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甜菜坏死黄脉病毒RNA4的菌传功能分析 被引量:4
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作者 韩成贵 李大伟 +4 位作者 王东勇 杨莉莉 于嘉林 蔡祝南 刘仪 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第10期772-774,共3页
构建了甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)RNA4全长核苷酸序列以及5种编码区突变体的侵染性cDNA克隆.不同结构的RNA4体外转录物与只含有RNA1,2和3的BNYVV分离物总RNAs混合后分别接种寄主植物番杏(Tetragonia expansa)作为毒源,繁殖后接种甜菜... 构建了甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)RNA4全长核苷酸序列以及5种编码区突变体的侵染性cDNA克隆.不同结构的RNA4体外转录物与只含有RNA1,2和3的BNYVV分离物总RNAs混合后分别接种寄主植物番杏(Tetragonia expansa)作为毒源,繁殖后接种甜菜,利用无毒甜菜多黏菌(Polymyxa betae)进行传毒实验.结果表明,RNA4编码区内各种缺失突变均能显著地抑制多黏菌的传播,但插入4个碱基的移码突变体对传毒没有影响,说明BNYVV RNA4中的部分核苷酸序列对于被真菌介体高效传播是必需的,并且可能是在RNA水平上具有功能. 展开更多
关键词 甜菜坏死黄脉病毒 rna4 BNYVV rna突变 功能分析 介体传毒 多黏菌 核苷酸序列分析
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基于基因序列聚类的甲型流行性感冒病毒H3抗原变异规律研究 被引量:8
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作者 张文彤 姜庆五 +1 位作者 蒋露芳 居丽雯 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1046-1049,共4页
目的 利用聚类分析方法探讨全球甲型流行性感冒病毒(流感)H3亚型抗原的变异规律。方法下载NCBI GenBank和流感病毒数据库中全部的甲型流感病毒RNA4节段H3亚型基因序列,在Clustalx中进行序列对齐后,使用两阶段聚类法进行分析,并随后探讨... 目的 利用聚类分析方法探讨全球甲型流行性感冒病毒(流感)H3亚型抗原的变异规律。方法下载NCBI GenBank和流感病毒数据库中全部的甲型流感病毒RNA4节段H3亚型基因序列,在Clustalx中进行序列对齐后,使用两阶段聚类法进行分析,并随后探讨各类的三间分布。结果 所有序列可被分为10类,其中7类主要为人流感病毒,人流感病毒和鸟类、其他哺乳动物的流感病毒被明确的分为不同类别,但和猪流感病毒则共存于数个类中。各类呈现出明显的时间分布和宿主分布规律,但并未发现地域分布规律。结论 由于受到人类免疫系统的选择压力,H3抗原呈现出5-7年出现一次较大变异的流行特征,且这一趋势随着近十年来流感疫苗的普遍使用而呈现加速趋势。同时,猪流感病毒和人流感病毒出现在同一类别中,两者的遗传距离较近,这为猪作为病毒重配的载体提供了新的佐证。 展开更多
关键词 甲型流行性感冒病毒 人流感 亚型 抗原变异 基因序列 流感疫苗 猪流感病毒 遗传距离 变异规律 rna4
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甜菜坏死黄脉病毒RNA4 cDNA克隆、序列分析及其编码蛋白基因在大肠杆菌中的表达 被引量:5
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作者 于嘉林 韩成贵 +2 位作者 杨莉莉 李大伟 刘仪 《微生物学报》 CSCD 北大核心 1997年第1期7-14,共8页
以甜菜坏死黄脉病毒(Beet Necrotic Yellow Vein Virus,简称BNYVV)内蒙分离物(NM)RNA为模板,通过反转录和PCR扩增得到了BNYVV RNA4基因组的cDNA克隆pGBF6。序列分析结果表明,pGBF6含有全长RNA4 cDNA插入片段,大小为1465个核苷酸,含有一... 以甜菜坏死黄脉病毒(Beet Necrotic Yellow Vein Virus,简称BNYVV)内蒙分离物(NM)RNA为模板,通过反转录和PCR扩增得到了BNYVV RNA4基因组的cDNA克隆pGBF6。序列分析结果表明,pGBF6含有全长RNA4 cDNA插入片段,大小为1465个核苷酸,含有一个849个核苷酸的开放阅读框架,编码产生由282个氨基酸组成的分子量为31kDa的蛋白。与法国F2分离物RNA4相比,其核苷酸序列和由此推导的氨基酸序列同源性分别为97.1%和96.4%,并在5'端非编码区比F2分离物缺失了3个核苷酸。将RNA4编码区cDNA克隆到原核表达载体pFLAG·MAC上,获得融合蛋白表达质粒pFMBF87。所构建的融合蛋白由载体序列编码的14个氨基酸和31kDa蛋白C端的233个氨基酸组成。经IPTG诱导,Westem blotting分析表明,该融合蛋白在大肠杆菌中得到高效表达。本文还对内蒙分离物的株系划分进行了讨论。 展开更多
关键词 甜菜 坏死黄脉病毒 rna4 CDNA 克隆 序列分析
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水稻条纹病毒山东济宁分离物RSV-SD-JN2分子变异分析 被引量:2
4
作者 马进 宋云枝 +2 位作者 李开东 朱常香 温孚江 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期415-420,共6页
