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乳酸菌基因组学研究进展 被引量:14
1
作者 张文羿 孟和 张和平 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1270-1275,共6页
伴随着高通量测序技术的快速发展和测序成本的降低,越来越多的微生物基因组全序列测定得以实现,从基因组学的层面了解乳酸菌的遗传结构和组成,进而分析和掌握其生物学功能已经逐渐成为可能。迄今为止已经有22株乳酸菌的基因组完成测序... 伴随着高通量测序技术的快速发展和测序成本的降低,越来越多的微生物基因组全序列测定得以实现,从基因组学的层面了解乳酸菌的遗传结构和组成,进而分析和掌握其生物学功能已经逐渐成为可能。迄今为止已经有22株乳酸菌的基因组完成测序并公开发表,还有至少12株测序工作仍在进行中。本文在分析相关文献和生物信息数据基础上,从乳酸菌基因组特点、代谢多样性、进化及共线性四个方面对乳酸菌基因组学研究进展进行了总结,旨在为乳酸菌研究和应用提供参考。 展开更多
关键词 乳酸菌 基因组 代谢 进化 共线性
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logistic回归模型共线性三种降维方法的模拟比较研究 被引量:11
2
作者 蒋红卫 张罗漫 孟虹 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2010年第6期562-566,共5页
目的 logistic回归模型中解释变量存在共线性的情形下,比较联合式偏最小二乘logistic回归(IPLSLR),耦合式偏最小二乘logistic回归(CPLSLR)和主成分logistic回归(PCLR)三种降维方法所得到的回归系数估计的偏差和稳定性。方法运用MonteCa... 目的 logistic回归模型中解释变量存在共线性的情形下,比较联合式偏最小二乘logistic回归(IPLSLR),耦合式偏最小二乘logistic回归(CPLSLR)和主成分logistic回归(PCLR)三种降维方法所得到的回归系数估计的偏差和稳定性。方法运用MonteCarlo随机法,采用SAS软件编程,模拟估算不同共线性情形下三种降维方法所得到的回归系数估计均值及标准差。结果简单共线性情形下,IPLSLR与CPLSLR回归系数估计的偏差较小,PCLR估计则相对稳定。多重共线性情形下,当样本量较大时,若共线性较高,IPLSLR,CPLSLR和PCLR均获得偏差较小、稳定性较好的回归系数估计;若共线性较低,PCLR回归系数估计的偏差明显大于IPLSLR和CPLSLR。当样本量较小时,IPLSLR与CPLSLR在回归系数估计偏差和稳定性方面互有优劣。结论应根据共线性的程度和样本量的大小决定使用相应的降维方法用于处理logistic回归模型中共线性情况。通过对三种降维方法不足的分析,提出了进一步改进的原则。 展开更多
关键词 LOGISTIC回归模型 共线性 偏最小二乘 主成分
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小麦抗白粉病基因pm42的EST连锁图谱构建和比较基因组学分析 被引量:10
3
作者 刘子记 朱婕 +3 位作者 华为 杨作民 孙其信 刘志勇 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1569-1576,共8页
目的基因精细遗传连锁图谱的构建是图位克隆的基础,小麦功能基因精细遗传连锁图谱的构建依赖于比较基因组学分析。水稻和短柄草(Brachypodium distachyon)基因组序列是小麦比较基因组学分析和功能基因精细遗传定位的重要工具。本研究利... 目的基因精细遗传连锁图谱的构建是图位克隆的基础,小麦功能基因精细遗传连锁图谱的构建依赖于比较基因组学分析。水稻和短柄草(Brachypodium distachyon)基因组序列是小麦比较基因组学分析和功能基因精细遗传定位的重要工具。本研究利用小麦、短柄草和水稻的基因组共线性关系对小麦抗白粉病基因pm42进行比较基因组学分析,明确了pm42基因所在2BS基因组区域与短柄草第1染色体和水稻第3染色体直系同源基因组区域的对应关系,开发出与抗白粉病基因pm42连锁的EST-SSCP(expressed sequence tag-single strand conformation polymorphism)标记CD452782和BF201235,以及EST-STS(expressed sequence tag-sequence tagged site)标记CJ674042、EB513371和CV771633,构建了pm42基因EST标记遗传连锁图谱,CJ674042、BF201235、CD452782和CV771633位于pm42近端粒侧,距离pm42的遗传距离分别为1.9、12.0、19.7和25.7cM;EB513371位于pm42近着丝粒侧,与pm42的遗传距离为14.6cM。整合原有的作图数据,构建了pm42基因的高密度比较基因组学遗传连锁图谱,pm42被定位于3.3cM的区间,该区间对应于短柄草66kb的基因组区域及水稻69kb的基因组区域。该结果为抗白粉病基因pm42高密度精细遗传连锁图谱构建、分子辅助选择和基因聚合奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦抗白粉病基因 pm42 比较基因组学 二穗短柄草 共线性 EST-STS EST-SSCP
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基于奇异值分解算法的大坝监测数据回归模型 被引量:10
4
作者 吴雄伟 程伟平 《水电自动化与大坝监测》 2007年第3期53-55,共3页
针对大坝观测数据统计回归计算中出现的数据共线性和观测数据中的粗差问题,应用奇异值分解算法计算大坝统计模型中的系数。计算结果表明,基于奇异值分解算法的模型能够在这2个常见问题上均取得较满意的结果。
