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绵羊多羔主效基因FecB高通量检测方法的建立及应用 被引量:25
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作者 刘秋月 胡文萍 +10 位作者 贺小云 潘章源 郭晓飞 冯涛 曹贵玲 黄冬维 贺建宁 狄冉 曹晓涵 王翔宇 储明星 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期39-51,共13页
基于前期分型基础,为了更进一步提高分型的效率和准确性,本试验建立了Taqman探针和SNaPshot两种高通量FecB突变分型方法。结果显示,与传统的PCR-RFLP和PCR-SSCP分型方法相比,这两种高通量分型方法在节省检测成本的同时,大大缩短了检测周... 基于前期分型基础,为了更进一步提高分型的效率和准确性,本试验建立了Taqman探针和SNaPshot两种高通量FecB突变分型方法。结果显示,与传统的PCR-RFLP和PCR-SSCP分型方法相比,这两种高通量分型方法在节省检测成本的同时,大大缩短了检测周期,并在检测效率上也有了大幅度的提高,对利用FecB进行分子育种具有潜在的应用价值。自2003年至今,本实验室应用这两种方法对10个中国本地绵羊品种、3个培育品种以及一些杂交群体的23 264只绵羊的FecB频率进行了检测,结果显示,湖羊和小尾寒羊携带FecB基因的频率最高,小尾寒羊FecB基因的B等位基因频率为0.432~0.833。跟踪以小尾寒羊作为母本和杜泊羊级进杂交后代群体发现,随着杂交的进行FecB基因在培育的鲁西黑头肉羊中的B等位基因频率提升到了0.432,但在横交固定阶段有所下降。本研究所得结果可为今后在肉用绵羊品种多羔改良和多羔肉用新品种培育过程中通过引入FecB基因提高繁殖性能提供参考数据。 展开更多
关键词 FECB基因 产羔数 Taqman探针法 snapshot分型 等位基因频率 绵羊
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福建地区稀有血型JK(a-b-)表型筛选及分子遗传学分析 被引量:4
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作者 张爱 池泉 林授 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2018年第3期173-177,共5页
目的了解福建地区无偿献血者Kidd血型系统中JK(a-b-)表型的分布频率并分析其遗传学特征。方法用尿素溶解试验筛查福建地区180 626例无偿献血者JK(a-b-)表型;用经典血清学方法确证其表型;对JK基因的启动子、11个外显子及其侧翼区域(50~15... 目的了解福建地区无偿献血者Kidd血型系统中JK(a-b-)表型的分布频率并分析其遗传学特征。方法用尿素溶解试验筛查福建地区180 626例无偿献血者JK(a-b-)表型;用经典血清学方法确证其表型;对JK基因的启动子、11个外显子及其侧翼区域(50~150 bp)扩增后测序并分析序列信息;用SNa Pshot技术分析福建地区200例献血者JK基因的单核苷酸多态性(SNP)。结果 180 626例无偿献血者中检出15例JK(a-b-)表型个体。分析15例JK(a-b-)表型个体JK基因,检测出的4种隐性基因分别为JK*B(IVS5-1G>A)、JK*B(896G>A)、JK*A(130G>A,220A>G)和JK*B(130G>A,956C>T),这4种隐性基因分别占检出无效基因的66.67%、23.33%、6.67%和3.33%。分析上述200例献血者JK基因SNP发现,JK*B(IVS5-1G>A)为0.75%,JK基因的G130A是一种常见的多态性,未检测到A220G、C222T、C956T、G896A变异。结论福建地区无偿献血人群中JK(a-b-)表型频率估计约为0.008%,JK*B(IVS5-1G>A)和JK*B(896G>A)是该地区JK(a-b-)表型的主要流行基因,发现1个新的引起JK(a-b-)表型的JK-null基因,即SLC14A1 130A,220G。 展开更多
关键词 KIDD血型 JK(a-b-)表型 尿素溶解试验 JK基因 基因测序 snapshot分型
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候选基因多态性与湘西地区侗族2型糖尿病相关性研究 被引量:1
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作者 刘立亚 陈立章 +3 位作者 张英 田玉梅 樊婵 易宗娓 《中国预防医学杂志》 CAS CSCD 2018年第3期228-233,共6页
