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小尾寒羊4个微卫星座位的克隆及序列分析 被引量：69
1
作者 储明星 王吉振 +2 位作者 王爱国 李宁 傅金恋 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第5期402-405,共4页
小尾寒羊是我国优良的地方绵羊品种 ,具有极高的繁殖力 ,平均每胎产羔 2 6只。利用与Booroola绵羊高繁殖力主效基因 FecB连锁的 4个微卫星座位 OarAE10 1、OarHH35、BM14 3和BMS2 5 0 8对小尾寒羊、多赛特羊、多赛特公羊×小尾寒... 小尾寒羊是我国优良的地方绵羊品种 ,具有极高的繁殖力 ,平均每胎产羔 2 6只。利用与Booroola绵羊高繁殖力主效基因 FecB连锁的 4个微卫星座位 OarAE10 1、OarHH35、BM14 3和BMS2 5 0 8对小尾寒羊、多赛特羊、多赛特公羊×小尾寒羊母羊杂一代羔羊 3个绵羊群体 15 9只绵羊进行了遗传检测 ,证实了微卫星DNA的共显性遗传特性。用非变性 (中性 )聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物。对小尾寒羊 4个微卫星座位 6个克隆的PCR扩增片段测序获得的序列已被GenBank接受 ,登录号分别为AF394 4 4 5、AF394 4 4 6、AF394 4 4 7、AF394 4 4 8、AF394 4 4 9、AF394 4 5 0。本研究中小尾寒羊微卫星OarAE10 1的测序结果与GenBank登录的绵羊OarAE10 1序列的同源性为 98% ,小尾寒羊微卫星OarHH35的测序结果与GenBank登录的绵羊OarHH35序列的同源性为 99% ,小尾寒羊微卫星BM14 3的测序结果与GenBank登录的牛BM14 3序列的同源性为 95 % ,小尾寒羊微卫星BMS2 5 0 8的测序结果与GenBank登录的牛BMS2 5 0 8序列的同源性为 95 %。测得的小尾寒羊微卫星OarAE10 1、OarHH35、BM14 3和BMS2 5 0 8均为完全的微卫星 (TG) n。 展开更多
关键词 小尾寒羊 微卫星座位 克隆 序列分析
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基于微卫星标记对长江中上游胭脂鱼增殖放流效果的评估 被引量：26
2
作者 成为为 汪登强 +4 位作者 危起伟 王成友 杜浩 吴金明 李雷 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期574-580,共7页
利用已经发表的11对胭脂鱼多态性微卫星标记,对长江中上游胭脂鱼（Myxocyprinus asiaticus）增殖放流效果进行评估。结果表明,5个胭脂鱼养殖场内所有的149尾繁殖亲本和长江中上游采集的65尾胭脂鱼中共观测到140个等位基因,其观测杂合度... 利用已经发表的11对胭脂鱼多态性微卫星标记,对长江中上游胭脂鱼（Myxocyprinus asiaticus）增殖放流效果进行评估。结果表明,5个胭脂鱼养殖场内所有的149尾繁殖亲本和长江中上游采集的65尾胭脂鱼中共观测到140个等位基因,其观测杂合度和期望杂合度的平均值（范围）分别为0.771（0.519~0.906）和0.759（0.469~0.894）,多态信息含量（范围）为0.726（0.392~0.882）。通过软件Cervus统计得到,11个微卫星座位累计排除率为99.9983%,并且在长江中上游采集的65个样本中,11个样本与养殖场内繁殖亲本确定存在亲子关系,据此确定这11尾为增殖放流的胭脂鱼,并由此推算增殖放流的胭脂鱼对长江中上游野生群体的贡献量为16.92%。研究结果表明,增殖放流是实现胭脂鱼野生种群资源恢复的有效途径。 展开更多
关键词 胭脂鱼 微卫星标记 亲子鉴定 增殖放流 效果评估 长江中上游 Myxocyprinus asiaticus (Bleeker)
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西藏牦牛微卫星DNA的遗传多样性 被引量：24
3
作者 李铎 柴志欣 +3 位作者 姬秋梅 张成福 信金伟 钟金城 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期175-184,共10页
