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3-PBA降解菌BA3的降解特性及基因工程菌构建 被引量:14
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作者 段晓芹 郑金伟 +3 位作者 张隽 杭宝建 何健 李顺鹏 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第1期240-246,共7页
从石油污染土壤中分离到1株能以3-苯氧基苯甲酸(3-PBA)为唯一碳源生长的细菌,命名为BA3.根据其生理生化特征和16S rDNA序列相似性分析,将该菌鉴定为鞘脂菌属(Sphingobium sp.).该菌株在60 h内对100 mg.L-1的3-苯氧基苯甲酸的降解率达到9... 从石油污染土壤中分离到1株能以3-苯氧基苯甲酸(3-PBA)为唯一碳源生长的细菌,命名为BA3.根据其生理生化特征和16S rDNA序列相似性分析,将该菌鉴定为鞘脂菌属(Sphingobium sp.).该菌株在60 h内对100 mg.L-1的3-苯氧基苯甲酸的降解率达到99%.降解3-苯氧基苯甲酸的最适温度为30℃,pH值为7.0,降解速率与初始接种量呈正相关.拟除虫菊酯类杀虫剂水解酶基因pytH为本实验室克隆到的一个新的菊酯水解酶基因,通过PCR从菊酯降解菌株JZ-2总DNA扩增了pytH,将pytH定向克隆到pBBRMCS-5载体上,构建重组质粒pPYTH,在辅助质粒pRK600的帮助下,通过三亲接合将pPYTH转移到3-PBA降解菌株Sphingobium sp.BA3中,获得工程菌Sphingobium sp.BA3-pytH;甲氰菊酯的降解实验表明,菌株JZ-2在48 h内对50 mg.L-1的甲氰菊酯降解率仅为60%左右,工程菌BA3-pytH相同条件下对50 mg.L-1的甲氰菊酯降解率达到95%以上,同时对甲氰菊酯的降解中间产物3-PBA也能较快降解,不会对菊酯的降解产生反馈抑制.工程菌BA3-pytH因其对甲氰菊酯和其降解中间产物3-PBA的快速降解能力,比原始菌株JZ-2在菊酯污染土壤生物修复应用中更具有优势. 展开更多
关键词 3-苯氧基苯甲酸 生物降解 鞘脂菌 菊酯水解酶基因 基因工程菌
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Sphingobium sp.JZ-1对菊酯类农药的降解特性研究 被引量:6
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作者 李恋 王保战 +4 位作者 周维友 杭宝剑 郭鹏 何健 李顺鹏 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期389-396,共8页
研究了菊酯降解菌株Sphingobium sp.JZ-1及其粗酶液对菊酯类农药的降解特性。结果表明,该菌能降解目前使用的各种菊酯类农药,降解速率顺序为:氯菊酯>甲氰菊酯≈氯氰菊酯>功夫菊酯>氰戊菊酯>溴氰菊酯>联苯菊酯;Sphingobiu... 研究了菊酯降解菌株Sphingobium sp.JZ-1及其粗酶液对菊酯类农药的降解特性。结果表明,该菌能降解目前使用的各种菊酯类农药,降解速率顺序为:氯菊酯>甲氰菊酯≈氯氰菊酯>功夫菊酯>氰戊菊酯>溴氰菊酯>联苯菊酯;Sphingobium sp.JZ-1对菊酯的降解没有手性选择性;高效液相色谱检测结果表明Sphingobium sp.JZ-1对氯氰菊酯降解的初始反应是在菊酯水解酶的催化下羧酸酯键断裂生成二氯菊酸和3-苯氧基苯甲醛,3-苯氧基苯甲醛进一步氧化成苯氧基苯甲酸。Sphingobium sp.JZ-1细胞中菊酯水解酶酶活不需要菊酯的诱导。 展开更多
关键词 菊酯类农药 生物降解 鞘氨醇杆菌属 手性选择
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Sphingobium sp.和Delftia sp.复合降解苯酚的研究 被引量:2
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作者 许甜甜 陈军 《上海师范大学学报(自然科学版)》 2012年第1期94-98,共5页
将已分离获得的两株苯酚降解菌Sphingobium sp.和Delftia sp.按1∶1(V/V)复合后降解苯酚的效果显著.通过Plackett-Burman试验设计得出影响两株菌复合降解苯酚的3个主效应因素分别是pH,苯酚,接种量;并由单因素试验得出复合降解苯酚的有... 将已分离获得的两株苯酚降解菌Sphingobium sp.和Delftia sp.按1∶1(V/V)复合后降解苯酚的效果显著.通过Plackett-Burman试验设计得出影响两株菌复合降解苯酚的3个主效应因素分别是pH,苯酚,接种量;并由单因素试验得出复合降解苯酚的有利条件是:pH 6.0,接种量3.5%,苯酚的复合降解率随苯酚含量的增高而降低.在这个条件下,两株菌1∶1(V/V)复合后28 h内即可将500 mg.L-1苯酚完全降解,比单个菌株降解苯酚明显缩短了时间. 展开更多