为从分子水平探讨强致病性水稻条纹病毒山东济宁分离物RSV-SD-JN2的变异及其致病性,采用RT-PCR技术,克隆RSV-SD-JN2的RNA3、RNA4区段cDNA。结果显示,RSV-SD-JN2的RNA3和RNA4核苷酸序列长度分别为2487、2157bp;RNA3中,NS3基因长为636bp,... 为从分子水平探讨强致病性水稻条纹病毒山东济宁分离物RSV-SD-JN2的变异及其致病性,采用RT-PCR技术,克隆RSV-SD-JN2的RNA3、RNA4区段cDNA。结果显示,RSV-SD-JN2的RNA3和RNA4核苷酸序列长度分别为2487、2157bp;RNA3中,NS3基因长为636bp,基因间隔区(IR)为725bp,CP基因为969bp;RNA4中,SP基因长为537bp,基因间隔区(IR)为654bp,NSvc4基因为861bp。不同时期、不同区域和不同致病性的RSV分离物的序列比较发现,RNA3、RNA4序列5′和3′末端非编码区具有高度保守性,仅存在个别碱基的差异;基因编码区保守性较高,核苷酸和氨基酸序列同源性分别在93%和97%以上,且大部分碱基变异为无意义变异;基因间隔区(IR)易于变异。RSV的分子变异与其地理分布具有密切的关系。RNA4的IR的变异导致RNA二级结构——发夹结构的稳定性提高是病毒致病性增强的重要原因。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 rna3 rna4 序列分析 分子变异
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流感病毒H9N2亚型毒株RNA_4节段基因序列分析 被引量:2
5
作者 王占菊 郭剑声 +2 位作者 黄芳 王健 许鸣 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期31-32,共2页
目的 了解新分离到的禽H9N2亚型流感病毒毒株RNA4节段核苷酸间的关系。方法 病毒RNA经逆转录合成cDNA ,经聚合酶链反应 (PCR)扩增 ,产物纯化 ,采用双脱氧链末端终止法进行核苷酸序列测定。结果 香港鹌鹑流感病毒 (quHK197)、香港猪... 目的 了解新分离到的禽H9N2亚型流感病毒毒株RNA4节段核苷酸间的关系。方法 病毒RNA经逆转录合成cDNA ,经聚合酶链反应 (PCR)扩增 ,产物纯化 ,采用双脱氧链末端终止法进行核苷酸序列测定。结果 香港鹌鹑流感病毒 (quHK197)、香港猪流感病毒 (swHK998)、香港鸡流感病毒 (ckHK997)和禽代表株威斯康星火鸡流感病毒(tywis6 6 )的H9N2亚型RNA4节段长度分别为 16 72、16 70、16 5 1和 16 83个核苷酸 ,编码血凝素 (HA)蛋白。这 3株分离到的禽H9N2亚型之间的同源性在 92 7%~ 96 9%之间 ,与禽H9N2代表株间的同源性在 87 8%~ 89 0 %之间。结论 新分离到的禽H9N2亚型毒株与代表株的同源性差异较大。 展开更多
关键词 流感病毒 H9N2亚型 rna4 序列分析 核苷酸
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Functional analysis of beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) RNA4 in fungal transmission 被引量:1
6
作者 HAN Chenggui LI Dawei +4 位作者 WANG Dongyong YANG Lili YU Jialin CAI Zhunan LIU Yi 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2002年第15期1281-1284,共4页
Full-length RNA4 of beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) and its mutants, including a frame-shift and deletions within the coding region, were inserted into a transcription plasmid. Transcripts derived from these p... Full-length RNA4 of beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) and its mutants, including a frame-shift and deletions within the coding region, were inserted into a transcription plasmid. Transcripts derived from these plasmids and RNAs extracted from a BNYVV isolate containing only RNAs 1, 2 and 3 were coinoculated to Tetragona expansa. Then these recombinant isolates were inoculated to sugar beet plants grown in a sand culture system containing Po-lymyxa betae that had been freed of virus particles to test efficiency of BNYVV transmission. The result showed that the efficiency of BNYVV transmission among the plants by Polymyxa betae was highly decreased by different deletions in the coding region of RNA4, but not affected by the frame-shift mutant with four nucleotides insertion. The observations suggest that at least some of the RNA4 sequence encompassing the deleted region of 580 nucleotide acids (525 -1105 nt) are necessary for high efficient transmission of the virus by the fungus. 展开更多
关键词 BNYVV MUTATION of rna4 FUNCTIONAL analysis trans-mission by Polymyxa betae.
