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籼稻品种93-11同义密码子的使用偏性 被引量:36
1
作者 刘庆坡 谭军 薛庆中 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第4期335-340,共6页
利用籼稻品种 93 11的全基因组序列及相应的EST数据 ,对影响同义密码子用法的若干因子进行了详细分析。指出 93 11基因的表达水平 (mRNA丰度 )与 3个同义密码子偏性指标CAI、CPP和ENC相关极显著 (r =0 2 2 7 ,0 14 5 和 - 0 14 7 ... 利用籼稻品种 93 11的全基因组序列及相应的EST数据 ,对影响同义密码子用法的若干因子进行了详细分析。指出 93 11基因的表达水平 (mRNA丰度 )与 3个同义密码子偏性指标CAI、CPP和ENC相关极显著 (r =0 2 2 7 ,0 14 5 和 - 0 14 7 ) ,表明高表达的基因其同义密码子非随机使用的程度越大 ;基因长度与CAI和CPP极显著负相关 (r=- 0 4 13 和 - 0 4 80 ) ,与ENC极显著正相关 (r=0 2 10 ) ,暗示较短的基因具有更高的转录活性 ;编码区G +C含量对其同义密码子偏性的贡献率远高于mRNA丰度和基因长度 ,G +C含量与CAI、CPP和ENC相关系数分别高达 0 877 ,0 832 和 - 0 74 0 ;起始编码区内A、T、C、G 4种碱基呈明显的 3周期振荡 ,尤以ATG下游第一个密码子所在的 3个位点 (+4、+5和 +6 )偏置最强烈 ,由此认为在这 3个特殊位点有较高的自然选择压存在 ;93 11中 2 5个最优密码子的首次确定将对水稻转基因具有指导意义。 展开更多
关键词 水稻 同义密码子使用偏性 基因表达水平 基因长度 编码区G+C含量 起始编码区 最优密码子
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杨树同义密码子用法的初步分析(英文) 被引量:22
2
作者 周猛 童春发 施季森 《植物生理与分子生物学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期285-293,共9页
杨树是世界上广泛栽培的重要造林树种之一,已经成为林木基因工程研究的模式植物。用杨树的314个蛋白编码基因,通过对应分析和ENC-plot分析探讨了若干重要因子对杨树密码子用法的效应。从分析结果中可以看出,在影响最大的第一条向量轴上... 杨树是世界上广泛栽培的重要造林树种之一,已经成为林木基因工程研究的模式植物。用杨树的314个蛋白编码基因,通过对应分析和ENC-plot分析探讨了若干重要因子对杨树密码子用法的效应。从分析结果中可以看出,在影响最大的第一条向量轴上,基因的坐标位置与该基因的表达水平(CAI)极显著负相关(r=-0.94**),其次是与GC3S和基因长度极显著相关(r=0.86**和r=-0.57**),说明基因表达水平高低是影响密码子发挥作用的主要因素,基因编码区碱基组成和基因长度次之。ENC-plot分析结果也证明了这一点。相对密码子使用值(RSCU)的计算结果表明,高表达基因强烈偏好以A或T结尾的密码子,并确定了TTA和ATA等10个密码子为杨树的主要偏爱密码子。将杨树的密码子使用频率与拟南芥、水稻、大肠杆菌和人等不同模式生物种比较后发现,杨树密码子的偏爱性与同为双子叶植物的拟南芥最为相似,与人和大肠杆菌之间的差异较大。 展开更多
关键词 密码子用法 对应分析 GC35含量 基因长度 基因表达水平 优越密码子 杨树
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影响链球菌属肺炎球菌基因组密码子使用的因素分析 被引量:9
3
作者 侯卓成 杨宁 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第8期747-752,共6页
链球菌属肺炎球菌 (Streptococcuspneumoniae)的完整基因组序列已经测定完毕并于近期发表。对肺炎球菌基因组序列进行了详细分析 ,研究了基因组密码子的使用模式和影响密码子使用的因素。高水平表达基因的密码子第三位碱基使用胞嘧啶 (C... 链球菌属肺炎球菌 (Streptococcuspneumoniae)的完整基因组序列已经测定完毕并于近期发表。对肺炎球菌基因组序列进行了详细分析 ,研究了基因组密码子的使用模式和影响密码子使用的因素。高水平表达基因的密码子第三位碱基使用胞嘧啶 (C)的频率比表达水平低的基因使用C有显著的提高 ,表达水平较低的基因在密码子的第三位碱基更趋向使用鸟嘌呤 (G)。基因的表达水平与对应分析的第一条向量轴呈显著相关 (R =0 .86 )。比较表达水平高、低的两组基因的密码子使用模式发现 ,基因的表达水平对于密码子使用有显著的影响。基因碱基G +C的组成与基因的表达水平 (R =0 .4 4 )、对应分析的第一条向量轴 (R =0 .5 1)有显著的相关 ,对基因的表达水平、密码子的使用有显著的影响。通过GC skew、蛋白质的疏水性、基因的长度分析 ,发现不同长度的基因表达水平、GC含量、GC3s有差异。结果表明 ,在表达水平上的自然选择以及基因的碱基组成是影响肺炎球菌基因密码子使用的主要因素 。 展开更多
