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甘蔗条纹花叶病毒 P3 蛋白与甘蔗 Rubisco 大亚基互作的研究 被引量:11
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作者 朱海龙 程光远 +4 位作者 彭磊 柴哲 郭晋隆 许莉萍 徐景升 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期676-681,共6页
该研究以甘蔗条纹花叶病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)的P3蛋白(SCSMV-P3)为诱饵,采用酵母双杂交技术(yeast two-hybrid system,Y2HS)从甘蔗酵母文库中筛选到1个编码核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(ribulose-1,5-bisphospha... 该研究以甘蔗条纹花叶病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)的P3蛋白(SCSMV-P3)为诱饵,采用酵母双杂交技术(yeast two-hybrid system,Y2HS)从甘蔗酵母文库中筛选到1个编码核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase,Rubisco)大亚基的基因,命名为ScRbcL。序列分析表明,该基因开放读码框(open reading frame,ORF)长度为1 337bp,编码478个氨基酸残基。Y2HS和双分子荧光互补(bimolecular flourescence complementation,BiFC)实验表明,ScRbcL与SCSMV-P3存在互作关系。研究认为SCSMV-P3与ScRbcL的互作可能是SCSMV侵染甘蔗导致花叶症状发生的分子基础。 展开更多
关键词 甘蔗条纹花叶病毒 P3蛋白 RUBISCO 互作
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52个甘蔗品种在广西受病毒侵染情况 被引量:7
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作者 沈林波 吴楠楠 +5 位作者 冯小艳 熊国如 赵婷婷 王文治 王俊刚 张树珍 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2020年第1期116-126,共11页
为明确国家糖料体系甘蔗集成示范及区试品种在广西被病毒侵染情况,2017年从广西北海、南宁、崇左、百色、来宾、柳城、桂林等地集成示范及区试的52个甘蔗品种上采集带有甘蔗花叶病、甘蔗黄叶病和甘蔗杆状病毒病显著病症或不显病症叶片样... 为明确国家糖料体系甘蔗集成示范及区试品种在广西被病毒侵染情况,2017年从广西北海、南宁、崇左、百色、来宾、柳城、桂林等地集成示范及区试的52个甘蔗品种上采集带有甘蔗花叶病、甘蔗黄叶病和甘蔗杆状病毒病显著病症或不显病症叶片样品,采用特异引物通过RT-PCR和PCR方法进行5种病毒检测(甘蔗黄叶病毒、甘蔗线条花叶病毒、高粱花叶病毒、甘蔗花叶病毒和甘蔗杆状病毒)。结果表明,SCYLV的平均检出率为25.00%;SCSMV的平均检出率为7.97%;SrMV的平均检出率为7.69%;SCMV的平均检出率最低,为7.42%;SCBV的平均检出率最高,为68.41%,远远高于其他病毒。7个地方的甘蔗受病毒混合侵染现象普遍存在,北海的病毒混合侵染率甚至高于单一病毒侵染率。52个甘蔗品种在广西受5种病毒的总侵染率为79.67%,对甘蔗的生产安全存在着严重的潜在威胁,建议推广种植甘蔗脱毒种苗来缓解甘蔗病毒病害的危害。 展开更多
关键词 甘蔗黄叶病毒 甘蔗线条花叶病毒 高粱花叶病毒 甘蔗花叶病毒 甘蔗杆状病毒 广西
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甘蔗分子伴侣ShDnaJ基因克隆及在甘蔗线条花叶病毒胁迫下的表达分析
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作者 冯小艳 王文治 +4 位作者 王俊刚 沈林波 赵婷婷 冯翠莲 张树珍 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期2310-2319,共10页