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鸡流感病毒H9N2亚型毒株RNA4节段基因序列测定及分析
7
作者 王占菊 温迎春 黄芳 《医学动物防制》 2001年第1期20-22,共3页
目的 弄清新分离到的鸡H9N2亚型流感病毒毒株RNA4节段核苷酸全序列及它与禽代表株威斯康星火鸡流感病毒(tywis66ha)之间的内在关系。方法 病毒RNA经逆转录合成cDNA,经聚合酶链反应(PCR)扩增,产物纯化,采用双脱氧链末端终止法进行核苷酸... 目的 弄清新分离到的鸡H9N2亚型流感病毒毒株RNA4节段核苷酸全序列及它与禽代表株威斯康星火鸡流感病毒(tywis66ha)之间的内在关系。方法 病毒RNA经逆转录合成cDNA,经聚合酶链反应(PCR)扩增,产物纯化,采用双脱氧链末端终止法进行核苷酸序列测定。结果 香港鸡流感病毒(ckHK997)禽代表株威斯康星火鸡流感病毒(tywis66ha)的H9N2亚型RNA4节段长度分别是1951和1683个核苷酸,编码血凝素(HA)蛋白。与禽H9N2代表株的同源性在89.0%。结论 新分离到的鸡H9N2亚型毒株与代表株的同源性差异较大。 展开更多
关键词 流感病毒H9N2亚型 rna4 序列分析
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水稻条纹病毒RNA4基因间隔区的分子变异 被引量:9
8
作者 魏太云 林含新 +2 位作者 吴祖建 林奇英 谢联辉 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期144-149,共6页
应用反转录 聚合酶链式反应 (RT PCR)和单链构象多态性 (single strandconformationpolymorphism ,SSCP)技术快速检测我国水稻条纹病毒 (RSV)RNA4基因间隔区 (intergenicregion ,IR)的分子变异 ,结果表明 ,我国RSVRNA4IR存在分子变异... 应用反转录 聚合酶链式反应 (RT PCR)和单链构象多态性 (single strandconformationpolymorphism ,SSCP)技术快速检测我国水稻条纹病毒 (RSV)RNA4基因间隔区 (intergenicregion ,IR)的分子变异 ,结果表明 ,我国RSVRNA4IR存在分子变异。供试的 7个分离物共有 4种泳动带型 ,其中YL、BS、JD、LY分离物完全一致 ,而SQ、PJ、JN各不相同。序列测定证实了PCR SSCP结果。各分离物RNA4IR序列均由 6 5 4个核苷酸组成 ,其中YL、BS、YL及JD 4个分离物序列完全一致 ;JN、PJ、SQ 3个分离物各不一样 ,序列之间的同源性均在 92 %~ 94%之间。IR序列内部具有两个重要的结构特征 :(1)有两处反向重复序列 ,可形成两个明显的发夹结构 ,其中一个序列比较保守 ,形成的发夹结构稳定 ;但另一个发夹结构由于碱基变异导致其稳定性在各个分离物中差异较大 ;(2 )具有插入序列 ,相对于日本M分离物 ,我国 7个分离物都有一段长 19bp的插入序列 ,这段插入序列比较保守 ,各分离物之间仅有 1~ 2个碱基的差异。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 rna4基因间隔区 PCR-SSCP 序列分析
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水稻条纹病毒RNA4基因间隔区序列分析——混合侵染及基因组变异证据 被引量:7
9
作者 魏太云 林含新 +2 位作者 吴祖建 林奇英 谢联辉 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期577-585,共9页
克隆和测定了我国水稻条纹病毒 (RSV) 2 2个分离物RNA4基因间隔区 (Intergenicre gion,IR)序列 ,序列比较结果表明 ,我国RSVRNA4IR在长度上存在 63 4bp、65 4bp及 73 2bp 3种不同的类型 ,其中 3种不同类型的序列在云南省均有存在 ,而在... 克隆和测定了我国水稻条纹病毒 (RSV) 2 2个分离物RNA4基因间隔区 (Intergenicre gion,IR)序列 ,序列比较结果表明 ,我国RSVRNA4IR在长度上存在 63 4bp、65 4bp及 73 2bp 3种不同的类型 ,其中 3种不同类型的序列在云南省均有存在 ,而在其它省份仅存在 65 4bp类型的序列 ,云南省还存在不同片段类型序列在同一分离物中混合侵染的现象。序列内部具有两个重要的结构特征 ,一是具有插入序列 ;二是有两处反向重复序列 ,可形成两个明显的发夹结构 ,其中一个序列比较保守 ,形成的发夹结构稳定 ;但另一个发夹结构由于碱基变异导致其稳定性在各个分离物中差异较大。本论文还讨论了插入片段特性。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 rna4基因 间隔区 序列分析 混合侵染 基因组变异
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2型糖尿病患者外周血miRNA表达谱差异研究 被引量:16
10
作者 郭宜晨 鲁亚静 +2 位作者 钟伟传 陈雪艳 郭广洲 《现代检验医学杂志》 CAS 2018年第6期5-8,共4页