关键词 大坝 监测数据 回归模型 粗差 共线性 奇异值 奇异值分解算法
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基于岭回归与灰色耦合模型的建设用地规模预测——以河南省焦作市为例 被引量:7
5
作者 余长坤 宋文博 +1 位作者 吴次芳 范慧萍 《地域研究与开发》 CSSCI 北大核心 2015年第1期155-159,共5页
对城市建设用地规模准确预测,能为土地利用管制提供合理的决策依据。以焦作市2002—2010年建设用地和社会经济发展数据为基础,运用岭回归分析对建设用地规模预测方程进行参数校正,并结合GM(1,1)模型对相应驱动因子2011—2015年的数值预... 对城市建设用地规模准确预测,能为土地利用管制提供合理的决策依据。以焦作市2002—2010年建设用地和社会经济发展数据为基础,运用岭回归分析对建设用地规模预测方程进行参数校正,并结合GM(1,1)模型对相应驱动因子2011—2015年的数值预测,得出"十二五"末的焦作市建设用地规模。研究表明,基础设施建设是影响焦作市建设用地规模的最主要因素,其次是人口因素和经济因素;焦作市建设用地规模在短期内将保持稳定增长,到"十二五"末的建设用地规模为923.06 km2。在可持续发展战略的指导下,结合研究结论和焦作市社会经济发展的实际情况,为焦作市建设用地管理提供相关建议。 展开更多
关键词 建设用地 共线性 岭回归 灰色预测 焦作市
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多重共线性及其处理办法 被引量:2
6
作者 张丕德 李河 《循证医学》 CSCD 2005年第6期354-355,358,共3页
关键词 共线性 多元相关 COX模型 主分量分析
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湖北省粮食产量影响因素分析─基于主成分回归
7
作者 舒服华 《陕西国防职教研究》 2024年第3期15-19,共5页
由于湖北省粮食播种面积、高标准农田数量、耕地有效灌溉面积、农业生产机械化率数据之间存在多重共线性,分析其对湖北省粮食产量影响时,运用最小二乘法估计参数容易失真而缺乏解释性。因此,利用能够解决多重共线性问题的主成分回归来... 由于湖北省粮食播种面积、高标准农田数量、耕地有效灌溉面积、农业生产机械化率数据之间存在多重共线性,分析其对湖北省粮食产量影响时,运用最小二乘法估计参数容易失真而缺乏解释性。因此,利用能够解决多重共线性问题的主成分回归来分析粮食播种面积、高标准农田数量、耕地有效灌溉面积、农业生产机械化率对湖北省粮食产量影响。回归的参数客观可靠,真实有效,通过对解释变量的释读,结果发现与湖北省粮食生产的实现情况基本吻合。 展开更多
关键词 湖北 粮食产量 影响因素 共线性 主成分回归
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一种基于最小特征根分析的直线检测算法 被引量:4
8
作者 匡平 朱清新 陈旭东 《电子测量与仪器学报》 CSCD 2007年第3期33-38,共6页
本文利用直线上的点具有的共线性特征来进行直线检测。连续边界上像素点坐标的统计可以构成一协方差矩阵,理论上证明了共线性特征可用此协方差矩阵的最小特征根描述,并发现:最小特征根值越小,这些像素点的共线性越好。由此提出了一种快... 本文利用直线上的点具有的共线性特征来进行直线检测。连续边界上像素点坐标的统计可以构成一协方差矩阵,理论上证明了共线性特征可用此协方差矩阵的最小特征根描述,并发现:最小特征根值越小,这些像素点的共线性越好。由此提出了一种快速、强健的直线检测算法。理论分析与试验结果表明,此方法大大加快了直线提取的速度,并具有较好的直线检测效果。 展开更多
关键词 直线检测 最小特征根 共线性 协方差矩阵 图像处理
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深圳市医疗服务整体管理与质量控制指标体系的内部检验 被引量:4
9
作者 周复 樊宏 +4 位作者 初笑宇 吴正治 赵志广 谢若斯 卢祖洵 《中国医院管理》 2009年第11期71-73,共3页
利用综合指数法、相关分析法和线性回归法对深圳市医疗服务整体管理与质量控制指标体系进行内部检验,为该指标体系的进一步完善提供参考依据。
关键词 内部检验 共线性 贡献性
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Symmetry of echinoderms: From initial bilaterally-asymmetric metamerism to pentaradiality
10
作者 Sergey V. Rozhnov 《Natural Science》 2014年第4期171-183,共13页
Echinoderm radial symmetry has first appeared in the ambulacral system, when the ambulacral channel assumed the shape of a closed ring or a horseshoe with approximated ends, and then spread onto other organ systems. I... Echinoderm radial symmetry has first appeared in the ambulacral system, when the ambulacral channel assumed the shape of a closed ring or a horseshoe with approximated ends, and then spread onto other organ systems. Its origin was a