为了解西藏牦牛品种或类群的遗传多样性和亲缘关系,文章选用8对微卫星标记引物,利用PCR和复合电泳银染技术,通过计算基因频率(P)、有效等位基因数(Ne)、群体杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和遗传距离(D),对西藏11个牦牛类群共480个个体... 为了解西藏牦牛品种或类群的遗传多样性和亲缘关系,文章选用8对微卫星标记引物,利用PCR和复合电泳银染技术,通过计算基因频率(P)、有效等位基因数(Ne)、群体杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和遗传距离(D),对西藏11个牦牛类群共480个个体进行了遗传多样性和系统进化分析。结果表明:(1)8个微卫星标记在西藏牦牛类群中均表现出多态性,且均属高度多态位点,遗传多样性丰富;(2)8个微卫星标记的平均多态信息含量在西藏牦牛类群中均高于0.5,其中HEL13最高为0.8496,TGLA57最低为0.7349;在11个牦牛类群中,桑日牦牛的平均多态信息含量最高(0.7949),该群体内部存在较多的遗传变异;丁青牦牛最低(0.7505),则群体相对较纯;(3)在11个牦牛类群中,其杂合度大小分别为:桑日(0.8193)>江达(0.8190)>桑桑(0.8157)>巴青(0.8150)>康布(0.8123)>嘉黎(0.8087)>工布江达(0.8054)>斯布(0.8041)>类乌齐(0.8033)>帕里(0.8031)>丁青(0.7831),西藏东部牦牛的遗传多样性较西部的遗传多样性大,预示西藏东部可能是牦牛的发源地之一;(4)根据遗传距离,用UPGMA法构建聚类关系,表明西藏11个牦牛类群可以分为三大类,即嘉黎牦牛、帕里牦牛、桑桑牦牛、巴青牦牛、类乌齐牦牛、康布牦牛聚为一类,斯布牦牛、工布江达牦牛、桑日额牛、江达牦牛聚为一类,丁青牦牛单独成为一类。综上所述,西藏牦牛的遗传多样性较丰富,所选微卫星标记可用于西藏牦牛遗传多样性的评估。 展开更多
关键词 西藏牦牛 微卫星 遗传多样性
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微卫星位点获取方法的研究进展 被引量：18
4
作者 孙波 鲍毅新 +2 位作者 赵庆洋 张龙龙 胡知渊 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期2130-2137,共8页
微卫星标记(simple sequence repeat,SSR)是进行分子遗传学研究的一种有效手段,并以其多态性高、信息含量大、保守性等特点成为最受人们欢迎的分子标记之一。但微卫星标记具有种族特异性,必须采用特异引物进行PCR检测,因而存在引物开发... 微卫星标记(simple sequence repeat,SSR)是进行分子遗传学研究的一种有效手段,并以其多态性高、信息含量大、保守性等特点成为最受人们欢迎的分子标记之一。但微卫星标记具有种族特异性,必须采用特异引物进行PCR检测,因而存在引物开发的问题。本文就筛选基因组文库法、微卫星富集法、数据库查找法、近缘物种筛选法、TOMMI法和FI-ASCO法等具有代表性的微卫星标记开发策略进行了综述,旨在为分子生态学研究过程中微卫星位点筛选方法的选择提供参考。 展开更多
关键词 微卫星位点 分离方法 数据库查找 近缘物种 基因组DNA
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贵州地方山羊品种遗传背景的微卫星分析 被引量：16
5
作者 毛凤显 皇甫江云 赵有璋 《畜牧与兽医》 北大核心 2006年第2期13-15,共3页
用15个牛微卫星位点,以波尔山羊为对照,研究了4个贵州地方山羊品种(贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊、榕江小香羊)的遗传背景。结果:可分析的多态位点6个(BM1258、D1S104、ILSTS030、INRA063、INRABERN192、RM088),占40%(6/15),反应... 用15个牛微卫星位点,以波尔山羊为对照,研究了4个贵州地方山羊品种(贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊、榕江小香羊)的遗传背景。结果:可分析的多态位点6个(BM1258、D1S104、ILSTS030、INRA063、INRABERN192、RM088),占40%(6/15),反应了牛微卫星位点与山羊有较高同源性;贵州地方山羊品种比波尔山羊具有较高的遗传多样性,高低顺序是贵州白山羊>贵州黑山羊>黔北麻羊>榕江小香羊>波尔山羊;群体遗传分化大,群体变异主要存在于品种内,而品种间的变异较小;贵州白山羊与贵州黑山羊遗传距离最近,其次是榕江小香羊、黔北麻羊,与波尔山羊遗传距离最远,这与它们的地理分布及品种形成相符。 展开更多