目的对2型糖尿病(type 2diabetes mellitus,T2DM)患者外周血血清miRNA差异表达分析,为筛选出T2DM发生发展有关的miRNA分子标记物奠定基础,从而为T2DM预防、早期诊断和治疗方案提供指导。方法采用GeneChip^(TM) miRNA 4.0Array筛选3组受... 目的对2型糖尿病(type 2diabetes mellitus,T2DM)患者外周血血清miRNA差异表达分析,为筛选出T2DM发生发展有关的miRNA分子标记物奠定基础,从而为T2DM预防、早期诊断和治疗方案提供指导。方法采用GeneChip^(TM) miRNA 4.0Array筛选3组受试者外周血血清(T2DM组、T1DM组、对照组)的差异miRNA,并对差异miRNA进行靶基因预测和靶基因信号通路富集分析(KEGG)。结果 T2DM组分别与对照组,T1DM组相比,hsa-miR-505-3p和hsa-miR-548an均上调,hsa-miR-296-3p,hsa-miR-3160-5p,hsa-miR-33a-5p,hsa-miR-572和hsa-miR-96-5p均下调。通过靶基因预测和Pathway分析,筛选出5个miRNA(hsa-miR-505-3p,hsa-miR-548an,hsa-miR-296-3p,hsa-miR-3160-5p,hsamiR-33a-5p,hsa-miR-572和hsa-miR-96-5p)、7个基因(MTOR,SLC2A2,PRKCE,IRS2,IRS1,MAPK8,MAPK10)可能与2型糖尿病胰岛素抵抗相关。结论该研究筛选出的5个miRNA和7个基因,可为2型糖尿病胰岛素抵抗的研究提供理论基础。 展开更多
关键词 2型糖尿病 MIrna GeneChipTM微小rna4.0Array 胰岛素抵抗 KEGG
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水稻条纹病毒两个分离物RNA4基因间隔区的序列比较 被引量:4
11
作者 魏太云 林含新 +2 位作者 吴祖建 林奇英 谢联辉 《中国病毒学》 CSCD 2000年第2期156-162,共7页
通过RT PCR扩增了我国水稻条纹病毒 (RSV)山东济宁 (JN)、云南宜良 (YL)两个分离物RNA4基因间隔区 (intergenicregion ,IR)序列 ,并克隆于 pGEM Teasy载体上。序列分析结果表明 :JN、YL两分离物RNA4IR均由 6 5 4个核苷酸组成 ,两者之间... 通过RT PCR扩增了我国水稻条纹病毒 (RSV)山东济宁 (JN)、云南宜良 (YL)两个分离物RNA4基因间隔区 (intergenicregion ,IR)序列 ,并克隆于 pGEM Teasy载体上。序列分析结果表明 :JN、YL两分离物RNA4IR均由 6 5 4个核苷酸组成 ,两者之间的同源率为 92 %。JN、YL两个分离物RNA4IR在AU碱基富集处可形成两个明显的发夹结构 ,其中一个序列比较保守 ,形成的发夹结构稳定 ;但另一个由于碱基变异导致所形成的发夹结构的稳定性在各个分离物中差异较大。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 rna4基因间隔区 序列
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rAAV介导的HIF-1α—RNAi载体的构建 被引量:3
12
作者 陈传贵 陈剑秋 +1 位作者 孙晋津 王丰 《世界肿瘤杂志》 2006年第2期83-85,94,共4页
目的构建以rAAV为载体、GFP为报告基因和HIF-1α为靶基因的RNA干扰。方法提取人基因组DNA,PCR扩增人H1启动子,插入载体质粒pAAV-hrGFP的CMV启动子前方Mlu Ⅰ单克隆位点,构建成pH1—hrGFP;根据HIF-1α的有效干扰位点,合成两条分别为... 目的构建以rAAV为载体、GFP为报告基因和HIF-1α为靶基因的RNA干扰。方法提取人基因组DNA,PCR扩增人H1启动子,插入载体质粒pAAV-hrGFP的CMV启动子前方Mlu Ⅰ单克隆位点,构建成pH1—hrGFP;根据HIF-1α的有效干扰位点,合成两条分别为58bp互补的寡核苷酸链,通过体外退火形成双链,然后插入pH1-hrGFP的H1启动子尾部Xba Ⅰ和MunⅠ位点,构建成pH1—siRNA;将载体质粒pH1-siRNA和辅助质粒pRC、pHelper共转染HEK293细胞,反复冻溶后收集上清,浓缩纯化,电镜观察病毒形态和ELISA法测定病毒滴度。结果构建的pH1-hrGFP质粒,通过酶切、PCR检测以及测序鉴定均正确;构建的pH1—siRNA,通过酶切及测序鉴定也正确;包装的rAAV经电镜检测形态正常,滴度达1.2×10^12 v.p/mL。结论成功构建了rAAV介导的HIF-1α—RNAi表达载体,为今后的体内外试验奠定了基础。 展开更多
关键词 重组腺相关病毒 缺氧诱导因子 小干扰rna4
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Long noncoding RNA RP4 functions as a competing endogenous RNA through miR-7-5p sponge activity in colorectal cancer 被引量:17
13
作者 Mu-Lin Liu Qiao Zhang +4 位作者 Xiao Yuan Long Jin Li-Li Wang Tao-Tao Fang Wen-Bin Wang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2018年第9期1004-1012,共9页