natural consequence of a steady increase of the original asymmetry of bilaterally-asymmetric three-segmented ancestors of echinoderms, culminated by closing of the ancestral linear metamerism into radiality. The evolutionary transformation from a simple pouchlike hydrocoel with one side channel to an elongated hydrocoel (located under the oesophagus) with two side channels, and finally to a nearly closed horseshoeshaped hydrocoel with three radial channels can be reconstructed based on the theca structure and the number of ambulacra in the row SolutaCincta-Helicoplacoidea. After the hydrocoel with three outbound ambulacral channels circled around the oesophagus as a horseshoe, it either closed into a ring, or its ends became closely approximated. This has determined the primary triradiate symmetry, which quickly transformed into pentaradial symmetry of the 2-1-2 type as a result of branching of two of the three primary radial channels. This occurred no earlier than the Late Vendian, when the first bilaterians appeared to have begun to acquire body appendages, and no later than the Early Cambrian, when the first skeletal remains of echinoderms entered the fossil record (in the Atdabanian). The 2-1-2 pentaradial symmetry evolved into the true pentaradiality as a result of shifting the timing of tentacle branching to earlier stages of ontogenesis and even spreading of the five tentacle primordia over the ambulacral ring. This occurred during the Ordovician. 展开更多
关键词 ECHINODERMATA SYMMETRY Asymmetry METAMERISM Pentaradiality Body Plan HOX Genes colinearity
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基于直线检测的宽带信源个数估计新方法 被引量:2
11
作者 唐涛 吴瑛 《系统工程与电子技术》 EI CSCD 北大核心 2009年第8期1878-1881,共4页
为了快速有效地估计复杂条件下的宽带信源个数,提出了一种基于直线检测的宽带信源个数估计新方法。该方法通过对宽带信号的阵列采样输出分段并进行FFT变换,得到多个频率点上的窄带采样协方差矩阵,再利用盖氏圆技术和校正技术得到修正的... 为了快速有效地估计复杂条件下的宽带信源个数,提出了一种基于直线检测的宽带信源个数估计新方法。该方法通过对宽带信号的阵列采样输出分段并进行FFT变换,得到多个频率点上的窄带采样协方差矩阵,再利用盖氏圆技术和校正技术得到修正的盖氏半径。最后通过直线检测的方法快速有效地分离信号圆盘和噪声圆盘,从而估计出宽带信源个数。在低信噪比、色噪声环境下通过计算机仿真表明了该算法的正确性和有效性。 展开更多
关键词 阵列信号处理 宽带信号 共线性 信源个数
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柚子基因组比较分析以及祖先染色体重构 被引量:2
12
作者 袁嘉庆 王金朋 王希胤 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期48-54,61,共8页
柚子(Citrus grandis Osbeck)全基因组测序完成为柑橘植物乃至整个芸香科植物提供了研究机会。本研究通过对柚子基因组结构分析,鉴定柚子基因组中存在的由多倍化产生的重复基因,构建了葡萄基因组和柚子基因组之间与多倍化、物种分化相... 柚子(Citrus grandis Osbeck)全基因组测序完成为柑橘植物乃至整个芸香科植物提供了研究机会。本研究通过对柚子基因组结构分析,鉴定柚子基因组中存在的由多倍化产生的重复基因,构建了葡萄基因组和柚子基因组之间与多倍化、物种分化相关联的同源共线性基因列表,为柚子基因组进化和基因功能演化提供了重要的比较基因组学数据资源;通过与外类群葡萄保留的同源染色体区域进行比较,发现柚子基因组在多倍化之后发生了大量的片段化重组;利用葡萄基因组保留有较完整的染色体结构相对于真双子叶六倍体(ECH),结合葡萄和柚子基因组之间的同源关系,推断出柚子祖先基因组结构。本研究对理解柚子基因组乃至柑橘植物基因组以及其进化提供了重要的比较基因组学的基础。 展开更多
