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小体鲟Ar-tnfsf10和Ar-tnfrsf10基因的克隆、表达和功能初步探究
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作者 展敏月 王建 范纯新 《上海海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期472-480,共9页
为了探究TNFSF和TNFRSF在硬骨鱼中的表达和功能,克隆小体鲟Ar-tnfsf10和Ar-tnfrsf10基因,并对小体鲟Tnfsf10和Tnfrsf10序列进行进化分析以及蛋白高级结构预测。结果表明,小体鲟Tnfsf10和Tnfrsf10在进化树中位于辐鳍亚纲的基部,虽然与四... 为了探究TNFSF和TNFRSF在硬骨鱼中的表达和功能,克隆小体鲟Ar-tnfsf10和Ar-tnfrsf10基因,并对小体鲟Tnfsf10和Tnfrsf10序列进行进化分析以及蛋白高级结构预测。结果表明,小体鲟Tnfsf10和Tnfrsf10在进化树中位于辐鳍亚纲的基部,虽然与四足动物的Tnfsf10和Tnfrsf10同源性不高,但其三维结构与人的Tnfsf10和Tnfrsf10相近。原位杂交结果显示:Ar-tnfsf10和Ar-tnfrsf10均在小体鲟躯干水平肌隔、眼部的眶下管、前鳃盖管和腹侧吻端的神经丘处有较强表达。经Tnfrsf10特异性激活剂Bioymifi处理后,小体鲟仔鱼整体结构无显著变化,但神经丘中毛细胞显著增多。综上结果表明:小体鲟Tnfsf10和Tnfrsf10代表了硬骨鱼同源蛋白的原始形式,可能特异性参与侧线神经丘毛细胞的发育。 展开更多
关键词 小体鲟 Tnfsf10 tnfrsf10 表达 侧线 机械感受器感觉细胞 电感受器感觉细胞
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TNFRSF10D在胶质瘤中的表达及其与免疫细胞浸润的关系
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作者 任秀芳 刘佳妹 +2 位作者 亢野 关晓娇 杨向红 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期769-775,共7页
目的分析不同级别胶质瘤中肿瘤坏死因子受体超家族10D(TNFRSF10D)的表达水平及患者的预后情况,并探讨其与肿瘤免疫细胞的关系。方法从TCGA/CGGA数据库中下载胶质瘤患者的基因表达谱数据和临床信息。比较TNFRSF10D在不同病理分级、TCGA... 目的分析不同级别胶质瘤中肿瘤坏死因子受体超家族10D(TNFRSF10D)的表达水平及患者的预后情况,并探讨其与肿瘤免疫细胞的关系。方法从TCGA/CGGA数据库中下载胶质瘤患者的基因表达谱数据和临床信息。比较TNFRSF10D在不同病理分级、TCGA分级及分子分型组织样本中的表达差异。采用Kaplan-Meier生存曲线和log-rank检验评价TNFSFR10D的预后价值,采用基因集富集分析(GSEA)探索TNFRSF10D在胶质瘤中的免疫相关基因集,采用CIBERSORT分析TNFRSF10D与胶质瘤免疫微环境细胞构成的关系。分析TNFRSF10D表达水平与肿瘤纯度和免疫细胞浸润程度之间的关系,通过胶质瘤石蜡标本免疫组化染色进行验证。结果TNFRSF10D的表达与胶质瘤的恶性程度呈正相关,并与患者的预后不良显著相关。TNFRSF10D的表达水平可影响胶质瘤免疫微环境中免疫细胞的构成。TNFRSF10D高表达与巨噬细胞的富集有较强的相关性。结论TNFRSF10D可影响胶质瘤的免疫过程,并可作为胶质瘤的独立预后因素。 展开更多
关键词 胶质瘤 tnfrsf10D 肿瘤微环境 免疫细胞 肿瘤纯度
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TNFRSF10A基因多态性与非小细胞肺癌临床病理参数及预后的相关性
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作者 黄惠娟 欧阳学农 +1 位作者 赵忠全 余宗阳 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期275-279,共5页
目的:研究肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)的死亡受体4(TRAIL-DR4,TNFRSF10A)基因-972 C/T位点和-397G/T位点的多态性与非小细胞肺癌(NSCLC)临床病理关系,探讨其在NSCLC预后中的潜在意义。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多... 目的:研究肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)的死亡受体4(TRAIL-DR4,TNFRSF10A)基因-972 C/T位点和-397G/T位点的多态性与非小细胞肺癌(NSCLC)临床病理关系,探讨其在NSCLC预后中的潜在意义。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法,检测92例初治、经完全手术后、存有病理组织且经3年随访的NSCLC患者标本的TNFRSF10A基因-972 C/T和-397 G/T位点多态性,用非条件LogiStic回归模型经性别、年龄、吸烟校正混杂因素分析基因型分布频率与临床病理特征的关系,并用kaplan-Meier、Log-rank曲线分析其与NSCLC患者3年生存率之间的关系,Cox回归模型分析NSCLC预后的影响因素及对可能相关因素进行分层分析。结果:-972C/T位点与NSCLC的肿瘤细胞病理分化程度具有一定的相关性,进一步以不同的分化程度来分层分析得出:CT基因型较CC和TT基因型分化程度低(P=0.012,OR=7.599,95%CI:1.564~36.917)但该位点与NSCLC的病理类型、临床分期、肿瘤大小及淋巴结转移状态均无显著相关。与NSCLC 3年生存率及预后的研究结果表明,该位点与3年生存率、预后均无显著相关性。然而Cox回归分析提示病理类型、分化程度、临床分期影响预后,由此可推断该位点与预后仍存在一定的相关性。-397 G/T位点的多态性与JNSCLC的各病理参数、3年生存率和预后均不存在关联。结论:-972 C/T位点的基因多态性与NSCLC病理肿瘤细胞分化程度相关,且-972 C/T位点杂合基因型的患者可能提示预后不良本研究表明,TNFRSF10A基因的多态性检测与临床病理参数存在一定的关联以期指导临床,且对NSCLC患者的预后评价可能存在一定的价值。 展开更多