AIM To investigate the role of long noncoding RNA(lnc RNA) RP4 in colorectal cancer.METHODS Lentivirus-mediated lnc RNA RP4 overexpression and knockdown were performed in the colorectal cancer cell line SW480. Cell pr... AIM To investigate the role of long noncoding RNA(lnc RNA) RP4 in colorectal cancer.METHODS Lentivirus-mediated lnc RNA RP4 overexpression and knockdown were performed in the colorectal cancer cell line SW480. Cell proliferation, tumor growth, and early apoptosis were evaluated by a cell counting kit-8 assay, an in vivo xenograft tumor model, and annexin V/propidium iodide staining, respectively. Analysis of the lnc RNA RP4 mechanism involved assessment of the association of its expression with mi R-7-5 p and the SH3 GLB1 gene. Western blot analysis was also performed to assess the effect of lnc RNA RP4 on the autophagy-mediated cell death pathway and phosphatidylinositol-3-kinase(PI3 K)/Akt signaling.RESULTS Cell proliferation, tumor growth, and early apoptosis in SW480 cells were negatively regulated by lnc RNA RP4. Functional experiments indicated that lnc RNA RP4 directly upregulated SH3 GLB1 expression by acting as a competing endogenous RNA(ce RNA) for mi R-7-5 p. This interaction led to activation of the autophagy-mediated cell death pathway and de-repression of PI3 K and Akt phosphorylation in colorectal cancer cells in vivo.CONCLUSION Our results demonstrated that lnc RNA RP4 is a ce RNA that plays an important role in the pathogenesis of colorectal cancer, and could be a potential therapeutic target for colorectal cancer treatment. 展开更多
关键词 COLORECTAL cancer LONG noncoding rna RP4 SH3GLB1 miR-7-5p competing ENDOGENOUS rna
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冠心病患者血清环状RNA人肾结核蛋白4、微小RNA⁃665表达与冠状动脉狭窄程度及主要不良心血管事件相关性研究 被引量:3
14
作者 刘光姣 王晓光 +2 位作者 王焱 王雪 申卫东 《临床军医杂志》 CAS 2023年第5期483-487,共5页
目的探讨冠心病(CAD)患者血清环状RNA人肾结核蛋白4(circNPHP4)、微小RNA⁃665(miR⁃665)表达与冠状动脉狭窄程度及主要不良心血管事件(MACE)的相关性。方法选取自2020年8月至2022年5月于解放军总医院确诊为CAD的95例患者纳入CAD组。另选... 目的探讨冠心病(CAD)患者血清环状RNA人肾结核蛋白4(circNPHP4)、微小RNA⁃665(miR⁃665)表达与冠状动脉狭窄程度及主要不良心血管事件(MACE)的相关性。方法选取自2020年8月至2022年5月于解放军总医院确诊为CAD的95例患者纳入CAD组。另选取90例同期行冠状动脉造影检查未见明显病变者纳入对照组。采用RT⁃qPCR检测所有研究对象血清circNPHP4、miR⁃665相对表达量。根据Gensini评分将CAD患者分为轻度病变组(n=39)、中度病变组(n=35)、重度病变组(n=21),比较不同冠状动脉病变程度患者血清circNPHP4、miR⁃665水平及Gensini评分。采用Pearson法分析血清circNPHP4、血清miR⁃665、Gensini评分间的相关性。采用Logistic回归分析探讨CAD患者发生MACE的影响因素。结果CAD组患者血清circNPHP4表达水平高于对照组,miR⁃665表达水平低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。轻度组、中度组、重度组患者血清circNPHP4水平、血清miR⁃665水平、Gensini评分比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。circNPHP4与miR⁃665呈负相关(r=-0.509,P<0.05),circNPHP4与Gensini评分呈正相关(r=0.528,P<0.05),miR⁃665与Gensini评分呈负相关(r=-0.648,P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,circNPHP4、Gensini评分是CAD患者发生MACE的危险因素(P<0.05),miR⁃665是CAD患者发生MACE的保护因素(P<0.05)。结论CAD患者血清circNPHP4表达水平升高,miR⁃665表达水平降低。血清circNPHP4、miR⁃665水平与冠状动脉Gensini评分相关,是CAD患者发生MACE的影响因素,可作为评估患者病情与预后的标志物。 展开更多
关键词 冠心病 环状rna人肾结核蛋白4 微小rna⁃665 冠状动脉狭窄程度 主要不良心血管事件