关键词 贵州地方山羊 微卫星 分析 遗传背景
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西藏小型猪线粒体D-loop区及微卫星多态性的遗传学分析 被引量：12
6
作者 付艳艳 顾为望 +2 位作者 刘运忠 彭瑾瑜 常弘 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2006年第4期318-321,共4页
目的通过分析西藏小型猪线粒体控制区(D-loop区)及微卫星位点的遗传多态性,检测西藏小型猪的遗传背景,从而为其作为实验动物提供分子生物学方面的可靠依据。方法利用特异性引物对西藏小型猪的线粒体D-loop区及10个具有多态性的微卫星位... 目的通过分析西藏小型猪线粒体控制区(D-loop区)及微卫星位点的遗传多态性,检测西藏小型猪的遗传背景,从而为其作为实验动物提供分子生物学方面的可靠依据。方法利用特异性引物对西藏小型猪的线粒体D-loop区及10个具有多态性的微卫星位点进行扩增,割胶纯化并对线粒体D-loop区进行测序,另外采用聚丙烯酰胺凝胶电泳的方法分离微卫星位点的等位基因。结果西藏小型猪线粒体D-loop区全序列没有多态性,微卫星位点则具有高度的遗传多态性和杂合度,分别为0.584和0.573。结论西藏小型猪线粒体基因组无多态性,证明其在母系进化和遗传上与其他猪种较为一致,本实验所用的西藏小型猪生长于一个封闭的环境,导致其微卫星位点遗传多态性的中低度水平。 展开更多
关键词 西藏小型猪 线粒体 微卫星
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探讨微卫星作为地方山羊品种生长性状的遗传标记 被引量：9
7
作者 王建民 孙允东 +4 位作者 李宏滨 王桂芝 尚友国 关伟军 马月辉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期961-966,共6页
采用微卫星技术及最小二乘拟合线性模型,利用崂山奶山羊、济宁青山羊、鲁北白山羊和莱芜黑山羊4个地方山羊品种中的10个多态性微卫星基因座,分析了微卫星基因座及其等位基因对山羊生长性状的关联效应。结果表明:与品种、性别和年龄等因... 采用微卫星技术及最小二乘拟合线性模型,利用崂山奶山羊、济宁青山羊、鲁北白山羊和莱芜黑山羊4个地方山羊品种中的10个多态性微卫星基因座,分析了微卫星基因座及其等位基因对山羊生长性状的关联效应。结果表明:与品种、性别和年龄等因子比较,标记因子对山羊体重和体尺性状的影响较小,但发现BM6404、BM1818、BM812和BM6444基因座对体重有显著影响(P<0.05或P<0.01),BM6404、BM1818、BMS12484、MAF70基因座对主要体尺性状有显著影响(P<0.05或P<0.01)。BM6404基因座的等位基因130可能对山羊的胸围、体高、尻宽均有正效应;120对胸围有较强的负效应,而对体高、尻长则有较强的正效应;168对尻长、尻宽均表现为负效应。MAF70基因座的等位基因142对体长有正效应,178对体长有负效应。BMS1248基因座的等位基因128对管围有正效应。 展开更多
关键词 山羊 微卫星基因座 等位基因 生长性状 遗传标记
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应用微卫星标记对中国10个品种猪遗传变异的研究 被引量：2
8
作者 李雪梅 谷忠新 +2 位作者 李奎 彭中镇 龚炎长 《山东农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 2000年第3期261-264,268,共5页
对我国 7个地方猪品种 (二花脸、通城、清平、阳新、皖南花、赣东黑、万安 )和 3个引进品种 (长白、大白、杜洛克 )的 4个微卫星位点的多态性进行了检测 ,并对品种内和品种间的遗传变异进行了群体遗传学分析。结果初步表明 ,地方品种中... 对我国 7个地方猪品种 (二花脸、通城、清平、阳新、皖南花、赣东黑、万安 )和 3个引进品种 (长白、大白、杜洛克 )的 4个微卫星位点的多态性进行了检测 ,并对品种内和品种间的遗传变异进行了群体遗传学分析。结果初步表明 ,地方品种中二花脸、赣东黑、通城的品种内遗传变异较高 ,万安的品种内遗传变异最低。除万安猪外 ,其它地方品种的品种内变异均大于引进品种。品种间的聚类结果基本符合品种的地缘分布。 展开更多