关键词 肺癌 TRAIL DR4 tnfrsf10A 基因多态性
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Aberrant methylation frequency of TNFRSF10C promoter in pancreatic cancer cell lines 被引量:4
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作者 Hui-Hua Cai,Yue-Ming Sun,Yi Miao,Wen-Tao Gao,Quan Peng,Jie Yao and Han-Lin Zhao Department of General Surgery,First Affiliated Hospital, Nanjing Medical University,Nanjing 210029,China Department of General Surgery, Jiangsu Province Hospital of Traditional Chinese Medicine,Nanjing 210029, China 《Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International》 SCIE CAS 2011年第1期95-100,共6页
BACKGROUND:A growing body of evidence suggests that many tumors are initiated by both epigenetic abnormalities and gene mutations,which promote tumor progression. Epigenetic abnormalities include changes in DNA methyl... BACKGROUND:A growing body of evidence suggests that many tumors are initiated by both epigenetic abnormalities and gene mutations,which promote tumor progression. Epigenetic abnormalities include changes in DNA methylation and in the modification of histones.This study aimed to assess the status of methylation in the CpG island(CGI)of the tumor necrosis factor receptor superfamily member 10c(TNFRSF10C) with combined bisulfite restriction analysis(COBRA)and to evaluate its role in the progression of pancreatic cancer(PC). METHODS:The methylation status of four PC cell lines was assessed using COBRA and/or bisulfite genomic sequencing (BGS).Changes in methylation and TNFRSF10C expression in PC cell lines before and after treatment with 5-aza-2’-deoxycytidine(5-aza-dC)and/or trichostatin A(TSA)were assessed by BGS and real-time RT-PCR.Apoptosis in the four cell lines was tested by flow cytometry(FCM)and TUNEL assay. RESULTS:The methylation status of the TNFRSF10C promoter was assessed in PC cells(BxPC-3:68.84±8.71%;CFPAC-1:0; PANC-1:96.77±4.57%;SW1990:54.97±7.33%)with the COBRA assay,which was confirmed by the results of BGS.After treatment with 5-aza-dC and/or TSA,apoptosis was induced in PC cells to different degrees,and the levels of TNFRSF10C transcriptional expression in the PC cell lines(except CFPAC-1) increased markedly after 5-aza-dC treatment. CONCLUSIONS:A high frequency of CGI methylation in the TNFRSF10C promoter results in inactivation of the gene and enhancement of tumor growth in most PC cell lines(except CFPAC-1).Inactivation of TNFRSF10C by CGI hypermethylation can play an important role in PC progression and be potentially useful as a diagnostic marker and a new therapeutic approach for PC. 展开更多
关键词 METHYLATION CpG island pancreatic cancer tnfrsf10C
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实时荧光定量PCR检测应力性骨折新兵外周血TNFRSF10C mRNA表达