关键词 苯酚 生物降解 sphingobium sp. Delftia sp. PLACKETT-BURMAN 试验设计
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共代谢基质对苯酚降解菌XTT-3降酚作用的影响 被引量:3
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作者 许甜甜 陈军 《环境污染与防治》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期39-42,共4页
采用驯化的方法从活性污泥中分离到一株苯酚降解菌XTT-3,经16SrDNA鉴定为Sphingobiumsp.。对该菌株进行碳饥饿处理,发现其降解苯酚的能力受到抑制。以只含苯酚的M9培养基为参照,添加0.2g/L酵母膏作为共代谢基质,对XTT-3菌株降解苯酚有... 采用驯化的方法从活性污泥中分离到一株苯酚降解菌XTT-3,经16SrDNA鉴定为Sphingobiumsp.。对该菌株进行碳饥饿处理,发现其降解苯酚的能力受到抑制。以只含苯酚的M9培养基为参照,添加0.2g/L酵母膏作为共代谢基质,对XTT-3菌株降解苯酚有较明显的促进作用,36h后苯酚降解率为68%。在含0.2g/L酵母膏的M9培养基中,同时添加20mg/L邻苯二酚,XTT-3降解苯酚作用显著增加,24h后苯酚降解率达75%,苯酚降解速度达0.261mg/min。 展开更多
关键词 苯酚 生物降解 sphingobium sp. 共代谢 碳饥饿
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一株鞘氨醇杆菌对低阶煤的降解研究
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作者 任恒星 李国富 +5 位作者 陈林勇 王美林 赵娜 刘建民 郭鑫 何环 《煤炭转化》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期28-35,共8页
利用鞘氨醇杆菌(Sphingobium sp.)对硝酸氧化的低阶煤进行降解,并利用紫外-可见分光光度计、气相色谱-质谱联用仪和红外光谱仪对生物降解过程中煤与降解液的化学组成以及降解产物的有机组分进行表征,对生物降解效果和降解机理进行分析... 利用鞘氨醇杆菌(Sphingobium sp.)对硝酸氧化的低阶煤进行降解,并利用紫外-可见分光光度计、气相色谱-质谱联用仪和红外光谱仪对生物降解过程中煤与降解液的化学组成以及降解产物的有机组分进行表征,对生物降解效果和降解机理进行分析。结果表明:鞘氨醇杆菌对煤的降解率达到32%,降解过程中降解液pH值不断升高,最高达到9.0;鞘氨醇杆菌的胞外液对煤具有显著的降解作用,且胞外液对煤的降解率与初始pH值密切相关;高温加热后的胞外液对煤的降解效果明显降低。红外光谱分析结果显示,经鞘氨醇杆菌降解后煤中的羧基官能团和硝基官能团含量明显降低;气相色谱-质谱联用分析结果显示,降解产物主要含有羧酸、醇、醛、酚和杂环类化合物,其中脂肪酸含量最多。鞘氨醇杆菌可通过产生胞外酶和碱性物质对义马低阶煤进行高效降解,降解产物中含有丰富的脂肪酸,经生物降解后煤中氧含量明显降低。 展开更多
关键词 鞘氨醇杆菌 降解机理 碱性物质 胞外酶 降解产物
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Effects of Bacterial-Feeding Nematode Grazing and Tea Saponin Addition on the Enhanced Bioremediation of Pyrene-Contaminated Soil Using Polycyclic Aromatic Hydrocarbon-Degrading Bacterial Strain 被引量:7
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作者 SUN Mingming LIU Kuan +5 位作者 ZHAO Yuanchao TIAN Da YE Mao LIU Manqiang JIAO Jiaguo JIANG Xin 《Pedosphere》 SCIE CAS CSCD 2017年第6期1062-1072,共11页
