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猪巨细胞病毒SC株DNA聚合酶基因的克隆及生物信息学分析 被引量:2
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作者 王燕群 徐志文 +2 位作者 郭万柱 朱玲 梅淼 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期886-891,共6页
为克隆出猪巨细胞病毒SC株DNA聚合酶(DPOL)基因并对其进行分析,根据GenBank中的DPOL基因序列(AF268040)设计了1对引物,用PCR法扩增出猪巨细胞病毒SC株DPOL基因,将其克隆到T载体,测序并进行生物信息学分析。测序结果表明,猪巨细胞病毒DPO... 为克隆出猪巨细胞病毒SC株DNA聚合酶(DPOL)基因并对其进行分析,根据GenBank中的DPOL基因序列(AF268040)设计了1对引物,用PCR法扩增出猪巨细胞病毒SC株DPOL基因,将其克隆到T载体,测序并进行生物信息学分析。测序结果表明,猪巨细胞病毒DPOL基因全长3 024bp,为一个完整ORF,共编码1 008个氨基酸;与参考毒株的核苷酸同源性为98%,系统进化树表明猪巨细胞病毒与人疱疹病毒6型和7型关系最近;运用生物信息学软件推导出该蛋白的基本性质,并预测出高级结构。成功地进行了猪巨细胞病毒SC株DPOL基因的克隆和生物信息学分析,为今后此基因生物学功能和猪巨细胞病毒复制机理的研究以及病毒系统分类工作提供了参考。 展开更多
关键词 猪巨细胞病毒 sc DNA聚合酶基因 克隆 生物信息学分析
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猪伪狂犬病病毒流行毒株体外中和抗体系列研究的启示 被引量:2
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作者 林云雄 梁培新 +6 位作者 杨玉坚 向华 王一成 徐敏 刘亚彬 余庆 王科文 《养猪》 2015年第5期89-93,共5页
2011年以后,从北到南,我国多数养猪地区的许多原本伪狂犬病(Pseudorabies,PR)阴性的猪场逐渐转阳。随后有研究表明,本次流行的伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)毒株相对经典毒株(SC株)而言,多个基因有较大的差异,毒力也更强... 2011年以后,从北到南,我国多数养猪地区的许多原本伪狂犬病(Pseudorabies,PR)阴性的猪场逐渐转阳。随后有研究表明,本次流行的伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)毒株相对经典毒株(SC株)而言,多个基因有较大的差异,毒力也更强,且现有的商品化疫苗对其感染的保护力相对更差[1](通过羊的免疫攻毒试验)。中和抗体作为评估疫苗免疫保护水平的一个重要指标, 展开更多
关键词 猪伪狂犬病病毒 流行毒 中和抗体 体外 免疫攻毒试验 VIRUS 免疫保护 sc
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鸡传染性支气管炎病毒SC株N基因序列测定与同源性分析 被引量:1
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作者 李广兴 马德星 《吉林畜牧兽医》 2004年第7期19-21,34,共4页
从我国四川省一疑似鸡传染性支气管炎(Avian infectious bronchitis virus,IB)的雏鸡病料中成功 分离到一株鸡传染性支气管炎病毒(Infectious Bronchitis Virus,IBV),命名为SC。病毒经鸡胚传代、血 凝试验监测和负染电镜检查证实为IBV... 从我国四川省一疑似鸡传染性支气管炎(Avian infectious bronchitis virus,IB)的雏鸡病料中成功 分离到一株鸡传染性支气管炎病毒(Infectious Bronchitis Virus,IBV),命名为SC。病毒经鸡胚传代、血 凝试验监测和负染电镜检查证实为IBV。自接毒鸡胚尿囊液中提取RNA后应用反转录-聚合酶链反 应(RT-PCR)扩增得到了IBV SC株mRNA 6 cDNA(编码N蛋白)。应用DNA star 5.06,Clustal 1.8分析软件 将克隆测序的N蛋白基因与Genbank中11株国内外参考毒株进行序列比较分析和同源性分析,发现 IBV SC株变异独特,明显不同于国内外参考毒株。 展开更多
关键词 传染性支气管炎病毒 sc N基因 序列测定 同源性分析
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鸡传染性支气管炎病毒SC株mRNA5及mRNA6 cDNA分子特征
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作者 马德星 刘胜旺 李广兴 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2007年第8期6-7,共2页
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 分子特征 CDNA sc virus 冠状病毒属 冠状病毒科 代表种
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鸡传染性支气管炎病毒SC株S1基因的序列分析
5
作者 刘洪义 刘兴友 《中国兽医科技》 CSCD 北大核心 2003年第12期47-50,共4页
用RT PCR扩增了鸡传染性支气管炎病毒 (IBV)SC株S1基因 ,连接到 pMD 18 T载体上 ,克隆后进行了核酸序列分析 ,证实SC株S1基因与基因库中收录的国外毒株H12 0和M 4 1的同源性较低 ,分别为 81.1%和 80 .0 % ,而与国内JX990 1株的同源性达... 用RT PCR扩增了鸡传染性支气管炎病毒 (IBV)SC株S1基因 ,连接到 pMD 18 T载体上 ,克隆后进行了核酸序列分析 ,证实SC株S1基因与基因库中收录的国外毒株H12 0和M 4 1的同源性较低 ,分别为 81.1%和 80 .0 % ,而与国内JX990 1株的同源性达到 91.3% ,初步证实国内存在IBV新毒株。 展开更多
关键词 传染性支气管炎 病毒 sc S1基因 序列分析