关键词 引进品种 遗传变异 二花 地方品种 微卫星标记 种猪 种内变异 微卫星位点 多态性 群体遗传学
全文增补中
黄河下游家绵羊与家山羊遗传关系的微卫星分析 被引量：8
9
作者 王建民 岳文斌 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期53-62,共10页
为了探讨家养绵羊与山羊的属间遗传关系,我们利用13个定位于绵羊染色体上的微卫星基因座,分析了黄河下游4个地方绵羊品种、4个地方山羊品种和1个杂交绵羊类群的遗传结构及其系统发生关系。经Hardy-Weinberg平衡检验和中性测试,发现地方... 为了探讨家养绵羊与山羊的属间遗传关系,我们利用13个定位于绵羊染色体上的微卫星基因座,分析了黄河下游4个地方绵羊品种、4个地方山羊品种和1个杂交绵羊类群的遗传结构及其系统发生关系。经Hardy-Weinberg平衡检验和中性测试,发现地方绵羊和山羊种群均处于不平衡状态(P<0.01),61.53%的基因座属于中性位点,说明所研究种群属于非随机交配,可能受到选择、迁移等进化因素的影响。对有效等位基因数、多态信息含量、Shannon信息指数、观察杂合度和期望杂合度等遗传多样性参数进行比较,发现绵羊种群的遗传变异程度明显(P<0.01或P<0.05)高于山羊种群,但不同基因座上的差异效应不一致;结合F统计量和亲缘关系等参数,可推测绵羊和山羊虽然均存在不同程度的近交现象(He>Ho,FIS>0),但分别属于杂交和近交繁殖。通过群体遗传分化和系统发育拓扑结构分析,证明绵羊属由共同祖先分化而来的时间晚于山羊属,两属间的遗传距离为1.0708-1.5927,遗传分化时间约为19,807-28,955年;绵羊属内品种间的遗传分化程度(FST<0.05)均低于山羊属内品种间的分化(FST>0.15)。本研究揭示了人工选择对同域家养绵羊与山羊交配系统的形成及群体遗传分化具有深刻的影响。 展开更多
关键词 OVIS aries Capra hircus 微卫星基因座 多态信息含量 杂合度 遗传距离
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应用微卫星标记对中国7个品种猪遗传变异的研究 被引量：7
10
作者 李雪梅 李奎 +1 位作者 彭中镇 龚炎长 《河北职业技术师范学院学报》 2000年第2期8-12,共5页
对中国 4个地方猪品种 (二花脸、通城、清平、皖南花 )和 3个引进品种 (长白、大白、杜洛克 )的 6个微卫星位点的多态性进行了检测 ,并对品种内和品种间的遗传变异进行了群体遗传学分析。初步结果表明 ,地方猪品种的群体内变异均大于引... 对中国 4个地方猪品种 (二花脸、通城、清平、皖南花 )和 3个引进品种 (长白、大白、杜洛克 )的 6个微卫星位点的多态性进行了检测 ,并对品种内和品种间的遗传变异进行了群体遗传学分析。初步结果表明 ,地方猪品种的群体内变异均大于引进品种 ,其中二花脸的品种内变异最高。品种间的聚类结果表明 ,地方品种与引进品种间具有较远的亲缘关系 。 展开更多
关键词 中国猪 遗传变异 品种 微卫星标记 选育
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广西不同地区克氏原螯虾群体遗传多样性微卫星分析 被引量：12
11
作者 黄小芳 唐章生 +6 位作者 刘俊丹 张宏燕 钟一治 卢智发 侯树鉴 王大鹏 陆专灵 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期437-444,共8页
【目的】了解当前广西克氏原螯虾(Procambarus clarkii)群体的遗传背景,为其人工养殖及种质资源保护提供参考依据。【方法】选取广西5个地区(南宁、大塘、融水、柳州和来宾)的克氏原螯虾群体作为研究对象,利用8对微卫星引物对各克氏原... 【目的】了解当前广西克氏原螯虾(Procambarus clarkii)群体的遗传背景,为其人工养殖及种质资源保护提供参考依据。【方法】选取广西5个地区(南宁、大塘、融水、柳州和来宾)的克氏原螯虾群体作为研究对象,利用8对微卫星引物对各克氏原螯虾群体基因组DNA进行PCR检测,然后通过PopGene32和NTSYSpc 2.1等在线软件分析广西克氏原螯虾群体的遗传多样性。