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茶树EST-SSR的信息分析与标记建立 被引量：85
1
作者 金基强 崔海瑞 +4 位作者 陈文岳 卢美贞 姚艳玲 忻雅 龚晓春 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期17-23,共7页
在1589条茶树EST中,共发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%,平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61kb。在茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复。设计了19对SSR引物,... 在1589条茶树EST中,共发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%,平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61kb。在茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复。设计了19对SSR引物,在对引物、dNTP、MgCl2的浓度及退火温度等参数进行测试后,建立了合适的PCR反应体系。以衍生绝大多数EST-SSR的龙井43DNA为模板,对引物进行了筛选,有16对引物显示扩增,可用率为84.2%;进一步在10个茶树品种中进行多态性测试,显现出多态性的引物占可扩增引物的62.5%。本文研究结果证明了根据茶树EST建立SSR标记是有效、可行的。 展开更多
关键词 茶树 EST SSR信息 标记建立
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白菜EST-SSR信息分析与标记的建立 被引量：73
2
作者 忻雅 崔海瑞 +4 位作者 卢美贞 姚艳玲 金基强 林容杓 崔水莲 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期549-554,共6页
数量迅速增加的EST为开发新的SSR标记提供了宝贵的资源。本研究对4584条白菜EST进行了搜索,共检索出474个SSR,检出率为10·3%,包括40种重复基元。其中二核苷酸和三核苷酸重复单元的EST-SSR占主导地位,二者出现的频率基本相近,占总SS... 数量迅速增加的EST为开发新的SSR标记提供了宝贵的资源。本研究对4584条白菜EST进行了搜索,共检索出474个SSR,检出率为10·3%,包括40种重复基元。其中二核苷酸和三核苷酸重复单元的EST-SSR占主导地位,二者出现的频率基本相近,占总SSR的近83%;其它重复类型所占比例均不足5%。GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的71·5%和37·5%。设计了15对EST-SSR引物,在合适的PCR反应体系下,以构建EST的白菜自交系A的DNA为模板,对设计的EST-SSR引物进行筛选,发现15对EST-SSR引物都能扩增出产物。进一步用这些可扩增的引物对28个白菜品种进行PCR扩增,发现7对引物显示多态性,占引物总数的46·7%。此结果表明,根据EST建立EST-SSR标记是一条简便而又有效的途径。 展开更多
关键词 白菜 EST SSR信息 标记
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SSR分子标记的开发技术研究进展 被引量：34
3
作者 唐荣华 张君诚 吴为人 《西南农业学报》 CSCD 2002年第4期106-109,共4页
综述简单重复序列标记(SSR)的特点及在作物遗传图谱构建、品种鉴定及分子标记辅助育种等方面的应用价值。重点描述开发SSR标记的两种方法的基本原理和主要步骤,一种是通过克隆酶切片段和大量测序寻找SSR标记的传统方法,一种是应用SAGE... 综述简单重复序列标记(SSR)的特点及在作物遗传图谱构建、品种鉴定及分子标记辅助育种等方面的应用价值。重点描述开发SSR标记的两种方法的基本原理和主要步骤,一种是通过克隆酶切片段和大量测序寻找SSR标记的传统方法,一种是应用SAGE原理不需要克隆的STMP技术。介绍这两种方法在创建小麦或大豆SSR标记中的应用。它们都能有效地开发可扩增出特定位点SSR的PCR引物。 展开更多
关键词 SSR分子标记 开发技术 引物开发 农业生物工程
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水稻香米基因标记的开发与应用 被引量：57