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猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株N基因的克隆及原核表达 被引量:3
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作者 宋振辉 郭万柱 +1 位作者 韩国全 骆爱芳 《四川农业大学学报》 CSCD 2006年第2期210-213,共4页
通过PCR方法扩增猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株核衣壳蛋白(N)基因,然后将重组到pMD18-T载体中的约1174 bp的基因片段亚克隆到PET-32a(+)表达载体上,通过酶切及PCR鉴定阳性的重组质粒命名为PET-N,核苷酸及推导的氨基酸序列分析表明,该基因与... 通过PCR方法扩增猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株核衣壳蛋白(N)基因,然后将重组到pMD18-T载体中的约1174 bp的基因片段亚克隆到PET-32a(+)表达载体上,通过酶切及PCR鉴定阳性的重组质粒命名为PET-N,核苷酸及推导的氨基酸序列分析表明,该基因与其他猪传染性胃肠炎病毒相应基因具有很高的同源性,将阳性重组质粒转化BL21(DE3),经IPTG诱导可表达分子量约66 kD的融合蛋白,N基因的表达可为传染性胃肠炎病毒的诊断提供良好的物质材料。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 sc-Y N基因 克隆 原核表达
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慢病毒载体介导稳定表达pAPN的Vero细胞系的构建及应用 被引量:2
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作者 陆倩倩 王广操 +2 位作者 许长萌 王志建 王先炜 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期419-426,共8页
将完整的pAPN序列通过同源重组克隆入慢病毒表达载体pLVX-mCherry,并将该重组质粒pLVX-mCherry-pAPN与慢病毒包装质粒pLP1、pLP2、pLP-VSVG共转染293T细胞,在293T细胞中包装成含目的基因的重组慢病毒。将收获的重组病毒感染Vero细胞,经... 将完整的pAPN序列通过同源重组克隆入慢病毒表达载体pLVX-mCherry,并将该重组质粒pLVX-mCherry-pAPN与慢病毒包装质粒pLP1、pLP2、pLP-VSVG共转染293T细胞,在293T细胞中包装成含目的基因的重组慢病毒。将收获的重组病毒感染Vero细胞,经过嘌呤霉素筛选和细胞有限稀释法,筛选出表达pAPN的细胞。通过RT-PCR和间接免疫荧光试验(IFA)证明了所获细胞株能够稳定表达pAPN蛋白,命名为Vero-APN-B6。IFA试验和TCID50试验结果表明:与Vero细胞相比,Vero-APN-B6更能促进猪流行性腹泻病毒(PEDV)的增殖。利用该细胞株成功地从猪小肠组织中分离到了PEDV SC-MS株;经过鉴定该毒株为变异毒株。 展开更多
关键词 pAPN 细胞系 慢病毒载体 PEDV sc-MS
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乳酸芽孢杆菌SC复合诱变与选育 被引量:1
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作者 刘颖 潘俊福 +1 位作者 谢为天 徐春厚 《中国酿造》 CAS 北大核心 2010年第1期58-61,共4页
以乳酸芽孢杆菌SC为出发菌株,紫外线-亚硝基胍复合诱变出200个菌株,进行培养液pH值、抑菌活性、芽孢形成率的测定,再进行稳定性和急性毒性试验。结果表明,乳酸芽孢杆菌SC27诱变菌株与出发菌株比较,培养液pH值降低了10.8%,对金黄色葡萄... 以乳酸芽孢杆菌SC为出发菌株,紫外线-亚硝基胍复合诱变出200个菌株,进行培养液pH值、抑菌活性、芽孢形成率的测定,再进行稳定性和急性毒性试验。结果表明,乳酸芽孢杆菌SC27诱变菌株与出发菌株比较,培养液pH值降低了10.8%,对金黄色葡萄球菌的抑菌圈直径增大了23.9%,对大肠埃希菌的抑菌圈直径增大了20.7%,芽孢形成率达到36.1%;该菌株产酸、产活性物质及芽孢形成的性能稳定,并属于无毒物质。 展开更多
关键词 乳酸芽孢杆菌 sc27 复合诱变 选育
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猪传染性胃肠炎病毒SC-H株M基因的克隆与序列分析
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作者 黄小波 曹三杰 +3 位作者 文心田 杨恒 秦学远 杨利 《四川农业大学学报》 CSCD 2008年第2期180-184,共5页
参照Genbank已发表的TGEV的核酸序列设计一对扩增M基因的引物,经RT-PCR扩增了SC-H株的M基因cDNA片段,插入pMD18-T构建重组质粒pMD-M,对pMD-M进行了酶切鉴定及核苷酸测序,将M基因核苷酸序列及推导的氨基酸序列与参考毒株进行了比较分析... 参照Genbank已发表的TGEV的核酸序列设计一对扩增M基因的引物,经RT-PCR扩增了SC-H株的M基因cDNA片段,插入pMD18-T构建重组质粒pMD-M,对pMD-M进行了酶切鉴定及核苷酸测序,将M基因核苷酸序列及推导的氨基酸序列与参考毒株进行了比较分析。结果表明SC-H株M基因扩增片段长度为852bp,包含789bp的M基因编码区,编码262个氨基酸;SC-H株与TS、96-1933、FS772/70、HN2002、TFI、Purdue及TO14株的M基因核苷酸序列同源性为97.8%、94.2%、97.2%、97.8%、99.7%、96.8%及98.2%,氨基酸同源性为96.6%、92.0%、95.4%、96.6%、99.2%、95.8%及97.7%,表明不同毒株的M基因高度保守,系统进化分析显示SC-H株与Prudue株有较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 sc—H M基因 克隆 序列分析
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