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中国白城兵器试验中心场区鼠疫菌生物学性状的研究
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作者 谷春广 张春华 +6 位作者 丛显斌 闫卫东 徐国鑫 王忠惠 岳明祥 赵铭山 张晶仁 《中国地方病防治》 2001年第5期272-274,共3页
为研究探讨吉林西部草原鼠疫菌生物学性状,本研究对该地区30株鼠疫菌的生化性状、质粒种类及质粒DNA酶切图谱、染色体PCR指纹图谱和外膜蛋白种类进行了测试。通过系统研究,证实该地区鼠疫菌生化结果为,分解葡萄糖、麦芽糖和... 为研究探讨吉林西部草原鼠疫菌生物学性状,本研究对该地区30株鼠疫菌的生化性状、质粒种类及质粒DNA酶切图谱、染色体PCR指纹图谱和外膜蛋白种类进行了测试。通过系统研究,证实该地区鼠疫菌生化结果为,分解葡萄糖、麦芽糖和甘油,不分解乳糖、蔗糖、山梨醇、鼠李糖、密二糖和尿素,硝酸盐还原(脱氧)试验阳性,靛基质试验阳住,V-P试验阴性,M-R试验阳性;试验全部菌株都具有规范的质粒图谱,携带的质粒种类为,65Mdal、45Mdal、6Mdal3种;被试菌株的质粒单纯用EcoRI酶切,可切成16个片段;鼠疫菌染色体PCR指纹图谱分析,吉林西部草原场区鼠疫菌的染色体可产生8条主要DNA带;可产生15条外膜蛋白带。 展开更多
关键词 鼠疫菌 质粒 外膜蛋白 染色体 pcr-指纹图 生物学
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鳊鱼出血病嗜水气单胞菌的分离·鉴定与ERIC-PCR指纹图谱研究 被引量:7
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作者 胡王 蒋启欢 +2 位作者 范腾飞 江河 叶应旺 《安徽农业科学》 CAS 2012年第4期2056-2057,共2页
[目的]对鳊鱼嗜水气单胞菌进行分离与鉴定。[方法]从鳊鱼中分离出嗜水气单胞菌,并进行16S rDNA特异性分子鉴定。分析嗜水气单胞菌的生化特征,并构建嗜水气单胞菌ERIC-PCR指纹图谱。[结果]分离株的测序结果与GenBank中嗜水气单胞菌的标... [目的]对鳊鱼嗜水气单胞菌进行分离与鉴定。[方法]从鳊鱼中分离出嗜水气单胞菌,并进行16S rDNA特异性分子鉴定。分析嗜水气单胞菌的生化特征,并构建嗜水气单胞菌ERIC-PCR指纹图谱。[结果]分离株的测序结果与GenBank中嗜水气单胞菌的标准菌株序列相似度达98%~99%。分离菌的生化特征结果均呈阳性。同一菌株的ERIC-PCR具有较好的重复性和稳定性,可用于嗜水气单胞菌的分型溯源。[结论]该研究为预防和控制鳊鱼出血病的发生和蔓延提供了参考。 展开更多
关键词 鳊鱼出血病 病原鉴定 ERIC-pcr分子指纹图
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油菜菌核病生防芽孢杆菌的分离鉴定及其脂肽化合物分析 被引量:35
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作者 薛鹏琦 刘芳 +3 位作者 乔俊卿 伍辉军 冯致科 高学文 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期127-132,共6页
采用平板拮抗筛选,分别从西藏日喀则地区和拉萨地区杂草根围土壤中筛选到2个对油菜菌核病菌有显著拮抗活性的芽孢杆菌菌株RJGP16和YBWC43。通过生理生化鉴定、16S rDNA序列分析和BOX-PCR指纹图谱分析,鉴定菌株RJGP16为萎缩芽孢杆菌Bacil... 采用平板拮抗筛选,分别从西藏日喀则地区和拉萨地区杂草根围土壤中筛选到2个对油菜菌核病菌有显著拮抗活性的芽孢杆菌菌株RJGP16和YBWC43。通过生理生化鉴定、16S rDNA序列分析和BOX-PCR指纹图谱分析,鉴定菌株RJGP16为萎缩芽孢杆菌Bacillus atrophaeus,菌株YBWC43为解淀粉芽孢杆菌Bacillus amyloliquefaciens。离体叶片试验结果显示,菌株RJGP16和YBWC43对油菜菌核病菌防治效果分别为50.24%和100.00%。脂肽化合物种类分析显示,菌株RJGP16产生脂肽化合物表面活性素和芬枯草菌素,菌株YBWC43产生杆菌霉素D和芬枯草菌素。表明菌株RJGP16和YBWC43对油菜菌核病的防治效果与其产生的脂肽化合物有关。 展开更多
