文摘目的:利用多中心样本探究长非编码RNA LOC285194在宫颈癌组织中的表达水平及相关内源竞争RNA网络。方法:收集来自GEO、TCGA、ArrayExpress、SRA等数据库中与宫颈癌相关的高通量数据集,利用散点图和独立样本t检验探究各个数据集中LOC285194在宫颈癌组织与非癌宫颈组织对照中的表达差异。同时,合并计算标准化均数差(SMD)以综合评估LOC285194在宫颈癌组织中的表达水平。DIANA-LncBase v3和TargetScan Human v8.0数据库用于预测与LOC285194有靶向关系的miRNA以及相关的mRNA,ENCORI数据库用于计算miRNA与相应靶基因表达的相关性。结果:通过综合计算618例样本(CC样本399例,正常宫颈样本219例)的SMD,结果提示LOC285194在宫颈癌组织中的表达水平显著低于正常对照组织(SMD=-0.43,95%CI-0.61~-0.25,P<0.05)。结合预测以及综合计算SMD,3个与LOC285194相关的miRNA被纳入:hsa-miR-130b-5p、hsa-miR-141-5p和hsa-miR-200a-5p。同时,通过综合计算,hsa-miR-141-5p在宫颈癌组织中的高表达及其靶基因ZNF385D的低表达得到了验证。结论:LOC285194在宫颈癌组织中呈显著的低表达,其可能通过相关的内源竞争RNA机制参与宫颈癌的发生与发展,值得进一步的研究探讨。