关键词 链球菌属肺炎球菌 基因组 密码子 使用 因素分析
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木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基基因全长克隆 被引量:2
4
作者 郭雅静 罗兴录 陈会鲜 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期1147-1153,共7页
【目的】克隆木薯腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)小亚基基因cDNA全长序列,为木薯高淀粉品种的分子育种提供依据。【方法】根据木薯AGPase小亚基基因已知片段设计特异性引物,以木薯根、茎、叶为材料,利用PCR及RACE克隆木薯AGPase小... 【目的】克隆木薯腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)小亚基基因cDNA全长序列,为木薯高淀粉品种的分子育种提供依据。【方法】根据木薯AGPase小亚基基因已知片段设计特异性引物,以木薯根、茎、叶为材料,利用PCR及RACE克隆木薯AGPase小亚基基因cDNA全长序列。运用生物信息学方法对其核苷酸序列和推导氨基酸的理化性质、蛋白质三级结构进行系统分析。【结果】克隆获得木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基cDNA全长1566bp,其中包括1566bp的完整ORF,编码一个含521个氨基酸的多肽。其理论蛋白质分子量57.01kDa,等电点6.1,呈酸性。多重序列比较分析结果显示,木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基核苷酸序列与蓖麻、麻风树和杨树相应序列的相似性分别为87%、87%和86%。结合系统进化树分析结果推测,木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基在不同物种及进化过程中具有高度的保守性。蛋白三级结构分析结果表明,木薯AGPase小亚基蛋白具有15个α-螺旋、24个β-折叠和多个转角。【结论】木薯AGPase小亚基基因cDNA全长序列与蓖麻、麻风树和杨树等具有较高的同源性。 展开更多
关键词 木薯 腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase) 基因克隆 序列分析 基因全长
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禽传染性支气管炎病毒江西分离株JX/WTF09全基因序列分析
5
作者 先国兰 张连英 +1 位作者 郭丽娜 刘启亮 《中国临床药理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期441-443,共3页
目的食品安全越来越受关注,肉鸡药物使用严格受限,病毒性疾病防控重在预防。为了解肾型禽传染性支气管炎病毒(IBV)江西流行株全基因序列特点,对JX/WTF09 IBV分离株进行了全基因序列测定,并从同源性、遗传进化和各基因长度进行了分析,为... 目的食品安全越来越受关注,肉鸡药物使用严格受限,病毒性疾病防控重在预防。为了解肾型禽传染性支气管炎病毒(IBV)江西流行株全基因序列特点,对JX/WTF09 IBV分离株进行了全基因序列测定,并从同源性、遗传进化和各基因长度进行了分析,为疫苗研制提供数据支撑。方法收集2009年从江西发病肉鸡上分离的IBV,RT-PCR扩增22个片段,应用DNASTAR.Lasergene.v7.1拼接全基因序列,NCBI BLAST SERVER同源性检索,应用MEGA5.0分析全基因系统进化树。结果与国内分离株相似性最大、遗传进化关系最近,各基因虽有突变,但无太多的插入和缺失。结论JX/WTF09分离株主要是国内IBV毒株变异而来,不属于国外IBV分支,也不属于国内的IBV疫苗株分支。 展开更多
关键词 IBV全基因 基因长度 流行
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人类1号染色体可变剪接与普通剪接基因同义密码子的使用分析 Ⅱ.基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱(英文)
6
作者 陈学平 武耀廷 +2 位作者 张成 郭家明 马飞 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期6-14,共9页
