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题名五指山小型猪PPARγ2基因启动子多态性分析
被引量：3
- 1
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作者
潘金春
闵凡贵
王希龙
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机构
广东省实验动物监测所
广东省实验动物重点实验室
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出处
《中国比较医学杂志》
CAS
北大核心
2018年第9期21-26,共6页
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基金
广东省科技计划项目(编号:2017B030314171
2017A070702001)
广州市科技计划项目(编号:201707010376)
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文摘
目的对五指山小型猪PPARγ2基因启动子调控区域多态性进行分析。方法根据猪PPARγ2启动子调控区域2200 bp设计5对引物,对57头封闭群五指山小型猪的多态性进行检测,并用多种生物信息学软件对调控区域的启动子、转录因子结合位点、RNA二级结构、Cp G岛进行预测分析。结果筛选到9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,分别是:-1595T/C、-1534G/A、-1262C/A、-1220C/A、-1017A/G、-963A/G、-955G/A、-866A/G、-333G/A。SNPs都没有处在软件识别的启动子区域中,但-333G/A突变位于核心启动子(-656^-23 bp)区域。突变的SNP位点附近转录因子结合位点会发生改变,突变前后RNA二级结构最小自由能发生变化,其结构也发生显著变化。目标序列未找到Cp G岛。结论筛选到的五指山小型猪PPARγ2启动子调控区域SNPs可能对该基因的表达调控产生影响,为进一步研究其功能奠定基础。
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关键词
五指山小型猪
PPARΓ2
启动子
单核苷酸多态性
生物信息学
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Keywords
wuzhishan minipig(wzsp)
PPARγ2
promoter
single.nucleotide polymorphism(SNP)
bioinformatics
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分类号
R-33
[医药卫生]
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题名利用微卫星标记对五指山小型猪近交群的遗传分析
被引量：3
- 2
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作者
袁文
王静
刘香梅
闵凡贵
潘金春
王希龙
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机构
广东省实验动物重点实验室
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出处
《实验动物与比较医学》
CAS
2012年第4期329-333,共5页
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基金
广东省自然科学基金，广东省科技计划项目，广东省实验动物重点实验室
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文摘
目的分析五指山小型猪近交群的遗传变异及近交程度。方法利用26个微卫星基因座对五指山小型猪近交群进行了遗传多样性检测，统计了各位点等位基因组成，并计算它们的平均基因纯合率、平均多态信息含量和平均杂合度。结果近交群26个基因座的共检测到180个等位基因，平均等位基因数为6．92，平均基因纯合率为56．57％，平均多态信息含量为0．6042，平均杂合度为0．4478。结论五指山小型猪近交群具有较高的纯合度，保持了一定的遗传稳定性。
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关键词
五指山小型猪
微卫星
遗传变异
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Keywords
wuzhishan minipig （wzsp）
Microsatellite
Genetic variation
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分类号
Q95-33
[生物学—动物学]
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