【结果】南宁(NN)、大塘(DT)、融水(RS)、柳州(LZ)和来宾(LB)5个克氏原螯虾群体的平均有效等位基因数(Ne)为2.5142~3.0574,平均期望杂合度(He)为0.5708~0.6489,平均多态信息含量(PIC)为0.4899~0.5843,存在中度至高度的遗传多样性,其中南宁群体和大塘群体的遗传多样性略低于融水群体、柳州群体和来宾群体。5个克氏原螯虾群体的平衡偏离指数(D)均为负值,且发生一定程度的Hardy-Weinberg平衡偏离,杂合子缺失现象普遍存在。5个克氏原螯虾群体间的基因流(Nm)为2.3898~6.0284,遗传分化指数(Fst)为0.0398~0.0947,表明各群体间存在广泛的基因交流,仅存在低度至中度的遗传分化;各克氏原螯虾群体间的遗传相似系数和遗传距离分别为0.6861~0.8583和0.1528~0.3768,其中,遗传距离趋势与Fst趋势一致,而遗传相似系数与Nm趋势一致,均表明柳州群体与来宾群体具有高度的相似性,遗传距离较近。UPGMA聚类分析结果也显示,南宁群体和大塘群体聚类为一支,而柳州群体先与来宾群体聚类再与融水群体聚类成另一支。【结论】广西不同地区克氏原螯虾群体具有一定的遗传多样性,但其杂合子缺失现象普遍存在,应通过适当引种及加强不同地区群体间的遗传交流,保护好克氏原螯虾的优良种质资源。 展开更多
关键词 克氏原螯虾 遗传多样性 微卫星位点 杂合子缺失 广西
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猪个体基因杂合度对肉质的影响 被引量：9
12
作者 刘桂琼 姜勋平 +2 位作者 熊远著 邓昌彦 屈彦纯 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期56-60,共5页
用分布在 1,2和 6号染色体上的 2 4个微卫星座位估计 14 0头F2 杂种猪的个体基因杂合度 ,并测定了这些个体的系水力 (WHC)、失水率 (WLR)、肌苷含量 (HR)、肌内脂肪 (IMF)、蛋白质含量、股二头肌 pH (pH (B) )、背最长肌 pH (pH (L) )... 用分布在 1,2和 6号染色体上的 2 4个微卫星座位估计 14 0头F2 杂种猪的个体基因杂合度 ,并测定了这些个体的系水力 (WHC)、失水率 (WLR)、肌苷含量 (HR)、肌内脂肪 (IMF)、蛋白质含量、股二头肌 pH (pH (B) )、背最长肌 pH (pH (L) )、复合肌 pH (pH (C) ) 8个肉质性状 ,并分析这些性状随个体基因杂合度增加的变化规律。结果表明 ,WHC和HR在个体基因杂合度超过 0 5时随杂合度增加而降低 ;WLR在个体基因杂合度小于 0 6 5时随杂合度增加而增加 ,之后随杂合度增加而降低 ;随个体基因杂合度的增加 ,蛋白质含量的变化不显著 ;IMF在个体基因杂合度小于 0 6 5时呈不规则变化 ,之后随个体基因杂合度增加而增加 ;pH (B)、pH (L)和 pH (C)随个体基因杂合度的增加变化趋势和幅度不明显。 展开更多
关键词 猪 个体基因 杂合度 杂种优势 肉质性状 微卫星座位
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波尔山羊微卫星标记多态性与生长性能的关系研究 被引量：12
13
作者 姚红卫 杨利国 +4 位作者 沈忠 张春艳 徐云翔 滑国华 陈世林 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1312-1319,共8页
根据山羊遗传连锁图谱和相关文献资料,选择2号和5号染色体上的8个微卫星座位作为分子标记,选用250头纯种波尔山羊作为实验群体,通过对该群体这8个微卫星座位的检测分析表明:BMS1248、BMS1898、IL-STS034、LSCV22、LSCV37、OarFCB011I、D... 根据山羊遗传连锁图谱和相关文献资料,选择2号和5号染色体上的8个微卫星座位作为分子标记,选用250头纯种波尔山羊作为实验群体,通过对该群体这8个微卫星座位的检测分析表明:BMS1248、BMS1898、IL-STS034、LSCV22、LSCV37、OarFCB011I、DVGA64和INRA040在波尔山羊群体中的有效等位基因数、遗传杂合度和多态信息含量分别为10.057 6、0.900 6、0.892 0,6.831 5、0.853 6、0.839 6,8.101 8、0.876 6、0.864 0,7.067 5、0.858 5、0.841 7,7.730 7、0.870 6、0.857 3,5.912 5、0.830 9、0.810 1,6.134 7、0.837 2、0.817 2,5.957 8、0.832 2、0.812 2。