期刊文献+
共找到3篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
基于TCGA数据集分析mRNA在子宫内膜癌中差异表达及对预后影响 被引量:3
1
作者 张洁 赵曼曼 周妍 《临床军医杂志》 CAS 2020年第1期59-62,共4页
目的基于TCGA数据集分析mRNA在子宫内膜癌中的差异表达,建立mRNA差异表达与子宫内膜癌预后的关联。方法提取TCGA数据库中子宫内膜癌样本的mRNA表达量及临床数据资料,采用edgeR算法比较正常组织与子宫内膜癌组织的mRNA表达量,通过mRNA差... 目的基于TCGA数据集分析mRNA在子宫内膜癌中的差异表达,建立mRNA差异表达与子宫内膜癌预后的关联。方法提取TCGA数据库中子宫内膜癌样本的mRNA表达量及临床数据资料,采用edgeR算法比较正常组织与子宫内膜癌组织的mRNA表达量,通过mRNA差异表达和临床存活时间作生存分析,寻找对子宫内膜癌预后产生影响的mRNA。结果正常组织与子宫内膜癌组织之间共发现4 429个差异表达mRNA,从中选取前1 000个差异表达mRNA进行GO富集分析、KEGG富集分析及蛋白互作网络分析,筛选出20例hub基因。通过生存分析发现,7个差异表达mRNA(ASPM、AURKA、BUB1、CDCA8、KIF2C、TOP2A、UBE2C)与子宫内膜癌患者存活时间相关(P <0. 05)。结论正常组织和子宫内膜癌组织之间的ASPM、AURKA、BUB1、CDCA8、KIF2C、TOP2A、UBE2C 7个差异表达mRNA与子宫内膜癌患者预后相关,对mRNA在子宫内膜癌领域的研究具有参考价值。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 tcga数据集 MRNA
下载PDF
基于GTEx联合TCGA数据集筛选肝癌中mRNA研究 被引量:1
2
作者 张燕明 韩涛 +1 位作者 郑振东 韩磊 《临床军医杂志》 CAS 2019年第12期1281-1283,共3页
目的探讨mRNA在肝癌及对照正常肝组织中的表达差异,并分析其与肝癌预后的关系。方法提取GTEx和TCGA数据库中肝癌样本的mRNA表达量及肝癌生存数据。通过WilcoxTest算法比较正常组织与肿瘤组织数据的mRNA表达量。联合差异mRNA与临床生存... 目的探讨mRNA在肝癌及对照正常肝组织中的表达差异,并分析其与肝癌预后的关系。方法提取GTEx和TCGA数据库中肝癌样本的mRNA表达量及肝癌生存数据。通过WilcoxTest算法比较正常组织与肿瘤组织数据的mRNA表达量。联合差异mRNA与临床生存时间作生存分析,寻找对肝癌预后产生影响的mRNA,并通过GO、KEGG富集分析其相关机制。结果共获取334个差异表达mRNA。通过生存分析发现,CFB、FCN3、CFHR2、COLEC10等110个差异mRNA与肝癌患者预后相关。GO、KEGG富集结果提示,humoral immune response、DNA damage response、drug metabolism-other enzymes、chemical carcinogenesis等与肝癌患者生存时间相关。结论共获得110个与肝癌患者总生存相关的差异基因,其可能通过humoral immune response、DNA damage response、drug metabolism-other enzymes、chemical carcinogenesis等功能集发挥生物学作用,对mRNA在肝癌领域的研究具有借鉴价值。 展开更多
关键词 肝癌 MRNA GTEx数据集 tcga数据集 预后
下载PDF
利用TCGA数据集分析PTPN5在肝癌中表达及其作用机制
3
作者 张燕明 韩涛 +3 位作者 张跃 李高 李婉君 郑振东 《临床军医杂志》 CAS 2020年第3期260-263,共4页
目的分析PTPN5在肝癌组织中表达及其可能的作用机制。方法从TCGA数据集中收集肝癌及癌旁组织中的基因表达数据,提取癌及癌旁组织PTPN5分子表达水平,分析表达差异。联合患者临床信息分析PTPN5与临床指标相关性。利用GSEA分析PTPN5可能的... 目的分析PTPN5在肝癌组织中表达及其可能的作用机制。方法从TCGA数据集中收集肝癌及癌旁组织中的基因表达数据,提取癌及癌旁组织PTPN5分子表达水平,分析表达差异。联合患者临床信息分析PTPN5与临床指标相关性。利用GSEA分析PTPN5可能的作用机制。结果癌组织PTPN5分子表达水平显著高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。PTPN5表达水平与患者5年存活期及有无微血管侵犯相关(P<0.05)。GSEA分析结果显示,PTPN5高表达的组织样本富集了细胞粘附因子、黏着斑激酶、MAPK、WNT信号传导通道等功能集团基因。结论在肝癌组织中,PTPN5特异性表达,可能通过细胞粘附因子、黏着斑激酶、MAPK、WNT信号传导通道等功能集团发挥作用,其可能成为预测肝癌患者存活期的一项指标。 展开更多
关键词 肝癌 PTPN5 tcga数据集
下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部