【目的】克隆甘蔗分子伴侣基因Sh DnaJ,并分析其在甘蔗线条花叶病毒(SCSMV)胁迫下的表达模式,为探究ShDnaJ基因在甘蔗应答SCSMV侵染过程中的功能和作用机制提供理论参考。【方法】通过同源克隆技术克隆ShDnaJ基因完整开放阅读框(ORF)序... 【目的】克隆甘蔗分子伴侣基因Sh DnaJ,并分析其在甘蔗线条花叶病毒(SCSMV)胁迫下的表达模式,为探究ShDnaJ基因在甘蔗应答SCSMV侵染过程中的功能和作用机制提供理论参考。【方法】通过同源克隆技术克隆ShDnaJ基因完整开放阅读框(ORF)序列,利用生物信息学软件对其进行分析,再利用绿色荧光蛋白(GFP)融合表达法分析ShDnaJ蛋白的亚细胞定位,采用实时荧光定量PCR检测ShDnaJ基因在甘蔗不同组织及在SCSMV胁迫下的表达水平。【结果】ShDnaJ基因ORF全长1260 bp,编码419个氨基酸残基,蛋白分子量为45682.47 Da,理论等电点(pI)为8.78,属于稳定的亲水蛋白,含有DnaJ结构域,属于DnaJ超家族成员,定位于内质网。ShDnaJ蛋白的二级结构由113个α-螺旋、31个β-转角、78个延伸链和197个无规则卷曲组成。ShDnaJ蛋白与高粱SbDnaJ蛋白的氨基酸序列相似性最高,为96.93%,说明两者亲缘关系最近。ShDnaJ基因在甘蔗根、茎和叶中均有表达,且根和茎中的相对表达量显著高于叶中(P<0.05,下同),但未成熟茎Sh DnaJ基因的相对表达量高于成熟茎;成熟叶ShDnaJ基因的相对表达量高于未成熟叶。随着处理时间的推移,SCSMV胁迫组和对照组(磷酸缓冲液处理)中ShDnaJ基因的相对表达量整体呈下降趋势,但SCSMV接种后不同时间点ShDnaJ基因的相对表达量均显著高于对照组。【结论】ShDnaJ基因具有组织表达特异性,且组织的成熟程度会影响其表达水平。SCSMV胁迫下该基因表达上调,推测该基因参与调控甘蔗植株对SCSMV的抗性。 展开更多
关键词 甘蔗 分子伴侣DnaJ 基因克隆 甘蔗线条花叶病毒(scsmv) 表达分析
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甘蔗线条花叶病毒RT-LAMP检测方法的建立及应用 被引量:3
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作者 李战彪 谢慧婷 +2 位作者 崔丽贤 蔡健和 秦碧霞 《广东农业科学》 CAS 2020年第4期92-98,共7页
【目的】建立甘蔗线条花叶病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)的RT-LAMP检测方法,为SCSMV的检测提供技术支持。【方法】根据甘蔗线条花叶病毒外壳蛋白基因的保守序列设计特异引物,优化RT-LAMP的反应条件,对比分析RT-LAMP的检测... 【目的】建立甘蔗线条花叶病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)的RT-LAMP检测方法,为SCSMV的检测提供技术支持。【方法】根据甘蔗线条花叶病毒外壳蛋白基因的保守序列设计特异引物,优化RT-LAMP的反应条件,对比分析RT-LAMP的检测灵敏度和特异性;并在RT-LAMP反应产物中加入SYBR GREEN I进行可视化检测,方便快速判定结果。【结果】成功建立了一种用于检测SCSMV的RT-LAMP方法,可在60~63℃下60 min完成对SCSMV的检测,且具有较高的灵敏度,比传统RT-PCR高100倍,最低检测RNA浓度为167.9×10-5 ng。此外,该方法具有较高的特异性,可特异检测SCSMV。【结论】建立了一种灵敏、简便、快速的SCSMV RT-LAMP检测方法并用于田间甘蔗样品的检测。 展开更多
关键词 甘蔗 甘蔗线条花叶病毒(scsmv) 环介导等温扩增(RT-LAMP) 外壳蛋白基因 田间检测
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对甘蔗线条花叶病毒存在抗性差异的2个甘蔗品种中eIF4E基因序列分析 被引量:1
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作者 单红丽 陈都 +5 位作者 王晓燕 张荣跃 李婕 王长秘 李银煳 黄应昆 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期624-632,共9页
甘蔗线条花叶病毒(sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)是近年引起甘蔗花叶病的主要病原,选育和利用抗病品种是防控甘蔗花叶病最经济有效的手段。不同品种对甘蔗花叶病具有不同抗性,明确抗性差异的来源对于选育抗病品种具有重要意义... 甘蔗线条花叶病毒(sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)是近年引起甘蔗花叶病的主要病原,选育和利用抗病品种是防控甘蔗花叶病最经济有效的手段。不同品种对甘蔗花叶病具有不同抗性,明确抗性差异的来源对于选育抗病品种具有重要意义。本研究以SCSMV的高抗品种CP94-1100和高感品种ROC22为对象,对两个品种的致病病毒和真核生物翻译起始因子4E(eukaryotic translation initiation factor 4E,eIF4E)序列进行分析。在致病病毒方面,侵染CP94-1100和ROC22的SCSMV分离物cp基因和vpg基因核苷酸序列和蛋白编码情况基本相同,为同一分子变种。在寄主eIF4E方面,从CP94-1100和ROC22中均分离到eIF4E基因,均包含由663 bp构成的ORF,编码1个含220个氨基酸残基的多肽,氨基酸序列同源性仅为98.2%,说明抗性差异可能与eIF4E差异相关。生物信息学分析显示,CP94-1100和ROC22中eIF4E基因编码的蛋白均为稳定亲水性蛋白,属于IF4E家族蛋白,而CP94-1100中eIF4E基因编码的蛋白还包含1个CDC 33或PTZ00040的结构域。遗传分析表明eIF4E基因与禾本科其他作物高度相似,其中CP94-1100的eIF4E基因与割手密亲缘关系最近,说明它们也具有类似的功能。 展开更多