关键词 柚子 共线性 多倍化 片段化 染色体重构
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一种基于直线特征的信源个数估计新算法 被引量:2
13
作者 唐涛 吴瑛 《现代雷达》 CSCD 北大核心 2009年第3期56-59,共4页
在空间谱估计技术中,估计信号源个数是一个关键问题,其漏警或虚警会直接影响到测向算法的准确度。然而现有的信号源估计方法在低信噪比、色噪声环境下估计成功概率低且运算复杂,针对该缺点,文中提出一种基于直线特征的信源个数估计新算... 在空间谱估计技术中,估计信号源个数是一个关键问题,其漏警或虚警会直接影响到测向算法的准确度。然而现有的信号源估计方法在低信噪比、色噪声环境下估计成功概率低且运算复杂,针对该缺点,文中提出一种基于直线特征的信源个数估计新算法。在低信噪比、色噪声环境下通过计算机仿真表明了该算法的正确性和有效性。 展开更多
关键词 阵列信号处理 共线性 信源个数
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谷类作物基因结构及其数量的比较
14
作者 薛庆中 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期119-124,共6页
本文综述了谷类作物基因组结构现状,基于水稻和拟南芥全基因组分析以及谷类作物基因组长片段的测序注释表明,谷类作物基因组存在许多嵌合结构,富基因岛重组上活性部分常被高拷贝DNA模块分隔.谷类作物基因组内,具保守的宏共线性.玉米,水... 本文综述了谷类作物基因组结构现状,基于水稻和拟南芥全基因组分析以及谷类作物基因组长片段的测序注释表明,谷类作物基因组存在许多嵌合结构,富基因岛重组上活性部分常被高拷贝DNA模块分隔.谷类作物基因组内,具保守的宏共线性.玉米,水稻,高梁,小麦,及大麦的Sh2/A1直向同源区域的基因顺序分析表明,Sh2和A1同系物间隔分别为20kb(在水稻和高梁)和140kb(在玉米);小麦族Sh2/A1区同线性在X1和X2基因间有一个断裂.如同其他禾本科作物,A1和X2基因在部分同源染色体保留共线性,Sh2和X1直向同源依然是共线性,但在非部分同源染色体的位置已改变.植物基因可以通过多倍体化,节段重复及局部基因扩增3种途径增加序列的数量.单个基因内,微共线性常被破坏.对基因组直向同源区段的初步比较分析暗示,植物基因组内基因局部扩增和易位也许有某些关联. 展开更多
关键词 谷类作物 基因结构 基因数 共线性
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An optimal on-site calibration method in measurement system of dynamic envelope curve of high-speed vehicle
15
作者 LIU Meng LIU Chang-jie WU Xiao-han 《Journal of Measurement Science and Instrumentation》 CAS CSCD 2016年第4期398-404,共7页
High-speed vehicle dynamic envelope curve is defined as the maximum limit outline affected by a variety of adverse factors while the train is running. Considering the difficulties in the current measurement system suc... High-speed vehicle dynamic envelope curve is defined as the maximum limit outline affected by a variety of adverse factors while the train is running. Considering the difficulties in the current measurement system such as complicated calibration process,cumbersome aided-instruments,strict limitation of working distance, this paper carries out an optical method in which two high-speed cameras with variable-zoom lenses are adopted as binocular stereo sensors of measurement system and a high-ac-curacy 3D target with fast reconstruction is designed. The intrinsic parameters of the sensors and the relative positions between coordinate systems are solved by the method of colinearity constrained optimization algorithm. The calibration process is easy to operate and the device is also of portability. Most importantly, the severe working distance limitation between sensors and measured body is solved, enhancing the adaptability of measurement system to environment. Experimental results show that when the sensors are in the range of 8 -16 m away from the measured body, system accuracy can reach up to ±0. 5 mm, which meets the requirements to measure the dynamic envelope curve of high-speed vehicle. 展开更多