进一步研究基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱之间的关系。多变量统计分析发现,人类1号染色体选择性剪接基因和普通剪接基因密码子使用变化都呈现单一趋势,且它们之间的密码子使用模式也非常相似,推测的高表达基因确实偏爱以C或G... 进一步研究基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱之间的关系。多变量统计分析发现,人类1号染色体选择性剪接基因和普通剪接基因密码子使用变化都呈现单一趋势,且它们之间的密码子使用模式也非常相似,推测的高表达基因确实偏爱以C或G结尾的密码子,基因表达水平与密码子使用偏爱之间的关联也达到显著水平。因此,人类1号染色体高表达基因密码子的使用偏爱可能主要被翻译选择所决定。此外,基因长度与密码子偏爱水平之间也存在高度相关,说明相对较短的基因具有较高的密码子使用偏爱,翻译选择可能缩短了高表达基因的长度从而提高翻译效率。 展开更多
关键词 人类 1号染色体 可变剪接 普通剪接 基因表达 基因长度 翻译选择 密码子使用 偏爱模式
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基因在长度方面的关联
7
作者 晋宏营 刘美云 《新乡师范高等专科学校学报》 2004年第5期11-13,共3页
以流感嗜血菌和结核分枝杆菌两种生物的全基因组作为研究对象,运用信息论的方法,研究了基因组内基因之间在长度方面的关联特征。发现对于这两种生物的基因组来说,基因之间存在着较强的短程关联,而且全基因组基因间关联要强于正链或... 以流感嗜血菌和结核分枝杆菌两种生物的全基因组作为研究对象,运用信息论的方法,研究了基因组内基因之间在长度方面的关联特征。发现对于这两种生物的基因组来说,基因之间存在着较强的短程关联,而且全基因组基因间关联要强于正链或负链上基因之间的关联,并对这些现象进行了相应的解释。 展开更多
关键词 基因长度 信息关联 基因组 流感嗜血菌 结核分枝杆菌
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人补体C4短基因分布频率在我国南北人群中存在的差异
8
作者 吴雄文 姜晓丹 +3 位作者 杨志章 季安全 刘敏 赵修竹 《同济医科大学学报》 CSCD 2000年第1期8-10,共3页
采用限制性片段长度多态性(RFLP)方法对北京(60例)和湖北(58例)地区随机人群的补体C4基因的长度进行检测。结果:湖北人群C4短基因的分布频率较北京人群高,其表型频率分别为 79. 31%、61.44%,基因频率... 采用限制性片段长度多态性(RFLP)方法对北京(60例)和湖北(58例)地区随机人群的补体C4基因的长度进行检测。结果:湖北人群C4短基因的分布频率较北京人群高,其表型频率分别为 79. 31%、61.44%,基因频率分别为51.72%、37.50%,差异均有显著意义(均为P<0.05),而且C4短基因在上述二个人群中的分布均符合Hardg-Wenberg平衡。结果表明,湖北人群C4短基因的频率高于北京人群。这种由于逆转录病毒序列的插入所致的C4基因长度的变化为研究某些疾病的遗传易感性提供了线索。 展开更多
关键词 补体4 汉族人群 基因长度 基因分布频率
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低密度cDNA芯片技术的优化 被引量:2
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作者 赵雨杰 黄宝俊 +1 位作者 徐惠绵 何群 《生命科学研究》 CAS CSCD 2004年第4期322-328,共7页
为了建立稳定的低密度cDNA芯片技术平台,研究靶基因的最适长度、浓度、点样溶液种类及杂交反应动力学,并了解该芯片的重复性与可靠性.结果表明,杂交具有较好的特异性,不同长度(189~1078bp)、浓度(0.5g/L、1.0g/L、1.5g/L)的同一靶基因... 为了建立稳定的低密度cDNA芯片技术平台,研究靶基因的最适长度、浓度、点样溶液种类及杂交反应动力学,并了解该芯片的重复性与可靠性.结果表明,杂交具有较好的特异性,不同长度(189~1078bp)、浓度(0.5g/L、1.0g/L、1.5g/L)的同一靶基因杂交信号强度无明显差别;以50%DMSO为点样溶液者杂交信号最好(P=0.0001).60℃杂交18h信号最佳(P<0.001).重复2次检测结果差异无显著性(P=0.348),重复性较好,其相关系数为0.588.与RT-PCR结果相比,相关系数为-0.778(P<0.0001),特异性为100%,灵敏度为80%(16/20),可靠性较好. 展开更多
关键词 CDNA芯片 靶基因长度和浓度 点样溶液 杂交动力学 可靠性