4
作者 王军 杨杰 +1 位作者 陈志德 仲维功 《分子植物育种》 CAS CSCD 2008年第6期1209-1212,共4页
稻米的香味是稻米食味品质的重要指标,而香味是受隐性核基因控制,杂合基因型不表现出香味,因此在香米育种中需要寻找一种快速、简便、准确的香味基因检测方法。本实验分别设计了水稻香米基因fgr的2个等位基因的基因标记(InDel-E2、InDel... 稻米的香味是稻米食味品质的重要指标,而香味是受隐性核基因控制,杂合基因型不表现出香味,因此在香米育种中需要寻找一种快速、简便、准确的香味基因检测方法。本实验分别设计了水稻香米基因fgr的2个等位基因的基因标记(InDel-E2、InDel-E7),利用这两个标记对20个香米和2个非香稻品种(品系),以及2个香米/非香米组合的Fl进行快速检测。结果显示,InDel-E2能检测到11个香米品种(品系),InDel-E7可检测其余9个香米品种(品系),且2个标记都能检测杂合基因型,说明本研究中的20个香米品种(品系)受2个香米基因控制。供试材料的分子检测结果与香米的基因型完全相符,因此本研究开发的2对标记可应用于香米育种的基因标记辅助选择和新香米基因的筛选。 展开更多
关键词 水稻 香米基因 基因标记 开发和应用
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EST分子标记开发及在比较基因组学中的应用 被引量：36
5
作者 李小白 崔海瑞 张明龙 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期541-547,共7页
数量迅速增加的EST(expressed sequence tags)为分子标记的开发提供了宝贵的资源。与来自于基因组DNA开发的传统标记相比,以EST为基础的分子标记是一种新型分子标记,具有其显著的优势,如开发简便、信息量高和通用性好等,在多方面都有重... 数量迅速增加的EST(expressed sequence tags)为分子标记的开发提供了宝贵的资源。与来自于基因组DNA开发的传统标记相比,以EST为基础的分子标记是一种新型分子标记,具有其显著的优势,如开发简便、信息量高和通用性好等,在多方面都有重要的利用价值。本文详细地介绍了目前基于EST开发的5类分子标记以及基于生物信息学方法的开发策略,这些标记包括EST-PCR、EST-SSR、EST-SNP、EST-RFLP和EST-AFLP。此外,对这些标记在比较基因组学研究中的应用进行了评述,包括比较作图、遗传多样性评价及系统发育研究等。 展开更多
关键词 EST 标记开发 比较作图 遗传多样性 系统发育学
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中药质量评价研究思路及创新发展趋势 被引量：45
6
作者 陈丽华 肖发林 +4 位作者 黄诗雨 朱卫丰 管咏梅 应鹏云 吕志豪 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期2541-2547,共7页
建立科学的中药质量评价体系是保障中药国际化、产业化的关键,通过中药有效性-物质基础-质量控制关联链辨识质量标志成分,将化学物质与临床疗效关联,以此评价中药有效性、安全性,实现中药整体质量评价。从中药质量评价体系发展历程出发... 建立科学的中药质量评价体系是保障中药国际化、产业化的关键,通过中药有效性-物质基础-质量控制关联链辨识质量标志成分,将化学物质与临床疗效关联,以此评价中药有效性、安全性,实现中药整体质量评价。从中药质量评价体系发展历程出发,对围绕中药性状的传统质量评价模式及活性成分的现代质量评价模式进行分析,基于质量标志物(quality marker,Q-Marker)与多学科内容有机结合,探讨Q-Marker质量评价模式的建立,提出创新方法导入中药质量评价的发展趋势。 展开更多
关键词 质量评价 中药 质量标志物 研究思路 创新发展
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甘蓝EST-SSR标记的开发与应用 被引量：42
7
作者 陈琛 庄木 +6 位作者 李康宁 刘玉梅 杨丽梅 张扬勇 程斐 孙培田 方智远 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期221-228,共8页
