期58-67,共10页
Objective:Lingzhihuang capsule(LZHC)is a natural product that consists of 10 commonly used medicinal plants,and it is used in traditional Chinese medicine to promote people’s overall health.Previously,LZHC was succes... Objective:Lingzhihuang capsule(LZHC)is a natural product that consists of 10 commonly used medicinal plants,and it is used in traditional Chinese medicine to promote people’s overall health.Previously,LZHC was successfully used as adjuvant therapy for treating patients with cancer.However,the chemical constituents of LZHC and their potential biological functions remain unclear.The aim of this study is to investigate the major bioactive compounds in LZHC and predict their pharmacological targets.Methods:The LZHC constituents were putatively identified by ultra-high performance liquid chromatography coupled with timeof-flight mass spectrometry combined with mass spectrometry-based molecular networking.The targets were predicted using SwissTargetPrediction software,and the associated gene ontology and Kyoto encyclopedia of genes and genomes pathways were analyzed using the Database for Annotation,Visualization,and Integrated Discovery.The mass spectrometry-based molecular network and compound-target-pathway network were constructed using Cytoscape 3.8.0 software.Results:We putatively identified 94 compounds of LZHC by mass spectrometry-based molecular networking,including triterpene(the main structural type)and other clusters(ie,flavonoids and organic acids).Our results suggested that multiple pivotal targets were regulated by LZHC,including tumor necrosis factor,nitric oxide synthase 2,glucocorticoid receptor,estrogen receptor,3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase 2,prostaglandin e2 receptor ep4 subtype,estrogen receptor beta,phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform,mitogen-activated protein kinase 3,and racalpha serine,which are related to signal transduction,positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoters,oxidation-reduction processes,inflammatory responses,and other biological processes.Functional annotation of those targets suggested that several signaling pathways may be regulated by LZHC,such as cancer-related proteoglycans,the PI3K-Aktsignaling 展开更多
关键词 Lingzhihuang capsule molecular networking Network pharmacology UPLC-Q-TOF/MS
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Acetylcholinesterase inhibitors and antioxidants mining from marine fungi:bioassays,bioactivity coupled LC-MS/MS analyses and molecular networking 被引量:2
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作者 Yingying Nie Wencong Yang +4 位作者 Yayue Liu Jingming Yang Xiaoling Lei William HGerwick Yi Zhang 《Marine Life Science & Technology》 2020年第4期386-397,共12页
Marine fungi are potentially important resources for bioactive lead compounds for discovering new drugs for diseases such as Alzheimer's disease.In this paper,the combined bioassay model of acetylcholinesterase(AC... Marine fungi are potentially important resources for bioactive lead compounds for discovering new drugs for diseases such as Alzheimer's disease.In this paper,the combined bioassay model of acetylcholinesterase(AChE)inhibition,1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl(DPPH)free radical scavenging,and Artemi ci larval lethality was used to evaluate the activity and toxicity of 35 n narine fun gal strains from seas around China.Their bioactive constitue nfs were revealed by thin layer chromatography(TLC)autography,bioactivity coupled LC-MS/MS and Global Natural Products Social Molecular Networking(GNPS).The results show that the extracts of five strains exhibited higher AChE inhibition ratios than the positive control compound,'tacrine;for which the ratio was 89.8%at 200 pig/ml.Six strains displayed both AChE inhibition(inhibition ratios>20%at 200 pg/ml)and DPPH scavenging activity(scavenging ratios>30%at 200 pg/ml)together