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LncRNA SNHG4调控牙周膜干细胞成骨分化过程中的miR-152-3p
15
作者 周明华 胡晓宇 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第1期38-43,共6页
背景:研究表明长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因4(LncRNA SNHG4)参与了多种炎症性疾病的进展,而关于LncRNA SNHG4对牙周炎治疗过程中人牙周膜干细胞成骨分化的影响尚不明确。目的:探讨LncRNA SNHG4通过调节miR-152-3p对人牙周膜干细胞成... 背景:研究表明长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因4(LncRNA SNHG4)参与了多种炎症性疾病的进展,而关于LncRNA SNHG4对牙周炎治疗过程中人牙周膜干细胞成骨分化的影响尚不明确。目的:探讨LncRNA SNHG4通过调节miR-152-3p对人牙周膜干细胞成骨分化的影响。方法:从因正畸需要而拔除的前磨牙牙周膜组织中分离出人牙周膜干细胞,将其进行成骨诱导分化0,7,14 d后,qRT-PCR检测Runt相关转录因子2、骨钙素、LncRNA SNHG4及miR-152-3p表达。取第3代人牙周膜干细胞,将其分为NC组、pcDNA组、pcDNA-SNHG4组、inhibitor NC组、miR-152-3p inhibitor组、pcDNA-SNHG4+mimic NC组、pcDNA-SNHG4+miR-152-3p mimic组,qRT-PCR检测各组人牙周膜干细胞中LncRNA SNHG4、miR-152-3p表达,CCK-8法检测细胞增殖情况;比色法检测碱性磷酸酶活性;茜素红染色检测矿化结节形成情况;Western blot检测Runt相关转录因子2、骨钙素、碱性磷酸酶蛋白表达;双荧光素酶报告基因实验验证LncRNA SNHG4与miR-152-3p的关系。结果与结论:①与成骨诱导0 d比较,成骨诱导7,14 d后人牙周膜干细胞中Runt相关转录因子2、骨钙素、LncRNA SNHG4表达升高,miR-152-3p表达降低(P<0.05);②过表达LncRNA SNHG4或抑制miR-152-3p均可提高人牙周膜干细胞的增殖能力及碱性磷酸酶活性、矿化结节形成量和Runt相关转录因子2、骨钙素、碱性磷酸酶的蛋白表达(P<0.05);miR-152-3p mimic减弱了过表达LncRNA SNHG4对人牙周膜干细胞成骨分化的促进作用;LncRNA SNHG4与miR-152-3p存在靶向关系;③结果表明,过表达LncRNA SNHG4可能通过抑制miR-152-3p促进人牙周膜干细胞成骨分化。 展开更多
关键词 长链非编码rna 核仁小rna宿主基因4 牙周膜干细胞 成骨分化
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环状RNA MAPK4通过吸附miR-125a-3p对神经胶质瘤细胞生物学行为的影响
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作者 郝建强 何森 +2 位作者 谢飞 张文彦 叶勇强 《贵州医科大学学报》 CAS 2024年第2期248-254,共7页
目的 探讨环状RNA MAPK4(circ-MAPK4)对神经胶质瘤细胞生物学行为的影响。方法 使用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)检测人神经胶质瘤细胞株(U138、U373、U87、A172、U251)和人正常性星形胶质细胞(HA1800)中circ-MAPK4、微小RNA-125a-... 目的 探讨环状RNA MAPK4(circ-MAPK4)对神经胶质瘤细胞生物学行为的影响。方法 使用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)检测人神经胶质瘤细胞株(U138、U373、U87、A172、U251)和人正常性星形胶质细胞(HA1800)中circ-MAPK4、微小RNA-125a-3p(miR-125a-3p)表达水平,将U138细胞分为circ-MAPK4低表达组(si-circMAPK4组)、阴性对照组(si-NC组)、无转染组(control组),si-circMAPK4组、si-NC组U138细胞分别转染circ-MAPK4 siRNA及其阴性对照siRNA-NC,control组细胞不做转染处理;采用circNet、StarBase分析预测circ-MAPK4与miR-125a-3p的靶向关系并使用荧光素酶实验进行验证;将si-circMAPK4组U138细胞分为circ-MAPK4+miR-inhibitor组、circ-MAPK4+NC-inhibitor组2个亚组并完成相关转染,采用CCK-8法检测U138细胞活力、细胞集落实验检测细胞克隆形成率、Transwell检测细胞侵入细胞数目、流式细胞法检测细胞凋亡率,Western blot检测细胞增殖蛋白(Ki67、cycD)、侵袭蛋白(E-cadherin、N-cadherin、Vimentin)、凋亡蛋白(Ceaved-caspase3/caspase3)表达水平。结果 与HA1800细胞比较,U138、U373、U87和A172细胞的circ-MAPK4表达水平升高(P<0.05),miR-125a-3p表达水平下降(P<0.05);荧光素酶实验结果显示circ-MAPK4-mut/miR-125a-3p mimics、circ-MAPK4-mut/NC-mimics、circ-MAPK4-WT/NC-mimics细胞的荧光素酶相对活性均高于circ-MAPK4-WT/miR-125a-3p mimics细胞(F=437.659,P<0.001);与si-NC组比较,si-circMAPK4组细胞活力、克隆形成率、细胞侵入细胞数目、Ki67、cycD、N-cadherin和Vimentin蛋白表达降低(P<0.05),而细胞凋亡率、Ceaved-caspase3/caspase3和E-cadherin蛋白表达升高(P<0.05);与circ-MAPK4+NC-inhibitor组比较,circ-MAPK4+miR-inhibitor组细胞活力、克隆形成率、细胞侵入细胞数目、Ki67、cycD、N-cadherin和Vimentin蛋白表达升高(P<0.05),细胞凋亡率、Ceaved-caspase3/caspase3和E-cadherin蛋白表达降低(P<0.05)。结论 circ-MAPK4低表达能减弱人神经胶质瘤细胞U138细胞增 展开更多
