目的:以肿瘤坏死因子(TNF)为受体挖掘治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在中药单体。方法:借助TCMSP数据库和DrugBank数据库检索作用于TNF的中药单体和化学药物。借助Auto Dock Vina将筛选得到的中药单体和化学药物与新型冠状病毒肺...目的:以肿瘤坏死因子(TNF)为受体挖掘治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在中药单体。方法:借助TCMSP数据库和DrugBank数据库检索作用于TNF的中药单体和化学药物。借助Auto Dock Vina将筛选得到的中药单体和化学药物与新型冠状病毒肺炎最为相关的靶点进行分子对接并计算总结合能。通过PharmMapper数据库查询吴茱萸次碱的作用靶点,通过Uniprot数据库进行靶点名校正,进而运用STRING11.0构建蛋白互作(PPI)网络,通过DAVID进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制。结果:网络药理学分析发现共有20个化合物作用于TNF,分子对接结果显示吴茱萸次碱与SARS-CoV-2、ACE2、IL-6和TNF的结合能比较好;PPI网络显示,吴茱萸次碱作用于18个关键靶点;GO功能富集分析得到GO条目117个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目92个,细胞组成(CC)条目9个,分子功能(MF)条目16个;KEGG通路富集筛选得到7条信号通路(P<0.05),主要涉及癌症通路、小细胞肺癌和T细胞受体信号通路等。结论:吴茱萸次碱可以作用于TNF,调节多条信号通路,从而对COVID-19有潜在治疗作用。展开更多
文摘目的:以肿瘤坏死因子(TNF)为受体挖掘治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在中药单体。方法:借助TCMSP数据库和DrugBank数据库检索作用于TNF的中药单体和化学药物。借助Auto Dock Vina将筛选得到的中药单体和化学药物与新型冠状病毒肺炎最为相关的靶点进行分子对接并计算总结合能。通过PharmMapper数据库查询吴茱萸次碱的作用靶点,通过Uniprot数据库进行靶点名校正,进而运用STRING11.0构建蛋白互作(PPI)网络,通过DAVID进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制。结果:网络药理学分析发现共有20个化合物作用于TNF,分子对接结果显示吴茱萸次碱与SARS-CoV-2、ACE2、IL-6和TNF的结合能比较好;PPI网络显示,吴茱萸次碱作用于18个关键靶点;GO功能富集分析得到GO条目117个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目92个,细胞组成(CC)条目9个,分子功能(MF)条目16个;KEGG通路富集筛选得到7条信号通路(P<0.05),主要涉及癌症通路、小细胞肺癌和T细胞受体信号通路等。结论:吴茱萸次碱可以作用于TNF,调节多条信号通路,从而对COVID-19有潜在治疗作用。