关键词 油菜菌核病 芽孢杆菌 16S RDNA BOX-pcr指纹图 脂肽化合物
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西藏低温适生芽孢杆菌的分离鉴定及其抗菌和促生作用 被引量:28
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作者 刘芳 薛鹏琦 +3 位作者 乔俊卿 伍辉军 孙健 高学文 《中国生物防治》 CSCD 北大核心 2010年第4期453-460,共8页
从西藏拉萨色拉寺杂草根围土壤中分离到1株低温适生芽孢杆菌LSSC3,对该菌株进行了形态学、生理生化和分子生物学鉴定及抗菌和促生作用研究。菌株LSSC3细胞短杆状,芽孢圆形,10℃条件下生长良好。生理生化特征显示,该菌株与巨大芽孢杆菌Ba... 从西藏拉萨色拉寺杂草根围土壤中分离到1株低温适生芽孢杆菌LSSC3,对该菌株进行了形态学、生理生化和分子生物学鉴定及抗菌和促生作用研究。菌株LSSC3细胞短杆状,芽孢圆形,10℃条件下生长良好。生理生化特征显示,该菌株与巨大芽孢杆菌Bacillus megaterium特征一致,但ERIC-PCR指纹图谱分析表明其与B. megaterium模式菌株存在显著差异。16SrRNA基因序列分析结果显示,菌株LSSC3与B. subtilis和B. atrophaeus的系统发育相似性均很高。进一步通过gyrB基因测序和比对,其同源性与B. atrophaeus达到100%,没有找到与B. subtilis的同源性关系。据此,将其鉴定为B. atrophaeus。菌株LSSC3对植物病原真菌和细菌均具有很强的抑制作用,同时对拟南芥有良好的促生长作用。该菌具有耐低温和生防的双重特点,具有在农业生产上应用的潜力。 展开更多
关键词 低温适生芽孢杆菌 ERIC-pcr指纹图 16S rRNA系统发育 gyrB基因 抑菌作用 促生作用
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刺参肠道及养殖池塘菌群组成的PCR-DGGE指纹图谱分析 被引量:26
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作者 王轶南 朱世伟 常亚青 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2010年第3期119-122,共4页
采用基于16S rDNA的PCR-DGGE指纹图谱技术对黄海北部刺参养殖池塘(底泥、海水)及刺参肠道的菌群组成进行了初步分析。结果显示,从刺参肠道、底泥及海水样品分别获得41、31及41条扩增条带,其中优势条带分别为12、9及10条;三者具20条共有... 采用基于16S rDNA的PCR-DGGE指纹图谱技术对黄海北部刺参养殖池塘(底泥、海水)及刺参肠道的菌群组成进行了初步分析。结果显示,从刺参肠道、底泥及海水样品分别获得41、31及41条扩增条带,其中优势条带分别为12、9及10条;三者具20条共有条带,其中4条为各样品的优势条带,共有条带在各样品中的丰度不同;三者分别具5、2及13条特异条带,其中肠道中的第34、42条带以及海水中的第25、46条带丰度均较高;肠道与底泥的菌群组成相似性系数(戴斯系数)为77.8%,二者与海水菌群组成的相似性系数分别为65.9%和55.6%。 展开更多
关键词 刺参Apostichopus JAPONICUS 肠道 养殖池塘 菌群 pcr-DGGE指纹图
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焦化废水处理系统微生物群落结构动态的ERIC-PCR指纹图谱分析 被引量:15
6
作者 高平平 赵义 赵立平 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期705-710,共6页
ERIC PCR群落指纹图谱监测与常规技术相结合 ,分析了焦化废水处理系统曝气池的微生物群落结构动态变化与污染负荷和主要污染物降解效果变化的关系 .在每 3d 1次 ,连续 8个时间点的监测中 ,待处理废水中苯酚负荷在 35 5 3mg L和132 82m... ERIC PCR群落指纹图谱监测与常规技术相结合 ,分析了焦化废水处理系统曝气池的微生物群落结构动态变化与污染负荷和主要污染物降解效果变化的关系 .在每 3d 1次 ,连续 8个时间点的监测中 ,待处理废水中苯酚负荷在 35 5 3mg L和132 82mg L之间波动 ,氰化物负荷从 0 96mg L变化到 34 75mg L ,CODCr最低为 10 4 4 10mg L ,最高时为 7930 90mg L .第 4监测期间高浓度矿物油冲击使活性污泥的沉降能力和对CODCr的降解效率显著降低 ,但对苯酚和氰化物的降解能力造成的影响较小 .监测期间 2个曝气池微生物群落的ERIC PCR指纹图谱的平均相似性系数 (Cs)分别为 94 1%和 96 6 % ,多样性指数在 1 77— 2 34和 1 6 0— 2 16之间 ,表明用ERIC PCR检测出的该系统中的活性污泥这部分微生物种群的结构比较稳定 ,可能构成了苯酚和氰化物去除效率在监测期间相对稳定的基础 . 展开更多