从NCBI数据库下载62567条甘蓝相关EST,处理后得到19611条无冗余的EST,对其进行SSR搜索,共得到1219条SSR,分布在1176条EST上,分布密度为1/11.48kb,包括273种重复基元。在甘蓝EST-SSR中,二核苷酸(353个SSR)和三核苷酸(423个SSR)占主导地位... 从NCBI数据库下载62567条甘蓝相关EST,处理后得到19611条无冗余的EST,对其进行SSR搜索,共得到1219条SSR,分布在1176条EST上,分布密度为1/11.48kb,包括273种重复基元。在甘蓝EST-SSR中,二核苷酸(353个SSR)和三核苷酸(423个SSR)占主导地位,所占比例分别为28.96%和34.70%;出现最多的重复基元是AG/CT,占总数的25.59%,其次为AAG/CTT(94个,占7.71%)。针对1176条含有SSR的EST设计合成了978对引物。用两份甘蓝自交系对978对引物进行初筛,897对引物有扩增产物,共扩增出1026条扩增带;128对引物表现出多态性,共有258条多态性带(占总带数的25.15%)。利用4对多态性引物,初步构建了中甘11、8398、中甘15、中甘21杂交新品种及其亲本的指纹图谱。以上结果说明从甘蓝相关EST数据库中开发的SSR引物有较好的可用性。 展开更多
关键词 甘蓝 EST-SSR 标记开发 指纹图谱
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与位点PbBa8.1紧密连锁分子标记的开发及甘蓝型油菜根肿病抗性育种 被引量：27
8
作者 战宗祥 江莹芬 +11 位作者 朱紫媛 张春沙 杨庆勇 李倩 侯照科 龚建芳 程雨贵 吴江生 傅廷栋 周永明 朴钟云 张椿雨 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期766-771,共6页
为培育抗根肿病的甘蓝型油菜新品系,提高油菜抗根肿病能力,以抗病芜菁ECD04(Brassica rapa,AA,2n=20)为供体,结合回交及分子标记辅助选择,将ECD04中抗根肿菌4号生理小种的位点Pb Ba8.1定向地转育到油菜常规品种华双5号(Brassica napus,A... 为培育抗根肿病的甘蓝型油菜新品系,提高油菜抗根肿病能力,以抗病芜菁ECD04(Brassica rapa,AA,2n=20)为供体,结合回交及分子标记辅助选择,将ECD04中抗根肿菌4号生理小种的位点Pb Ba8.1定向地转育到油菜常规品种华双5号(Brassica napus,AACC,2n=38)的遗传背景中。通过将所获得的抗病新品系在多个田间天然病圃进行测试,发现该位点对安徽黄山、湖北枝江、巴东地区的生理小种均表现为单基因显性抗病,由此培育出了ZHE-226抗病新品系。此外,通过借助二代测序技术及比较基因组学研究,还开发了与抗病基因更加紧密连锁的分子标记A08-300。 展开更多
关键词 根肿病 甘蓝型油菜 芜菁 标记开发 分子标记辅助选择
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高丹草EST-SSR标记的开发及其遗传多样性 被引量：26
9
作者 温莹 逯晓萍 +3 位作者 任锐 米福贵 韩平安 薛春雷 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期225-232,共8页
对NCBI数据库中210 878条高粱EST序列进行处理,得到57 498条无冗余EST序列,经SSR搜索,发现3 338个SSR分布于3 116条EST序列中,分布频率为1/11.28 kb,包括215种基元重复类型。其中三核苷酸重复最高,占68.33%,二核苷酸重复占17.97%。3 338... 对NCBI数据库中210 878条高粱EST序列进行处理,得到57 498条无冗余EST序列,经SSR搜索,发现3 338个SSR分布于3 116条EST序列中,分布频率为1/11.28 kb,包括215种基元重复类型。其中三核苷酸重复最高,占68.33%,二核苷酸重复占17.97%。3 338条SSR序列中有1 694条序列能够设计出引物,所占比例为50.75%。选取14对引物进行合成,对50份高丹草、7份高粱和3份苏丹草材料进行了EST-SSR扩增,共检测到72个等位变异,平均每对引物检测出5.14个基因位点。每对引物多态性指数范围为0.54~0.93,遗传距离的变化范围0.1646~0.6398。结果显示：供试材料具有较丰富的遗传多样性,根据EST-SSR数据的聚类分析,将供试材料按亲缘关系远近分为5大类,来源相同的品种大致聚在一类,呈现出一定的地域性分布规律。同时发现4个特异分子标记,其中引物D1763只对314A和白壳苏丹草杂交后代GB-4-2高丹草审定品种产生特异性,此标记已作为该材料的特异性标记用于种质资源的鉴定中,同时表明,EST-SSR标记是高丹草遗传多样性及特异性研究的一种有效方法。 展开更多
关键词 高丹草 EST-SSR 标记开发 遗传多样性 特异性