with low Artemia larval toxicity(lethal rates<12%).TLC autography showed that the fractioned extracts of four strains contained highly diverse and different bioactive constituents,includi ng strains Talaromyces sp.C2\-\,Aspergillus ter re us C23-3,Trichoderma harzianum DLEN2008005,and Penicillium corylophilum TBG1-17.From the most potent sample F-l 1-1-b(derived from Aspergillus tern us C23-3),five AChE inhibitors and seven antioxida nts were recognized as bioactive molecules by AChE coupled ultrafiltration followed by LC-MS/MS,and LC-MS/MS coupled with DPPH incubation.Furthermore,with the aid of GNPS,the AChE inhibitors were plausibly annotated as territrem analogues including territrems A-C/D,arisugacin A and an unknown compound 4,and the seven antioxidants were assigned as butyrolactone I.aspernolide E,a phenolic derivative and possibly unknown compounds 8-10 and 12. 展开更多
关键词 Acetylcholinesterase inhibition Antioxida Marine fungi LC-MS/MS molecular networking
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Rapid identification of stigmastane-type steroid saponins from Vernonia amygdalina leaf based onα-glucosidase inhibiting activity and molecular networking
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作者 GAO Juanjuan ZHAO Mengling +3 位作者 SHAN Shujun LI Yongyi LUO Jun LI Yi 《Chinese Journal of Natural Medicines》 SCIE CAS CSCD 2022年第11期846-853,共8页
Steroid saponins are secondary metabolites with multiple medicinal values that are found in large quantities in natural medicines,especially Vernonia amygdalina,a famous nature medicine for the treatment of tonsilliti... Steroid saponins are secondary metabolites with multiple medicinal values that are found in large quantities in natural medicines,especially Vernonia amygdalina,a famous nature medicine for the treatment of tonsillitis,diabetes,pneumonia.The current study was designed to combine molecular networking(MN)with diagnostic ions for rapid identification ofΔ^(7,9(11))stigmastane-type saponins which were theα-glucosidase inhibitory active substances in V.amygdalina.First,theα-glucosidase inhibitory activities of fiveΔ^(7,9(11))stigmastane-type steroid saponins that were previously isolated were screened,which indicated that theΔ^(7,9(11))stigmastane-type steroid saponin was one of the active constituents responsible for ameliorating diabetes.Furthermore,a strategy was proposed to identify stigmastane-type steroid saponins and verify the plausibility of derived fragmentation pathways by applying MN,MolNetEnhancer and unsupervised substructure annotation(MS2LDA).Based on this strategy,other sevenΔ^(7,9(11))stigmastane-type steroid saponins were identified from this plant.Our research provide scientific evidence for the antidiabetic potential of the steroid saponin-rich extract of V.amygdalina leaf. 展开更多
关键词 Δ^(7 9(11))Stigmastane-type steroid saponins α-Glucosidase inhibitory activity Fragmentation pathways Diagnostic ions molecular networking
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南海来源放线菌Streptomyces sp.HDN1844000中lobophorin N的分离与结构鉴定
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作者 邢丽 常一民 +5 位作者 韩亚欣 张国建 朱天骄 彭吉星 李德海 车茜 《中国海洋药物》 CAS CSCD 2021年第5期9-15,共7页
目的对南海来源放线菌Streptomyces sp.HDN1844000的次级代谢产物进行研究。方法在生物活性筛选和液相二级质谱(LC-MS/MS)分子网络化学信息学策略指导下,采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶层析和高效液相色谱法(HPLC),对菌株提取物进... 目的对南海来源放线菌Streptomyces sp.HDN1844000的次级代谢产物进行研究。方法在生物活性筛选和液相二级质谱(LC-MS/MS)分子网络化学信息学策略指导下,采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶层析和高效液相色谱法(HPLC),对菌株提取物进行分离纯化,通过质谱(MS)、核磁共振谱(NMR)分析和与文献比对,阐明化合物结构,并对化合物的抑菌活性进行评价。结果从放线菌Streptomyces sp.HDN1844000的次级代谢产物中分离出1个新的spirotetronate类抗生素lobophorin N(1)和1个已知的类似物lobophorin A(2)。化合物1是1个新的lobophorin衍生物,其带有1个含3-氨基的D-kijanose变体并且在C-32处有1个甲基。生物活性筛选结果表明化合物1对蜡状芽孢杆菌、变形杆菌、草分枝杆菌和副溶血弧菌具有良好的抑菌活性,最低抑菌浓度(MIC)值为0.10~0.39μmol/L。 展开更多
关键词 抑菌 lobophorins 海洋链霉菌 分子网络 中国南海
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