As one of the most widely distributed bacterial predators in the soil, the role of bacterivorous nematodes on the enhanced bioremediation of polycyclic aromatic hydrocarbon-contaminated soils is crucial, but remains t... As one of the most widely distributed bacterial predators in the soil, the role of bacterivorous nematodes on the enhanced bioremediation of polycyclic aromatic hydrocarbon-contaminated soils is crucial, but remains to be investigated.A microcosm-level study was conducted to examine the effects of bacterial-feeding nematode grazing and tea saponin(TS) addition on bioremediation of a pyrene-contaminated soil enhanced by the polycyclic aromatic hydrocarbon(PAH)-degrading bacterial strain Sphingobium sp.PHE9.After 180 d of incubation, the highest pyrene dissipation(71.3%) was achieved through a combination of Sphingobium sp.PHE9 inoculation with nematode and TS addition.Meanwhile, high counts of culturable PAH-degrading bacteria, soil enzyme activity, and biodiversity indices were observed under the combined treatment, implying that the microbiological function of the contaminated soil was significantly restored.Additionally, the results of Tenax~ extraction with the first-order three-compartment model indicated that rate-limiting factors varied among treatments.The lack of degrading microorganisms was the main rate-limiting factor for the treatments involving TS/nematode addition, and inadequate bioaccessible pyrene was the vital rate-limiting factor in the treatments involving Sphingobium sp.PHE9 inoculation.The proposed combined clean-up strategy proved to be a promising bioremediation technology for aged pyrene-contaminated soils. 展开更多
关键词 desorbing fraction desorption rate constant physiological profile of soil microbial community Shannon-Weaver index Simpson index soil microbial activity sphingobium sp.PHE9
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麦草畏降解菌株Sphingobium sp.Dca-5的分离、鉴定及降解特性 被引量:3
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作者 李娜 彭乾 +4 位作者 何健 张浩 黄红慧 李景照 惠丰立 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期943-949,共7页
