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布莱凯特黑牛PDSS1基因的克隆测序及生物信息学分析 被引量:2
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作者 杨莉 董雅娟 +3 位作者 柏学进 赵仕全 牛召珊 张新浩 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2013年第21期14-18,共5页
对布莱凯特黑牛PDSS1基因cDNA进行克隆测序,为进一步研究PDSS1基因与布莱凯特黑牛胴体内CoQ10含量、肉质性状等的相关性提供理论基础。针对Ensembl公布的牛(参照)PDSS1基因中11个外显子,设计9对引物,对布莱凯特黑牛基因组DNA进行PCR扩... 对布莱凯特黑牛PDSS1基因cDNA进行克隆测序,为进一步研究PDSS1基因与布莱凯特黑牛胴体内CoQ10含量、肉质性状等的相关性提供理论基础。针对Ensembl公布的牛(参照)PDSS1基因中11个外显子,设计9对引物,对布莱凯特黑牛基因组DNA进行PCR扩增、克隆测序;利用软件Lasergene 7.0拼接出PDSS1基因cDNA,提交至GenBank并进行生物信息学分析。结果表明:布莱凯特黑牛PDSS1基因cDNA全长1 574 bp,包括一个长1 257 bp的完整开放阅读框,编码418个氨基酸。PDSS1蛋白含5个跨膜区,信号肽由26个氨基酸组成,成熟肽由392个氨基酸组成。布莱凯特黑牛与牛(参照)、海福特牛、马、猪、犬、小鼠、黑猩猩、人在编码区核酸序列同源性依次为99.9%、99.8%、89.0%、83.1%、88.6%、81.1%、80.8%、80.9%;推导氨基酸序列的同源性依次为100%、99.8%、92.0%、81.8%、91.6%、79.0%、80.4%、80.7%。本试验成功克隆了布莱凯特黑牛PDSS1基因cDNA,并提交至GenBank(登录号:KC787698)。布莱凯特黑牛与牛(参照)、海福特牛在PDSS1基因编码区的同源性极高,聚为一类;与马、犬、猪、小鼠、人、黑猩猩等物种的同源性相对低些。 展开更多
关键词 CoQ10 pdss1 克隆测序 生物信息学 布莱凯特黑牛
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辅酶Q_(10)及其合成限速酶编码基因的研究进展
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作者 张新浩 董雅娟 +3 位作者 牛召珊 赵仕全 杨莉 柏学进 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第12期220-224,共5页
辅酶Q10(CoQ10)是一种醌环类化合物,广泛存在于动植物及微生物细胞内,其在氧化磷酸化、细胞凋亡、体内自由基清除和增强机体免疫力等方面起着重要作用,被生物学家称为维生素Q。CoQ10合成酶编码基因的多态性影响机体内CoQ10水平,这为将... 辅酶Q10(CoQ10)是一种醌环类化合物,广泛存在于动植物及微生物细胞内,其在氧化磷酸化、细胞凋亡、体内自由基清除和增强机体免疫力等方面起着重要作用,被生物学家称为维生素Q。CoQ10合成酶编码基因的多态性影响机体内CoQ10水平,这为将其作为候选基因用于布莱凯特黑牛育种提供了可能。作者就CoQ10参与氧化磷酸化和清除自由基的作用机制、合成限速酶编码基因定位及结构等内容进行阐述,为借助分子标记技术促进国内肉牛新品种培育提供参考。 展开更多
关键词 CoQ10 布莱凯特黑牛 pdss1 COQ2 分子标记
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CoQ_(10)-Dps编码基因的研究进展及其在布莱凯特黑牛分子育种中的应用
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作者 杨莉 董雅娟 +2 位作者 赵仕全 牛召珊 柏学进 《安徽农业科学》 CAS 2013年第1期141-143,244,共4页
CoQ10作为生物细胞呼吸链中的重要递氢体,广泛存在于动植物及微生物体内,是人体唯一可利用的CoQ类,而Dps(十聚异戊二烯焦磷酸合成酶)是决定其类别的关键酶。CoQ10在脏器(心脏、肝脏、肾脏)、牛肉、豆油、花生等食物中含量较高,摄入1.0 k... CoQ10作为生物细胞呼吸链中的重要递氢体,广泛存在于动植物及微生物体内,是人体唯一可利用的CoQ类,而Dps(十聚异戊二烯焦磷酸合成酶)是决定其类别的关键酶。CoQ10在脏器(心脏、肝脏、肾脏)、牛肉、豆油、花生等食物中含量较高,摄入1.0 kg牛肉或1.5kg花生均可提供约30 mg CoQ10。因此,利用CoQ10合成过程中的各类关键酶编码基因对布莱凯特黑牛进行分子遗传标记辅助育种的研究,有助于促进高档优质肉牛新品种的培育。简要概述了CoQ10和CoQ10-PPP(聚异戊二烯焦磷酸)侧链的生物合成,并对其关键酶Dps编码基因的研究现状及在布莱凯特黑牛分子育种中的应用进行评述。 展开更多
关键词 CoQ10 DPS pdss1 pdss2 布莱凯特黑牛
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布莱凯特黑牛PDSS1基因单核苷酸多态性分析 被引量:2
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作者 杨莉 董雅娟 +4 位作者 柏学进 牛召珊 宋少康 赵仕全 张新浩 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2013年第7期125-129,133,共6页
为研究布莱凯特黑牛PDSS1(decaprenyl diphosphate synthase subunit 1)基因与肉质性状的相关性,采用PCR-SSCP技术对96头布莱凯特黑牛进行单核苷酸多态性检测。经PCR-SSCP检测及克隆测序发现,布莱凯特黑牛PDSS1基因各扩增片段中,P4表现... 为研究布莱凯特黑牛PDSS1(decaprenyl diphosphate synthase subunit 1)基因与肉质性状的相关性,采用PCR-SSCP技术对96头布莱凯特黑牛进行单核苷酸多态性检测。经PCR-SSCP检测及克隆测序发现,布莱凯特黑牛PDSS1基因各扩增片段中,P4表现为AA、AB、BB 3种基因型,P9表现为CC、CD 2种基因型,且各存在1个SNP位点:第4个外显子122bp处发生A→G的碱基突变,并引起相应氨基酸的改变(N156S);第11个外显子6bp处发生C→T的碱基突变,但未引起氨基酸的改变。经肉质性状关联性分析发现,AA、AB、BB不同基因型间差异不显著(P>0.05),但AB型的综合肉质指标较好。研究表明,布莱凯特黑牛PDSS1基因各外显子核苷酸序列的稳定性极高;外显子4内的碱基突变可能会引起PDSS1蛋白质空间结构及功能的改变,但与肉质性状相关性不显著。 展开更多
关键词 布莱凯特黑牛 pdss1基因 单核苷酸多态性 肉质性状
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