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EST分子标记开发研究进展 被引量：21
10
作者 陈全求 詹先进 +1 位作者 蓝家样 黄云 《中国农学通报》 CSCD 2008年第9期72-77,共6页
EST(expressed sequence tags)计划作为植物基因组计划的一个重要组成部分,已经在多种植物物种中开展起来,EST资源库的不断扩充为利用这些数据来开发EST分子标记奠定了基础。概括介绍了几种主要EST标记(EST-SSR,EST-PCR,EST-SNP,EST-AFL... EST(expressed sequence tags)计划作为植物基因组计划的一个重要组成部分,已经在多种植物物种中开展起来,EST资源库的不断扩充为利用这些数据来开发EST分子标记奠定了基础。概括介绍了几种主要EST标记(EST-SSR,EST-PCR,EST-SNP,EST-AFLP,EST-RFLP)的开发策略,同时也提出了EST标记开发存在的一些问题及解决方法。 展开更多
关键词 EST 分子标记 开发
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杜仲基因组微卫星特征及SSR标记开发 被引量：22
11
作者 吴敏 杜红岩 +2 位作者 乌云塔娜 刘攀峰 荆腾 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2015年第3期387-393,共7页
为全面解读杜仲的遗传背景,本研究在基因组测序(数据未公布)的基础上,通过MISA软件搜索杜仲基因组(26 947/854 758 160 bp)中的完整型(1 7核苷酸重复)及复合型SSR序列,共查找出25 694个Scaffolds含有488592个SSR位点,占总Scaffolds的95... 为全面解读杜仲的遗传背景,本研究在基因组测序(数据未公布)的基础上,通过MISA软件搜索杜仲基因组(26 947/854 758 160 bp)中的完整型(1 7核苷酸重复)及复合型SSR序列,共查找出25 694个Scaffolds含有488592个SSR位点,占总Scaffolds的95.3%。从SSR位点分布密度上讲,平均每1 749 bp出现1个微卫星,其中单核苷酸重复单元的SSR含量最多,约占总数的54.34%,其次为二核苷酸(20.47%),而复合模式、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸和七核苷酸重复分别占20.29%、23.89%、0.77%、0.13%、0.10%和0.01%,并发现SSR中均以含A、T的重复类型占主导地位。根据SSR位点设计并合成引物290对,162对SSR引物扩增出清晰的目的条带,其中16对引物多态性高、稳定性好,在8份杜仲资源中共检测到84个等位基因,平均每个SSR位点检测到5.25个等位基因。本研究对于进一步利用SSR分子标记分析杜仲遗传多样性、遗传图谱构建、杜仲雌雄株早期鉴定等具有较高的应用价值。 展开更多
关键词 杜仲 基因组 标记开发 多态性
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植物病原菌SSR标记开发与利用 被引量：14
12
作者 徐静静 蔺宇 朱振东 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期14-21,共8页
SSR标记具有共显性、高多态性、位点专化性、稳定性好、操作技术简单等特点,是十分理想的分子标记。随着一些简单、经济和高效的SSR分离技术的发展,SSR标记已逐渐在植物病原菌中被开发和利用。本文综述了植物病原菌中SSR标记的主要开发... SSR标记具有共显性、高多态性、位点专化性、稳定性好、操作技术简单等特点,是十分理想的分子标记。随着一些简单、经济和高效的SSR分离技术的发展,SSR标记已逐渐在植物病原菌中被开发和利用。本文综述了植物病原菌中SSR标记的主要开发策略及其应用进展。 展开更多
关键词 植物病原菌 SSR标记 开发 利用
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GenBank数据库中黄麻EST-SSR标记的开发及其通用性评价 被引量：15
13
作者 张立武 袁民航 +6 位作者 何雄威 刘星 方平平 林荔辉 陶爱芬 徐建堂 祁建民 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期1213-1219,共7页