关键词 焦化废水 水处理系统 微生物群落结构 活性污泥 ERIC-pcr指纹图 生物监测
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厚朴的任意引物PCR指纹图谱分析 被引量:4
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作者 苏应娟 朱建明 +3 位作者 王艇 李雪雁 曾庆文 夏念和 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期545-548,共4页
目的 鉴别中药材厚朴、凹叶厚朴及其常见的伪品和混淆品。方法 采用任意引物 PCR (arbitrarilyprim ed PCR,AP- PCR)技术扩增植物基因组 DNA样品。结果  AP- PCR技术获得清晰可靠的 DNA指纹图谱 ,根据琼脂糖凝胶上显示的 DNA带型差... 目的 鉴别中药材厚朴、凹叶厚朴及其常见的伪品和混淆品。方法 采用任意引物 PCR (arbitrarilyprim ed PCR,AP- PCR)技术扩增植物基因组 DNA样品。结果  AP- PCR技术获得清晰可靠的 DNA指纹图谱 ,根据琼脂糖凝胶上显示的 DNA带型差异可迅捷地区分厚朴、凹叶厚朴及其伪品、混淆品。结论 为应用 AP- PCR技术在分子水平上鉴别中药材厚朴 ,保证引种的准确性奠定了基础。 展开更多
关键词 厚朴 任意引物 pcr指纹图 AP-pcr
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污染土壤中有机磷农药降解菌的分离及其多样性 被引量:13
8
作者 张瑞福 吴旭平 +3 位作者 樊奔 何健 蒋建东 李顺鹏 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期1502-1508,共7页
采用添加有机磷农药的选择性培养基,在长期受有机磷农药污染的土壤中分离到7株有机磷农药降解菌,经生理生化鉴定和系统发育分析,菌株mp-1鉴定为Pseudaminobactersp.,菌株mp-2为Alcaligenessp.,菌株mp-7为Brucellasp.,其他菌株为Ochrobac... 采用添加有机磷农药的选择性培养基,在长期受有机磷农药污染的土壤中分离到7株有机磷农药降解菌,经生理生化鉴定和系统发育分析,菌株mp-1鉴定为Pseudaminobactersp.,菌株mp-2为Alcaligenessp.,菌株mp-7为Brucellasp.,其他菌株为Ochrobactrumsp.。16SrDNA序列同源性比较、系统发育分析和染色体ERIC-PCR指纹图谱扩增表明有机磷农药长期污染的土壤中有机磷农药降解菌具有丰富的多样性。 展开更多
关键词 有机磷农药 降解菌 系统发育 ERIC-pcr指纹图 多样性
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中国北方地区甘草根瘤菌表型及遗传多样性研究 被引量:11
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作者 谷峻 陈文新 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期1321-1327,共7页
【目的】了解中国北方地区甘草根瘤菌的生物多样性。【方法】采用表型数值分类、16SrDNAPCR-RFLP分析和BOX-PCR指纹图谱分析的方法对北方地区的甘草根瘤菌进行表型、遗传多样性分析。【结果】供试菌株在数值分类聚类分析中约85%的相似... 【目的】了解中国北方地区甘草根瘤菌的生物多样性。【方法】采用表型数值分类、16SrDNAPCR-RFLP分析和BOX-PCR指纹图谱分析的方法对北方地区的甘草根瘤菌进行表型、遗传多样性分析。【结果】供试菌株在数值分类聚类分析中约85%的相似水平上产生2个表观群,有11株菌未与已知参比菌株聚群。16SrDNAPCR-RFLP分析表明,供试的20株菌共产生14种遗传型,表现出丰富的遗传多样性。BOX-PCR指纹图谱分析进一步证明与甘草共生的根瘤菌的基因组也具有多样性。【结论】在中国北方地区与甘草共生的根瘤菌在Sinorhizobium、Rhizobium和Mesorhizobium属中均有分布。 展开更多