关键词 神经胶质瘤 环状rna MAPK4 微小rna-125a-3p 细胞增殖 细胞侵袭 细胞凋亡
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长链非编码RNA SLCO4A1-AS1靶向微小RNA-615-5p对食管癌细胞增殖、凋亡和炎症因子表达的影响
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作者 卡比努尔·阿里马斯 陈海林 +3 位作者 艾山江·木合塔尔 麦麦提热夏提·苏帕吉 吴春平 安尼瓦尔·买买提 《实用临床医药杂志》 CAS 2024年第1期13-19,共7页
目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员4A1反义RNA1(SLCO4A1-AS1)靶向微小RNA-615-5p(miR-615-5p)对食管癌细胞增殖、凋亡和炎症因子表达的影响。方法运用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)分析LncRNA SL... 目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员4A1反义RNA1(SLCO4A1-AS1)靶向微小RNA-615-5p(miR-615-5p)对食管癌细胞增殖、凋亡和炎症因子表达的影响。方法运用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)分析LncRNA SLCO4A1-AS1和miR-615-5p在食管癌组织、细胞系中表达情况。将si-NC、si-LncRNA SLCO4A1-AS1、miR-NC、miR-615-5p模拟物、pcDNA、pcDNA-LncRNA SLCO4A1-AS1、si-LncRNA SLCO4A1-AS1+anti-miR-NC、si-LncRNA SLCO4A1-AS1+anti-miR-615-5p分别转染Eca109细胞。CCK-8和流式细胞术用于检测细胞活力和凋亡率;平板克隆实验用于检测细胞增殖;酶联免疫吸附法(ELISA)试剂盒检测培养液中白细胞介素-6(IL-6)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平。采用双荧光素酶报告基因法确定LncRNA SLCO4A1-AS1与miR-615-5p的关系。结果食管癌组织、细胞系中LncRNA SLCO4A1-AS1表达上调,miR-615-5p表达下调。抑制LncRNA SLCO4A1-AS1表达后,细胞活力、细胞克隆形成数量以及培养液中IL-6和TNF-α水平降低,miR-615-5p表达量、细胞凋亡率升高,差异有统计学意义(P<0.05)。与miR-NC组比较,miR-615-5p组Eca109细胞中miR-615-5p表达量、Cleaved-caspase-3蛋白水平、凋亡率升高,细胞活力、细胞克隆形成数量、培养液中IL-6和TNF-α水平降低,差异有统计学意义(P<0.05)。与si-LncRNA SLCO4A1-AS1+anti-miR-NC比较,si-LncRNA SLCO4A1-AS1+anti-miR-615-5p组Eca109细胞中miR-615-5p表达量、Cleaved-caspase-3蛋白水平、凋亡率降低,细胞活力、细胞克隆形成数量、培养液中IL-6和TNF-α水平升高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论LncRNA SLCO4A1-AS1能够促进食管癌的发生和发展。抑制LncRNA SLCO4A1-AS1能够减少食管癌细胞的增殖,降低炎症因子的表达,诱导癌细胞凋亡。 展开更多
关键词 食管癌 长链非编码rna SLCO4A1-AS1 微小rna-615-5p 增殖 炎症 凋亡
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ESET通过lncRNA GMDS-AS1调控肝癌细胞增殖、凋亡、糖酵解的研究
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作者 黄俊玲 钟腾猛 +1 位作者 黄森平 高鑫艳 《安徽医药》 CAS 2023年第12期2402-2407,共6页
目的探究组蛋白甲基转移酶集合域分叉1(ESET)、长链非编码RNA甘露糖4,6-脱水酶反义RNA1(lncRNA GMDSAS1)对肝癌细胞增殖、凋亡、糖酵解的调控及二者之间的潜在关系。方法收集右江民族医学院附属医院和百色市人民医院2019年1月至2020年1... 目的探究组蛋白甲基转移酶集合域分叉1(ESET)、长链非编码RNA甘露糖4,6-脱水酶反义RNA1(lncRNA GMDSAS1)对肝癌细胞增殖、凋亡、糖酵解的调控及二者之间的潜在关系。方法收集右江民族医学院附属医院和百色市人民医院2019年1月至2020年1月期间手术切除的肝癌组织及癌旁组织49例。