关键词 甘蔗线条花叶病毒 抗性差异 外壳蛋白 病毒基因组连接蛋白 真核生物翻译起始因子4E
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Virus Infection Situation of 37 Sugarcane Varieties in Guilin City
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作者 Shen Linbo Xiong Guoru +3 位作者 Wang Wenzhi Feng Xiaoyan Feng Cuilian Zhang Shuzhen 《Plant Diseases and Pests》 CAS 2017年第6期24-27,共4页
To understand virus infection situation of integrated demonstration and regional test sugarcane varieties in national sugarcane system in Guilin City,Guangxi Province,leaf samples with or without symptoms were collect... To understand virus infection situation of integrated demonstration and regional test sugarcane varieties in national sugarcane system in Guilin City,Guangxi Province,leaf samples with or without symptoms were collected from 37 sugarcane varieties,and five kinds of viruses were detected by RT-PCR with specific primers,including Sugarcane yellow leaf virus( SCYLV),Sugarcane streak mosaic virus( SCSMV),Sorghum mosaic virus( SrM V),Sugarcane mosaic virus( SCMV) and Sugarcane bacilliform virus( SCBV). The results showed that SCYLV was detected from four sugarcane varieties,and the detection rate was10. 81%; SCSMV was detected from five sugarcane varieties,and the detection rate was 13. 51%; SrM V was detected from four sugarcane varieties,and the detection rate was 10. 81%; SCMV had not been found; SCBV was detected from 27 sugarcane varieties,and the detection rate was 72. 9%. Additionally,mixed infection of different viruses was widespread,and the total mixed infection rate was 21. 62%. Thus,integrated demonstration and regional test sugarcane varieties in national sugarcane system in Guilin City had been seriously infected by viruses,and mixed infection of different viruses was common. The paper will provide a reference for breeding and popularization of antiviral sugarcane varieties. 展开更多
关键词 SUGARCANE yellow leaf virus(SCYLV) SUGARCANE streak MOSAIC virus(scsmv) Sorghum MOSAIC virus(SrMV) SUGARCANE MOSAIC virus(SCMV) SUGARCANE BACILLIFORM virus(SCBV)
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