关键词 根瘤菌 数值分类 16S RDNA pcr-RFLP BOX—pcr指纹图
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强脉冲电场对细胞膜通透性及其DNA的影响 被引量:9
10
作者 张鹰 曾新安 +1 位作者 温其标 冯洁 《高电压技术》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第2期90-93,共4页
为探讨脉冲电场(PEF)致死微生物的机理,研究了不同场强与处理时间对悬浮在温度为30°C,电导率σ为340μS/cm的NaCl溶液中大肠杆菌的灭菌效果。紫外分光光度计分析PEF处理前后核酸与蛋白质的溢出情况的结果显示,电场强度为30 kV/cm,... 为探讨脉冲电场(PEF)致死微生物的机理,研究了不同场强与处理时间对悬浮在温度为30°C,电导率σ为340μS/cm的NaCl溶液中大肠杆菌的灭菌效果。紫外分光光度计分析PEF处理前后核酸与蛋白质的溢出情况的结果显示,电场强度为30 kV/cm,处理时间266 ms时,大肠杆菌全部杀灭。经PEF处理后的大肠杆菌液中的核酸与蛋白质相对于未处理的大肠杆菌液有明显提高,说明用PEF处理提高了细胞膜的通透性。采用ERIC-PCR技术比较脉冲电场处理前后大肠杆菌的DNA指纹图谱变化的结果表明:强PEF(场强≥20kV/cm)导致大肠杆菌的DNA链损伤与降解,在指纹图谱上表现为DNA大分子条带的缺失与小分子量条带的增加。 展开更多
关键词 高强脉冲电场 大肠杆菌 细胞膜通透性 ERIC-pcr指纹图 DNA降解
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大熊猫粪便菌群ERIC-PCR指纹图谱的分析及优势菌群的鉴定 被引量:12
11
作者 崔明全 何廷美 +9 位作者 钟志军 王承东 张婷婷 周潇潇 周紫峣 李德生 张和民 李才武 何永果 彭广能 《畜牧与兽医》 北大核心 2013年第9期6-11,共6页
探讨1只野生大熊猫和不同年龄段圈养大熊猫粪便菌群的多样性和相似性,并鉴定野生大熊猫圈养之后,其粪便中的优势菌群。对来自3个年龄段9只(3只亚成体、3只成年体、3只老年体)圈养大熊猫及1只野生大熊猫圈养前、后的11份粪便细菌的DNA进... 探讨1只野生大熊猫和不同年龄段圈养大熊猫粪便菌群的多样性和相似性,并鉴定野生大熊猫圈养之后,其粪便中的优势菌群。对来自3个年龄段9只(3只亚成体、3只成年体、3只老年体)圈养大熊猫及1只野生大熊猫圈养前、后的11份粪便细菌的DNA进行ERIC-PCR指纹图谱分析,并利用16S rRNA基因序列分析对优势菌条带进行鉴定。结果显示:该只野生大熊猫粪便菌群多样性比圈养大熊猫丰富;圈养大熊猫粪便菌群多样性:成年体>亚成体>老年体;16s rRNA和ERIC-PCR指纹图谱优势条带鉴定的优势菌结果有差异性。结果表明:大熊猫的肠道菌群多样性易受生长环境、年龄因素的影响;其次,不同年龄段的圈养大熊猫,其肠道菌群的相似性与年龄因素不相关;利用ERIC-PCR指纹图谱优势条带鉴定优势菌的方法有一定的局限性。 展开更多
关键词 野生大熊猫 圈养大熊猫 肠道菌群 ERIC—pcr指纹图 16S RRNA基因
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药用植物内生芽孢杆菌的多样性和系统发育研究 被引量:10
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作者 陈兰 张小平 Kristina Lindstrom 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期432-438,共7页
