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Identification and Characterization of Cotton Genes Involved in Fuzz-Fiber Development 被引量:4
1
作者 Gaskin Wang Guo-Hong Zhao +1 位作者 Yin-Hua Jia Xiong-Ming Du 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2013年第7期619-630,共12页
Cotton fuzz fibers, like Arabidopsistrichomes, are elongated unicells. It is postulated that a transcriptional complex of GLABRA1 (GL1), GLABRA3 (GL3), and TRANSPARENT TESTAGLABRA1 (TTG1) might be in existence i... Cotton fuzz fibers, like Arabidopsistrichomes, are elongated unicells. It is postulated that a transcriptional complex of GLABRA1 (GL1), GLABRA3 (GL3), and TRANSPARENT TESTAGLABRA1 (TTG1) might be in existence in Arabidopsis as evidenced by their physical interaction in yeast, and the complex regulates expression of GLABRA2 (GL2) controlling trichome cell differentiation; it is also assumed that TRIPTYCHON (TRY) and CAPRICE (CPC) counteract the complex formation in neighboring cells. Here, the homologs GaMYB23 (a homolog of GL1), GaDEL65 (a homolog of GL3), GaTTG1, GaCPC and GaTRY were identified in Gossypium arboreum. We show that GaMYB23 can bind to and activate the promoters of GaCPC, GaGL2 and GaTRY, and that GaMYB23, GaTRY and GaTTG1 could interact with GaDEL65 in yeast and in planta. In situ analysis showed that GaMYB23, GaGL2, GaDEL65, and GaTRY were predominantly expressed in fuzz fiber, but GaTRY proteins were primarily found in undeveloped epidermal cells. A G. arboreum fuzzless mutant with consistently high level GaMYB23 transcript has lost the detectable GaMYB23-promoter of GaGL2 complex, corresponding to sharply reduced transcription of GaGL2. Our results support that cotton homologs to the genetic molecules regulating Arabidopsis trichome differentiation interacted in the epidermis of ovules and the redundant GaMYB23 serves as a negative regulator in fuzz-fiber patterning. 展开更多
关键词 Convergent evolution fuzz fuzzless mutant Gossypium arboreum lateral inhibitor trichome.
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陆地棉无短绒突变体GZnn的纤维发育及其基因表达分析 被引量:6
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作者 龚建 杜雄明 +4 位作者 路小铎 姜凌 沈颂东 范云六 张春义 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期790-797,共8页