从GenBank公共数据库中下载黄麻表达序列标签838条,利用SSRPrimer软件对其进行SSR位点查找,利用Primer 3.0软件设计66对SSR引物,通过琼脂糖凝胶研究这些SSR引物的PCR扩增特点,以检测其多态性。结果表明,66对SSR引物在黄麻属6个不同类型... 从GenBank公共数据库中下载黄麻表达序列标签838条,利用SSRPrimer软件对其进行SSR位点查找,利用Primer 3.0软件设计66对SSR引物,通过琼脂糖凝胶研究这些SSR引物的PCR扩增特点,以检测其多态性。结果表明,66对SSR引物在黄麻属6个不同类型材料的扩增中,42(63.6%)对引物至少在2个材料之间存在多态性。(AT)n重复基元和(GC-)n丰富的三核苷酸重复基元多态性较高,可作为黄麻SSR标记引物设计的首选。黄麻EST-SSR标记开发效率较高,不仅可以丰富黄麻分子标记的数量,而且为剖析黄麻重要性状的遗传机制奠定基础,这对于黄麻的遗传基础研究具有重要应用价值。 展开更多
关键词 黄麻 EST SSR 标记开发 多态性
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基于石榴全基因组序列的SSR标记开发及鉴定 被引量：13
14
作者 洪文娟 郝兆祥 +5 位作者 刘康佳 罗华 毕润霞 苑兆和 宗世祥 王君 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期38-47,共10页
【目的】利用cDNA文库筛选的石榴SSR多态性标记数量有限,为进一步推动石榴遗传多样性分析、遗传图谱构建、品种鉴定等研究,有必要系统开发高效稳定的分子标记位点。【方法】本研究根据已发表的石榴基因组测序数据利用MISA软件对1~6核苷... 【目的】利用cDNA文库筛选的石榴SSR多态性标记数量有限,为进一步推动石榴遗传多样性分析、遗传图谱构建、品种鉴定等研究,有必要系统开发高效稳定的分子标记位点。【方法】本研究根据已发表的石榴基因组测序数据利用MISA软件对1~6核苷酸重复的SSR位点进行了查找,分析了不同类型SSR位点的序列特征,进而设计引物并检测了引物的有效性和多态性。【结果】(1)石榴基因组中共检测到146 445个SSR位点,其中以单核苷酸重复型SSR最多(占51.95%),六核苷酸重复型最少(仅占0.38%);SSR序列以A/T碱基占主导,具有偏向性。(2)石榴基因组SSR序列长度变化范围为10~252 bp,平均长度15.48 bp。不同长度重复单元类型的SSR序列长度存在丰富变异,呈现随着重复次数增多,SSR序列丰度减少的趋势。(3)根据不同类型SSR位点设计并合成引物140对,其中119对在12份石榴种质中可扩增出有效条带,41对可产生多态性条带,PIC值在0.007~0.566之间;从中筛选出多态性较高、稳定性好的引物15对,共检测到等位基因44个,平均每个SSR位点检测到2.933 3个等位基因。【结论】利用石榴全基因组序列可实现SSR标记的大规模开发,并可鉴定出大量适用于石榴遗传多样性分析、遗传图谱构建、品种鉴定等研究的SSR引物。相关研究为石榴的遗传育种研究提供了丰富的SSR序列信息和标记资源。 展开更多
关键词 石榴 基因组 SSR 标记开发 多态性
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基于菊芋转录组的SSR分子标记开发及鉴定 被引量：13
15
作者 杨世鹏 孙雪梅 +5 位作者 王丽慧 高洁铭 李莉 田洁 赵孟良 钟启文 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期484-492,共9页
利用菊芋(Helianthus tuberosus L.)转录组测序获得的63 089条Unigene(45.71 Mb)进行SSR查找分析,共检测出6 635个SSR位点,包含于5 452条Unigene中,出现频率为10.52%,SSR位点发生频率为8.64%,其中SSR位点的主要类型为二核苷酸重复,占总... 利用菊芋(Helianthus tuberosus L.)转录组测序获得的63 089条Unigene(45.71 Mb)进行SSR查找分析,共检测出6 635个SSR位点,包含于5 452条Unigene中,出现频率为10.52%,SSR位点发生频率为8.64%,其中SSR位点的主要类型为二核苷酸重复,占总SSR的45.24%,其次为三核苷酸重复。SSR位点中共包含180种重复基序,其中出现频率较高的基序主要有AG/CT、ACC/GGT、ATC/ATG、AAG/CTT。设计36对多态性SSR引物组合进行扩增和多态性评价,其中,20对引物存在多态性差异,占55.56%。利用20对引物对18个菊芋资源样品进行多样性分析,分析表明,有效等位基因(Ne)在SSR位点上变化幅度较小;Shannon指数平均值为0.622;期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho)平均值分别为0.434和0.447。系统进化树显示,菊芋资源可从块茎表皮颜色上分为白皮和红皮2大类。此外,从地域来源上进行聚类,能将18份菊芋种质资源聚为5类。以上分析表明,菊芋转录组测序产生的Unigene信息可作为开发SSR标记的有效来源,利用获得的SSR标记可为菊芋及其近缘种的遗传图谱构建、遗传多样性分析、基因组比较研究等提供丰富可靠的标记选择。 展开更多