【目的】了解药用植物内生芽孢杆菌的生物多样性。【方法】采用数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、BOX-PCR指纹图谱和16S rDNA序列分析技术对分离于几种药用植物的内生芽孢杆菌和已知参比菌株进行表型、遗传多样性及系统发育研究。【结果】... 【目的】了解药用植物内生芽孢杆菌的生物多样性。【方法】采用数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、BOX-PCR指纹图谱和16S rDNA序列分析技术对分离于几种药用植物的内生芽孢杆菌和已知参比菌株进行表型、遗传多样性及系统发育研究。【结果】供试菌株在数值分类聚类分析中在84%的相似水平上产生13个表观群。16S rDNA PCR-RFLP分析表明供试菌株表现出丰富的遗传多样性。BOX-PCR指纹图谱分析进一步证明药用植物的内生芽孢杆菌的基因组也具有多样性,聚群的结果与数值分类有较好一致性。用软件在Genbank中进行所得序列的同源性检索,并构建系统发育树。由16S rDNA序列分析可知,供试的代表菌株SCAU11与球形芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)亲缘关系最近,SCAU78和SCAU25为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)的两个亚种,代表菌株SCAU39与巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)的亲缘关系最近。【结论】研究结果表明药用植物内生芽孢杆菌具有明显的表型和遗传多样性。 展开更多
关键词 芽孢杆菌 多样性 数值分类 16S DNA pcr-RFLP BOX-pcr指纹图 系统发育
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华北及西北地区岩黄芪根瘤菌的表型及遗传多样性 被引量:8
13
作者 刘洋 隋新华 陈文新 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期1088-1094,共7页
选用分离自河北、内蒙古等5省区的岩黄芪根瘤菌30株及17株已知参比菌株,进行了营养利用、抗生素抗性、耐逆性及生理生化反应等12 5项表型性状研究,所得数值分类树状图表明不同宿主及不同地域的岩黄芪根瘤菌的表型多样性。通过对其中部... 选用分离自河北、内蒙古等5省区的岩黄芪根瘤菌30株及17株已知参比菌株,进行了营养利用、抗生素抗性、耐逆性及生理生化反应等12 5项表型性状研究,所得数值分类树状图表明不同宿主及不同地域的岩黄芪根瘤菌的表型多样性。通过对其中部分菌株进行16 S r DNA PCR- RFL P及BOX- PCR指纹图谱分析,聚类结果表明供试岩黄芪根瘤菌具有遗传多样性。 展开更多
关键词 岩黄芪根瘤菌 多样性 数值分类 16S RDNA pcr—RFLP BOX—pcr指纹图
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沙城产区酿酒酵母多样性研究 被引量:8
14
作者 赵静静 李艳 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第5期224-228,共5页
对沙城产区龙眼葡萄相关环境中分离筛选的酿酒酵母进行多样性研究。在连续3年(2008、2009、2010年)的实验中,共从葡萄园土壤、葡萄酒厂设备表面、接触过葡萄酒厂设备的葡萄汁和自然发酵过程中采集菌源样品227份,共分离得到1358株酵母菌... 对沙城产区龙眼葡萄相关环境中分离筛选的酿酒酵母进行多样性研究。在连续3年(2008、2009、2010年)的实验中,共从葡萄园土壤、葡萄酒厂设备表面、接触过葡萄酒厂设备的葡萄汁和自然发酵过程中采集菌源样品227份,共分离得到1358株酵母菌。用5.8S-ITS区域RFLP方法进行分子水平的分类鉴定及赖氨酸培养基复筛,得到了270株酿酒酵母。再利用Interdelta PCR指纹图谱法将酿酒酵母区分为16类,其中土壤5类,自然发酵过程中第2、3、4期分别得到4类、10类和11类;酒厂设备表面3类;接触酒厂设备的葡萄汁3类。酿酒酵母的种类因样品采集时间、采集地点等不同有明显区别。自然发酵过程中得到的酿酒酵母被认为是本土酵母的可能性最大。 展开更多
关键词 酿酒酵母 5.8S-ITS区域RFLP分析 Interdelta pcr指纹图 生物多样性 本土酵母
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南美白对虾养殖底泥细菌多样性研究 被引量:7