【目的】利用棉花无短绒突变体GZnn为材料,分离与棉花纤维发育相关的重要基因,从而揭示棉花纤维发育的分子机理。【方法】通过扫描电镜观察GZnn与其近等基因系TM-1在纤维发育上的差别;采用差异显示RT-PCR方法寻找GZnn与TM-1之间的差异... 【目的】利用棉花无短绒突变体GZnn为材料,分离与棉花纤维发育相关的重要基因,从而揭示棉花纤维发育的分子机理。【方法】通过扫描电镜观察GZnn与其近等基因系TM-1在纤维发育上的差别;采用差异显示RT-PCR方法寻找GZnn与TM-1之间的差异表达片段,并进行相应分析。【结果】用扫描电镜观察突变体GZnn与TM-1的胚珠表面纤维细胞起始发生的情况,发现GZnn不仅在纤维细胞发生和延伸上延迟,而且纤维细胞总数也明显减少。利用差异显示PCR进行比较筛选,获得了12个差异表达的EST片段,其中,DS3只特异性地在GZnn开花前(-3~0DPA)的胚珠中特异表达,而在其近等基因系TM-1中没有表达,推测DS3可能是一个纤维启动过程中的MYB类负调控转录因子。【结论】本研究利用棉花无短绒突变体GZnn发现,棉纤维细胞在早期分化和形态建成过程中大量基因表达,对其中的关键基因的表达模式和功能开展深入研究将有助于阐明棉纤维分化发育的分子机理,为棉花遗传改良提供理论基础。 展开更多
关键词 陆地棉 无短绒 扫描电镜 纤维细胞起始 MRNA差异显示 RT-PCR
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亚洲棉短绒突变体纤维发育及其差异基因表达分析 被引量:5
3
作者 王晓阳 王丽媛 +4 位作者 潘兆娥 何守朴 王骁 龚文芳 杜雄明 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期645-660,共16页
棉花纤维是重要的天然纺织材料,是最长的单细胞,是研究纤维发育的良好材料。本研究以亚洲棉短绒突变体(FZ)及其野生型(fz)为材料,结合扫描电镜、石蜡切片、RNA-seq技术,解析棉花短绒起始的可能机制。与野生型(fz)的0DPA时期胚珠相比,突... 棉花纤维是重要的天然纺织材料,是最长的单细胞,是研究纤维发育的良好材料。本研究以亚洲棉短绒突变体(FZ)及其野生型(fz)为材料,结合扫描电镜、石蜡切片、RNA-seq技术,解析棉花短绒起始的可能机制。与野生型(fz)的0DPA时期胚珠相比,突变体的胚珠在该时期仅有少量的纤维起始。在+3DPA时,突变体没有短绒细胞起始,仅有长纤维细胞,而野生型有大量的短纤维细胞和长纤维细胞。对这2个材料的0DPA、+3DPA、+5DPA和+8DPA胚珠差异基因分析结果显示,在短绒突变体(FZ)和野生型(fz)的4个纤维发育时期共挖掘出3780个差异表达基因,其中0DPA时差异基因数目最少,随着胚珠发育时间的延长,差异基因的数目逐渐增加。KEGG分析发现这些基因主要参与蜡质、角质生物合成,以及苯丙烷代谢和植物信号传导过程。共表达趋势分析显示,在突变体+3DPA上调的差异基因中,参与离子结合、MAPK级联反应、氧化还原活性和转录调控的基因表达受到正影响(表达水平提高),造成突变体短绒纤维不能正常起始。这些结果描述了二倍体亚洲棉短绒起始的动态变化,可为进一步研究棉纤维发育提供参考。 展开更多
关键词 亚洲棉 短绒突变体 差异表达基因 共表达趋势
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A New Fuzzless Seed Locus in an Upland Cotton (<i>Gossypium hirsutum</i>L.) Mutant
4
作者 Efrem Bechere Rick B. Turley +1 位作者 Dick L. Auld Linghe Zeng 《American Journal of Plant Sciences》 2012年第6期799-804,共6页
Various fiber mutants of cotton have been reported since 1920. Two of the best characterized mutants are the naked seed loci, N1N1 and n2n2. Recently, a naked-tufted mutant called 9023 nt4 was developed from the culti... Various fiber mutants of cotton have been reported since 1920. Two of the best characterized mutants are the naked seed loci, N1N1 and n2n2. Recently, a naked-tufted mutant called 9023 nt4 was developed from the cultivar SC 9023 through chemical mutagenesis. The mutant was tested to determine if it was allelic to either N1, or n2 or was a unique mutant in a new uncharacterized locus. In 1999, one M3 plant from SC 9023 with tufted partially