关键词 菊芋 SSR 转录组 标记开发
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玉米分子标记辅助育种及标记开发研究进展 被引量：12
16
作者 陈秀华 于丽娟 +2 位作者 罗黎明 陈洪梅 刘丽 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期26-31,共6页
为了充分挖掘和利用分子标记辅助育种在玉米中的应用潜力,分析了影响标记辅助育种效率的诸多因素,总结了可用于育种实践的标记开发方法,阐述了其在玉米品质和抗性育种中的应用现状,并列举了一些可用于辅助分析的工具软件。最后对玉米标... 为了充分挖掘和利用分子标记辅助育种在玉米中的应用潜力,分析了影响标记辅助育种效率的诸多因素,总结了可用于育种实践的标记开发方法,阐述了其在玉米品质和抗性育种中的应用现状,并列举了一些可用于辅助分析的工具软件。最后对玉米标记辅助育种现存问题进行了深入解析,提出我国应大力开展玉米重要农艺性状的基因定位研究,并拓展分子标记辅助育种的应用范畴。 展开更多
关键词 玉米 分子标记辅助育种 标记开发:数量性状基因座
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一种水稻高氮利用率NRT1.1B基因功能标记的开发与应用 被引量：12
17
作者 田孟祥 余本勋 +4 位作者 张时龙 何友勋 吴瑞 田井平 叶永印 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期410-416,共7页
水稻NRT1.1B是一个高氮利用率基因,在育种中有着重要的应用价值。为提高NRT1.1B基因的选择效率,根据野生型NRT1.1B与突变型nrt1.1b基因存在的单核苷酸差异,结合四引物扩增受阻突变体系PCR的技术原理开发基因功能标记。使用8份含NRT1.1B... 水稻NRT1.1B是一个高氮利用率基因,在育种中有着重要的应用价值。为提高NRT1.1B基因的选择效率,根据野生型NRT1.1B与突变型nrt1.1b基因存在的单核苷酸差异,结合四引物扩增受阻突变体系PCR的技术原理开发基因功能标记。使用8份含NRT1.1B基因的常规籼稻、8份含nrt1.1b基因的常规粳稻及4份含NRT1.1B/nrt1.1b基因的F1材料对功能标记进行检测验证,结果表明,所开发的基因功能标记可准确区分NRT1.1B基因的纯合显性、纯合隐性和杂合基因型,其扩增带型与基因型完全吻合,是一种鉴定NRT1.1B基因的有效方法。该方法操作简便,且费用低廉,可广泛应用于水稻NRT1.1B基因的资源鉴定和分子标记辅助选择育种。利用NRT1.1B功能标记,对本课题组的籼粳杂交育种材料进行鉴定,筛选出了一批含高氮利用率NRT1.1B的材料,为进一步的育种利用奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 高氮利用率 NRT1.1B基因 功能标记 开发与应用
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马铃薯块茎形状基因CAPS标记的开发与验证 被引量：11
18
作者 朱文文 徐建飞 +6 位作者 李广存 段绍光 刘杰 卞春松 庞万福 Walter De Jong 金黎平 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1529-1536,共8页
马铃薯块茎形状(薯形)是选育马铃薯品种尤其是加工品种最重要的性状之一。前人研究表明薯形是由位于第10染色体的单基因Ro控制的,并且圆形对长形为显性。本研究以二倍体马铃薯长薯形基因型10618-01和圆薯形基因型320-02及其213个F1代薯... 马铃薯块茎形状(薯形)是选育马铃薯品种尤其是加工品种最重要的性状之一。前人研究表明薯形是由位于第10染色体的单基因Ro控制的,并且圆形对长形为显性。本研究以二倍体马铃薯长薯形基因型10618-01和圆薯形基因型320-02及其213个F1代薯形分离群体为材料,基于马铃薯基因组相关序列信息结合分离群体分组分析法开发标记,获得了一个CAPS标记1137-CAPSVI。利用该标记对53份不同薯形的四倍体马铃薯高代品系进行验证,结果表明该标记的选择准确率达83.02%,进一步的Pearson双侧相关分析显示其相关性达极显著水平,且该标记对圆薯形材料的选择准确率更高,达91.42%。该CAPS标记的获得对于四倍体马铃薯分子标记辅助育种,加速马铃薯品种尤其是加工专用型品种的选育具有重要意义。 展开更多