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作者 金风杰 蒋德明 +4 位作者 王亭芳 孙霏 常忠义 赵云龙 高红亮 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2013年第3期193-198,212,共7页
【目的】研究南美白对虾养殖池一个养殖周期的底泥细菌多样性,为指导水产养殖提供参考。【方法】于2011年7-9月,采集上海市金山区水产养殖基地南美白对虾养殖池塘的底泥,提取底泥中细菌的总DNA,扩增细菌16SrDNA的V3可变区,采用DGGE指纹... 【目的】研究南美白对虾养殖池一个养殖周期的底泥细菌多样性,为指导水产养殖提供参考。【方法】于2011年7-9月,采集上海市金山区水产养殖基地南美白对虾养殖池塘的底泥,提取底泥中细菌的总DNA,扩增细菌16SrDNA的V3可变区,采用DGGE指纹图谱技术以及基因测序技术,对该养殖周期的底泥细菌多样性进行研究。【结果】不同月份虾池底泥中存在一定数量的共有优势菌群,7月和8月的共有优势菌群分别为黄杆菌属和绿弯菌门细菌,8月和9月共有优势菌群为梭菌属细菌,7月份和9月份共有优势菌群为拟杆菌门细菌和硫酸盐还原菌;同时,7-9月底泥中还各自分布有除硫单胞菌属、蛭弧菌属、δ-变形菌门、酸杆菌门、厚壁菌门、聚球藻属等细菌。【结论】南美白对虾养殖底泥中细菌多样性丰富。 展开更多
关键词 南美白对虾养殖池 底泥 DNA提取 pcr-DGGE指纹图 细菌多样性
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ERIC-PCR指纹图谱技术对低温下SUFR反应器中菌群结构分析 被引量:6
16
作者 叶姜瑜 王图锦 +1 位作者 罗固源 季铁军 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期101-107,共7页
使用ERIC-PCR指纹图谱技术对螺旋升流式反应器(SpiralUp-FlowReactor,SUFR)在低温下的微生物群落结构进行了分析.结果表明,低温下反应器中微生物菌群呈多样性分布,优势菌群突出;在遭受约5℃低温条件冲击后,反应器中菌群多样性和反应器... 使用ERIC-PCR指纹图谱技术对螺旋升流式反应器(SpiralUp-FlowReactor,SUFR)在低温下的微生物群落结构进行了分析.结果表明,低温下反应器中微生物菌群呈多样性分布,优势菌群突出;在遭受约5℃低温条件冲击后,反应器中菌群多样性和反应器脱氮除磷效率都有所降低,但TN去除率和TP去除率仍然达到了72.35%和93.28%,维持了反应器的正常功能.不同温度下对比分析可以看出,在低温和常温下反应器中优势菌群发生了一定变化,常温条件下的优势菌群比低温条件下更丰富多样.总体看来,SUFR反应器良好的螺旋升流特质有利于不同菌群在不同温度下的功能发挥,特别是低温下脱氮除磷功能的维持. 展开更多
关键词 SUFR反应器 ERIC-pcr指纹图 活性污泥 菌群结构 脱氮除磷
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水稻土中紫色光合细菌沿纬度梯度的空间分异特征 被引量:5
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作者 俎千惠 王保战 +2 位作者 贾仲君 林先贵 冯有智 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第21期6730-6737,共8页
紫色光合细菌由于其代谢途径的多样性,在环境中广泛分布,是生态系统中碳循环的参与者和推动者之一。但是,水稻土中紫色光合细菌群落结构的空间分异却鲜有报道。基于此,沿我国温度梯度带(纬度梯度:28.38°N—47.43°N),采集了8... 紫色光合细菌由于其代谢途径的多样性,在环境中广泛分布,是生态系统中碳循环的参与者和推动者之一。但是,水稻土中紫色光合细菌群落结构的空间分异却鲜有报道。基于此,沿我国温度梯度带(纬度梯度:28.38°N—47.43°N),采集了8个典型水稻土,利用PCR-DGGE指纹图谱和系统发育树分析揭示不同地点水稻土中紫色光合细菌群落的组成;结合多个环境因子,利用生物信息学,典范对应分析(Canonical Correspondence Analysis,CCA)和最小判别效应分析(Cladogram,LDA)明确水稻土中紫色光合细菌的空间分异规律。研究发现我国8个典型水稻土中紫色光合细菌主要由变形菌门(Proteobacteria)的α和β这两个分支组成,主要为紫色非硫细菌;p H和纬度都是驱动水稻土中紫色光合细菌群落结构分异的关键因子。该认知不仅有助于更好地揭示稻田关键功能微生物群的生物地理学分布,还有助于进一步探究我国稻田生态系统有机质转化的时空差异。 展开更多