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中国人内源性高甘油三酯血症患者脂蛋白脂酶及肝脂酶常见基因变异的研究 被引量:19
10
作者 张秋萍 刘秉文 +6 位作者 刘宇 张蓉 张荣爵 江渝 付明德 吴兆丰 David J.Galton 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1997年第5期289-293,共5页
为了解中国人内源性高甘油三酯血症患者脂蛋白脂酶及肝脂酶常见基因变异情况,应用多聚酶链反应(PCR)对成都地区69例内源性高甘油三酯血症患者(HTG)及74例正常人脂蛋白脂蛋酶(LPL)及肝脂酶(HL)基因的多态性进行... 为了解中国人内源性高甘油三酯血症患者脂蛋白脂酶及肝脂酶常见基因变异情况,应用多聚酶链反应(PCR)对成都地区69例内源性高甘油三酯血症患者(HTG)及74例正常人脂蛋白脂蛋酶(LPL)及肝脂酶(HL)基因的多态性进行了研究。检测的LPL基因突变位点有:Asp9→Asn,Asn291→Ser,Thr361→Thr,Ser447→Ter及内含子8的HindⅢ酶切位点;HL基因突点位点为Thr202→Thr。结果表明,在欧洲白种人中存在的与HTG相关联的Asp9→Asn及Asn291→Ser突变在69例HTG及74例正常中国人中1例也未发现(P<0.03);与欧洲白种人比较,LPL基因其余3个酶切位点少见等位基因频率则未见差异;而HL基因C679→G中G等位基因频率中国人显著低于欧洲白种人(0.057vs0.500,P<0.0001)。中国人HTG组与正常对照组比较,LPL基因5个突变位点及HL基因C679→G突变的少见等位基因频率均未见差异,且LPL及HL基因型亚型血脂及载脂蛋白(apo)水平均无差异。上述结果表明,中国人内源性高甘油三酯血症可能与LPL基因C1338→A,C1595→G及内含子8HindⅢ位点? 展开更多
关键词 高甘油三酯血症 脂蛋白脂酶 肝酶基因
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中国人冠心病与载脂蛋白B基因Xba I酶切多态性关联的研究 被引量:13
11
作者 叶平 王士雯 陈保生 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1995年第2期75-78,共4页
应用多聚酶链反应(PCR)研究了100例正常人和103例冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)患者apoB基因XbaI酶切位点的限制性片段长度多态性(RFLP)。结果表明:冠心病患者和正常人均以X-等位基因为主,绝大... 应用多聚酶链反应(PCR)研究了100例正常人和103例冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)患者apoB基因XbaI酶切位点的限制性片段长度多态性(RFLP)。结果表明:冠心病患者和正常人均以X-等位基因为主,绝大多数为纯合子X-X-基因型。少见X+等位基因,其频率显著低于欧美白种人(P<0.001)。冠心病组中X+等位基因频率明显高于正常对照组(0.088:0.025,P<0.01)。冠心病组中X+X-基因型者高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平明显低于X-X-基因型者。XbaI酶切位点的核苷酸序列分析,cDNA第7673位核苷酸C→T突变,产生一个XbaI酶切点,即X+等位基因。推测apoB基因XbaI酶切位点的RFLP与中国人冠心病发病可能有一定关联,通过降低HDL-C水平而增加了动脉粥样硬化的易感性。 展开更多
关键词 冠心病 载脂蛋白B 基因 多态性 RFLP
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中国汉族人群vWF基因Msp Ⅰ和Rsa Ⅰ限制性片段长度多态性研究 被引量:7
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作者 李震宇 万海英 +4 位作者 台虹 王泳 王迎春 宋建新 阮长耿 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1998年第3期115-117,共3页
目的:研究我国汉族人群vWF基因的多态性特点。方法:应用聚合酶链反应(PCR)技术结合MspⅠ和RsaⅠ酶切分析研究了52名汉族人104条染色体vWF基因MspⅠ限制性片段长度多态性(RFLP)和48名汉族人96条染... 目的:研究我国汉族人群vWF基因的多态性特点。方法:应用聚合酶链反应(PCR)技术结合MspⅠ和RsaⅠ酶切分析研究了52名汉族人104条染色体vWF基因MspⅠ限制性片段长度多态性(RFLP)和48名汉族人96条染色体的RsaⅠRFLP。结果:在我国汉族人中,等位基因MspⅠ+/MspⅠ-的频率为0.20∶0.80,理论杂合频率为36%;RsaⅠ+/RsaⅠ-的频率为0.93∶0.07,理论杂合频率为13%。结论:在我国汉族人中,在vWF基因的5′端存在MspⅠ和RsaⅠ的多态性位点,可用于血管性血友病的遗传咨询和产前诊断。 展开更多