目的探讨PARD3B、LOC729993、EPHA4、HNT基因多态性与湘西地区侗族人群2型糖尿病(T2DM)的相关性。方法按照WHO 1999年2型糖尿病(T2DM)诊断标准,将研究对象分为T2DM患者、糖调节受损者(IGR)和正常糖耐量者(NGT),通过问卷调查、体格测量... 目的探讨PARD3B、LOC729993、EPHA4、HNT基因多态性与湘西地区侗族人群2型糖尿病(T2DM)的相关性。方法按照WHO 1999年2型糖尿病(T2DM)诊断标准,将研究对象分为T2DM患者、糖调节受损者(IGR)和正常糖耐量者(NGT),通过问卷调查、体格测量获得人口统计学资料,同时抽取血样用于生化指标检测,采用多重PCR-SNaPshot基因分型技术,对PARD3B、LOC729993、EPHA4、HNT基因的4个多态位点rs849230、rs149228、rs16862811、rs3099797进行基因分型,分析各因素与2型糖尿病的相关性。结果结果发现年龄、胰岛素抵抗指数(INSIR)、β细胞功能指数(INSβC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、体质量指数(BMI)、腰臀比(WHR)、糖尿病家族史、rs849230的AA基因型及其风险等位基因A与糖尿病和糖调节受损有关(均P<0.05);调整年龄和BMI后,rs849230位点的AA基因型与T2DM相关(OR=2.557,95%CI:1.039~6.303,P<0.05)。结论PARD3B基因的rs849230基因位点是湘西地区侗族T2DM的风险基因,可能通过影响胰岛β细胞功能引起糖尿病。 展开更多
关键词 2型糖尿病 侗族 候选基因 基因多态性 PARD3B snapshot基因分型 关联研究
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TOMM7遗传变异及基因-环境交互作用与我国侗族人群2型糖尿病的关联研究 被引量:2
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作者 刘立亚 陈立章 +4 位作者 李战战 李亮 王冕 屈健 薛静 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期31-38,共8页
目的:探讨全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)中识别的7个遗传位点与我国侗族人群2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的相关性。方法:在我国侗族人群中采用病例对照研究方法,利用多重PCR-SNa Pshot法对PARD... 目的:探讨全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)中识别的7个遗传位点与我国侗族人群2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)的相关性。方法:在我国侗族人群中采用病例对照研究方法,利用多重PCR-SNa Pshot法对PARD3B(rs849230),LOC729993(rs149228),EPHA4(rs16862811),HNT(rs3099797),PTPRD(rs17584499与rs649891),TOMM7(rs2240727)6个基因的7个位点进行基因分型。采用非条件二分类logistic回归方法分析每个多态位点与T2DM的相关性,利用边缘结构线性优势比模型进行基因与环境因素的交互作用分析。结果:本研究共包括209例T2DM患者与209例健康对照。TOMM7基因的rs2240727位点多态性与T2DM相关(对于每个拷贝的风险等位基因T,OR=1.50,P=0.004),且CT和TT基因型是T2DM的风险基因型,OR分别为2.07(95%CI:1.14~3.76)和2.75(95%CI:1.46~5.17),经Bonferroni多重比较校正后,上述结果仍然有意义(均P<0.05)。经调整年龄、性别、体质量指数(body mass index,BMI)后,rs2240727位点与T2DM仍有相关性(P<0.01)。交互作用分析结果表明:rs2240727位点与BMI、腰臀比(waist-hip ratio,WHR)、高血压、糖尿病家族史之间存在正交互作用,调整性别、年龄后,交互作用超额相对危险度(relative excess risk of interaction,RERI)分别为1.5430(95%CI:0.5797~2.5062),2.6520(95%CI:1.7516~3.5524),2.9131(95%CI:1.7959~4.0303),4.2062(95%CI:1.1686~8.2439),差异有统计学意义(均P<0.05)。结论:TOMM7基因的rs2240727位点遗传变异与我国侗族人群的T2DM相关,且与BMI、WHR、高血压和糖尿病家族史之间存在正交互作用。 展开更多
关键词 2型糖尿病 侗族 基因多态性 TOMM7 snapshot基因分型
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