脂质体法将空白组(不做任何处理)、空载体组(转染pcDNA或si-con)、敲减ESET组(转染si-ESET)、过表达lncRNA GMDS-AS1组(转染pcDNA-GMDS-AS1)转染至HepG2细胞;实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)实验、蛋白质印迹法实验检测ESET、lncRNA GMDS-AS1、细胞增殖抗原标志物Ki-67、葡萄糖转运蛋白1(GLUT-1)、乳酸脱氢酶A(LDHA)、活化胱天蛋白酶-3(C-caspase-3)的表达;细胞计数试剂盒(CCK8)法、流式细胞术检测细胞增殖、凋亡;RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)实验检测ESET与lncRNA GMDS-AS1的关系。结果肝癌组织中ESETmRNA和蛋白表达量为5.18±0.94、0.69±0.14,显著高于癌旁组织的0.99±0.33、0.23±0.07,肝癌组织lncRNA GMDS-AS1表达量为0.63±0.20,显著低于癌旁组织的1.02±0.31(P<0.05),二者呈负相关性;与空载体组相比,敲减ESET组细胞ESET的表达明显降低,细胞增殖抗原标志物Ki-67蛋白表达显著降低,细胞活性显著降低,GLUT-1、LDHA的蛋白表达明显降低,C-caspase-3蛋白表达显著升高,凋亡率显著升高(P<0.05);过表达lncRNA GMDS-AS1组细胞具有与敲减ESET组相似的上述检测指标的变化。RIP实验显示,ESET与lncRNA GMDS-AS1具有结合能力。结论甲基转移酶ESET参与肝癌细胞的增殖、凋亡和糖酵解过程,其潜在的机制可能与负向调节lncRNA GMDS-AS1有关。 展开更多
关键词 肝肿瘤 甲基转移酶ESET 长链非编码rna甘露糖4 6-脱水酶反义rna1 增殖 凋亡 糖酵解
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LncRNA SNHG4表达与结直肠癌预后的关系
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作者 王健 赵海剑 +2 位作者 孙静 张晓雨 陈柏羽 《中华消化病与影像杂志(电子版)》 2023年第3期139-144,共6页
目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)小核仁RNA宿主基因4(SNHG4)在结直肠癌患者肿瘤组织和癌旁对照组织中的相对表达水平差异和患者临床病理特征及预后之间的关系。方法收集2016年6月至2020年12月淮安市第二人民医院80例结直肠癌手术患者的... 目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)小核仁RNA宿主基因4(SNHG4)在结直肠癌患者肿瘤组织和癌旁对照组织中的相对表达水平差异和患者临床病理特征及预后之间的关系。方法收集2016年6月至2020年12月淮安市第二人民医院80例结直肠癌手术患者的临床病理特征及预后信息。采用实时荧光定量PCR方法,检测肿瘤组织和癌旁对照组织标本中LncRNA SNHG4的相对表达量。结果80例结直肠癌患者中有66例患者的癌组织中LncRNA SNHG4表达高于癌旁对照组织,高表达率为82.50%。癌组织中LncRNA SNHG4相对表达量是癌旁对照组织的3.774倍,差异有统计学意义(t=8.643,P<0.01)。根据LncRNA SNHG4相对表达量中位数值将患者分为高表达组和低表达组,每组各40例。LncRNA SNHG4表达水平与患者的肿瘤T分期、淋巴结转移状态、TNM分期、血浆癌胚抗原水平、组织分化程度高度相关。生存分析结果表明LncRNA SNHG4高表达组5年OS显著低于低表达组患者(χ^(2)=4.876,P=0.027)。COX模型单因素变量分析显示TNM分期、肿瘤浸润层次、LncRNA SNHG4表达水平、肿瘤组织分化程度与结直肠癌患者的OS密切相关。COX多因素分析显示肿瘤TNM分期(Ⅲ/Ⅳ期vsⅠ/Ⅱ期)(HR=3.702,95%CI1.096~12.502,P=0.035)是结直肠癌患者总生存期的独立影响因子。结论结直肠癌患者LncRNA SNHG4表达增加,并且LncRNA SNHG4与恶性病理特征有关。LncRNA SNHG4可促进结直肠癌的进展和转移,影响生存和预后,可作为监测结直肠癌进展和预后的生物学标志物。 展开更多
关键词 结直肠癌 长链非编码rna 小核仁rna宿主基因4 预后
原文传递
长链非编码RNASPRY4-IT1对宫颈癌细胞的生物学行为影响 被引量:5
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作者 宋燕 吴琼蔚 《现代中西医结合杂志》 CAS 2018年第8期803-806,共4页
目的探讨长链非编码RNA(lnc RNA)SPRY4-IT1对宫颈癌细胞增殖侵袭及迁移的影响。方法宫颈癌细胞株He La中设计并合成SPRY4-IT1 RNA片段及其转染形成的si RNA片段(si-SPRY4-IT1 RNA),q RT-PCR技术检测其沉默效率,MTT检测SPRY4-IT1 RNA片段... 目的探讨长链非编码RNA(lnc RNA)SPRY4-IT1对宫颈癌细胞增殖侵袭及迁移的影响。方法宫颈癌细胞株He La中设计并合成SPRY4-IT1 RNA片段及其转染形成的si RNA片段(si-SPRY4-IT1 RNA),q RT-PCR技术检测其沉默效率,MTT检测SPRY4-IT1 RNA片段对He La细胞的增殖影响,Transwell实验检测He La细胞的侵袭、迁移能力,研究si-SPRY4-IT1 RNA对宫颈癌细胞He La侵袭凋亡能力的影响。结果长链非编码RNA SPRY4-IT1在人宫颈癌细胞He La中的表达明显增高,si-SPRY4-IT1RNA可下调He La细胞中SPRY4-IT1的表达,并抑制宫颈癌细胞He La的增殖和侵袭迁移能力。结论 SPRY4-IT1是宫颈肿瘤的一个致癌基因,可作为新的靶向治疗目标。 展开更多
关键词 宫颈癌 长链非编码rna SPRY4-IT1 增殖 侵袭 迁移
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