关键词 血管性血友病 VWF基因 RFLP 血友病 基因多态性
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冠心病的载脂蛋白AⅠ-CⅢ-AⅣ基因簇多态性分析 被引量:6
13
作者 但青宏 黄元伟 +4 位作者 彭章平 刘忠 韩阳 金争鸣 孙坚 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1995年第10期584-587,共4页
为探讨载脂蛋白(apo)AI-CIII-AIV基因簇的变异与冠心病的关系,应用apoAI基因探针Southern杂交的方法,检测了43例冠心病患者及60例正常人apoAI-CIII-AIV基因区域PstI和SstI酶... 为探讨载脂蛋白(apo)AI-CIII-AIV基因簇的变异与冠心病的关系,应用apoAI基因探针Southern杂交的方法,检测了43例冠心病患者及60例正常人apoAI-CIII-AIV基因区域PstI和SstI酶切位点上限制性片段长度多态性(RFLPs),结果表明,冠心病组中PstI和SstI酶切位点上少见P2和S2等位基因的相对频率高于正常对照组;S2等位基因的相对频率随冠状动脉病变支数的增多而增高,以3支病变增高最为明显;不同基因型的冠心病患者其部分血脂及氧自由基指标的变化水平不同。本研究结果提示,apoAI-CIII-AIV基因区域PstI和SstI酶切点的基因变异可能与冠心病的发病及病变程度有一定关系。 展开更多
关键词 冠心病 载脂蛋白 限制性片段长度 多态性
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基于PacBio 16S rRNA基因全长测序调查某校园水体微生物群落结构及多样性研究
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作者 叶珏妃 张逸博 +2 位作者 万晶 党晨原 付杰 《环境科学与管理》 CAS 2023年第6期110-115,共6页
水体是校园环境的重要部分,了解水体特征对于校园水体治理和完善校园生态环境研究具有重要意义。采用PacBio 16S rRNA基因全长测序技术,对某校园水体微生物群落的结构及多样性进行分析。结果显示各处校园水体的群落丰度与多样性呈现出差... 水体是校园环境的重要部分,了解水体特征对于校园水体治理和完善校园生态环境研究具有重要意义。采用PacBio 16S rRNA基因全长测序技术,对某校园水体微生物群落的结构及多样性进行分析。结果显示各处校园水体的群落丰度与多样性呈现出差异,源湖、南一楼西湖和东湖的微生物群落丰度和多样性要高于东九湖、醉晚亭西湖和东湖。具体表现为水体的菌门和菌属的组成与丰度有所不同,呈现出复杂的变化情况。Beta多样性分析结果显示空间距离小的水体的微生物组成更为相似。水体微生物群落多样性受到NH_(3)-N、TP、DO等多种环境因子的共同作用。 展开更多
关键词 微生物多样性 群落结构 水体 16S rRNA基因全长测序
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小肠脂酸结合蛋白基因多态性与2型糖尿病合并冠心病的关系 被引量:4
15
作者 黄敏 杨香玖 +2 位作者 李丽 胡正国 王中丽 《中华内分泌代谢杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期290-293,共4页
目的 为了解小肠脂酸结合蛋白基因(FABP2)多态性与2 型糖尿病合并冠心病(CHD)的关系。方法 2 型糖尿病无冠心病组(DM1)64 例,2 型糖尿病合并冠心病组(DM2)82 例,非糖尿病冠心病组62 例,正常对... 目的 为了解小肠脂酸结合蛋白基因(FABP2)多态性与2 型糖尿病合并冠心病(CHD)的关系。方法 2 型糖尿病无冠心病组(DM1)64 例,2 型糖尿病合并冠心病组(DM2)82 例,非糖尿病冠心病组62 例,正常对照组60 例。应用聚合酶链反应(PCR)技术检测268 例对象FABP2 Hha I位点的限制性片段长度多态性(RFLPs) 。结果 (1) 武汉地区汉族人存在PABP2 HhaI多态性位点,可产生Thr54( - )和Thr54( +) 多态片段。(2)2 型糖尿病合并冠心病患者FABP2 Thr54( +) 基因型频率显著高于正常人(P< 0.05)。(3)FABP2 Thr54( +) 基因类型对2 型糖尿病合并冠心病的参与风险率为25 .6 % ,比数比为2.13(95% 可信限是1 .05 ~4.45)。(4)2 型糖尿病合并冠心病组含FABP2Thr54(+ )基因类型患者与含FABP2 Thr54(- )基因类型患者比较,空腹胰岛素水平显著增高( P<0.01),胰岛素敏感指数显著下降( P< 0.05) 。(5)2 型糖尿病合并冠心病组含FABP2 Thr54(+ )基因类型患者的血甘油三酯水平显著高于含FABP2 ? 展开更多