naked seed coat (fuzzless) was identified. In 2004, 2006, and 2007 (Lubbock, TX), 2007 (College Station, TX), and 2011 (Stoneville, MS), the homozygous naked seed mutant was evaluated with the non-mutated wild type parent (SC 9023) in rep-licated trials for agronomic and fiber traits. Crosses between the mutant and the wild type was made at Stoneville, MS in 2009. The F2 of this cross segregated in a 3 fuzzy: 1 fuzzless ratio indicating that the fuzzless trait in the mutant is controlled by a recessive locus. Allelism tests with N1N1, n2n2 and n3n3, lint percent, and fiber trait data indicated that the new locus in the mutant differs from the previously characterized fuzzless seed alleles in that it does not appear to decrease lint percent. We have putatively designated this gene nt4nt4 . 展开更多
关键词 Fuzzy fuzzless LINT Percent Mutagenesis mutant Naked SEED
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亚洲棉短纤维发育相关长链非编码RNA的鉴定及表达 被引量:1
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作者 王晓阳 彭振 +5 位作者 邢爱双 赵盈睿 马欣丽 刘方 杜雄明 何守朴 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第23期4565-4584,I0001-I0003,共23页
【目的】长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类无蛋白质编码能力,但参与许多重要生命活动调控过程的长度大于200 nt的RNA。通过对亚洲棉无短纤维突变体(GA0149)和野生型(GA0146)纤维发育早期的转录组数据进行分析,挖掘调... 【目的】长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一类无蛋白质编码能力,但参与许多重要生命活动调控过程的长度大于200 nt的RNA。通过对亚洲棉无短纤维突变体(GA0149)和野生型(GA0146)纤维发育早期的转录组数据进行分析,挖掘调控短纤维发育的lncRNA,并明确其调控网络,为进一步解析棉花纤维发育机制奠定基础。【方法】选择GA0146和GA01492个材料在开花后当天(0 DPA)及花后3 d(3 DPA)、5 d(5 DPA)和8 d(8 DPA)的胚珠和纤维为材料进行转录组测序。鉴定lncRNA并预测其调控的靶基因;通过mRNA和lncRNA的差异表达分析,比较2个材料在不同纤维发育时期的差异。进一步利用KOBAS软件预测对差异lncRNA的靶基因进行富集分析并预测其参与的生物过程;最后通过实时荧光定量(RT-qPCR)技术对25个差异表达的lncRNA转录组数据进行验证。【结果】共鉴定获得15339个lncRNA,其中11595个lncRNA位于基因间区,包括2428个反义lncRNA、350个内含子lncRNA及966个正义lncRNA。共有1932个差异表达lncRNA(DE-lncRNA),它们所对应的8134个靶基因中,有788个为差异表达基因(DE-mRNA)。KEGG代谢通路富集分析表明,DE-mRNA主要参与植物激素信号转导(plant hormone signal transduction)和内质网中蛋白质加工过程(protein processing in endoplasmic reticulum)。共表达调控网络分析显示,表达量差异比较显著的lncRNA(MSTRG.454250.3)和其所调控的靶基因表达趋势一致,仅在野生型(GA0146)短纤维发育早期胚珠中特异表达;而lncRNA(MSTRG.454261.4)与其调控的靶基因表达趋势相反,在突变体(GA0149)中的表达量显著高于野生型。RT-qPCR结果证实了转录组数据的真实性。【结论】鉴定了26个与亚洲棉短纤维发育相关的lncRNA,其通过调控植物激素信号转导途径相关的吲哚乙酸合成酶基因(Ga03G2421)和生长素响应蛋白基因(Ga05G1344)的表达而影响短纤维的发育。 展开更多
关键词 亚洲棉 短纤维突变体 长链非编码RNA 调控网络 荧光定量PCR