关键词 水稻土 紫色光合细菌 pcr-DGGE指纹图 典范对应分析 群落组成空间分异
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我国8个典型水稻土中产甲烷古菌群落组成的空间分异特征 被引量:5
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作者 俎千惠 王保战 +3 位作者 郑燕 贾仲君 林先贵 冯有智 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1397-1405,共9页
【目的】产甲烷古菌主导稻田甲烷生成,是稻田生态系统的模式微生物类群之一,具有重要的生态学意义。然而,水稻土产甲烷古菌群落组成的空间分异却鲜有报告。【方法】本研究沿20.55°N至47.43°N梯度,采集了我国不同纬度上8个典... 【目的】产甲烷古菌主导稻田甲烷生成,是稻田生态系统的模式微生物类群之一,具有重要的生态学意义。然而,水稻土产甲烷古菌群落组成的空间分异却鲜有报告。【方法】本研究沿20.55°N至47.43°N梯度,采集了我国不同纬度上8个典型水稻土,利用PCR-DGGE指纹图谱和系统发育树分析揭示不同地点水稻土中产甲烷古菌群落的组成;结合多个环境因子,利用生物信息学,典范对应分析(Canonical Correspondence Analysis,CCA)和维恩图(Venn diagram)明确产甲烷古菌的空间分异规律。【结果】研究发现p H值是驱动水稻土中产甲烷古菌群落组成分异的主要因子;此外,沿纬度梯度,8个地区的产甲烷古菌群落组成也呈现出规律性变化。【结论】本研究首次阐明了稻田中产甲烷古菌群落分布情况,并揭示其主要驱动因子。该认知不仅有助于我们更好地了解产甲烷古菌的生物地理学分布,还有助于从微生物学机制上阐明我国温度梯度带上有机质转化空间的差异。 展开更多
关键词 水稻土 产甲烷古菌 群落组成空间分异 pcr-DGGE指纹图 典范对应分析
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甜菜贮藏期致腐真菌和细菌的分离与鉴定
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作者 魏学军 王泽玉 +6 位作者 秦亚楠 刘静宜 陈海军 孙剑 齐树森 魏国坤 张菡 《农产品加工》 2024年第17期57-61,65,共6页
甜菜是我国主要的糖料作物之一。目前,制约我国甜菜制糖业发展的重要因素之一是致腐菌的侵染。为明确导致新疆甜菜腐败的优势致腐细菌和真菌。对焉耆地区贮藏末期甜菜(2023年11月)中的真菌、细菌进行分离。共分离出60株细菌和40株真菌,... 甜菜是我国主要的糖料作物之一。目前,制约我国甜菜制糖业发展的重要因素之一是致腐菌的侵染。为明确导致新疆甜菜腐败的优势致腐细菌和真菌。对焉耆地区贮藏末期甜菜(2023年11月)中的真菌、细菌进行分离。共分离出60株细菌和40株真菌,通过PCR指纹图谱、16S rRNA和26S rDNA技术对分离真菌和细菌进行分型鉴定。共鉴定出6属6种细菌和4属4种真菌。通过构建系统发育树,确定优势致腐细菌为Bacillus Mojavensis-X1(27%)和Atlantibacter hermannii-X6(25%);优势致腐真菌为Pichia kluyveri-A(35%)和Aspergillus fumigatus-B(25%)。 展开更多
关键词 微生物 pcr指纹图 基因分型 甜菜 贮藏
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吉林西北部草原鼠疫菌染色体PCR指纹图谱分析 被引量:3
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作者 张春华 谷春广 +5 位作者 丛显斌 闫卫东 王忠惠 徐国鑫 岳明祥 张晶仁 《中国地方病防治》 2001年第4期193-194,共2页
本文通过PCR指纹图谱,分析了吉林西部草原鼠疫菌染色体NDA特征,结果显示该地区鼠疫菌染色体可产生8条非常明显的扩增区带,其他对照的菌株只产生6条扩增区带。分析认为这种差别可能是该地菌株的一特征。
关键词 鼠疫菌 染色体 pcr指纹图 吉林西北部
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