关键词 糖尿病 Ⅱ型 冠心病 FABP2 基因多态性
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胃癌高系家族成员胃蛋白酶原C基因多态性及其诊断意义的探讨 被引量:3
16
作者 袁媛 董明 +8 位作者 何安光 张荫昌 张宝庚 金春莲 路平 邢承忠 王选杰 刘言厚 吕芳 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 1995年第4期356-357,共2页
采用限制性酶切片段长度多态性分析法,检测在胃癌高发区庄河检出的19例胃癌高系家族成员胃蛋白酶原C基因多态性,发现三种常见片段及一种稀有片段。对其中4例携带稀有片段的受检者进行了胃镜追踪观察,2.5年后发现1例早期胃癌... 采用限制性酶切片段长度多态性分析法,检测在胃癌高发区庄河检出的19例胃癌高系家族成员胃蛋白酶原C基因多态性,发现三种常见片段及一种稀有片段。对其中4例携带稀有片段的受检者进行了胃镜追踪观察,2.5年后发现1例早期胃癌。本文对此作了初步探讨。 展开更多
关键词 胃肿瘤 胃蛋白酶原C 基因多态性 高系家族
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中国人内源性高甘油三酯血症载脂蛋白AⅠ基因多态性的研究 被引量:3
17
作者 张秋萍 刘秉文 +5 位作者 刘宇 范萍 张荣爵 吴兆丰 傅明德 DavidJGalton 《华西医科大学学报》 CSCD 1997年第3期233-238,共6页
应用多聚酶链反应(PCR)对74例正常人及69例内源性高甘油三酯血症(HTG)患者载脂蛋白(apo)AⅠ基因的限制性片段长度多态性(RestrictionFragmentsLengthPolymorphism,RFL... 应用多聚酶链反应(PCR)对74例正常人及69例内源性高甘油三酯血症(HTG)患者载脂蛋白(apo)AⅠ基因的限制性片段长度多态性(RestrictionFragmentsLengthPolymorphism,RFLP)进行了研究。检测的apoAⅠ基因位点有:MspⅠ(内含子3C-G突变)、XmnⅠ(5′非编码区)及PstⅠ(3′非编码区G-C突变)。结果表明,HTG组及对照组均以M1、X1及P1等位基因为主,大多数为M1M1、X1X1及P1P1纯和子基因型;少见的M2及X2等位基因频率显著高于欧洲白种人(0.293vs0.111,P<0.006及0.286vs0.130,P<0.004),而P2等位基因频率则未见差异(0.071vs0.046,P>0.05)。与对照组比较,除少见的M2等位基因频率HTG组有增加趋势外(0.353vs0.293,P>0.05),其余则未见差异。在所研究的对象中,具有M2M2基因型者血清apoCⅢ水平及TG/HDL-C比值较M1M2及M1M1基因型者明显升高(P<0.03及P<0.04),血清TG、TC、apoCⅡ及apoE水平有增加趋势。具有P1P2及P2P2基因型者,血清? 展开更多
关键词 载脂蛋白 多态性 高脂血症 HTG
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血管紧张素Ⅱ-1型受体基因A^(1166)→C多态性与冠心病关联的研究 被引量:2
18
作者 刘瑞 陈玉成 +4 位作者 白怀 李献 刘宇 邓珏琳 刘秉文 《华西医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期533-535,539,共4页
目的 探讨血管紧张素 - 1型受体 (AT1 R)基因 A1 1 6 6→ C多态性与冠心病的关系。方法 应用多聚酶链反应 (PCR)对成都地区汉族 133例正常对照及 113例冠心病患者 (其中 5 2例伴有高血压 )的 AT1 R基因A1 1 6 6 → C多态性进行分析... 目的 探讨血管紧张素 - 1型受体 (AT1 R)基因 A1 1 6 6→ C多态性与冠心病的关系。方法 应用多聚酶链反应 (PCR)对成都地区汉族 133例正常对照及 113例冠心病患者 (其中 5 2例伴有高血压 )的 AT1 R基因A1 1 6 6 → C多态性进行分析。结果 冠心病患者的 C等位基因频率与正常对照组比较无显著性差异 (0 .0 6 6 vs0 .0 75 ,P>0 .0 5 )。冠心病伴有高血压组的 C等位基因频率与未伴有高血压组的 C等位基因频率比较 ,有降低趋势(0 .0 38vs 0 .0 90 ,P=0 .0 9)。冠心病伴有高血压组与正常对照组比较 ,C等位基因频率也有降低趋势 (0 .0 38vs0 .0 75 ,P=0 .14 )。结论  AT1 R基因 A1 1 6 6 → C多态性与冠心病无关联 ,AT1 R基因 A1 1 6 6 → 展开更多