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棉花光籽基因n_2的精细定位
6
作者 李思敏 左东云 +6 位作者 程海亮 张友平 王巧连 刘珂 冯晓旭 耿洪伟 宋国立 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期114-120,共7页
【目的】棉纤维是由胚珠外珠被表皮单细胞经突起并极性伸长而成的,棉花种子上的短绒是由胚珠外珠被表皮单细胞突起而产生的。因此,本研究对棉纤维光籽基因n_2进行定位,旨在为其克隆和功能研究奠定基础。【方法】以海岛棉新海21和陆地棉... 【目的】棉纤维是由胚珠外珠被表皮单细胞经突起并极性伸长而成的,棉花种子上的短绒是由胚珠外珠被表皮单细胞突起而产生的。因此,本研究对棉纤维光籽基因n_2进行定位,旨在为其克隆和功能研究奠定基础。【方法】以海岛棉新海21和陆地棉光籽突变体n_2为亲本构建F_2群体,结合棉花基因组数据,开发简单序列重复标记,定位该基因,获得预测的基因序列,通过实时荧光定量聚合酶链式反应分析候选基因的表达量差异。【结果】光籽基因n_2被定位在染色体A12上,位于标记P61与Z10之间的181 kbp内。该区间共有7个候选基因。实时荧光定量聚合酶链式反应分析显示,候选基因72098在2个亲本中的表达量有显著差异。【结论】本试验精细定位了光籽基因n_2,初步分析了候选基因,为其图位克隆和功能验证奠定了基础。 展开更多
关键词 陆地棉 纤维 光籽突变体 精细定位 表达分析
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与亚洲棉光籽突变体DPL972中光籽基因紧密连锁的SSR分子标记的开发与应用(英文)
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作者 冯晓旭 邹长松 +5 位作者 陆才瑞 程海亮 张友平 Mkulama A P Mtawa 王巧连 宋国立 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2016年第4期392-398,共7页
对棉纤维相关性状基因的克隆及遗传分析可为阐明纤维形成机制奠定良好基础。以野生型材料DPL971及其光籽突变体DPL972为亲本构建F2群体,其中光籽与毛籽性状分离比符合3∶1,表明突变体DPL972中的光籽基因为显性单基因(将其命名为Ga Fzl)... 对棉纤维相关性状基因的克隆及遗传分析可为阐明纤维形成机制奠定良好基础。以野生型材料DPL971及其光籽突变体DPL972为亲本构建F2群体,其中光籽与毛籽性状分离比符合3∶1,表明突变体DPL972中的光籽基因为显性单基因(将其命名为Ga Fzl)。结合棉花基因组数据,合成1567对SSR(Simple sequence repeat)引物,覆盖了A组13条染色体,标记多态性分析和群体连锁分析发现在染色体A08上存在15对与光籽基因Ga Fzl连锁的标记,其中最近的标记为SSR82,遗传距离为6.6 c M。本实验完成了Ga Fzl基因的染色体初步定位,开发了15个与其连锁的SSR标记,为下一步图位克隆奠定了基础。 展开更多
关键词 纤维 光籽突变体 GA Fzl SSR 连锁图
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一个陆地棉无絮突变体的遗传分析 被引量:25
8
作者 张天真 潘家驹 《江苏农业学报》 CSCD 1991年第3期13-16,共4页
江苏省徐州地区农科所发现的徐州142无纤维无短绒(简称无絮)突变性状由两对隐性互作基因控制,其中的一对控制无短绒的表现,并且它的显性等位基因对控制无纤维性状的隐性基因有显性上位作用。等位性测验结果表明,无絮棉的隐性无短绒基因... 江苏省徐州地区农科所发现的徐州142无纤维无短绒(简称无絮)突变性状由两对隐性互作基因控制,其中的一对控制无短绒的表现,并且它的显性等位基因对控制无纤维性状的隐性基因有显性上位作用。等位性测验结果表明,无絮棉的隐性无短绒基因和N_1表现为非等位,但表现出是n_2的等位基因。作者建议把控制棉纤维发育的基因符号定为Li_3。这样,无絮棉突变体的基因型可能为li_3li_3n_1n_1n_2n_2,它可能产生于徐州142品种(li_3li_3n_1n_1N_2N_2)的隐性突变。 展开更多
关键词 陆地棉 无絮 遗传 互作 棉花
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内源及外源植物激素对陆地棉无絮突变体胚珠纤维初始发育诱导效应的研究(英文) 被引量:10
9
作者 刘康 孙敬 +1 位作者 张天真 潘家驹 《棉花学报》 CSCD 北大核心 1999年第1期48-50,共3页
采用陆地棉徐州142无絮突变体(FL)与其正常品种(WT)比较,研究了外源激素对离体胚珠纤维的诱导作用以及纤维初始发育过程中胚珠内源激素(IAA,GA,ABA和iPA)含量的变化。结果表明,GA能够诱导离体的正常和突... 采用陆地棉徐州142无絮突变体(FL)与其正常品种(WT)比较,研究了外源激素对离体胚珠纤维的诱导作用以及纤维初始发育过程中胚珠内源激素(IAA,GA,ABA和iPA)含量的变化。结果表明,GA能够诱导离体的正常和突变体未受精和受精胚珠产生出纤维,开花前2d~3d的胚珠培养到天然开花日之后纤维方才突起。开花当天内源IAA含量的急剧上升可能是胚珠表皮细胞迅速伸长的一个重要原因。开花前4d到开花后4d突变体胚珠内高水平的iPA阻碍其纤维发生。 展开更多