麦草畏是一种广谱高效除草剂,随着抗麦草畏转基因作物的推广和使用,麦草畏的使用量急剧增加.为研究麦草畏的微生物降解机制,发掘新的麦草畏高效降解菌株和基因资源,从农药厂排污口土壤中筛选到一株以麦草畏为唯一碳源生长的鞘酯菌属(Sph... 麦草畏是一种广谱高效除草剂,随着抗麦草畏转基因作物的推广和使用,麦草畏的使用量急剧增加.为研究麦草畏的微生物降解机制,发掘新的麦草畏高效降解菌株和基因资源,从农药厂排污口土壤中筛选到一株以麦草畏为唯一碳源生长的鞘酯菌属(Sphingobium sp.)细菌Dca-5.该菌株48 h内完全矿化2.0 mmol/L的麦草畏,并检测到代谢产物3,6-二氯水杨酸,表明该菌株通过脱甲基起始麦草畏降解. Dca-5粗酶液在添加NADH时具有麦草畏脱甲基酶活性,但加入细胞色素P450抑制剂1-氨基苯并三唑、增效醚或马拉硫磷后酶活受到显著抑制.在Dca-5基因组中找到两个3,6-二氯水杨酸降解基因簇但未发现DMO和dmt同源基因.结果表明菌株Dca-5中的麦草畏脱甲基酶是一个新的细胞色素P450类单加氧酶.本研究为阐明麦草畏的微生物降解代谢机制,获得新的麦草畏脱甲基酶基因提供了菌株材料和理论依据;并且Sphingobium sp. Dca-5能快速矿化麦草畏,在麦草畏污染土壤的微生物修复方面具有良好的应用前景. 展开更多
关键词 麦草畏 分离鉴定 sphingobium sp. Dca-5 脱甲基酶 代谢途径 细胞色素P450类单加氧酶
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Sphingobium sp. MEA3-1对苯酚的降解特性及降解途径研究 被引量:1
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作者 程豪杰 侯颖 +3 位作者 卫晓博 李盛前 秦翠丽 徐建强 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期315-324,共10页
鞘脂菌(Sphingobium)MEA3-1是本课题组前期分离到的一株2,6-甲乙基苯胺高效降解菌,因发现其还能降解苯酚等多种芳香烃化合物,本研究遂对其降解苯酚的特性和途径进行了探究。结果表明:该菌株可以苯酚为唯一碳源生长,其降解苯酚的最适温度... 鞘脂菌(Sphingobium)MEA3-1是本课题组前期分离到的一株2,6-甲乙基苯胺高效降解菌,因发现其还能降解苯酚等多种芳香烃化合物,本研究遂对其降解苯酚的特性和途径进行了探究。结果表明:该菌株可以苯酚为唯一碳源生长,其降解苯酚的最适温度和pH值分别为30℃和6.0;在添加Zn^(2+)或Fe^(3+)条件下,该菌株可在3 d内将100 mg/L的苯酚降解93%以上。利用紫外分光光度计检测到MEA3-1粗酶液具有苯酚羟化酶和邻苯二酚1,2-双加氧酶活性,说明是通过邻位裂解途径降解苯酚的。以MEA3-1的总DNA为模板,成功扩增到1个933 bp的邻苯二酚2,3-双加氧基因(C23O)和大小分别为891 bp和894 bp的2个邻苯二酚1,2-双加氧酶基因(C12O-1和C12O-2),实现了其在大肠杆菌的表达,并验证了C23O和C12O-2的功能。本研究为利用鞘脂菌MEA3-1进行苯酚降解和进一步揭示其降解芳香烃化合物的机理提供了基础。 展开更多
关键词 鞘脂菌MEA3-1 苯酚 降解特性 降解途径
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2,4-二硝基甲苯磺酸盐降解菌株的分离、鉴定及降解特性研究 被引量:1
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作者 徐文杰 赵泉林 +1 位作者 罗明汉 叶正芳 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第4期733-738,共6页
针对TNT红水污染土壤生物修复菌种资源匮乏问题,从复合菌群中分离纯化出一株2,4-二硝基甲苯磺酸盐(DNTS)降解菌株X2,经生理生化分析及16S rDNA鉴定,该菌株属于鞘氨醇单胞菌属。进一步研究环境因素对菌株X2生长的影响,并探究X2对2,4-二... 针对TNT红水污染土壤生物修复菌种资源匮乏问题,从复合菌群中分离纯化出一株2,4-二硝基甲苯磺酸盐(DNTS)降解菌株X2,经生理生化分析及16S rDNA鉴定,该菌株属于鞘氨醇单胞菌属。进一步研究环境因素对菌株X2生长的影响,并探究X2对2,4-二硝基甲苯-3-磺酸盐(2,4-DNT-3-SO_(3)^(−))和2,4-二硝基甲苯-5-磺酸盐(2,4-DNT-5-SO_(3)^(−))的降解机理及对多种硝基芳香族炸药的降解效果。结果表明,X2的最佳生长条件为30℃,pH=7和1%盐度。菌株X2对初始浓度为500 mg/kg的2,4-DNT-3-SO_(3)^(−)和2,4-DNT-5-SO_(3)^(−)的降解率分别在第12天和第3天达到100%。液相色谱–质谱(LC-MS)分析表明,DNTS中的硝基被转化为氨基。鞘氨醇单胞菌X2具有广谱降解特性,不仅可以降解DNTS,还可以降解2,4,6-三硝基甲苯(TNT)、二硝基甲苯(DNT)和硝基甲苯(MNT)等多种硝基芳香族炸药,为TNT红水污染土壤生物修复提供可能性。 展开更多
关键词 菌株分离鉴定 鞘氨醇单胞菌X2 2 4-二硝基甲苯磺酸盐 微生物降解
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