关键词 马铃薯 薯形 标记开发 分子标记辅助育种
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南瓜属EST-SSR标记的开发及在杂种纯度鉴定中的应用 被引量：11
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作者 张国裕 张帆 +2 位作者 姜立纲 翟伟卜 李海真 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2011年第6期97-101,共5页
为利用SSR标记进行快速、准确的南瓜杂交种纯度分析,进行了南瓜EST-SSR标记的开发。从NCBI数据库下载1 457条南瓜属作物EST序列,去除冗余序列后进行SSR位点搜索,共得到215条含有SSR位点的EST序列。这些SSR位点包含111种重复基元,其中二... 为利用SSR标记进行快速、准确的南瓜杂交种纯度分析,进行了南瓜EST-SSR标记的开发。从NCBI数据库下载1 457条南瓜属作物EST序列,去除冗余序列后进行SSR位点搜索,共得到215条含有SSR位点的EST序列。这些SSR位点包含111种重复基元,其中二核苷酸(62个,占28.84%)和三核苷酸(86个,占40.0%)重复类型占主导地位;重复基元中出现最多的是CT(21个,占9.77%),其次为TC(13个,占6.05%)和AAG(12个,占5.58%)。将215个SSR位点设计成EST-SSR引物后,随机合成了其中的43对引物。利用4份遗传背景差异较大的南瓜自交系对合成的43对引物进行扩增效果评价,其中28对引物有稳定清晰的扩增产物,占合成引物的65.12%。利用这些有效扩增引物对南瓜属作物商品杂交种进行纯度检测,共获得13个杂交组合的特异性检测引物,F1杂交种的纯度在79.2%～100.0%,与田间检测结果相符。结果表明,利用南瓜EST序列开发SSR引物具有简单快速、成本低和适用性好的特点。 展开更多
关键词 南瓜 EST-SSR 标记开发 杂种纯度
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疏风解毒胶囊二次开发的系统研究 被引量：11
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作者 张铁军 朱强 +3 位作者 许浚 曹勇 申秀萍 李翔宇 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2019年第15期3517-3525,共9页
中药大品种二次开发研究是中药创新研究的重要内容,是继承和发展中医药理论,突破制约中医药理论和中药产业发展瓶颈的重要路径。以疏风解毒胶囊为研究对象,进行了系统的二次开发研究,通过药材、成品以及口服入血成分的辨识和表征,阐释... 中药大品种二次开发研究是中药创新研究的重要内容,是继承和发展中医药理论,突破制约中医药理论和中药产业发展瓶颈的重要路径。以疏风解毒胶囊为研究对象,进行了系统的二次开发研究,通过药材、成品以及口服入血成分的辨识和表征,阐释了疏风解毒胶囊的化学物质组,进一步通过UPLC-Q/TOF-MS整合核转录因子-κB(NF-κB)双荧光素酶报告基因系统、G-蛋白偶联受体结合实验以及网络药理学分析和谱-效筛选方法,筛选和明确了主要药效物质基础;基于传统功效,以整体动物模型、基因组学等方法,从抗炎免疫、解热等方面阐释其作用机制,并阐明主要成分的药动学及组织分布规律,阐释了疏风解毒胶囊的作用机制;通过拆方研究并与同类中药以及化学药比较,阐释了该药的组方特点和配伍规律,提炼和发现了其作用特点、比较优势和临床核心价值;通过多批样品、多指标成分的含量测定以及指纹图谱共有模式的建立等方面进行系统研究,建立疏风解毒胶囊的药材与成品的质量控制体系,对原有的质量标准进行了全面提升,保证了产品的质量均一、稳定、可控。为该品种的临床推广应用和指导临床实践提供了重要的理论和实验依据,并为其他中药大品种的二次开发研究提供了可参考的思路与模式。 展开更多
关键词 中药大品种 疏风解毒胶囊 质量标志物 二次开发 系统研究 网络药理学 谱-效关系
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