关键词 陆地棉 无絮突变体 纤维 初始发育 内源激素
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陆地棉纤维初始发育与胚珠过氧化物酶和吲哚乙酸氧化酶的关系的研究 被引量:3
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作者 刘康 张天真 潘家驹 《棉花学报》 CSCD 北大核心 1999年第6期293-296,302,共5页
比较研究陆地棉品种徐州142 与其无絮突变体开花前4d 至开花后6d 胚珠内细胞壁结合的离子型蛋白质含量、过氧化物酶和IAA氧化酶活性变化。结果表明, 过氧化物酶和IAA氧化酶阻碍纤维的初始发育。
关键词 纤维 无絮棉突变体 过氧化物酶 吲哚乙酸氧化酶
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利用显性光子突变体N1进行陆地棉衣分性状的遗传研究 被引量:6
11
作者 宋丽 郭旺珍 张天真 《分子植物育种》 CAS CSCD 2008年第6期1101-1106,共6页
棉花纤维产量与衣分呈高度正相关,因此对棉花衣分性状的遗传研究尤为重要。本研究用衣分差异较大的显性光子突变体N1和TM-1所配制的杂交组合对衣分性状进行了遗传研究。由F2的衣分频数分布以及P1、P2和F1的衣分数据推测,TM-1中高衣分性... 棉花纤维产量与衣分呈高度正相关,因此对棉花衣分性状的遗传研究尤为重要。本研究用衣分差异较大的显性光子突变体N1和TM-1所配制的杂交组合对衣分性状进行了遗传研究。由F2的衣分频数分布以及P1、P2和F1的衣分数据推测,TM-1中高衣分性状受一个显性主基因控制,与光子基因(N1)的显性方向相反。用SPSS11.5对F2群体的短绒和衣分性状做相关性分析,结果表明衣分与光子之间存在极显著负相关,光子基因(N1)对衣分具有减效作用,可解释表型变异的24.44%。利用P1、P2、F1和F2等4个世代联合分离分析方法,对该组合的衣分性状进行主基因-多基因混合遗传模型分析,结果表明,该组合中衣分的最适遗传模型为一对加性-显性主基因+加性-显性-上位性多基因模型,主基因和多基因遗传率分别是82.70%和5.65%。 展开更多
关键词 陆地棉 显性光子突变体N1 衣分 遗传分析
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Molecular Cloning,Expression,and Characterization of an Adenylyl Cyclase-associated Protein from Gossypium arboreum Fuzzless Mutant
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作者 WANG Sheng,ZHAO Guo-hong,JIA Yin-hua,DU Xiong-ming(Cotton Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement,Ministry of Agriculture,Anyang,Henan 455000,China) 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期69-,共1页
CAP,an adenylyl cyclase-associated protein,is predicted to be involved in cytoskeletal organization and signal transduction.Recently,we found that CAP may play an important role in fuzz-like fiber cell initiation in c... CAP,an adenylyl cyclase-associated protein,is predicted to be involved in cytoskeletal organization and signal transduction.Recently,we found that CAP may play an important role in fuzz-like fiber cell initiation in cotton.For the further research,we isolated two CAP homologues from wild 展开更多
关键词 Molecular Cloning Expression and Characterization of an Adenylyl Cyclase-associated Protein from Gossypium arboreum fuzzless mutant CAP
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