关键词 冠心病 血管紧张素Ⅱ-1型受体基因 限制性片段长度多态性
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载脂蛋白AI基因的基因型与冠心病临床表现型的关系 被引量:2
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作者 但青宏 黄元伟 +4 位作者 彭章平 刘忠 韩阳 金争鸣 孙坚 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1995年第6期337-340,共4页
对43例经冠状动脉造影证实的冠心病患者及60例正常人载脂蛋白(Apo)AI基因PstⅠ酶切位点限制性片段长度多态性(RFLPs)进行检测,结果表明:冠心病组中少见P2等位基因的相对频率为0.14,明显高于正常对照组的... 对43例经冠状动脉造影证实的冠心病患者及60例正常人载脂蛋白(Apo)AI基因PstⅠ酶切位点限制性片段长度多态性(RFLPs)进行检测,结果表明:冠心病组中少见P2等位基因的相对频率为0.14,明显高于正常对照组的0.05(P<0.05);P2等位基因的相对频率随冠状动脉病变支数的增多而增高,以3支病变增高最为明显;冠心病组中具P1P2基因型者与具P1P1基因型者比较,HDL-C和SOD水平明显降低(P分别<0.01,<0.05),而TC及LPO水平则明显增高(P分别<0.05,<0.05),提示APOAI基因RFLPs的变异可能与冠心病发病及病变范围有一定关系,APOAI基因的基因型可能对冠心病临床表现型有一定影响。 展开更多
关键词 冠心病 载脂蛋白 基因型 临床表现型
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RFLP OF HLA CLASS I GENES IN CHINESE POPULATION AND ITS CORRELATION WITH SEROLOGICALLY DEFINED ANTIGEN SPECIFICITIES
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作者 王亚新 林性玉 +4 位作者 孙婕 张来仪 陈诗书 王福庆 徐静娟 《Medical Bulletin of Shanghai Jiaotong University》 CAS 1991年第1期1-5,共5页
The restriction fragnent length polymorphisms (RFLPs) of HLA class I genes in 104 unrelated healthy Chinese individuals were analyzed with Southern blot assay. The DNAs from peripheral blood leucocytes were digested... The restriction fragnent length polymorphisms (RFLPs) of HLA class I genes in 104 unrelated healthy Chinese individuals were analyzed with Southern blot assay. The DNAs from peripheral blood leucocytes were digested with EcoRI, EcoRV and XbaI respectively, and hybridized with <sup>32</sup>P-labeled HLA class I probe ( 1.4Kb, B7 cDNA ). The results showed that 3 EcoRI fragments (13.7, 8.1 and 5.2 Kb ), 3 EcoR V fragments (11.3, 7.8 and 4.1 Kb) and 7 Xbal fragmnents (21.9, 19.2, 16.3, 6.0, 3.8, 1.8 and 1.5 Kb) were polymorphic. Ten of the fragments were found to be correlated significantly with the serologically de fined antigen specificities. The significance of this kind of correlation is discussed. 展开更多
关键词 HLA class I gene RESTRICTION fragrnent length POLYMORPHISM Chinese population
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