关键词 zoom lens 3D target colinearity constrain optimization algorithm binocular stereo vision dynamic envelope curve
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基于光谱反射特征葡萄叶片含水率模型的建立 被引量:22
16
作者 毛罕平 张晓东 +1 位作者 李雪 张元 《江苏大学学报(自然科学版)》 EI CAS 北大核心 2008年第5期369-372,共4页
采用光谱分析技术对葡萄缺水状况进行了定量分析,对4种水分胁迫下的葡萄叶片的光谱数据进行分析,发现703 nm的导数光谱及460,720,1450,1 650和1920 nm波段的光谱反射率与葡萄干基含水率呈极显著相关.为克服多重共线性影响,采用主成分回... 采用光谱分析技术对葡萄缺水状况进行了定量分析,对4种水分胁迫下的葡萄叶片的光谱数据进行分析,发现703 nm的导数光谱及460,720,1450,1 650和1920 nm波段的光谱反射率与葡萄干基含水率呈极显著相关.为克服多重共线性影响,采用主成分回归法建立了叶片干基含水率的定量分析模型,模型预测值与实测值的相关系数为0.94,模型的检验误差(RMSE)为0.15. 展开更多
关键词 葡萄 含水率 光谱分析 多重共线性 主成分分析
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基于主成分回归的公路客运量预测模型研究 被引量:12
17
作者 李晓刚 贾元华 敖谷昌 《交通标准化》 2009年第9期77-81,共5页
运用主成分回归分析法,将影响公路客运量的众多相关因素简化为少数不相关因素,消除因变量过多导致的多重共线性,可构建公路客运量预测模型。实例证明,该模型具有较高的精度,适合影响因素指标发展较为明确的客运量短期预测。
关键词 主成分回归 多重共线性 客运量预测
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线性结构模型及其在现场资料分析中的应用研究 被引量:6
18
作者 张风雨 富振英 +2 位作者 金水高 马林茂 田凤调 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 1992年第5期17-23,共7页
本文从多元线性回归和通径分析方法的一些缺点及现场资料潜变量的分析出发引入线性结构模型,对模型的基本原理给予简单地介绍,阐述了它与传统的一些统计方法的关系。结合实例分析了医学现场资料中一些潜变量之间的关系,得到了较满意的结... 本文从多元线性回归和通径分析方法的一些缺点及现场资料潜变量的分析出发引入线性结构模型,对模型的基本原理给予简单地介绍,阐述了它与传统的一些统计方法的关系。结合实例分析了医学现场资料中一些潜变量之间的关系,得到了较满意的结果,较好地解决了多元线性回归和通径分析方法所不能解决的问题。并指出了线性结构模型在医学中的应用前景。 展开更多
关键词 医学统计 潜变量 多元线性回归 通径分析
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基于偏最小二乘回归的中长期电力负荷预测 被引量:12
19
作者 蒋惠凤 何有世 杨伟雄 《电力系统及其自动化学报》 CSCD 北大核心 2007年第5期110-113,共4页
为了支持将来的经济发展和不断满足电力需求,负荷预测已成为电力部门的重要任务,而提高预测精度是负荷预测的关键问题。为此,判断了影响负荷的经济因素之间存在的多重共线性,用偏最小二乘回归方法消除其共线性影响,并建立了预测模型。... 为了支持将来的经济发展和不断满足电力需求,负荷预测已成为电力部门的重要任务,而提高预测精度是负荷预测的关键问题。为此,判断了影响负荷的经济因素之间存在的多重共线性,用偏最小二乘回归方法消除其共线性影响,并建立了预测模型。结果表明,该方法能准确地估计出变量的回归系数,能避免使用普通最小二乘回归时出现的异常回归系数,预测的相对误差平均为9.83%,最小相对误差为-0.01%。 展开更多
关键词 负荷预测 多重共线性 方差膨胀因子 偏最小二乘回归
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毛竹枝、叶生物量模型研究 被引量:7
20
作者 洪伟 郑郁善 陈礼光 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 1998年第S1期11-15,共5页
毛竹枝、叶生物量是毛竹生态系统中经济指标和生态指标最基本的数量特征。本文系统阐述了林分各因子与毛竹枝、叶生物量之间的相互关系 ,进行线性和非线性数学模型拟合 ,用相关系数和标准差进行模型初选 ,再用共线性测定来决定自变量取... 毛竹枝、叶生物量是毛竹生态系统中经济指标和生态指标最基本的数量特征。本文系统阐述了林分各因子与毛竹枝、叶生物量之间的相互关系 ,进行线性和非线性数学模型拟合 ,用相关系数和标准差进行模型初选 ,再用共线性测定来决定自变量取舍与Cp 值和方差膨胀系数作比较分析 ,选出最优的、高精度、实用可行的数学模型组 ,以便指导生产实践。 展开更多
关键词 毛竹 生物量 Cp值 共线性测定
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