8个微卫星座位与生长性状的最小二乘分析结果表明:微卫星座位BMS1248的162/140基因型对出生体重、出生体长、出生体高、出生胸围具有正效应;微卫星座位BMS1898的119/101基因型对出生体重、出生体长、出生体高具有正效应,111/111基因型对出生胸围具有正效应;微卫星座位ILSTS034的193/167基因型对出生体重有正效应,193/167和199/167基因型对出生胸围有正效应;微卫星座位LSCV37的161/147和159/143基因型对出生体重具有负效应,161/147对出生体长和出生体高具有负效应;微卫星座位IDVGA64的281/243基因型对出生体高和出生体长具有负效应;微卫星座位INRA040的246/216基因型对出生体重和出生胸围具有正效应,246/216和238/238基因型对体高具有正效应。 展开更多
关键词 波尔山羊 生长性状 微卫星座位
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中国疫区内苹果蠹蛾微卫星位点的扩增稳定性及遗传多样性 被引量：11
14
作者 门秋雷 陈茂华 +1 位作者 张雅林 冯纪年 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期341-346,共6页
为揭示欧洲苹果蠹蛾微卫星位点在中国苹果蠹蛾群体遗传学研究中的有效性,以12对微卫星引物对采自中国主要疫区新疆、甘肃、黑龙江的8个苹果蠹蛾地理种群的120头个体在各位点的遗传多样性及扩增稳定性进行研究。所选取的12个微卫星位点中... 为揭示欧洲苹果蠹蛾微卫星位点在中国苹果蠹蛾群体遗传学研究中的有效性,以12对微卫星引物对采自中国主要疫区新疆、甘肃、黑龙江的8个苹果蠹蛾地理种群的120头个体在各位点的遗传多样性及扩增稳定性进行研究。所选取的12个微卫星位点中,有8个能够稳定扩增,各位点在大多数种群中均显示偏离哈迪-温伯格平衡,各位点上的平均等位基因数量为3.750～12.500,平均观察杂合度Ho为0.025～0.783,平均期望杂合度He为0.284～0.892。位点Cp2.P和Cp4.56分别具有较低的观察杂合度(0.109、0.025)和较高的近交系数Fis(0.806、0.954),说明这2个位点上的杂合子非常缺乏,其余6个位点均具有较高的杂合度水平和等位基因数量,适用于中国疫区内苹果蠹蛾微卫星分子标记研究。 展开更多
关键词 苹果蠹蛾 微卫星位点 遗传多样性 扩增稳定性
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8个亚洲水牛群体的遗传结构分析 被引量：9
15
作者 王冬蕾 常洪 +9 位作者 杨军香 张桂香 王志刚 于波 廖信军 宋卫涛 韩旭 宋光明 王均辉 李荣岭 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1103-1109,共7页
应用13个微卫星标记结合荧光–多重PCR技术,对德昌水牛、兴隆水牛、富钟水牛、温州水牛、东流水牛、福安水牛和两个引进品种摩拉水牛、尼里-拉菲水牛进行遗传结构分析。结果表明:8个水牛群体在13个微卫星座位中共检测到157个等位基因,其... 应用13个微卫星标记结合荧光–多重PCR技术,对德昌水牛、兴隆水牛、富钟水牛、温州水牛、东流水牛、福安水牛和两个引进品种摩拉水牛、尼里-拉菲水牛进行遗传结构分析。结果表明:8个水牛群体在13个微卫星座位中共检测到157个等位基因,其中7个群体具有各自的特有等位基因,其和为23;8个群体的有效等位基因数在2.2908～4.2308之间,杂合度在0.4951～0.7194之间,多态信息含量在0.4495～0.6776之间;有11个座位为高度多态座位,是适合分析水牛遗传多样性的多态标记;聚类分析表明富钟水牛和东流水牛先聚在一起,再与兴隆水牛聚在一起,然后与温州水牛和福安水牛聚在一起,德昌水牛独自聚为一类;两个引进品种聚为一类。 展开更多
关键词 水牛 微卫星 遗传多样性 多重PCR
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基于微卫星标记的图们江大麻哈鱼亲子鉴定技术研究 被引量：11