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作者 王毅铮 赵化冰 +6 位作者 兰晓霞 张明顺 高宏生 张国辉 赵国平 尹光雅 王世鑫 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期132-135,共4页
目的:检测TNFRSF10C基因在应力性骨折(SF)患者与正常人之间的表达差异。方法:采用1:1配比的病例对照研究,选取入伍新兵SF病例及正常对照各10例,取受试者空腹肘静脉血,采用实时荧光定量PCR检测TNFRSF10C基因表达,结合管家基因GAPDH进行... 目的:检测TNFRSF10C基因在应力性骨折(SF)患者与正常人之间的表达差异。方法:采用1:1配比的病例对照研究,选取入伍新兵SF病例及正常对照各10例,取受试者空腹肘静脉血,采用实时荧光定量PCR检测TNFRSF10C基因表达,结合管家基因GAPDH进行相对定量分析。结果:设计并合成了一组只特异性结合人TNFRSF10C基因的实时荧光定量PCR引物,结果未发现非特异性扩增。10例SF样本中有7例TNFRSF10C基因表达上调,上调1.4倍至6.7倍,另3例SF样本TNFRSF10C基因表达下调,分别为50%、90%和90%。结论:本研究建立的TNFRSF10C基因实时荧光定量PCR检测体系特异性好、可靠。TNFRSF10C基因表达结果为分析SF发病的分子机制及SF早期诊断提供了重要线索。 展开更多
关键词 应力性骨折 外周血 tnfrsf10C基因 实时荧光定量PCR
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Long noncoding RNA TNFRSF10A-AS1 promotes colorectal cancer through upregulation of HuR
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作者 Dan-Dan Wang Dong-Lei Sun +5 位作者 Shao-Peng Yang Jia Song Meng-Yao Wu Wei-Wei Niu Mei Song Xiao-Lan Zhang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2022年第20期2184-2200,共17页
BACKGROUND Recent studies have emphasized the emerging importance of long noncoding RNAs(lncRNAs)in colorectal cancer(CRC).However,the functions and regulatory mechanisms of numerous lncRNAs in CRC have not been fully... BACKGROUND Recent studies have emphasized the emerging importance of long noncoding RNAs(lncRNAs)in colorectal cancer(CRC).However,the functions and regulatory mechanisms of numerous lncRNAs in CRC have not been fully elucidated.AIM To explore the functional role and underlying molecular mechanisms of lncRNA TNFRSF10A-AS1 in CRC.METHODS TNFRSF10A-AS1 expression was measured by quantitative real-time polymerase chain reaction in CRC,and the relationship between TNFRSF10A-AS1 levels and the clinicopathological features of CRC patients was analyzed.The effect of TNFRSF10A-AS1 expression on CRC proliferation and metastasis was examined in vitro and in vivo.Mechanistically,we investigated how TNFRSF10A-AS1 is involved in CRC as a competitive endogenous RNA.RESULTS TNFRSF10A-AS1 was expressed at a high level in CRC and the upregulation of TNFRSF10A-AS1 was associated with advanced T grade and tumor size in CRC patients.A functional investigation revealed that TNFRSF10A-AS1 enhanced the proliferation,migration ability and invasion ability of colon cancer cells in vitro and in vivo.A mechanistic analysis demonstrated that TNFRSF10A-AS1 acted as a miR-3121-3p molecular sponge to regulate HuR expression,ultimately promoting colorectal tumorigenesis and progression.CONCLUSION TNFRSF10A-AS1 exerts a tumor-promoting function through the miR-3121-3p/HuR axis in CRC,indicating that it may be a novel target for CRC therapy. 展开更多
关键词 Colorectal cancer Long noncoding RNA tnfrsf10A-AS1 miR-3121-3p HUR
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