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作者 韩叶 郑伟 +6 位作者 康学会 闫春梅 李忠强 刘慧吉 李秀颖 柳鹏 陈伟强 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期84-89,共6页
大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)是重要的洄游性经济鱼类,在中国分布于黑龙江、乌苏里江、绥芬河和图们江水域。为保护大麻哈鱼种质资源,恢复图们江流域野外种群数量,该研究基于微卫星标记技术,利用10对微卫星标记,对355尾回捕子代和91尾... 大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)是重要的洄游性经济鱼类,在中国分布于黑龙江、乌苏里江、绥芬河和图们江水域。为保护大麻哈鱼种质资源,恢复图们江流域野外种群数量,该研究基于微卫星标记技术,利用10对微卫星标记,对355尾回捕子代和91尾繁殖亲本开展了亲子关系鉴定研究。结果表明,检测等位基因数(Na)201个,观测杂合度(Ho)为0.617~0.895,平均0.744;期望杂合度(He)为0.676~0.909,平均0.824;多态信息含量(PIC)为0.628~0.900,平均0.805。利用Cervus 3.0软件计算10个微卫星座位的累积非亲排除率(CEP)达99.95%。5个回捕样本与繁殖亲本存在亲子关系,确定为增殖放流的大麻哈鱼。该研究成功利用微卫星标记技术明确回捕大麻哈鱼归属地,为巩固中国鱼源国地位提供有力证据,同时为评估大麻哈鱼的增殖放流效果提供技术支撑。 展开更多
关键词 大麻哈鱼 亲子鉴定 微卫星标记 增殖放流 图们江
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中国小型鹅种的遗传多样性分析 被引量：9
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作者 李慧芳 朱文奇 +2 位作者 高玉时 葛洪伟 许文娟 《家畜生态学报》 2007年第3期11-14,共4页
采用微卫星标记技术对我国13个小型家鹅群体（莲花白鹅、永康灰鹅、太湖鹅、闽北白鹅、长乐鹅、乌棕鹅、阳江鹅、酃县白鹅、右江鹅、籽鹅、百子鹅、豁眼鹅、伊犁鹅）的遗传多样性进行了分析。结果表明：13个品种的平均杂合度都较高,平... 采用微卫星标记技术对我国13个小型家鹅群体（莲花白鹅、永康灰鹅、太湖鹅、闽北白鹅、长乐鹅、乌棕鹅、阳江鹅、酃县白鹅、右江鹅、籽鹅、百子鹅、豁眼鹅、伊犁鹅）的遗传多样性进行了分析。结果表明：13个品种的平均杂合度都较高,平均杂合度最高的为太湖鹅,最低的为豁眼鹅,杂合度范围为0.5041~0.7145,13个鹅种资源群体平的均杂合度为0.6132,反映了各鹅种的杂合度都较高,遗传多样性丰富;通过计算DA遗传距离发现各群体的遗传距离较远,分化时间较长;NJ聚类结果将13个中型鹅种聚为三大类,NJ的聚类结果分析与几个鹅品种的地域分布和经济用途的关系并不密切。 展开更多
关键词 鹅 品种 微卫星位点 遗传多样性
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云南人群系统性红斑狼疮与TNF微卫星基因座关系的研究 被引量：3
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作者 初正韬 孙浩 +3 位作者 钱亚屏 史磊 俞建昆 褚嘉祐 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期11-13,共3页
位于MHC内的肿瘤坏死因子 (tomornecrosisfactor,TNF)基因区域有 5个微卫星基因座a、b、c、d和e,本研究调查了中国云南汉族系统性红斑狼疮 (systemiclupuserythematosus,SLE)与这几个微卫星基因座多态性的关系。本文用荧光标记引物和半... 位于MHC内的肿瘤坏死因子 (tomornecrosisfactor,TNF)基因区域有 5个微卫星基因座a、b、c、d和e,本研究调查了中国云南汉族系统性红斑狼疮 (systemiclupuserythematosus,SLE)与这几个微卫星基因座多态性的关系。本文用荧光标记引物和半自动基因扫描方法对云南地区 97例SLE患者及 79例健康对照者的这 5个微卫星基因座进行了基因分型 ,结果发现 ,SLE患者的TNFa1(P =0 0 2 0 6 ) ,c2 (P =0 0 0 0 0 )等位基因频率较正常人显著增高 ,而TNFa2 (P =0 0 16 3) ,c3(P =0 0 0 6 5 ) ,c4(P =0 0 0 12 ) ,d6 (P =0 0 44 8)等位基因频率则是正常对照较SLE患者高。同时我们还发现在这 5个微卫星基因座中 ,与白种人比较中国人出现了尚未发现的新等位基因。 展开更多
关键词 SLE TNF 微卫星基因座 基因扫描 云南 系统性红斑狼疮
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实验兔三个封闭群微卫星DNA多态性遗传分析 被引量：8
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作者 高子淇 刘先菊 +6 位作者 荣蓉 高进权 佟巍 张丽芳 王艳蓉 向志光 刘云波 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2012年第2期26-31,共6页
目的对日本大耳白兔、青紫蓝兔、新西兰兔三个封闭群体开展群体遗传学分析。方法利用10个微卫星位点,进行Hardy-Weinberg平衡(HWE)检验,统计三个种群的基因频率、观测杂合度、期望杂合度、F值和遗传距离。结果青紫蓝品种在12L1E11位点,... 目的对日本大耳白兔、青紫蓝兔、新西兰兔三个封闭群体开展群体遗传学分析。方法利用10个微卫星位点,进行Hardy-Weinberg平衡(HWE)检验,统计三个种群的基因频率、观测杂合度、期望杂合度、F值和遗传距离。结果青紫蓝品种在12L1E11位点,新西兰品种在INRACCDDV0087位点与INRACCDDV0203位点,日本大耳白兔在Sat12位点与INRACCDDV0203,P<0.05,显著偏离HWE,多数表现为杂合子缺陷;三个群体在Sat13、Sol44、6L1F10、7L1F1、12L4A1、INRACCDDV0016点上均符合HWE;各位点平均等位基因数5.9,种群整体基因频率差别较大,其范围为0～0.9060;三个种群的平均观测杂合度为0.6204,平均期望杂合度为0.6178;群体间分化系数(Fst)平均为0.0750,日本大耳白兔和青紫蓝兔遗传距离最近为0.1223,青紫蓝兔与新西兰兔遗传距离最远为0.1934。结论三个种群的遗传结构均表现出遗传稳定性和均一性,在10个微卫星位点上呈现高度多态性,种群间遗传分化明显。 展开更多
关键词 日本大耳白兔 青紫蓝兔 新西兰兔 封闭群 微卫星
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长江口江豚的遗传多样性现状及种群动态 被引量：8
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作者 张枫 张保卫 +3 位作者 唐文乔 刘健 吴建辉 唐斌 《上海海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期656-665,共10页
长江口地处长江与东海、黄海的交汇处,是窄脊江豚东亚亚种和长江亚种的重叠分布区和死亡率高发区。筛选出16个多态性微卫星位点,对采自长江口的36头窄脊江豚东亚亚种样本作了遗传多样性和种群动态分析。结果显示,除了2个微卫星位点显著... 长江口地处长江与东海、黄海的交汇处,是窄脊江豚东亚亚种和长江亚种的重叠分布区和死亡率高发区。筛选出16个多态性微卫星位点,对采自长江口的36头窄脊江豚东亚亚种样本作了遗传多样性和种群动态分析。结果显示,除了2个微卫星位点显著偏离了Hardy-Weinberg平衡外,其他14个位点均未偏离Hardy-Weinberg平衡。16个微卫星位点共获得了129个等位基因,平均等位基因数达8. 1个。计算获得的平均观察杂合度(Ho)为0. 733,平均期望杂合度(He)为0. 758,多态性信息含量(PIC)均在0. 5以上。其遗传多样性水平与印度洋江豚和海豹等海洋哺乳动物相近,但明显高于大熊猫、东北虎等陆生珍稀哺乳动物。杂合度检验和Mode-shift模型分析显示,该种群未经历过近期的遗传瓶颈效应。Msvar软件的4次模拟均未发现该种群在历史上发生过明显的有效数量波动,估算的当前有效种群大小约为5 623头。研究显示,在长江口发现的窄脊江豚东亚亚种个体,属于一个大而稳定的种群。 展开更多
关键词 窄脊江豚 东亚亚种 微卫星标记 遗传多样性指标 瓶颈效应 种群动态
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